FuNGI

L0PB58

Protein Details

Accession

L0PB58

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
820-846	DSAITKSPSKSKKDSKTKRTEFLKEIQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
825-835	KSPSKSKKDSK

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto_nucl 13.5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12611 RRM1_NGR1_NAM8_like cd12613 RRM2_NGR1_NAM8_like cd12346 RRM3_NGR1_NAM8_like

Amino Acid Sequences

MSFNYDYGKGSASAASVSAAQNQNNQIVAPSANASSPTFQTTNTTVQNVNNNQIPSSQSPLQGENKTALWMGELEPWVDEAFIRQVWFNLGEQVNVKMIRDKFSGSNAGYCFVDFSSTAAASKALSLNGTIIPGTTRLFKLNWASGGGLTDRKDDREPEFSIFVGDLGPEVNEYLLVSLFQSRYPSCKSAKIMTDLVSGMSRGYGFVRFSDEVDQRRALTEMQGVYCGSRPIRISTATPKNKPGMSHINMMHMGMSPLGYYGAPQPMNQFTDPNNTTVFVGGLSSFVTEDELRSFFQGFGEITYVKIPPGKGCGFVQFVQRHAAEMAISQMQGYPIGNSRVRLSWGRSQNNSGPIGTPYRPAPPPPVPYASMGLPPQHAYSSFAPLNPNAAHMHPPQQSGQPLPAQPGQLSGSRNPMDPIPVALLNELYSATRNARLDRLEADRIMRYADFDCLIFPLNRGVPMPEFRTSFCLTHDPDHITALNHQKKTLNSHGSGNTSMIEPNINIFDTYTTLTLPTVTTYISSLPPTDPIKISLHSWTLPHISRAMASMPPKPEENVAYIPMFEARVYVDGIPITYQLMLPHSKWPVVIDSYNDHNNTSQRFYFPNHKLENISSLTSYAVPPDFSSIKLILSEGWLQTRENMRPLFKRVRNIVCFMFQYAEPELLEASGISYPSFRPVNSYMLSCFSANSYVGFQPNDIPLPLSNDNSPHSSLSDTNIQMTNTLDDRIEEVVQLNTLSTSFDLNKSQFTMPLNTQGFPESFQESSLPIIQVDSSSSYNLYPSFIHPQKDTLLDTEPETNKENVSSLRRSPRKTFAPRDSAITKSPSKSKKDSKTKRTEFLKEIQVQDMISN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.12
3	0.13
4	0.13
5	0.19
6	0.22
7	0.23
8	0.28
9	0.3
10	0.32
11	0.3
12	0.29
13	0.22
14	0.21
15	0.2
16	0.16
17	0.15
18	0.13
19	0.13
20	0.15
21	0.16
22	0.17
23	0.18
24	0.22
25	0.21
26	0.21
27	0.25
28	0.27
29	0.32
30	0.33
31	0.34
32	0.31
33	0.34
34	0.43
35	0.42
36	0.43
37	0.41
38	0.38
39	0.36
40	0.35
41	0.36
42	0.29
43	0.33
44	0.32
45	0.31
46	0.33
47	0.38
48	0.43
49	0.41
50	0.39
51	0.35
52	0.32
53	0.29
54	0.27
55	0.22
56	0.16
57	0.14
58	0.14
59	0.17
60	0.16
61	0.15
62	0.15
63	0.16
64	0.15
65	0.13
66	0.12
67	0.09
68	0.11
69	0.12
70	0.13
71	0.12
72	0.13
73	0.15
74	0.18
75	0.16
76	0.2
77	0.2
78	0.2
79	0.21
80	0.23
81	0.24
82	0.23
83	0.23
84	0.23
85	0.24
86	0.27
87	0.28
88	0.29
89	0.27
90	0.31
91	0.37
92	0.31
93	0.35
94	0.31
95	0.32
96	0.29
97	0.26
98	0.23
99	0.16
100	0.16
101	0.1
102	0.11
103	0.12
104	0.12
105	0.13
106	0.12
107	0.12
108	0.1
109	0.13
110	0.13
111	0.1
112	0.1
113	0.1
114	0.11
115	0.12
116	0.12
117	0.1
118	0.08
119	0.09
120	0.1
121	0.11
122	0.13
123	0.13
124	0.15
125	0.16
126	0.2
127	0.25
128	0.28
129	0.28
130	0.26
131	0.26
132	0.23
133	0.25
134	0.22
135	0.2
136	0.17
137	0.21
138	0.21
139	0.23
140	0.26
141	0.28
142	0.3
143	0.32
144	0.34
145	0.32
146	0.32
147	0.29
148	0.27
149	0.23
150	0.19
151	0.13
152	0.1
153	0.07
154	0.06
155	0.06
156	0.05
157	0.05
158	0.05
159	0.04
160	0.04
161	0.05
162	0.05
163	0.05
164	0.05
165	0.09
166	0.09
167	0.1
168	0.14
169	0.14
170	0.19
171	0.24
172	0.28
173	0.28
174	0.34
175	0.37
176	0.4
177	0.44
178	0.44
179	0.42
180	0.39
181	0.38
182	0.32
183	0.29
184	0.22
185	0.18
186	0.13
187	0.11
188	0.09
189	0.07
190	0.08
191	0.1
192	0.1
193	0.1
194	0.16
195	0.16
196	0.18
197	0.24
198	0.27
199	0.28
200	0.31
201	0.32
202	0.26
203	0.27
204	0.27
205	0.2
206	0.18
207	0.19
208	0.17
209	0.16
210	0.17
211	0.16
212	0.15
213	0.16
214	0.17
215	0.13
216	0.14
217	0.15
218	0.17
219	0.2
220	0.21
221	0.23
222	0.3
223	0.41
224	0.46
225	0.48
226	0.49
227	0.5
228	0.51
229	0.48
230	0.46
231	0.45
232	0.4
233	0.44
234	0.4
235	0.4
236	0.38
237	0.37
238	0.31
239	0.21
240	0.18
241	0.11
242	0.1
243	0.05
244	0.05
245	0.06
246	0.05
247	0.05
248	0.08
249	0.13
250	0.13
251	0.14
252	0.16
253	0.19
254	0.22
255	0.22
256	0.21
257	0.18
258	0.26
259	0.27
260	0.26
261	0.23
262	0.21
263	0.2
264	0.19
265	0.17
266	0.08
267	0.08
268	0.06
269	0.06
270	0.05
271	0.05
272	0.05
273	0.05
274	0.06
275	0.06
276	0.07
277	0.08
278	0.09
279	0.09
280	0.1
281	0.11
282	0.1
283	0.1
284	0.11
285	0.09
286	0.08
287	0.1
288	0.09
289	0.09
290	0.1
291	0.1
292	0.09
293	0.11
294	0.11
295	0.1
296	0.16
297	0.16
298	0.17
299	0.18
300	0.21
301	0.22
302	0.23
303	0.3
304	0.26
305	0.26
306	0.28
307	0.27
308	0.24
309	0.21
310	0.19
311	0.11
312	0.1
313	0.11
314	0.07
315	0.07
316	0.06
317	0.07
318	0.07
319	0.07
320	0.07
321	0.06
322	0.08
323	0.12
324	0.13
325	0.14
326	0.15
327	0.16
328	0.19
329	0.2
330	0.22
331	0.26
332	0.34
333	0.39
334	0.39
335	0.42
336	0.44
337	0.46
338	0.43
339	0.35
340	0.27
341	0.23
342	0.25
343	0.21
344	0.19
345	0.16
346	0.19
347	0.19
348	0.2
349	0.25
350	0.26
351	0.3
352	0.31
353	0.33
354	0.3
355	0.31
356	0.31
357	0.25
358	0.22
359	0.19
360	0.17
361	0.14
362	0.14
363	0.13
364	0.11
365	0.11
366	0.12
367	0.13
368	0.17
369	0.17
370	0.17
371	0.18
372	0.17
373	0.2
374	0.16
375	0.17
376	0.13
377	0.13
378	0.16
379	0.16
380	0.22
381	0.21
382	0.23
383	0.22
384	0.24
385	0.24
386	0.21
387	0.22
388	0.18
389	0.17
390	0.18
391	0.19
392	0.17
393	0.16
394	0.17
395	0.16
396	0.16
397	0.17
398	0.15
399	0.2
400	0.2
401	0.2
402	0.19
403	0.17
404	0.16
405	0.14
406	0.14
407	0.09
408	0.09
409	0.09
410	0.08
411	0.08
412	0.07
413	0.07
414	0.06
415	0.05
416	0.05
417	0.06
418	0.07
419	0.1
420	0.11
421	0.12
422	0.14
423	0.15
424	0.15
425	0.17
426	0.2
427	0.19
428	0.19
429	0.19
430	0.17
431	0.17
432	0.16
433	0.13
434	0.11
435	0.1
436	0.1
437	0.09
438	0.08
439	0.08
440	0.08
441	0.09
442	0.08
443	0.07
444	0.09
445	0.09
446	0.09
447	0.09
448	0.1
449	0.1
450	0.13
451	0.16
452	0.16
453	0.16
454	0.17
455	0.21
456	0.22
457	0.21
458	0.2
459	0.22
460	0.21
461	0.22
462	0.24
463	0.22
464	0.2
465	0.21
466	0.2
467	0.16
468	0.19
469	0.27
470	0.31
471	0.29
472	0.29
473	0.31
474	0.32
475	0.38
476	0.42
477	0.37
478	0.32
479	0.36
480	0.37
481	0.36
482	0.36
483	0.29
484	0.21
485	0.17
486	0.15
487	0.11
488	0.09
489	0.07
490	0.07
491	0.07
492	0.07
493	0.06
494	0.06
495	0.06
496	0.07
497	0.08
498	0.08
499	0.07
500	0.07
501	0.07
502	0.07
503	0.07
504	0.06
505	0.06
506	0.06
507	0.06
508	0.06
509	0.08
510	0.09
511	0.09
512	0.09
513	0.09
514	0.14
515	0.15
516	0.16
517	0.15
518	0.17
519	0.19
520	0.19
521	0.2
522	0.18
523	0.19
524	0.18
525	0.18
526	0.17
527	0.19
528	0.19
529	0.18
530	0.16
531	0.15
532	0.14
533	0.15
534	0.14
535	0.14
536	0.15
537	0.19
538	0.2
539	0.21
540	0.22
541	0.21
542	0.22
543	0.2
544	0.22
545	0.19
546	0.19
547	0.17
548	0.16
549	0.16
550	0.15
551	0.13
552	0.09
553	0.07
554	0.06
555	0.07
556	0.08
557	0.08
558	0.08
559	0.07
560	0.08
561	0.08
562	0.07
563	0.07
564	0.06
565	0.06
566	0.06
567	0.09
568	0.11
569	0.12
570	0.16
571	0.18
572	0.18
573	0.18
574	0.18
575	0.18
576	0.2
577	0.19
578	0.17
579	0.18
580	0.22
581	0.26
582	0.26
583	0.23
584	0.23
585	0.25
586	0.25
587	0.27
588	0.24
589	0.22
590	0.23
591	0.27
592	0.34
593	0.37
594	0.43
595	0.41
596	0.42
597	0.42
598	0.41
599	0.42
600	0.34
601	0.29
602	0.21
603	0.19
604	0.18
605	0.16
606	0.15
607	0.12
608	0.1
609	0.1
610	0.1
611	0.13
612	0.13
613	0.13
614	0.16
615	0.14
616	0.14
617	0.14
618	0.14
619	0.1
620	0.12
621	0.14
622	0.12
623	0.13
624	0.14
625	0.14
626	0.18
627	0.24
628	0.23
629	0.27
630	0.29
631	0.32
632	0.35
633	0.43
634	0.49
635	0.48
636	0.53
637	0.56
638	0.62
639	0.61
640	0.61
641	0.56
642	0.49
643	0.45
644	0.39
645	0.32
646	0.23
647	0.23
648	0.2
649	0.19
650	0.15
651	0.14
652	0.12
653	0.1
654	0.1
655	0.06
656	0.06
657	0.06
658	0.06
659	0.06
660	0.07
661	0.07
662	0.12
663	0.14
664	0.12
665	0.17
666	0.2
667	0.25
668	0.25
669	0.27
670	0.24
671	0.26
672	0.28
673	0.22
674	0.2
675	0.16
676	0.16
677	0.15
678	0.15
679	0.14
680	0.15
681	0.17
682	0.17
683	0.17
684	0.17
685	0.19
686	0.19
687	0.17
688	0.16
689	0.14
690	0.21
691	0.23
692	0.22
693	0.21
694	0.22
695	0.25
696	0.26
697	0.27
698	0.21
699	0.2
700	0.21
701	0.2
702	0.21
703	0.26
704	0.24
705	0.25
706	0.26
707	0.25
708	0.23
709	0.24
710	0.23
711	0.17
712	0.17
713	0.14
714	0.12
715	0.14
716	0.16
717	0.15
718	0.12
719	0.12
720	0.12
721	0.12
722	0.12
723	0.1
724	0.08
725	0.08
726	0.08
727	0.07
728	0.1
729	0.11
730	0.14
731	0.19
732	0.2
733	0.22
734	0.25
735	0.25
736	0.25
737	0.27
738	0.29
739	0.26
740	0.35
741	0.35
742	0.31
743	0.31
744	0.31
745	0.28
746	0.25
747	0.26
748	0.19
749	0.18
750	0.18
751	0.18
752	0.16
753	0.18
754	0.19
755	0.17
756	0.14
757	0.14
758	0.13
759	0.13
760	0.14
761	0.14
762	0.12
763	0.13
764	0.14
765	0.13
766	0.15
767	0.15
768	0.15
769	0.13
770	0.16
771	0.26
772	0.29
773	0.33
774	0.32
775	0.35
776	0.36
777	0.39
778	0.36
779	0.29
780	0.29
781	0.27
782	0.28
783	0.33
784	0.32
785	0.32
786	0.33
787	0.31
788	0.28
789	0.27
790	0.28
791	0.26
792	0.31
793	0.33
794	0.38
795	0.48
796	0.55
797	0.61
798	0.65
799	0.68
800	0.72
801	0.77
802	0.79
803	0.78
804	0.79
805	0.74
806	0.74
807	0.68
808	0.62
809	0.56
810	0.52
811	0.48
812	0.44
813	0.52
814	0.53
815	0.57
816	0.63
817	0.7
818	0.74
819	0.8
820	0.85
821	0.87
822	0.9
823	0.91
824	0.9
825	0.89
826	0.87
827	0.81
828	0.78
829	0.77
830	0.73
831	0.67
832	0.6
833	0.53

L0PB58

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer