Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L0P872

Protein Details
Accession L0P872    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
142-162KTAYAKDKYIRKKIQKYQKGFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MVVCKNAQDLKTIIDEENPGREIIQPNSCIFLRLPSKLLKFIVVKPNTTINLGKFGTFSTNDIIGHPYGFTYEIYNHKLKIIKSNEIYEIEDEITNNKETIDDSFNQQLTYDEIMLLKQDKCLSSHDIINKIISSHKTYDQKTAYAKDKYIRKKIQKYQKGFTVIFPTIWEISEHILMKNFMKIMDLRAEIIAYILNLGNVQPNGRYIVVDETSGLLVAAILERMNRTGQVIYIHTNEHPNLDSCKYFGQDYLPEKLIQENILLTLNWLDIIDRNQKLELFIASTYEPSSILPHLIPSIAGSCPIIIYSPYREVLISTSHYISSRNTHDILAPIISEIRHRQYQTLSNRIHPFMTSRAFMGYVLSTIKVLPCFENFKPLGKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.28
3 0.26
4 0.29
5 0.27
6 0.23
7 0.21
8 0.25
9 0.27
10 0.28
11 0.32
12 0.31
13 0.3
14 0.35
15 0.34
16 0.32
17 0.27
18 0.3
19 0.29
20 0.29
21 0.32
22 0.35
23 0.38
24 0.41
25 0.42
26 0.39
27 0.38
28 0.43
29 0.49
30 0.46
31 0.44
32 0.42
33 0.47
34 0.42
35 0.42
36 0.37
37 0.29
38 0.33
39 0.32
40 0.3
41 0.24
42 0.24
43 0.24
44 0.22
45 0.22
46 0.17
47 0.19
48 0.18
49 0.19
50 0.21
51 0.17
52 0.16
53 0.14
54 0.11
55 0.1
56 0.11
57 0.1
58 0.1
59 0.13
60 0.18
61 0.24
62 0.26
63 0.26
64 0.29
65 0.33
66 0.32
67 0.37
68 0.38
69 0.4
70 0.41
71 0.45
72 0.45
73 0.42
74 0.43
75 0.34
76 0.3
77 0.23
78 0.2
79 0.17
80 0.15
81 0.15
82 0.14
83 0.13
84 0.11
85 0.1
86 0.1
87 0.13
88 0.16
89 0.15
90 0.18
91 0.23
92 0.24
93 0.23
94 0.23
95 0.2
96 0.18
97 0.19
98 0.15
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.12
103 0.14
104 0.12
105 0.12
106 0.14
107 0.15
108 0.16
109 0.2
110 0.23
111 0.22
112 0.27
113 0.29
114 0.3
115 0.3
116 0.3
117 0.26
118 0.22
119 0.23
120 0.2
121 0.21
122 0.2
123 0.26
124 0.32
125 0.34
126 0.41
127 0.39
128 0.4
129 0.4
130 0.42
131 0.42
132 0.38
133 0.39
134 0.37
135 0.43
136 0.48
137 0.55
138 0.58
139 0.61
140 0.69
141 0.75
142 0.8
143 0.81
144 0.8
145 0.74
146 0.72
147 0.68
148 0.59
149 0.52
150 0.47
151 0.38
152 0.32
153 0.27
154 0.22
155 0.16
156 0.16
157 0.14
158 0.08
159 0.09
160 0.11
161 0.11
162 0.1
163 0.11
164 0.11
165 0.12
166 0.12
167 0.11
168 0.08
169 0.09
170 0.09
171 0.1
172 0.12
173 0.12
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.1
178 0.09
179 0.07
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.06
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.07
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.09
200 0.08
201 0.08
202 0.07
203 0.04
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.1
218 0.11
219 0.13
220 0.14
221 0.15
222 0.15
223 0.17
224 0.16
225 0.16
226 0.15
227 0.14
228 0.16
229 0.17
230 0.17
231 0.15
232 0.17
233 0.16
234 0.16
235 0.15
236 0.15
237 0.19
238 0.22
239 0.25
240 0.24
241 0.24
242 0.24
243 0.25
244 0.22
245 0.17
246 0.14
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.08
252 0.08
253 0.07
254 0.07
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.11
259 0.18
260 0.18
261 0.2
262 0.21
263 0.21
264 0.22
265 0.21
266 0.18
267 0.12
268 0.11
269 0.12
270 0.11
271 0.11
272 0.11
273 0.1
274 0.1
275 0.08
276 0.11
277 0.09
278 0.11
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.1
284 0.09
285 0.1
286 0.08
287 0.09
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.07
293 0.07
294 0.09
295 0.13
296 0.16
297 0.17
298 0.17
299 0.17
300 0.17
301 0.18
302 0.19
303 0.18
304 0.18
305 0.18
306 0.19
307 0.2
308 0.2
309 0.21
310 0.24
311 0.26
312 0.27
313 0.27
314 0.27
315 0.28
316 0.28
317 0.28
318 0.22
319 0.17
320 0.13
321 0.14
322 0.13
323 0.15
324 0.18
325 0.22
326 0.28
327 0.29
328 0.31
329 0.36
330 0.45
331 0.49
332 0.54
333 0.52
334 0.54
335 0.58
336 0.57
337 0.52
338 0.44
339 0.39
340 0.37
341 0.38
342 0.31
343 0.26
344 0.26
345 0.25
346 0.24
347 0.23
348 0.16
349 0.14
350 0.14
351 0.13
352 0.12
353 0.12
354 0.15
355 0.15
356 0.16
357 0.17
358 0.2
359 0.27
360 0.27
361 0.36
362 0.35