Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L0PGA4

Protein Details
Accession L0PGA4    Localization Confidence High Confidence Score 20.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-101EDNNRKERKHIVEKNLDKRNIBasic
266-339NINVVNRRKERENKSRKKIQLKIEDKMVQTTEKKRKRNDDSDPNEINDKKRKRLSYIISRKKTEKKSTTGKTVTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
181-207KEKKRAPLTREENLRDGNPKKGKKGIV
272-287RRKERENKSRKKIQLK
298-302KKRKR
314-331KKRKRLSYIISRKKTEKK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MDAFTGRSKGTAFVCFHHKMDMENCLNVYRDLTQQSALSVNKKSTVLQNQILDDNIEKFTLDGHLVSVFPALNKEDISVIEDNNRKERKHIVEKNLDKRNIFLLNEGYIDPKSSLFNLLNETERDMRNQSLTQRKKLLEKNPSLYISLTRLAVRNIPKDISDKDLKALARKACVDFAKEVKEKKRAPLTREENLRDGNPKKGKKGIVRQAKILQEKNGQARGCGFIEYVGHRWALMGLRWLNGRKISSKKNENVKKRLIVEFALENINVVNRRKERENKSRKKIQLKIEDKMVQTTEKKRKRNDDSDPNEINDKKRKRLSYIISRKKTEKKSTTGKTVT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.37
3 0.37
4 0.38
5 0.36
6 0.32
7 0.34
8 0.4
9 0.35
10 0.33
11 0.34
12 0.3
13 0.31
14 0.28
15 0.26
16 0.19
17 0.21
18 0.21
19 0.22
20 0.22
21 0.2
22 0.21
23 0.25
24 0.25
25 0.25
26 0.25
27 0.25
28 0.27
29 0.28
30 0.29
31 0.32
32 0.38
33 0.4
34 0.43
35 0.45
36 0.43
37 0.44
38 0.42
39 0.35
40 0.28
41 0.23
42 0.18
43 0.14
44 0.12
45 0.1
46 0.11
47 0.11
48 0.1
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.09
53 0.1
54 0.1
55 0.08
56 0.08
57 0.1
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.11
62 0.1
63 0.11
64 0.14
65 0.14
66 0.13
67 0.19
68 0.23
69 0.25
70 0.33
71 0.37
72 0.33
73 0.35
74 0.43
75 0.45
76 0.52
77 0.59
78 0.59
79 0.66
80 0.75
81 0.81
82 0.82
83 0.75
84 0.64
85 0.57
86 0.53
87 0.46
88 0.37
89 0.3
90 0.23
91 0.21
92 0.22
93 0.2
94 0.17
95 0.13
96 0.13
97 0.12
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.13
102 0.12
103 0.13
104 0.16
105 0.17
106 0.18
107 0.18
108 0.2
109 0.19
110 0.19
111 0.2
112 0.19
113 0.18
114 0.19
115 0.2
116 0.25
117 0.32
118 0.36
119 0.39
120 0.43
121 0.44
122 0.5
123 0.55
124 0.56
125 0.55
126 0.56
127 0.56
128 0.54
129 0.54
130 0.47
131 0.4
132 0.32
133 0.25
134 0.21
135 0.17
136 0.13
137 0.13
138 0.13
139 0.17
140 0.19
141 0.2
142 0.2
143 0.19
144 0.2
145 0.22
146 0.22
147 0.23
148 0.22
149 0.2
150 0.19
151 0.22
152 0.22
153 0.22
154 0.26
155 0.22
156 0.21
157 0.23
158 0.22
159 0.23
160 0.23
161 0.22
162 0.19
163 0.2
164 0.24
165 0.25
166 0.29
167 0.3
168 0.38
169 0.38
170 0.42
171 0.5
172 0.48
173 0.49
174 0.55
175 0.57
176 0.55
177 0.6
178 0.57
179 0.49
180 0.46
181 0.43
182 0.4
183 0.35
184 0.37
185 0.38
186 0.38
187 0.39
188 0.43
189 0.48
190 0.49
191 0.58
192 0.58
193 0.61
194 0.6
195 0.62
196 0.62
197 0.62
198 0.6
199 0.53
200 0.47
201 0.42
202 0.44
203 0.45
204 0.44
205 0.38
206 0.32
207 0.31
208 0.3
209 0.25
210 0.21
211 0.16
212 0.11
213 0.13
214 0.15
215 0.15
216 0.13
217 0.12
218 0.11
219 0.11
220 0.12
221 0.12
222 0.1
223 0.14
224 0.14
225 0.16
226 0.19
227 0.2
228 0.21
229 0.23
230 0.25
231 0.25
232 0.32
233 0.39
234 0.45
235 0.53
236 0.58
237 0.66
238 0.73
239 0.77
240 0.78
241 0.76
242 0.74
243 0.69
244 0.65
245 0.57
246 0.49
247 0.42
248 0.35
249 0.3
250 0.24
251 0.19
252 0.16
253 0.13
254 0.15
255 0.16
256 0.17
257 0.23
258 0.25
259 0.3
260 0.39
261 0.48
262 0.56
263 0.63
264 0.73
265 0.76
266 0.82
267 0.87
268 0.88
269 0.89
270 0.87
271 0.85
272 0.85
273 0.81
274 0.76
275 0.75
276 0.71
277 0.62
278 0.58
279 0.49
280 0.44
281 0.44
282 0.49
283 0.51
284 0.55
285 0.62
286 0.67
287 0.76
288 0.8
289 0.84
290 0.84
291 0.84
292 0.83
293 0.84
294 0.79
295 0.71
296 0.68
297 0.61
298 0.58
299 0.57
300 0.56
301 0.56
302 0.62
303 0.64
304 0.64
305 0.71
306 0.74
307 0.75
308 0.79
309 0.81
310 0.81
311 0.81
312 0.83
313 0.83
314 0.83
315 0.83
316 0.8
317 0.78
318 0.8
319 0.83