FuNGI

L0PAP2

Protein Details

Accession

L0PAP2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
701-723	LDKILKKVFKKNSKRINKENIIG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto 5, golg 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR047107 DNA-dir_RNA_pol1_lsu_C IPR015699 DNA-dir_RNA_pol1_lsu_N IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR000722 RNA_pol_asu IPR007066 RNA_pol_Rpb1_3 IPR042102 RNA_pol_Rpb1_3_sf IPR007083 RNA_pol_Rpb1_4 IPR007081 RNA_pol_Rpb1_5 IPR038120 Rpb1_funnel_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00623 RNA_pol_Rpb1_2 PF04983 RNA_pol_Rpb1_3 PF05000 RNA_pol_Rpb1_4 PF04998 RNA_pol_Rpb1_5
CDD	cd02735 RNAP_I_Rpa1_C cd01435 RNAP_I_RPA1_N

Amino Acid Sequences

MHYANCNTYNADFDGDEMNMHLPQNENARTEALLIADTDSQYLVPTSGAPLRGLIQDHVVTGVWMTKKDTFFTKEQYQQLLYGPLRPEDNASNGGKILTLLPTILKPAVLWTGKQIISTVLLNLKPKNYPGLNLISKAKVSGEYWGIHTQEQIILFKDGYLLSGVLDKSQFGASSYGLVHSIYEVYGSSIAGKFLGVLSRLFTKYIQMRGFTCGIDDLCLNSDGDNCRKELINDKSFCTMEDLKSYIGLSGYDKLDDIILKTKLEQIYRDDEKLQGLDVIMKNKMSNLTSSIIKECIPKGLYIKFPWNNMQMMTVSSAKGNSVNVSQISCLLGQQELEGRRVPIMVSGKSLPSFKPYDMSPRASGYIYGRFLTGIGPQEYYFHCMAGREGLIDTAVKTSRSGYLQRCLIKHLEGIRVHYDDTVRDSDGSIVQFHYGEDSLDVTKQKHLLEFDFSVMNCRSLARKYRIKTIYKYLDHKKAVLYARKSIKDPLKYDPVLSKYSPSRFLGSISENFQQSIENYISKDPHNFFQKNKNNELIKNNISKDRFRFLMYMRYQQSLVYPGEAVGVLAGQSIGEPSTQMTLNTFHFAGFGAMNVTLGVPRLREIVLTAGLNIKTPTMTFRILDKISDYEAEMFAKNISKLILSDLVDKIIVTEYILVKTRVKKYEIKILFFSKSEYKEEYNLTSFELKKVMKIYFLKELDKILKKVFKKNSKRINKENIIGKDDATPYIGNTNSFQNSEGLQDQDDSLSDNIMNGVDSDIISMKTTFQSKRTIYNDDSDNDDYDDEDHDDRDDNDKQIIQEKNNSSHSDNDINDQNEIYDLEVYSDSESYGNNILDKFKIKENNNDSVIQNTKILENTYYTCSNCTRFEFDNINGEWCEIELVYPFDMPKLLLVGFIEMACQKTVIREMAGISKCFRIPPESKWDTSRVLCTDGVNFKGIWEAQDIVSLNTLYSNDITSVLRTYGVEAARNVIITEISKLFKAYGIVVDVRHLILISDYMTIDGSYKAFNRTSISSNVSPFLKMSYETSCNFLQEATLHGDTDLLKNPSAKLVMGKVVDVGTGSFDILMPLL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.17
3	0.17
4	0.14
5	0.14
6	0.13
7	0.14
8	0.14
9	0.13
10	0.17
11	0.25
12	0.28
13	0.28
14	0.28
15	0.29
16	0.28
17	0.27
18	0.25
19	0.17
20	0.14
21	0.12
22	0.13
23	0.13
24	0.13
25	0.12
26	0.11
27	0.1
28	0.1
29	0.1
30	0.09
31	0.07
32	0.08
33	0.11
34	0.14
35	0.16
36	0.16
37	0.16
38	0.18
39	0.21
40	0.22
41	0.2
42	0.21
43	0.2
44	0.2
45	0.2
46	0.17
47	0.14
48	0.13
49	0.17
50	0.14
51	0.15
52	0.18
53	0.23
54	0.25
55	0.27
56	0.33
57	0.34
58	0.37
59	0.43
60	0.49
61	0.51
62	0.54
63	0.56
64	0.51
65	0.47
66	0.45
67	0.45
68	0.37
69	0.35
70	0.32
71	0.3
72	0.3
73	0.28
74	0.3
75	0.25
76	0.28
77	0.28
78	0.28
79	0.27
80	0.26
81	0.25
82	0.21
83	0.18
84	0.16
85	0.12
86	0.1
87	0.1
88	0.11
89	0.11
90	0.14
91	0.14
92	0.12
93	0.1
94	0.13
95	0.2
96	0.2
97	0.2
98	0.21
99	0.28
100	0.28
101	0.29
102	0.27
103	0.2
104	0.22
105	0.22
106	0.2
107	0.18
108	0.21
109	0.24
110	0.27
111	0.28
112	0.28
113	0.29
114	0.34
115	0.31
116	0.31
117	0.31
118	0.38
119	0.38
120	0.39
121	0.42
122	0.36
123	0.35
124	0.33
125	0.29
126	0.22
127	0.2
128	0.2
129	0.2
130	0.2
131	0.24
132	0.27
133	0.27
134	0.25
135	0.25
136	0.22
137	0.21
138	0.21
139	0.19
140	0.16
141	0.17
142	0.16
143	0.16
144	0.16
145	0.13
146	0.12
147	0.11
148	0.09
149	0.08
150	0.12
151	0.12
152	0.12
153	0.12
154	0.11
155	0.12
156	0.13
157	0.13
158	0.1
159	0.12
160	0.1
161	0.13
162	0.13
163	0.12
164	0.12
165	0.12
166	0.1
167	0.09
168	0.09
169	0.07
170	0.07
171	0.06
172	0.07
173	0.07
174	0.07
175	0.09
176	0.09
177	0.09
178	0.09
179	0.08
180	0.07
181	0.08
182	0.1
183	0.09
184	0.09
185	0.11
186	0.16
187	0.17
188	0.18
189	0.17
190	0.21
191	0.25
192	0.33
193	0.34
194	0.31
195	0.32
196	0.35
197	0.37
198	0.3
199	0.26
200	0.2
201	0.17
202	0.16
203	0.15
204	0.11
205	0.11
206	0.12
207	0.12
208	0.1
209	0.13
210	0.16
211	0.21
212	0.21
213	0.2
214	0.21
215	0.22
216	0.23
217	0.29
218	0.35
219	0.39
220	0.4
221	0.42
222	0.44
223	0.43
224	0.42
225	0.39
226	0.33
227	0.26
228	0.27
229	0.26
230	0.22
231	0.22
232	0.22
233	0.16
234	0.13
235	0.12
236	0.1
237	0.13
238	0.13
239	0.13
240	0.13
241	0.12
242	0.13
243	0.13
244	0.12
245	0.14
246	0.15
247	0.15
248	0.16
249	0.21
250	0.24
251	0.25
252	0.25
253	0.24
254	0.31
255	0.34
256	0.36
257	0.31
258	0.29
259	0.29
260	0.27
261	0.23
262	0.15
263	0.12
264	0.16
265	0.17
266	0.19
267	0.18
268	0.18
269	0.18
270	0.19
271	0.21
272	0.16
273	0.15
274	0.16
275	0.18
276	0.19
277	0.21
278	0.22
279	0.2
280	0.2
281	0.22
282	0.19
283	0.22
284	0.2
285	0.2
286	0.22
287	0.25
288	0.28
289	0.28
290	0.37
291	0.35
292	0.37
293	0.4
294	0.4
295	0.36
296	0.32
297	0.31
298	0.22
299	0.2
300	0.2
301	0.16
302	0.13
303	0.12
304	0.12
305	0.11
306	0.12
307	0.11
308	0.1
309	0.1
310	0.11
311	0.12
312	0.12
313	0.12
314	0.11
315	0.12
316	0.11
317	0.1
318	0.08
319	0.08
320	0.07
321	0.08
322	0.12
323	0.12
324	0.14
325	0.15
326	0.15
327	0.15
328	0.15
329	0.14
330	0.14
331	0.17
332	0.15
333	0.17
334	0.18
335	0.19
336	0.2
337	0.22
338	0.17
339	0.18
340	0.19
341	0.17
342	0.18
343	0.18
344	0.26
345	0.29
346	0.33
347	0.3
348	0.29
349	0.31
350	0.28
351	0.29
352	0.23
353	0.24
354	0.21
355	0.2
356	0.18
357	0.16
358	0.16
359	0.15
360	0.15
361	0.13
362	0.12
363	0.13
364	0.13
365	0.15
366	0.16
367	0.19
368	0.16
369	0.13
370	0.12
371	0.12
372	0.12
373	0.12
374	0.12
375	0.08
376	0.08
377	0.08
378	0.08
379	0.08
380	0.08
381	0.08
382	0.09
383	0.08
384	0.08
385	0.1
386	0.12
387	0.15
388	0.2
389	0.21
390	0.26
391	0.32
392	0.35
393	0.34
394	0.35
395	0.33
396	0.28
397	0.29
398	0.26
399	0.28
400	0.25
401	0.28
402	0.28
403	0.27
404	0.26
405	0.24
406	0.21
407	0.15
408	0.17
409	0.16
410	0.13
411	0.12
412	0.12
413	0.12
414	0.13
415	0.13
416	0.11
417	0.09
418	0.09
419	0.09
420	0.09
421	0.09
422	0.07
423	0.06
424	0.06
425	0.07
426	0.07
427	0.09
428	0.1
429	0.1
430	0.11
431	0.14
432	0.14
433	0.15
434	0.17
435	0.16
436	0.19
437	0.19
438	0.18
439	0.17
440	0.16
441	0.18
442	0.17
443	0.16
444	0.12
445	0.12
446	0.13
447	0.15
448	0.23
449	0.27
450	0.33
451	0.35
452	0.45
453	0.52
454	0.55
455	0.54
456	0.56
457	0.58
458	0.55
459	0.61
460	0.58
461	0.59
462	0.55
463	0.52
464	0.44
465	0.41
466	0.43
467	0.42
468	0.38
469	0.36
470	0.42
471	0.43
472	0.43
473	0.43
474	0.44
475	0.43
476	0.43
477	0.41
478	0.42
479	0.4
480	0.4
481	0.38
482	0.35
483	0.31
484	0.29
485	0.27
486	0.25
487	0.27
488	0.29
489	0.26
490	0.25
491	0.23
492	0.24
493	0.23
494	0.21
495	0.21
496	0.2
497	0.21
498	0.19
499	0.19
500	0.17
501	0.15
502	0.12
503	0.14
504	0.11
505	0.1
506	0.11
507	0.12
508	0.13
509	0.14
510	0.18
511	0.16
512	0.19
513	0.27
514	0.28
515	0.29
516	0.38
517	0.46
518	0.47
519	0.49
520	0.51
521	0.46
522	0.48
523	0.49
524	0.44
525	0.4
526	0.4
527	0.38
528	0.36
529	0.35
530	0.35
531	0.34
532	0.31
533	0.28
534	0.25
535	0.26
536	0.22
537	0.29
538	0.28
539	0.33
540	0.31
541	0.31
542	0.3
543	0.28
544	0.27
545	0.21
546	0.19
547	0.12
548	0.1
549	0.09
550	0.09
551	0.09
552	0.08
553	0.04
554	0.04
555	0.03
556	0.03
557	0.03
558	0.02
559	0.02
560	0.02
561	0.03
562	0.03
563	0.03
564	0.03
565	0.05
566	0.05
567	0.06
568	0.07
569	0.08
570	0.09
571	0.11
572	0.11
573	0.09
574	0.09
575	0.09
576	0.09
577	0.07
578	0.06
579	0.05
580	0.05
581	0.05
582	0.05
583	0.05
584	0.04
585	0.05
586	0.05
587	0.04
588	0.05
589	0.06
590	0.06
591	0.06
592	0.07
593	0.08
594	0.09
595	0.09
596	0.09
597	0.1
598	0.1
599	0.11
600	0.1
601	0.09
602	0.08
603	0.08
604	0.09
605	0.1
606	0.11
607	0.11
608	0.13
609	0.18
610	0.18
611	0.18
612	0.17
613	0.15
614	0.15
615	0.15
616	0.13
617	0.1
618	0.1
619	0.11
620	0.1
621	0.09
622	0.09
623	0.1
624	0.09
625	0.09
626	0.08
627	0.07
628	0.08
629	0.09
630	0.12
631	0.11
632	0.15
633	0.14
634	0.14
635	0.14
636	0.14
637	0.12
638	0.09
639	0.08
640	0.05
641	0.07
642	0.07
643	0.09
644	0.11
645	0.12
646	0.15
647	0.21
648	0.28
649	0.29
650	0.33
651	0.38
652	0.39
653	0.48
654	0.49
655	0.46
656	0.44
657	0.43
658	0.41
659	0.35
660	0.35
661	0.29
662	0.28
663	0.28
664	0.27
665	0.25
666	0.26
667	0.28
668	0.28
669	0.24
670	0.22
671	0.21
672	0.22
673	0.21
674	0.19
675	0.22
676	0.19
677	0.2
678	0.23
679	0.22
680	0.23
681	0.25
682	0.27
683	0.31
684	0.33
685	0.33
686	0.3
687	0.33
688	0.34
689	0.36
690	0.35
691	0.31
692	0.36
693	0.38
694	0.46
695	0.52
696	0.55
697	0.62
698	0.7
699	0.75
700	0.8
701	0.84
702	0.85
703	0.85
704	0.8
705	0.76
706	0.75
707	0.69
708	0.62
709	0.54
710	0.46
711	0.39
712	0.34
713	0.28
714	0.21
715	0.17
716	0.13
717	0.16
718	0.16
719	0.12
720	0.13
721	0.16
722	0.16
723	0.17
724	0.17
725	0.15
726	0.15
727	0.16
728	0.16
729	0.13
730	0.12
731	0.12
732	0.11
733	0.1
734	0.1
735	0.09
736	0.08
737	0.08
738	0.07
739	0.07
740	0.07
741	0.07
742	0.07
743	0.05
744	0.05
745	0.05
746	0.05
747	0.06
748	0.06
749	0.06
750	0.07
751	0.07
752	0.08
753	0.1
754	0.16
755	0.17
756	0.19
757	0.26
758	0.27
759	0.36
760	0.39
761	0.43
762	0.4
763	0.43
764	0.44
765	0.37
766	0.41
767	0.34
768	0.31
769	0.25
770	0.23
771	0.18
772	0.15
773	0.15
774	0.12
775	0.12
776	0.11
777	0.11
778	0.12
779	0.13
780	0.17
781	0.19
782	0.17
783	0.19
784	0.2
785	0.2
786	0.27
787	0.3
788	0.27
789	0.33
790	0.36
791	0.4
792	0.43
793	0.45
794	0.4
795	0.4
796	0.42
797	0.39
798	0.36
799	0.34
800	0.35
801	0.32
802	0.31
803	0.27
804	0.22
805	0.17
806	0.16
807	0.13
808	0.08
809	0.07
810	0.08
811	0.08
812	0.09
813	0.09
814	0.09
815	0.09
816	0.08
817	0.08
818	0.09
819	0.12
820	0.11
821	0.12
822	0.13
823	0.14
824	0.16
825	0.19
826	0.2
827	0.23
828	0.31
829	0.33
830	0.42
831	0.47
832	0.53
833	0.52
834	0.53
835	0.47
836	0.44
837	0.44
838	0.35
839	0.3
840	0.23
841	0.22
842	0.2
843	0.21
844	0.16
845	0.16
846	0.17
847	0.2
848	0.23
849	0.22
850	0.23
851	0.25
852	0.27
853	0.28
854	0.29
855	0.3
856	0.3
857	0.35
858	0.36
859	0.35
860	0.39
861	0.37
862	0.35
863	0.3
864	0.28
865	0.22
866	0.18
867	0.16
868	0.08
869	0.08
870	0.07
871	0.08
872	0.09
873	0.1
874	0.1
875	0.09
876	0.1
877	0.1
878	0.09
879	0.09
880	0.08
881	0.08
882	0.09
883	0.1
884	0.1
885	0.09
886	0.1
887	0.09
888	0.1
889	0.1
890	0.1
891	0.09
892	0.1
893	0.14
894	0.15
895	0.15
896	0.14
897	0.16
898	0.24
899	0.27
900	0.26
901	0.24
902	0.26
903	0.26
904	0.26
905	0.26
906	0.26
907	0.27
908	0.32
909	0.4
910	0.42
911	0.44
912	0.47
913	0.5
914	0.47
915	0.46
916	0.46
917	0.38
918	0.36
919	0.35
920	0.32
921	0.34
922	0.33
923	0.32
924	0.27
925	0.25
926	0.21
927	0.24
928	0.23
929	0.18
930	0.16
931	0.16
932	0.14
933	0.19
934	0.19
935	0.16
936	0.17
937	0.16
938	0.13
939	0.13
940	0.13
941	0.11
942	0.11
943	0.11
944	0.1
945	0.12
946	0.12
947	0.12
948	0.14
949	0.13
950	0.13
951	0.12
952	0.14
953	0.17
954	0.18
955	0.2
956	0.18
957	0.21
958	0.21
959	0.21
960	0.18
961	0.14
962	0.13
963	0.11
964	0.15
965	0.15
966	0.15
967	0.15
968	0.16
969	0.16
970	0.17
971	0.17
972	0.15
973	0.14
974	0.17
975	0.18
976	0.18
977	0.19
978	0.19
979	0.17
980	0.16
981	0.13
982	0.1
983	0.08
984	0.09
985	0.08
986	0.09
987	0.09
988	0.09
989	0.09
990	0.09
991	0.1
992	0.1
993	0.1
994	0.11
995	0.13
996	0.17
997	0.18
998	0.2
999	0.23
1000	0.26
1001	0.29
1002	0.31
1003	0.36
1004	0.36
1005	0.37
1006	0.39
1007	0.36
1008	0.33
1009	0.29
1010	0.26
1011	0.21
1012	0.19
1013	0.2
1014	0.22
1015	0.26
1016	0.27
1017	0.3
1018	0.29
1019	0.28
1020	0.27
1021	0.24
1022	0.19
1023	0.15
1024	0.17
1025	0.2
1026	0.19
1027	0.18
1028	0.18
1029	0.2
1030	0.2
1031	0.22
1032	0.26
1033	0.21
1034	0.22
1035	0.24
1036	0.25
1037	0.28
1038	0.28
1039	0.25
1040	0.23
1041	0.24
1042	0.28
1043	0.27
1044	0.27
1045	0.24
1046	0.23
1047	0.22
1048	0.18
1049	0.14
1050	0.11
1051	0.1
1052	0.1
1053	0.08
1054	0.08

L0PAP2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer