FuNGI

L0PDE3

Protein Details

Accession

L0PDE3

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
284-304	IEEKEQKKKEKKQAAENQKAF	Hydrophilic
318-337	KLSRKEKNRRNASLDRKNQK	Basic
437-458	IAPSWRKPKGIDNRVRRRFKGQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
287-335	KEQKKKEKKQAAENQKAFGREKAQREMYRFDKLSRKEKNRRNASLDRKN
443-457	KPKGIDNRVRRRFKG

Subcellular Location(s)

nucl 25, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR001515 Ribosomal_L32e IPR036351 Ribosomal_L32e_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:1990904 C:ribonucleoprotein complex GO:0005840 C:ribosome GO:0003723 F:RNA binding GO:0003735 F:structural constituent of ribosome GO:0006412 P:translation
Pfam	View protein in Pfam PF01655 Ribosomal_L32e PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd00513 Ribosomal_L32_L32e

Amino Acid Sequences

LFDRKETKTNYYDRNFSDKNYGKDRDQLYKLDRSVSREQIPLPKEPPYTAHLGNLSFNITESEITDFFGEPFVTNIRLMRDQIDDRPKGFGYVEFTDLQALINAISLNGKTLSGRAIKITRKGHVDRDPVEDRTAGEWRRSSPLPPIETVHEKRSTYERRNCSGNNDRTYSSSDNNRDFSNWERKGPLQDLPGSDLSTEKHDYRNTDWRSGERYRNSGFGDRNYGNNNNYNTLRTSSIGERPKLVLKPRGETPEEPSQIPKTSTKPNPFGDARPVDSNARIREIEEKEQKKKEKKQAAENQKAFGREKAQREMYRFDKLSRKEKNRRNASLDRKNQKVEKKQVNVVNTKQNSSKIHSGDSSKSTDSISITEAEADVDGWSTVNKLSKKRIKFAPKDYKETNKTLCTSSIRYACIMEHSSFFKGVWLNLHYIDRYKCIAPSWRKPKGIDNRVRRRFKGQIAMPRIGYGSDKRTRHMRPGGRYTFLIRNISDVDVLLMHNQTYIGEIASTVSSRKRILIAEKAMKLGVKLTN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.67
2	0.61
3	0.56
4	0.59
5	0.56
6	0.56
7	0.58
8	0.58
9	0.52
10	0.58
11	0.61
12	0.59
13	0.56
14	0.57
15	0.54
16	0.57
17	0.56
18	0.56
19	0.53
20	0.51
21	0.55
22	0.55
23	0.53
24	0.48
25	0.51
26	0.51
27	0.52
28	0.51
29	0.46
30	0.45
31	0.42
32	0.41
33	0.4
34	0.35
35	0.38
36	0.32
37	0.34
38	0.3
39	0.3
40	0.29
41	0.27
42	0.25
43	0.19
44	0.18
45	0.15
46	0.13
47	0.12
48	0.12
49	0.14
50	0.13
51	0.13
52	0.14
53	0.13
54	0.12
55	0.14
56	0.13
57	0.09
58	0.11
59	0.12
60	0.12
61	0.13
62	0.15
63	0.17
64	0.2
65	0.2
66	0.22
67	0.25
68	0.27
69	0.34
70	0.42
71	0.41
72	0.39
73	0.42
74	0.39
75	0.35
76	0.33
77	0.27
78	0.24
79	0.23
80	0.26
81	0.22
82	0.22
83	0.21
84	0.2
85	0.18
86	0.12
87	0.1
88	0.06
89	0.07
90	0.06
91	0.06
92	0.07
93	0.07
94	0.08
95	0.08
96	0.08
97	0.08
98	0.09
99	0.13
100	0.15
101	0.16
102	0.19
103	0.26
104	0.3
105	0.38
106	0.42
107	0.42
108	0.47
109	0.5
110	0.53
111	0.55
112	0.57
113	0.52
114	0.55
115	0.55
116	0.49
117	0.47
118	0.39
119	0.32
120	0.28
121	0.31
122	0.25
123	0.25
124	0.25
125	0.26
126	0.3
127	0.3
128	0.29
129	0.31
130	0.36
131	0.35
132	0.35
133	0.35
134	0.34
135	0.42
136	0.44
137	0.41
138	0.39
139	0.36
140	0.37
141	0.44
142	0.49
143	0.5
144	0.56
145	0.57
146	0.56
147	0.61
148	0.6
149	0.6
150	0.61
151	0.6
152	0.55
153	0.51
154	0.49
155	0.45
156	0.49
157	0.43
158	0.37
159	0.36
160	0.37
161	0.37
162	0.38
163	0.37
164	0.32
165	0.31
166	0.34
167	0.37
168	0.33
169	0.31
170	0.33
171	0.34
172	0.38
173	0.38
174	0.35
175	0.27
176	0.29
177	0.27
178	0.28
179	0.28
180	0.23
181	0.2
182	0.18
183	0.15
184	0.15
