FuNGI

L0PCV5

Protein Details

Accession

L0PCV5

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-21	MGRRSKNIKVVHKNHQCEKDS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 9.5, mito 7, cyto 2.5, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045161 Utp18 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2

Amino Acid Sequences

MGRRSKNIKVVHKNHQCEKDSEIISSDLRSNINEKDEEEKILEAKVFGDINPFNDELKNALTETYDFHDSICLNSEAVDFSLLQDHELFYVDTSVDQKKCDYSLSKSFALNVVDKGFAWEDSDDERLVISLTSMGRLRKLRRSETDDTINGKEYCMRLREQFERVNPVPDWAVSKFLNDQDLKQDEDSNYGISEDSGFVDDVSIFDKSLKSLLMSSEGYVRKTTSSTLPPTTINIKRLRDANFCSPSESAILSLSFHSFYPLLLSGGYDRILRIFHIDGDVNPLVSSLYLRSSSIETAVFHPNDNKIMVGGRRKYFYIWDLESGDIRKVSRTYGHDDTFVTMEKFSLSPCGRFIGIIGNKGWFNVLSSRTGQWITGFKIEGDISSISWFKSGKEICIANRNGEIWEWDIMSQKVLSRWNDNNNVCTTKISLGGFDDRWFAVGSNTGVVNVYDRRDLFGESSKPYLYKTLDHLTTSINTLEFSPDGQILAMASREKSDFLRLIHFPTGSAYRNWPTASTPLGRISAVKFSPPGSEITIGNETGKIGLWRFAYYYS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.84
2	0.84
3	0.77
4	0.69
5	0.66
6	0.63
7	0.54
8	0.47
9	0.4
10	0.33
11	0.3
12	0.3
13	0.27
14	0.21
15	0.21
16	0.21
17	0.22
18	0.24
19	0.28
20	0.27
21	0.26
22	0.29
23	0.3
24	0.31
25	0.29
26	0.26
27	0.22
28	0.23
29	0.21
30	0.16
31	0.15
32	0.15
33	0.14
34	0.13
35	0.18
36	0.18
37	0.2
38	0.23
39	0.23
40	0.21
41	0.22
42	0.22
43	0.18
44	0.18
45	0.17
46	0.14
47	0.13
48	0.13
49	0.13
50	0.15
51	0.17
52	0.18
53	0.17
54	0.17
55	0.2
56	0.19
57	0.19
58	0.21
59	0.17
60	0.14
61	0.15
62	0.15
63	0.13
64	0.13
65	0.13
66	0.09
67	0.09
68	0.14
69	0.13
70	0.14
71	0.13
72	0.13
73	0.13
74	0.14
75	0.13
76	0.08
77	0.09
78	0.08
79	0.09
80	0.12
81	0.18
82	0.18
83	0.19
84	0.2
85	0.21
86	0.22
87	0.26
88	0.27
89	0.27
90	0.35
91	0.4
92	0.41
93	0.39
94	0.4
95	0.39
96	0.37
97	0.32
98	0.25
99	0.21
100	0.19
101	0.19
102	0.2
103	0.17
104	0.14
105	0.14
106	0.12
107	0.12
108	0.13
109	0.15
110	0.13
111	0.12
112	0.12
113	0.1
114	0.1
115	0.08
116	0.06
117	0.07
118	0.08
119	0.1
120	0.13
121	0.13
122	0.18
123	0.25
124	0.3
125	0.35
126	0.43
127	0.48
128	0.54
129	0.62
130	0.62
131	0.63
132	0.64
133	0.6
134	0.57
135	0.5
136	0.47
137	0.39
138	0.33
139	0.3
140	0.24
141	0.24
142	0.23
143	0.23
144	0.23
145	0.29
146	0.34
147	0.36
148	0.4
149	0.39
150	0.46
151	0.44
152	0.44
153	0.38
154	0.35
155	0.3
156	0.25
157	0.25
158	0.17
159	0.2
160	0.16
161	0.17
162	0.18
163	0.19
164	0.24
165	0.21
166	0.21
167	0.24
168	0.26
169	0.27
170	0.25
171	0.27
172	0.21
173	0.23
174	0.23
175	0.16
176	0.14
177	0.13
178	0.12
179	0.09
180	0.09
181	0.06
182	0.06
183	0.07
184	0.07
185	0.06
186	0.06
187	0.06
188	0.06
189	0.07
190	0.06
191	0.06
192	0.07
193	0.07
194	0.07
195	0.08
196	0.08
197	0.07
198	0.08
199	0.08
200	0.11
201	0.11
202	0.12
203	0.18
204	0.19
205	0.19
206	0.19
207	0.19
208	0.16
209	0.16
210	0.18
211	0.15
212	0.19
213	0.22
214	0.24
215	0.25
216	0.24
217	0.26
218	0.31
219	0.3
220	0.31
221	0.34
222	0.33
223	0.34
224	0.38
225	0.41
226	0.38
227	0.39
228	0.42
229	0.41
230	0.39
231	0.39
232	0.35
233	0.31
234	0.27
235	0.22
236	0.14
237	0.09
238	0.09
239	0.07
240	0.08
241	0.08
242	0.07
243	0.07
244	0.08
245	0.07
246	0.07
247	0.08
248	0.08
249	0.08
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.08
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.07
259	0.06
260	0.08
261	0.08
262	0.07
263	0.09
264	0.09
265	0.08
266	0.14
267	0.14
268	0.11
269	0.11
270	0.11
271	0.09
272	0.09
273	0.09
274	0.04
275	0.05
276	0.06
277	0.06
278	0.07
279	0.08
280	0.09
281	0.09
282	0.1
283	0.09
284	0.12
285	0.17
286	0.16
287	0.15
288	0.17
289	0.17
290	0.17
291	0.17
292	0.13
293	0.09
294	0.11
295	0.14
296	0.19
297	0.23
298	0.24
299	0.25
300	0.26
301	0.26
302	0.26
303	0.24
304	0.23
305	0.19
306	0.2
307	0.2
308	0.2
309	0.2
310	0.19
311	0.18
312	0.13
313	0.12
314	0.12
315	0.11
316	0.12
317	0.16
318	0.18
319	0.24
320	0.29
321	0.3
322	0.29
323	0.29
324	0.29
325	0.25
326	0.23
327	0.16
328	0.11
329	0.1
330	0.09
331	0.09
332	0.08
333	0.14
334	0.14
335	0.15
336	0.16
337	0.17
338	0.16
339	0.16
340	0.16
341	0.18
342	0.19
343	0.2
344	0.2
345	0.2
346	0.2
347	0.2
348	0.2
349	0.1
350	0.1
351	0.12
352	0.13
353	0.14
354	0.16
355	0.17
356	0.18
357	0.19
358	0.18
359	0.16
360	0.18
361	0.18
362	0.18
363	0.18
364	0.16
365	0.18
366	0.18
367	0.15
368	0.14
369	0.12
370	0.1
371	0.11
372	0.12
373	0.1
374	0.11
375	0.12
376	0.1
377	0.17
378	0.18
379	0.17
380	0.22
381	0.24
382	0.26
383	0.34
384	0.35
385	0.29
386	0.3
387	0.29
388	0.25
389	0.23
390	0.22
391	0.14
392	0.14
393	0.13
394	0.12
395	0.14
396	0.14
397	0.14
398	0.13
399	0.13
400	0.15
401	0.21
402	0.23
403	0.27
404	0.32
405	0.39
406	0.48
407	0.48
408	0.49
409	0.47
410	0.47
411	0.41
412	0.36
413	0.3
414	0.22
415	0.25
416	0.21
417	0.18
418	0.18
419	0.21
420	0.21
421	0.2
422	0.2
423	0.16
424	0.17
425	0.16
426	0.14
427	0.1
428	0.12
429	0.12
430	0.12
431	0.12
432	0.11
433	0.11
434	0.11
435	0.13
436	0.13
437	0.14
438	0.16
439	0.16
440	0.18
441	0.19
442	0.2
443	0.2
444	0.25
445	0.27
446	0.26
447	0.29
448	0.28
449	0.27
450	0.27
451	0.3
452	0.25
453	0.24
454	0.27
455	0.32
456	0.33
457	0.34
458	0.34
459	0.31
460	0.3
461	0.29
462	0.24
463	0.16
464	0.15
465	0.14
466	0.15
467	0.13
468	0.12
469	0.12
470	0.11
471	0.11
472	0.11
473	0.1
474	0.08
475	0.09
476	0.1
477	0.09
478	0.1
479	0.11
480	0.12
481	0.14
482	0.15
483	0.2
484	0.22
485	0.23
486	0.29
487	0.29
488	0.33
489	0.35
490	0.34
491	0.28
492	0.28
493	0.31
494	0.27
495	0.28
496	0.29
497	0.28
498	0.32
499	0.33
500	0.3
501	0.28
502	0.29
503	0.32
504	0.3
505	0.3
506	0.3
507	0.31
508	0.3
509	0.29
510	0.28
511	0.31
512	0.28
513	0.28
514	0.25
515	0.25
516	0.28
517	0.27
518	0.27
519	0.22
520	0.24
521	0.22
522	0.26
523	0.28
524	0.25
525	0.25
526	0.22
527	0.19
528	0.17
529	0.18
530	0.15
531	0.13
532	0.17
533	0.18
534	0.19

L0PCV5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer