Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L0PDX2

Protein Details
Accession L0PDX2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
145-169YLQENKRAPKPKSKKNRVMKYDLPYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
150-161KRAPKPKSKKNR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002125  CMP_dCMP_dom  
IPR016193  Cytidine_deaminase-like  
Gene Ontology GO:0003824  F:catalytic activity  
GO:0006139  P:nucleobase-containing compound metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00383  dCMP_cyt_deam_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51747  CYT_DCMP_DEAMINASES_2  
CDD cd01285  nucleoside_deaminase  
Amino Acid Sequences MTDHQDFMKEALNMAEIALKNNEIPVGCVFVHKNKMIAKEMNNTNKSFNGIFHCEIIAINNILKDYPSTIFEETDLYVTVEPCIMCASALRQLHIRSVYFGCANERFGGTGSVLRLHDDKGVDPTYPVFPGNYRKEAIFLLRQFYLQENKRAPKPKSKKNRVMKYDLPYLDLSRYESRIHIILSEKLILLVPQGKNIW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.18
3 0.13
4 0.15
5 0.16
6 0.15
7 0.14
8 0.15
9 0.16
10 0.11
11 0.13
12 0.12
13 0.14
14 0.14
15 0.17
16 0.18
17 0.23
18 0.28
19 0.27
20 0.31
21 0.31
22 0.35
23 0.38
24 0.41
25 0.39
26 0.43
27 0.5
28 0.55
29 0.55
30 0.51
31 0.48
32 0.44
33 0.43
34 0.34
35 0.28
36 0.24
37 0.26
38 0.26
39 0.24
40 0.23
41 0.2
42 0.2
43 0.18
44 0.14
45 0.1
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.08
52 0.08
53 0.09
54 0.1
55 0.12
56 0.13
57 0.13
58 0.14
59 0.14
60 0.13
61 0.12
62 0.11
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.07
68 0.07
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.05
73 0.05
74 0.07
75 0.11
76 0.12
77 0.12
78 0.14
79 0.15
80 0.18
81 0.19
82 0.18
83 0.14
84 0.15
85 0.15
86 0.14
87 0.13
88 0.14
89 0.13
90 0.14
91 0.12
92 0.11
93 0.1
94 0.1
95 0.1
96 0.08
97 0.09
98 0.08
99 0.1
100 0.1
101 0.11
102 0.11
103 0.11
104 0.13
105 0.12
106 0.12
107 0.14
108 0.15
109 0.14
110 0.13
111 0.14
112 0.13
113 0.14
114 0.13
115 0.1
116 0.11
117 0.2
118 0.25
119 0.26
120 0.26
121 0.25
122 0.27
123 0.27
124 0.28
125 0.26
126 0.23
127 0.23
128 0.22
129 0.23
130 0.22
131 0.24
132 0.29
133 0.26
134 0.32
135 0.35
136 0.4
137 0.48
138 0.56
139 0.57
140 0.59
141 0.66
142 0.69
143 0.74
144 0.8
145 0.83
146 0.85
147 0.92
148 0.88
149 0.87
150 0.84
151 0.79
152 0.77
153 0.67
154 0.6
155 0.51
156 0.45
157 0.38
158 0.32
159 0.3
160 0.25
161 0.26
162 0.24
163 0.23
164 0.24
165 0.24
166 0.23
167 0.21
168 0.21
169 0.22
170 0.23
171 0.24
172 0.21
173 0.2
174 0.2
175 0.16
176 0.16
177 0.2
178 0.18