185	0.17
186	0.14
187	0.18
188	0.2
189	0.23
190	0.27
191	0.36
192	0.36
193	0.39
194	0.39
195	0.38
196	0.42
197	0.45
198	0.47
199	0.41
200	0.42
201	0.38
202	0.4
203	0.4
204	0.39
205	0.35
206	0.3
207	0.33
208	0.28
209	0.29
210	0.3
211	0.3
212	0.27
213	0.3
214	0.29
215	0.26
216	0.26
217	0.25
218	0.23
219	0.22
220	0.21
221	0.16
222	0.18
223	0.17
224	0.24
225	0.27
226	0.26
227	0.26
228	0.26
229	0.3
230	0.3
231	0.32
232	0.32
233	0.29
234	0.32
235	0.35
236	0.38
237	0.37
238	0.34
239	0.35
240	0.37
241	0.37
242	0.34
243	0.31
244	0.29
245	0.27
246	0.28
247	0.25
248	0.2
249	0.27
250	0.33
251	0.37
252	0.41
253	0.41
254	0.45
255	0.44
256	0.42
257	0.4
258	0.35
259	0.32
260	0.27
261	0.28
262	0.23
263	0.24
264	0.27
265	0.2
266	0.21
267	0.19
268	0.18
269	0.24
270	0.26
271	0.32
272	0.36
273	0.41
274	0.46
275	0.53
276	0.6
277	0.62
278	0.68
279	0.7
280	0.7
281	0.7
282	0.74
283	0.77
284	0.8
285	0.81
286	0.73
287	0.67
288	0.6
289	0.57
290	0.47
291	0.39
292	0.34
293	0.3
294	0.33
295	0.36
296	0.41
297	0.42
298	0.44
299	0.47
300	0.44
301	0.45
302	0.41
303	0.39
304	0.4
305	0.42
306	0.48
307	0.53
308	0.6
309	0.63
310	0.7
311	0.77
312	0.79
313	0.8
314	0.78
315	0.78
316	0.78
317	0.79
318	0.8
319	0.77
320	0.71
321	0.7
322	0.68
323	0.67
324	0.66
325	0.65
326	0.65
327	0.63
328	0.66
329	0.66
330	0.66
331	0.63
332	0.58
333	0.57
334	0.49
335	0.47
336	0.42
337	0.43
338	0.4
339	0.39
340	0.41
341	0.33
342	0.34
343	0.34
344	0.35
345	0.34
346	0.34
347	0.32
348	0.26
349	0.25
350	0.23
351	0.22
352	0.19
353	0.16
354	0.14
355	0.12
356	0.11
357	0.11
358	0.1
359	0.09
360	0.08
361	0.07
362	0.06
363	0.05
364	0.05
365	0.04
366	0.04
367	0.05
368	0.07
369	0.12
370	0.16
371	0.2
372	0.31
373	0.39
374	0.44
375	0.51
376	0.59
377	0.65
378	0.69
379	0.76
380	0.78
381	0.75
382	0.78
383	0.76
384	0.77
385	0.72
386	0.69
387	0.63
388	0.57
389	0.53
390	0.48
391	0.46
392	0.41
393	0.4
394	0.4
395	0.39
396	0.35
397	0.33
398	0.32
399	0.28
400	0.28
401	0.27
402	0.21
403	0.19
404	0.21
405	0.22
406	0.21
407	0.21
408	0.19
409	0.17
410	0.17
411	0.19
412	0.19
413	0.19
414	0.21
415	0.23
416	0.21
417	0.25
418	0.25
419	0.24
420	0.25
421	0.24
422	0.23
423	0.25
424	0.34
425	0.38
426	0.47
427	0.54
428	0.61
429	0.64
430	0.65
431	0.71
432	0.73
433	0.75
434	0.74
435	0.75
436	0.77
437	0.83
438	0.88
439	0.81
440	0.79
441	0.76
442	0.74
443	0.73
444	0.69
445	0.69
446	0.68
447	0.69
448	0.61
449	0.54
450	0.46
451	0.37
452	0.33
453	0.27
454	0.29
455	0.33
456	0.34
457	0.36
458	0.45
459	0.49
460	0.55
461	0.61
462	0.61
463	0.62
464	0.72
465	0.74
466	0.69
467	0.66
468	0.62
469	0.59
470	0.56
471	0.51
472	0.4
473	0.37
474	0.36
475	0.35
476	0.3
477	0.22
478	0.18
479	0.14
480	0.14
481	0.13
482	0.12
483	0.1
484	0.1
485	0.1
486	0.09
487	0.1
488	0.1
489	0.08
490	0.07
491	0.07
492	0.09
493	0.1
494	0.11
495	0.11
496	0.15
497	0.18
498	0.19
499	0.22
500	0.24
501	0.28
502	0.34
503	0.41
504	0.48
505	0.53
506	0.54
507	0.53
508	0.51
509	0.47
510	0.4

L0PDE3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer