FuNGI

L0PGB8

Protein Details

Accession

L0PGB8

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
32-53	INGFNKLWRLKKKENIGKIFNE	Hydrophilic
835-855	IVQPYRKSSRKQIKTNLQSIF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 8.5, cyto_nucl 7.333, pero 6, cyto_mito 5.333, cyto 5, mito 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024075 DNA-dir_RNA_pol_helix_hairp_sf IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

QKYNILGNETTFALILKAALYIKEPEESKIAINGFNKLWRLKKKENIGKIFNENSILTNEEILKLFKIMDINFSELKQEYRHILKPIANIEKEKNSRTLCLSHPLENIPELLPTNIFGPGLQLLKKSLRPLTDPNIEIDYNIKDFPKEYHSVAFNMARQKLLEDNALDIALERWKWDHEQLAQKGGLRFSKSLNSILFEWHSLMIPLIKEEIERCKNAINGLIDKKIINNVNNDRLSYGVFIQLLAPEKLSTITILEVLRLHSTGGIAQGMRTARAILSVGKSIEKEYASEVLKKNKNFLGKNVNLSQIFGNPRQFQTMLQKTQNNINFEINPKWPTVVKAKIGSILISILIHVAKIDITTETEKGDTISQKAPAFYHTYQYQKGRKLGVIKLNDQVMKQLGSQPLRGNIHPRLLPMLVEPKPWISWDSGGYYLSKSTVMRSRDSIEQIQYLKIASERNNLKSIFEGLDVLGSTAWAINIPVFNVVIEVWNSGLEFAGIPPAESNIAFPPRPTSKDPADKISWQIQCRQIARDAQNKQSIRCDINYKLEIARAFLHEKMYFPHNLDFRGRAYPIPPHFNHLGNDLCRGLLTFHEAKEIGESGLRWLKIHLANICGFDKESFLEREAFTVENLKNIFDSADNPLKGSGWWLKFDDPWQTLAACFELTAALRFPDPHKFKSRLPIHQDGTCNGLQHYAALGGDILGARQVNLEPSNRPYDVYTRVAELVNEQVQKDAKEGNHLAVLLKDKIARKIVKQTVMTNVYGVTYVGARNQILNQLKNLNSLPREMLFVRAHKIQEWLNEAAKRISKSIDTSSYNGLNHMTSVIWTSPLNLPIVQPYRKSSRKQIKTNLQSIFITDPNDVSPVDTRKQQTAFPPNFIHSLDATHMLMSAISCKNAGLTFASVHDSYWTHAADVDNMNVILRETFVKLHEENIMENLLNEFRERYKGYKTLISISKDSKEMEEISSTRKHVSQSIKSESLNNNRKSETYKSLLKDTVKTNNKENTTNPSNQVTEKINSLNAENTIETDIKNKTKKKESVHVWVDLEFPPLPKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.09
3	0.07
4	0.09
5	0.09
6	0.1
7	0.12
8	0.15
9	0.16
10	0.21
11	0.22
12	0.22
13	0.24
14	0.25
15	0.24
16	0.26
17	0.26
18	0.27
19	0.27
20	0.29
21	0.28
22	0.32
23	0.35
24	0.36
25	0.43
26	0.48
27	0.55
28	0.61
29	0.68
30	0.74
31	0.8
32	0.84
33	0.84
34	0.81
35	0.78
36	0.77
37	0.71
38	0.62
39	0.55
40	0.45
41	0.38
42	0.33
43	0.28
44	0.21
45	0.2
46	0.19
47	0.18
48	0.18
49	0.18
50	0.17
51	0.15
52	0.15
53	0.14
54	0.18
55	0.16
56	0.21
57	0.22
58	0.26
59	0.27
60	0.27
61	0.28
62	0.25
63	0.27
64	0.23
65	0.23
66	0.25
67	0.3
68	0.35
69	0.36
70	0.4
71	0.42
72	0.46
73	0.51
74	0.54
75	0.51
76	0.5
77	0.51
78	0.56
79	0.57
80	0.54
81	0.53
82	0.47
83	0.47
84	0.47
85	0.46
86	0.4
87	0.44
88	0.45
89	0.42
90	0.43
91	0.41
92	0.39
93	0.35
94	0.33
95	0.24
96	0.22
97	0.18
98	0.16
99	0.14
100	0.12
101	0.13
102	0.12
103	0.11
104	0.09
105	0.1
106	0.13
107	0.15
108	0.16
109	0.16
110	0.19
111	0.24
112	0.27
113	0.3
114	0.32
115	0.32
116	0.36
117	0.43
118	0.47
119	0.5
120	0.47
121	0.45
122	0.45
123	0.41
124	0.36
125	0.32
126	0.27
127	0.21
128	0.21
129	0.19
130	0.15
131	0.17
132	0.19
133	0.23
134	0.24
135	0.24
136	0.28
137	0.3
138	0.3
139	0.34
140	0.35
141	0.32
142	0.36
143	0.35
144	0.3
145	0.28
146	0.29
147	0.28
148	0.26
149	0.26
150	0.19
151	0.2
152	0.2
153	0.19
154	0.17
155	0.14
156	0.13
157	0.12
158	0.11
159	0.1
160	0.11
161	0.13
162	0.16
163	0.19
164	0.23
165	0.28
166	0.38
167	0.39
168	0.44
169	0.43
170	0.44
171	0.44
172	0.42
173	0.39
174	0.32
175	0.31
176	0.28
177	0.33
178	0.32
179	0.34
180	0.31
181	0.3
182	0.27
183	0.29
184	0.27
185	0.22
186	0.21
187	0.17
188	0.16
189	0.13
190	0.13
191	0.12
192	0.11
193	0.1
194	0.1
195	0.1
196	0.1
197	0.13
198	0.21
199	0.24
200	0.25
201	0.25
202	0.28
203	0.29
204	0.29
205	0.32
206	0.27
207	0.29
208	0.31
209	0.32
210	0.3
211	0.29
212	0.29
213	0.3
214	0.3
215	0.26
216	0.31
217	0.36
218	0.43
219	0.44
220	0.43
221	0.37
222	0.33
223	0.31
224	0.24
225	0.19
226	0.13
227	0.12
228	0.11
229	0.11
230	0.13
231	0.15
232	0.14
233	0.14
234	0.11
235	0.11
236	0.12
237	0.12
238	0.1
239	0.07
240	0.07
241	0.1
242	0.1
243	0.1
244	0.1
245	0.11
246	0.12
247	0.11
248	0.11
249	0.08
250	0.09
251	0.08
252	0.09
253	0.09
254	0.08
255	0.08
256	0.11
257	0.11
258	0.12
259	0.11
260	0.11
261	0.09
262	0.1
263	0.11
264	0.1
265	0.12
266	0.14
267	0.14
268	0.15
269	0.16
270	0.16
271	0.18
272	0.16
273	0.14
274	0.14
275	0.19
276	0.19
277	0.25
278	0.28
279	0.34
280	0.4
281	0.4
282	0.42
283	0.41
284	0.47
285	0.43
286	0.46
287	0.47
288	0.45
289	0.51
290	0.49
291	0.5
292	0.42
293	0.41
294	0.35
295	0.29
296	0.3
297	0.27
298	0.29
299	0.27
300	0.28
301	0.3
302	0.29
303	0.27
304	0.33
305	0.38
306	0.39
307	0.42
308	0.44
309	0.42
310	0.5
311	0.52
312	0.45
313	0.39
314	0.36
315	0.32
316	0.32
317	0.35
318	0.3
319	0.27
320	0.24
321	0.23
322	0.2
323	0.22
324	0.26
325	0.27
326	0.28
327	0.29
328	0.3
329	0.31
330	0.31
331	0.27
332	0.21
333	0.16
334	0.12
335	0.09
336	0.08
337	0.06
338	0.06
339	0.05
340	0.05
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.05
345	0.04
346	0.07
347	0.09
348	0.1
349	0.1
350	0.1
351	0.1
352	0.11
353	0.14
354	0.13
355	0.14
356	0.16
357	0.19
358	0.2
359	0.21
360	0.21
361	0.2
362	0.25
363	0.22
364	0.24
365	0.24
366	0.27
367	0.31
368	0.38
369	0.42
370	0.41
371	0.44
372	0.41
373	0.4
374	0.42
375	0.44
376	0.44
377	0.42
378	0.39
379	0.38
380	0.39
381	0.38
382	0.32
383	0.28
384	0.21
385	0.18
386	0.16
387	0.18
388	0.2
389	0.2
390	0.23
391	0.22
392	0.27
393	0.28
394	0.29
395	0.29
396	0.27
397	0.3
398	0.28
399	0.27
400	0.24
401	0.22
402	0.21
403	0.17
404	0.22
405	0.18
406	0.19
407	0.19
408	0.17
409	0.17
410	0.17
411	0.17
412	0.11
413	0.12
414	0.12
415	0.14
416	0.14
417	0.14
418	0.14
419	0.13
420	0.12
421	0.11
422	0.1
423	0.08
424	0.11
425	0.16
426	0.18
427	0.19
428	0.21
429	0.23
430	0.26
431	0.29
432	0.29
433	0.24
434	0.25
435	0.24
436	0.23
437	0.2
438	0.16
439	0.13
440	0.12
441	0.14
442	0.12
443	0.19
444	0.22
445	0.25
446	0.29
447	0.29
448	0.27
449	0.25
450	0.26
451	0.19
452	0.15
453	0.13
454	0.09
455	0.09
456	0.08
457	0.08
458	0.05
459	0.04
460	0.04
461	0.03
462	0.03
463	0.03
464	0.03
465	0.04
466	0.04
467	0.04
468	0.05
469	0.05
470	0.04
471	0.05
472	0.05
473	0.05
474	0.05
475	0.05
476	0.05
477	0.05
478	0.05
479	0.04
480	0.04
481	0.04
482	0.03
483	0.03
484	0.05
485	0.05
486	0.05
487	0.05
488	0.06
489	0.06
490	0.06
491	0.07
492	0.07
493	0.1
494	0.1
495	0.1
496	0.15
497	0.17
498	0.21
499	0.23
500	0.25
501	0.29
502	0.38
503	0.4
504	0.4
505	0.4
506	0.37
507	0.38
508	0.41
509	0.38
510	0.31
511	0.34
512	0.34
513	0.36
514	0.36
515	0.35
516	0.3
517	0.32
518	0.36
519	0.39
520	0.38
521	0.38
522	0.44
523	0.43
524	0.41
525	0.39
526	0.38
527	0.31
528	0.3
529	0.29
530	0.24
531	0.29
532	0.29
533	0.25
534	0.23
535	0.23
536	0.21
537	0.18
538	0.17
539	0.13
540	0.14
541	0.14
542	0.16
543	0.14
544	0.14
545	0.15
546	0.16
547	0.15
548	0.15
549	0.19
550	0.17
551	0.19
552	0.2
553	0.2
554	0.19
555	0.21
556	0.19
557	0.16
558	0.16
559	0.21
560	0.23
561	0.28
562	0.27
563	0.28
564	0.3
565	0.31
566	0.3
567	0.27
568	0.27
569	0.21
570	0.22
571	0.18
572	0.15
573	0.13
574	0.13
575	0.1
576	0.07
577	0.11
578	0.11
579	0.11
580	0.13
581	0.13
582	0.13
583	0.14
584	0.14
585	0.09
586	0.08
587	0.08
588	0.09
589	0.12
590	0.12
591	0.11
592	0.11
593	0.16
594	0.17
595	0.21
596	0.19
597	0.19
598	0.2
599	0.23
600	0.23
601	0.18
602	0.16
603	0.13
604	0.13
605	0.11
606	0.12
607	0.1
608	0.11
609	0.13
610	0.13
611	0.13
612	0.14
613	0.13
614	0.11
615	0.16
616	0.15
617	0.15
618	0.16
619	0.15
620	0.14
621	0.14
622	0.14
623	0.08
624	0.1
625	0.12
626	0.18
627	0.18
628	0.18
629	0.18
630	0.18
631	0.17
632	0.19
633	0.2
634	0.16
635	0.19
636	0.2
637	0.21
638	0.22
639	0.24
640	0.27
641	0.21
642	0.21
643	0.2
644	0.18
645	0.17
646	0.17
647	0.16
648	0.09
649	0.07
650	0.06
651	0.06
652	0.06
653	0.06
654	0.06
655	0.06
656	0.06
657	0.08
658	0.1
659	0.19
660	0.23
661	0.27
662	0.34
663	0.37
664	0.4
665	0.49
666	0.55
667	0.54
668	0.58
669	0.61
670	0.57
671	0.57
672	0.57
673	0.47
674	0.44
675	0.36
676	0.29
677	0.21
678	0.19
679	0.14
680	0.12
681	0.12
682	0.08
683	0.07
684	0.06
685	0.06
686	0.04
687	0.05
688	0.05
689	0.04
690	0.04
691	0.04
692	0.04
693	0.05
694	0.05
695	0.07
696	0.1
697	0.12
698	0.13
699	0.17
700	0.21
701	0.21
702	0.22
703	0.21
704	0.23
705	0.26
706	0.28
707	0.25
708	0.22
709	0.23
710	0.23
711	0.21
712	0.18
713	0.17
714	0.18
715	0.18
716	0.17
717	0.17
718	0.18
719	0.19
720	0.19
721	0.19
722	0.15
723	0.21
724	0.22
725	0.21
726	0.21
727	0.2
728	0.19
729	0.17
730	0.2
731	0.14
732	0.15
733	0.18
734	0.18
735	0.22
736	0.29
737	0.3
738	0.3
739	0.4
740	0.45
741	0.48
742	0.48
743	0.46
744	0.48
745	0.48
746	0.45
747	0.35
748	0.28
749	0.22
750	0.19
751	0.17
752	0.09
753	0.06
754	0.06
755	0.08
756	0.09
757	0.09
758	0.1
759	0.11
760	0.18
761	0.22
762	0.23
763	0.24
764	0.28
765	0.28
766	0.31
767	0.31
768	0.29
769	0.25
770	0.26
771	0.25
772	0.2
773	0.23
774	0.2
775	0.25
776	0.23
777	0.25
778	0.26
779	0.28
780	0.29
781	0.27
782	0.29
783	0.25
784	0.26
785	0.29
786	0.29
787	0.3
788	0.3
789	0.31
790	0.32
791	0.33
792	0.3
793	0.26
794	0.25
795	0.22
796	0.25
797	0.28
798	0.31
799	0.3
800	0.31
801	0.34
802	0.35
803	0.33
804	0.3
805	0.26
806	0.19
807	0.17
808	0.15
809	0.11
810	0.08
811	0.1
812	0.09
813	0.1
814	0.09
815	0.12
816	0.14
817	0.16
818	0.17
819	0.15
820	0.15
821	0.21
822	0.28
823	0.28
824	0.28
825	0.31
826	0.39
827	0.45
828	0.5
829	0.53
830	0.58
831	0.65
832	0.72
833	0.78
834	0.79
835	0.82
836	0.85
837	0.77
838	0.69
839	0.6
840	0.52
841	0.45
842	0.36
843	0.29
844	0.21
845	0.19
846	0.16
847	0.17
848	0.15
849	0.13
850	0.16
851	0.19
852	0.21
853	0.27
854	0.29
855	0.33
856	0.35
857	0.37
858	0.41
859	0.47
860	0.48
861	0.47
862	0.48
863	0.44
864	0.45
865	0.42
866	0.35
867	0.24
868	0.23
869	0.19
870	0.19
871	0.17
872	0.15
873	0.14
874	0.12
875	0.12
876	0.09
877	0.13
878	0.12
879	0.12
880	0.12
881	0.12
882	0.13
883	0.13
884	0.14
885	0.11
886	0.11
887	0.12
888	0.13
889	0.17
890	0.15
891	0.15
892	0.17
893	0.15
894	0.15
895	0.18
896	0.17
897	0.13
898	0.16
899	0.16
900	0.18
901	0.2
902	0.19
903	0.17
904	0.16
905	0.16
906	0.14
907	0.13
908	0.09
909	0.08
910	0.09
911	0.09
912	0.11
913	0.13
914	0.18
915	0.18
916	0.2
917	0.23
918	0.22
919	0.22
920	0.22
921	0.22
922	0.17
923	0.17
924	0.17
925	0.14
926	0.13
927	0.13
928	0.13
929	0.14
930	0.19
931	0.22
932	0.24
933	0.3
934	0.35
935	0.38
936	0.42
937	0.43
938	0.45
939	0.49
940	0.51
941	0.49
942	0.48
943	0.47
944	0.44
945	0.43
946	0.36
947	0.32
948	0.3
949	0.26
950	0.27
951	0.25
952	0.28
953	0.32
954	0.31
955	0.31
956	0.31
957	0.31
958	0.33
959	0.41
960	0.45
961	0.49
962	0.56
963	0.57
964	0.56
965	0.61
966	0.62
967	0.63
968	0.64
969	0.61
970	0.58
971	0.55
972	0.56
973	0.54
974	0.53
975	0.5
976	0.47
977	0.49
978	0.48
979	0.53
980	0.56
981	0.55
982	0.54
983	0.53
984	0.57
985	0.58
986	0.58
987	0.6
988	0.62
989	0.62
990	0.61
991	0.58
992	0.57
993	0.55
994	0.57
995	0.53
996	0.5
997	0.48
998	0.45
999	0.47
1000	0.42
1001	0.37
1002	0.36
1003	0.34
1004	0.31
1005	0.3
1006	0.3
1007	0.28
1008	0.25
1009	0.26
1010	0.22
1011	0.21
1012	0.21
1013	0.21
1014	0.19
1015	0.21
1016	0.25
1017	0.31
1018	0.4
1019	0.45
1020	0.51
1021	0.61
1022	0.69
1023	0.73
1024	0.77
1025	0.77
1026	0.79
1027	0.78
1028	0.75
1029	0.66
1030	0.59
1031	0.54
1032	0.44
1033	0.39
1034	0.3

L0PGB8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer