Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L0PCA9

Protein Details
Accession L0PCA9    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
184-203KPLYRRRSFSTQKLYKKEKGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 25, mito_nucl 13.833, cyto_nucl 13.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12418  RRM_Aly_REF_like  
Amino Acid Sequences MSLEKSLDDIINDRKISRNSRTSDWILRRRFFKNARLAPYYKSINFYKRNYNEPWTHDLYEGLAEKPVGRISKQLYRPPSKGLSYRVKIENLHYELTEDDLNGLFKKIGPVTKLSIKYDRSGRSTGTAYVNFERIEDAHNAINQFNGANAAGQPITLTLDLQPPHKPQKGTGSLFSRISNFKVKPLYRRRSFSTQKLYKKEKGKYKTQEDLDNELDKYMNVAIQSKDVEKPMVIDQK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.39
3 0.45
4 0.49
5 0.51
6 0.5
7 0.54
8 0.6
9 0.6
10 0.63
11 0.66
12 0.67
13 0.66
14 0.67
15 0.67
16 0.63
17 0.67
18 0.64
19 0.63
20 0.64
21 0.64
22 0.66
23 0.67
24 0.65
25 0.58
26 0.59
27 0.55
28 0.46
29 0.43
30 0.41
31 0.43
32 0.49
33 0.5
34 0.53
35 0.51
36 0.56
37 0.56
38 0.58
39 0.55
40 0.53
41 0.55
42 0.5
43 0.47
44 0.41
45 0.37
46 0.3
47 0.27
48 0.23
49 0.17
50 0.13
51 0.11
52 0.11
53 0.12
54 0.14
55 0.13
56 0.12
57 0.16
58 0.2
59 0.28
60 0.34
61 0.4
62 0.45
63 0.51
64 0.52
65 0.53
66 0.52
67 0.48
68 0.45
69 0.46
70 0.47
71 0.43
72 0.47
73 0.45
74 0.43
75 0.4
76 0.39
77 0.39
78 0.32
79 0.31
80 0.25
81 0.22
82 0.2
83 0.21
84 0.17
85 0.09
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.06
92 0.06
93 0.08
94 0.09
95 0.11
96 0.11
97 0.13
98 0.16
99 0.22
100 0.25
101 0.25
102 0.29
103 0.28
104 0.3
105 0.34
106 0.34
107 0.31
108 0.3
109 0.28
110 0.26
111 0.26
112 0.25
113 0.22
114 0.2
115 0.19
116 0.19
117 0.2
118 0.17
119 0.16
120 0.14
121 0.11
122 0.12
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.12
127 0.13
128 0.12
129 0.12
130 0.1
131 0.09
132 0.07
133 0.07
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.05
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.1
147 0.12
148 0.14
149 0.17
150 0.21
151 0.29
152 0.33
153 0.33
154 0.32
155 0.41
156 0.48
157 0.48
158 0.49
159 0.47
160 0.46
161 0.47
162 0.45
163 0.38
164 0.31
165 0.31
166 0.33
167 0.28
168 0.3
169 0.37
170 0.39
171 0.47
172 0.56
173 0.63
174 0.62
175 0.68
176 0.7
177 0.71
178 0.75
179 0.75
180 0.75
181 0.74
182 0.76
183 0.79
184 0.8
185 0.78
186 0.79
187 0.79
188 0.78
189 0.75
190 0.77
191 0.77
192 0.78
193 0.79
194 0.75
195 0.74
196 0.69
197 0.69
198 0.63
199 0.56
200 0.47
201 0.39
202 0.34
203 0.25
204 0.22
205 0.16
206 0.13
207 0.1
208 0.14
209 0.14
210 0.17
211 0.2
212 0.21
213 0.23
214 0.24
215 0.24
216 0.21
217 0.23