Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L0PA59

Protein Details
Accession L0PA59    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
310-334SPIYAKSTLKRRRSKIPNEMIKNLNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007133  RNA_pol_II-assoc_Paf1  
Gene Ontology GO:0016593  C:Cdc73/Paf1 complex  
GO:0016570  P:histone modification  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF03985  Paf1  
Amino Acid Sequences MPSRRQDYISYIRYQNQLPLPPFAPKMLNIPIPLNKYTETSYLSQLIQEEPIHIELDPELGMPLDLTSYSKVRPYEALDLHDNAENVKLDPKDIALLKEVSSTPQRNSTGVSFLRRTEYISSEGAKNTIKTKGHDFRSVKSDDSENNKFENPEKQVEAIEAMFEDASKDLSSFTHPHRKYLTVVDSFPVFPDIDVSDQQFLLMKFTTDPGQKTISSEPSADCRLDLALFMPVSERGEEWLAYYLAEEDSYFQLKETLKNQNCEENKAPFLYNHIRNYDTMMHINQTPLDEVVLVFRNDATSDIKKGAFYSPIYAKSTLKRRRSKIPNEMIKNLNVSNIELRLRPLDEEENKERKRHCSTIDPYNYPNDSKEIEQEENIETTDIKQEISKNEN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.49
3 0.46
4 0.48
5 0.44
6 0.45
7 0.42
8 0.43
9 0.43
10 0.39
11 0.35
12 0.28
13 0.31
14 0.32
15 0.34
16 0.31
17 0.35
18 0.38
19 0.4
20 0.4
21 0.37
22 0.32
23 0.31
24 0.32
25 0.3
26 0.28
27 0.26
28 0.28
29 0.28
30 0.27
31 0.26
32 0.24
33 0.22
34 0.21
35 0.19
36 0.17
37 0.16
38 0.17
39 0.16
40 0.15
41 0.14
42 0.11
43 0.12
44 0.1
45 0.08
46 0.07
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.05
51 0.05
52 0.05
53 0.06
54 0.09
55 0.11
56 0.12
57 0.16
58 0.17
59 0.18
60 0.21
61 0.25
62 0.31
63 0.32
64 0.35
65 0.34
66 0.35
67 0.34
68 0.33
69 0.28
70 0.2
71 0.2
72 0.17
73 0.14
74 0.18
75 0.16
76 0.15
77 0.15
78 0.15
79 0.17
80 0.18
81 0.18
82 0.17
83 0.18
84 0.17
85 0.2
86 0.19
87 0.18
88 0.24
89 0.25
90 0.24
91 0.3
92 0.31
93 0.29
94 0.31
95 0.3
96 0.29
97 0.3
98 0.33
99 0.27
100 0.27
101 0.3
102 0.28
103 0.29
104 0.25
105 0.24
106 0.22
107 0.22
108 0.23
109 0.22
110 0.22
111 0.22
112 0.2
113 0.19
114 0.18
115 0.23
116 0.23
117 0.23
118 0.32
119 0.38
120 0.41
121 0.5
122 0.49
123 0.46
124 0.5
125 0.5
126 0.41
127 0.35
128 0.33
129 0.29
130 0.35
131 0.36
132 0.31
133 0.31
134 0.31
135 0.3
136 0.3
137 0.32
138 0.28
139 0.27
140 0.26
141 0.25
142 0.24
143 0.23
144 0.22
145 0.15
146 0.11
147 0.07
148 0.06
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.04
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.09
159 0.11
160 0.17
161 0.26
162 0.26
163 0.3
164 0.32
165 0.33
166 0.32
167 0.35
168 0.35
169 0.27
170 0.28
171 0.25
172 0.24
173 0.22
174 0.2
175 0.16
176 0.1
177 0.07
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.09
186 0.1
187 0.09
188 0.09
189 0.08
190 0.08
191 0.07
192 0.08
193 0.12
194 0.12
195 0.13
196 0.14
197 0.17
198 0.16
199 0.19
200 0.2
201 0.2
202 0.2
203 0.2
204 0.18
205 0.19
206 0.21
207 0.18
208 0.15
209 0.12
210 0.11
211 0.1
212 0.1
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.1
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.06
235 0.08
236 0.09
237 0.09
238 0.08
239 0.13
240 0.14
241 0.17
242 0.21
243 0.3
244 0.33
245 0.37
246 0.39
247 0.43
248 0.44
249 0.46
250 0.45
251 0.38
252 0.36
253 0.34
254 0.33
255 0.24
256 0.3
257 0.32
258 0.35
259 0.35
260 0.36
261 0.35
262 0.35
263 0.39
264 0.36
265 0.3
266 0.26
267 0.22
268 0.22
269 0.21
270 0.22
271 0.18
272 0.15
273 0.14
274 0.11
275 0.1
276 0.09
277 0.08
278 0.1
279 0.12
280 0.11
281 0.11
282 0.1
283 0.11
284 0.11
285 0.13
286 0.15
287 0.14
288 0.17
289 0.19
290 0.2
291 0.2
292 0.21
293 0.22
294 0.21
295 0.19
296 0.23
297 0.25
298 0.29
299 0.32
300 0.33
301 0.33
302 0.37
303 0.47
304 0.5
305 0.56
306 0.61
307 0.63
308 0.72
309 0.8
310 0.82
311 0.83
312 0.84
313 0.84
314 0.82
315 0.83
316 0.75
317 0.67
318 0.6
319 0.49
320 0.42
321 0.32
322 0.27
323 0.24
324 0.24
325 0.24
326 0.21
327 0.22
328 0.22
329 0.23
330 0.22
331 0.23
332 0.28
333 0.32
334 0.39
335 0.46
336 0.53
337 0.55
338 0.59
339 0.59
340 0.58
341 0.62
342 0.6
343 0.57
344 0.57
345 0.61
346 0.66
347 0.71
348 0.68
349 0.62
350 0.63
351 0.6
352 0.51
353 0.47
354 0.4
355 0.33
356 0.31
357 0.35
358 0.33
359 0.33
360 0.32
361 0.33
362 0.32
363 0.3
364 0.28
365 0.22
366 0.16
367 0.15
368 0.2
369 0.18
370 0.16
371 0.18
372 0.23