Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3RKF1

Protein Details
Accession E3RKF1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
463-482EQISAYLKKKKENRESARGRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
470-482KKKKENRESARGR
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 8, mito 2, plas 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040662  Tfb2_C  
IPR004598  TFIIH_p52/Tfb2  
Gene Ontology GO:0000112  C:nucleotide-excision repair factor 3 complex  
GO:0000439  C:transcription factor TFIIH core complex  
GO:0005675  C:transcription factor TFIIH holo complex  
GO:0001671  F:ATPase activator activity  
GO:0003690  F:double-stranded DNA binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG pte:PTT_08708  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03849  Tfb2  
PF18307  Tfb2_C  
Amino Acid Sequences MSASSSTQALEYLEGLPLATHKKLYEQPSTVLAVFRCMLPHLAKSIVMAMLYMPSPFPAADLDAWFKPSARKEKERATFTLDRLHIITSVRQDNGTLSWTLSPGFQRSLRNAIEGSGTHRSFGVPATKEESGKRVSVEFLDEYSRSQWEGILYYLVSGAAGLGKDNISRAEVSPSTKTLLNTGDLVRTIHGSPRITKDGFSFVLQETNAQVWSLLIIYLKVTNELGMSETEVLAFLFMLGSLELGQDYSTSTLSPTQLRMLDDLSSMGLIYRSDKNARTFYPTRLATTLTSDSGSAMSASSNDIAQAGQGNAGPSAAANKGFIIIETNYRLYAYTNSLIQIAILSLFTKLQHRFPNLVSGKLTKESVHKAVQSGITSAQIISYLTTYAHPQMQKTVPYIPPTVMDQIRLWEYEGERVETTPGYLMREFSSDTEYRDVMGYASALGVLVWQNDAARCFFVSQVEQISAYLKKKKENRESARGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.09
4 0.12
5 0.15
6 0.15
7 0.16
8 0.16
9 0.23
10 0.3
11 0.36
12 0.42
13 0.41
14 0.42
15 0.44
16 0.47
17 0.41
18 0.37
19 0.31
20 0.26
21 0.23
22 0.21
23 0.18
24 0.16
25 0.2
26 0.19
27 0.21
28 0.2
29 0.21
30 0.2
31 0.2
32 0.21
33 0.18
34 0.15
35 0.13
36 0.1
37 0.1
38 0.11
39 0.1
40 0.08
41 0.07
42 0.08
43 0.08
44 0.09
45 0.08
46 0.1
47 0.12
48 0.14
49 0.18
50 0.18
51 0.2
52 0.2
53 0.2
54 0.23
55 0.3
56 0.38
57 0.42
58 0.5
59 0.55
60 0.65
61 0.73
62 0.72
63 0.67
64 0.65
65 0.63
66 0.56
67 0.59
68 0.49
69 0.42
70 0.37
71 0.35
72 0.28
73 0.24
74 0.25
75 0.22
76 0.26
77 0.25
78 0.24
79 0.23
80 0.23
81 0.22
82 0.21
83 0.15
84 0.12
85 0.12
86 0.13
87 0.13
88 0.14
89 0.14
90 0.15
91 0.18
92 0.21
93 0.24
94 0.27
95 0.34
96 0.32
97 0.32
98 0.3
99 0.27
100 0.25
101 0.22
102 0.24
103 0.25
104 0.24
105 0.22
106 0.22
107 0.21
108 0.19
109 0.22
110 0.24
111 0.18
112 0.2
113 0.24
114 0.26
115 0.28
116 0.28
117 0.3
118 0.25
119 0.24
120 0.23
121 0.19
122 0.19
123 0.18
124 0.2
125 0.16
126 0.15
127 0.16
128 0.15
129 0.16
130 0.16
131 0.16
132 0.13
133 0.12
134 0.12
135 0.1
136 0.11
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.06
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.05
150 0.05
151 0.06
152 0.06
153 0.07
154 0.07
155 0.08
156 0.09
157 0.13
158 0.14
159 0.17
160 0.18
161 0.19
162 0.2
163 0.21
164 0.2
165 0.18
166 0.18
167 0.16
168 0.17
169 0.16
170 0.15
171 0.14
172 0.14
173 0.12
174 0.12
175 0.11
176 0.12
177 0.15
178 0.16
179 0.18
180 0.23
181 0.27
182 0.26
183 0.26
184 0.25
185 0.25
186 0.25
187 0.23
188 0.19
189 0.15
190 0.17
191 0.16
192 0.15
193 0.11
194 0.11
195 0.1
196 0.08
197 0.08
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.05
214 0.06
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.04
221 0.03
222 0.03
223 0.02
224 0.02
225 0.02
226 0.02
227 0.02
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.05
239 0.07
240 0.08
241 0.09
242 0.1
243 0.11
244 0.13
245 0.14
246 0.14
247 0.13
248 0.12
249 0.11
250 0.11
251 0.08
252 0.06
253 0.06
254 0.05
255 0.04
256 0.04
257 0.07
258 0.08
259 0.11
260 0.14
261 0.18
262 0.21
263 0.24
264 0.25
265 0.31
266 0.32
267 0.32
268 0.38
269 0.35
270 0.33
271 0.31
272 0.32
273 0.24
274 0.26
275 0.24
276 0.17
277 0.16
278 0.14
279 0.13
280 0.12
281 0.11
282 0.07
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.06
287 0.06
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.06
294 0.05
295 0.06
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.06
301 0.05
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.08
309 0.08
310 0.09
311 0.09
312 0.12
313 0.14
314 0.14
315 0.13
316 0.14
317 0.14
318 0.12
319 0.14
320 0.15
321 0.14
322 0.14
323 0.14
324 0.15
325 0.14
326 0.13
327 0.11
328 0.07
329 0.06
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.06
334 0.07
335 0.13
336 0.15
337 0.2
338 0.27
339 0.3
340 0.33
341 0.33
342 0.43
343 0.39
344 0.4
345 0.36
346 0.33
347 0.31
348 0.3
349 0.31
350 0.22
351 0.26
352 0.28
353 0.31
354 0.32
355 0.31
356 0.3
357 0.33
358 0.34
359 0.29
360 0.25
361 0.21
362 0.18
363 0.17
364 0.15
365 0.12
366 0.09
367 0.08
368 0.08
369 0.07
370 0.06
371 0.07
372 0.08
373 0.1
374 0.12
375 0.17
376 0.18
377 0.19
378 0.25
379 0.28
380 0.3
381 0.31
382 0.35
383 0.33
384 0.36
385 0.37
386 0.31
387 0.29
388 0.29
389 0.33
390 0.27
391 0.26
392 0.22
393 0.24
394 0.25
395 0.24
396 0.22
397 0.2
398 0.2
399 0.24
400 0.25
401 0.25
402 0.23
403 0.23
404 0.24
405 0.2
406 0.2
407 0.16
408 0.16
409 0.17
410 0.17
411 0.18
412 0.18
413 0.2
414 0.2
415 0.18
416 0.23
417 0.21
418 0.23
419 0.25
420 0.24
421 0.23
422 0.22
423 0.21
424 0.15
425 0.14
426 0.11
427 0.08
428 0.08
429 0.07
430 0.06
431 0.05
432 0.06
433 0.06
434 0.07
435 0.07
436 0.07
437 0.09
438 0.11
439 0.13
440 0.13
441 0.14
442 0.14
443 0.15
444 0.16
445 0.18
446 0.19
447 0.2
448 0.22
449 0.22
450 0.21
451 0.2
452 0.23
453 0.25
454 0.29
455 0.34
456 0.34
457 0.42
458 0.5
459 0.61
460 0.68
461 0.74
462 0.77