Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L0PB36

Protein Details
Accession L0PB36    Localization Confidence High Confidence Score 21.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-74FSEKLFKEKKEKLPKNEQTKENNHydrophilic
85-106DQEIFIKKSKKQKNETKKEYSEHydrophilic
216-242FTKGKEFRAEKSKKKKGSYHGGKINTNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
48-81GKHLFSEKLFKEKKEKLPKNEQTKENNEVKKRKK
91-96KKSKKQ
162-172KKDVKEKPKKK
220-232KEFRAEKSKKKKG
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MEIFDELLISTAKTFVKETGKKELFLQEKEIKSLIEVYNLYNKKKNEGKHLFSEKLFKEKKEKLPKNEQTKENNEVKKRKKTLLDQEIFIKKSKKQKNETKKEYSENETQTKILNTNYSDKENEKENEIAFENIPDIQLDKKEVTDNLGSKKVYNGKNLEEKKDVKEKPKKKSSFSRIDISKVEFAHNSLKDNSYAIAYKGEQDEYGTKANRDLIFTKGKEFRAEKSKKKKGSYHGGKINTNISRSFKFT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.18
3 0.28
4 0.34
5 0.38
6 0.46
7 0.47
8 0.47
9 0.49
10 0.53
11 0.49
12 0.45
13 0.49
14 0.46
15 0.45
16 0.46
17 0.44
18 0.35
19 0.29
20 0.33
21 0.25
22 0.22
23 0.21
24 0.21
25 0.3
26 0.33
27 0.36
28 0.36
29 0.36
30 0.4
31 0.45
32 0.47
33 0.49
34 0.55
35 0.57
36 0.61
37 0.68
38 0.63
39 0.59
40 0.63
41 0.53
42 0.54
43 0.52
44 0.45
45 0.46
46 0.51
47 0.6
48 0.63
49 0.7
50 0.69
51 0.77
52 0.83
53 0.85
54 0.84
55 0.81
56 0.78
57 0.75
58 0.74
59 0.71
60 0.69
61 0.67
62 0.68
63 0.69
64 0.71
65 0.71
66 0.69
67 0.68
68 0.7
69 0.73
70 0.74
71 0.68
72 0.59
73 0.61
74 0.6
75 0.54
76 0.48
77 0.4
78 0.33
79 0.41
80 0.47
81 0.49
82 0.54
83 0.63
84 0.72
85 0.8
86 0.84
87 0.83
88 0.8
89 0.76
90 0.71
91 0.66
92 0.61
93 0.55
94 0.49
95 0.41
96 0.36
97 0.31
98 0.28
99 0.23
100 0.17
101 0.15
102 0.14
103 0.19
104 0.2
105 0.22
106 0.22
107 0.22
108 0.23
109 0.25
110 0.24
111 0.21
112 0.2
113 0.18
114 0.18
115 0.18
116 0.17
117 0.12
118 0.11
119 0.09
120 0.08
121 0.08
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.08
127 0.08
128 0.09
129 0.1
130 0.1
131 0.13
132 0.16
133 0.18
134 0.19
135 0.23
136 0.22
137 0.21
138 0.25
139 0.3
140 0.3
141 0.33
142 0.33
143 0.33
144 0.43
145 0.46
146 0.46
147 0.44
148 0.44
149 0.43
150 0.49
151 0.49
152 0.5
153 0.57
154 0.61
155 0.65
156 0.73
157 0.74
158 0.72
159 0.79
160 0.78
161 0.78
162 0.75
163 0.73
164 0.65
165 0.64
166 0.59
167 0.51
168 0.45
169 0.36
170 0.33
171 0.25
172 0.24
173 0.28
174 0.27
175 0.26
176 0.24
177 0.25
178 0.23
179 0.24
180 0.22
181 0.17
182 0.16
183 0.14
184 0.15
185 0.14
186 0.16
187 0.17
188 0.17
189 0.15
190 0.17
191 0.18
192 0.18
193 0.24
194 0.23
195 0.21
196 0.23
197 0.29
198 0.28
199 0.29
200 0.28
201 0.27
202 0.34
203 0.34
204 0.39
205 0.39
206 0.4
207 0.44
208 0.45
209 0.46
210 0.49
211 0.57
212 0.61
213 0.66
214 0.74
215 0.75
216 0.81
217 0.83
218 0.81
219 0.84
220 0.84
221 0.83
222 0.82
223 0.81
224 0.75
225 0.7
226 0.69
227 0.62
228 0.54
229 0.48
230 0.45