FuNGI

L0PDM6

Protein Details

Accession

L0PDM6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
9-30	GLRRGKRLFHFMRQRINQQRLY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 23, cyto 2.5, cyto_nucl 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR018370 Chaperonin_Cpn60_CS IPR001844 Cpn60/GroEL IPR002423 Cpn60/GroEL/TCP-1 IPR027409 GroEL-like_apical_dom_sf IPR027413 GROEL-like_equatorial_sf IPR027410 TCP-1-like_intermed_sf
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0140662 F:ATP-dependent protein folding chaperone GO:0042026 P:protein refolding
Pfam	View protein in Pfam PF00118 Cpn60_TCP1
PROSITE	View protein in PROSITE PS00296 CHAPERONINS_CPN60
CDD	cd03344 GroEL

Amino Acid Sequences

MNHPYCSLGLRRGKRLFHFMRQRINQQRLYSTKELKFGQDVRSSLLNGVEVLAKAVSVTLGPKGRNVLIEQSFGSPKITKDGVTVAKSIILKDKFENLGARLVQDVANKTNETAGDGTTTATVLARAIFSESVKNVAAGCNPMDLRRGAQKAVDEVVKFLQKNKRDITTSEEIAQVATISANGDKHIGRLIANAMEKVGKEGVITVKEGKTIDDELEITEGMRFDRGYISPYFITDIKTQKCEFEKPLILLSEKKISALQDILPSLEIAVNQRRPLVIIAEDVDGEALAACILNKLRGQLQIAAVKAPGFGDNRKSILGDIGILTGGQVFTDELDMKLERVTPELLGSTGSVTITKEDIILLNGDGEKDLISQRCEQIRLAINDPTTSEYEKEKLQERLAKLSGGVAVIRVGGSSEIEVGEKKDRFVDALNATRAAVEEGILPGGGTAILKAVSILDAIAEKMDTFDEKLGVKTIQNAIQQPTRLIVQNTGIADGSVIIDRLTKEYGDQFLMGYDAVTGKICNMVSAGVVDPLKVVKTALVDAFSVASLMATSECAIVDAPEPPSTSGGPGGMGGMGGMGGMGGMGGMGGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.71
3	0.69
4	0.7
5	0.74
6	0.72
7	0.76
8	0.76
9	0.81
10	0.81
11	0.82
12	0.78
13	0.71
14	0.73
15	0.67
16	0.68
17	0.66
18	0.64
19	0.6
20	0.6
21	0.57
22	0.52
23	0.55
24	0.51
25	0.5
26	0.47
27	0.44
28	0.42
29	0.42
30	0.4
31	0.34
32	0.3
33	0.23
34	0.17
35	0.17
36	0.15
37	0.12
38	0.12
39	0.1
40	0.09
41	0.08
42	0.08
43	0.07
44	0.05
45	0.07
46	0.12
47	0.16
48	0.17
49	0.19
50	0.23
51	0.24
52	0.26
53	0.27
54	0.3
55	0.28
56	0.3
57	0.29
58	0.29
59	0.29
60	0.28
61	0.28
62	0.22
63	0.2
64	0.23
65	0.23
66	0.2
67	0.2
68	0.27
69	0.3
70	0.3
71	0.31
72	0.25
73	0.29
74	0.29
75	0.28
76	0.29
77	0.25
78	0.25
79	0.27
80	0.32
81	0.3
82	0.32
83	0.34
84	0.27
85	0.31
86	0.29
87	0.27
88	0.22
89	0.21
90	0.21
91	0.21
92	0.23
93	0.19
94	0.22
95	0.22
96	0.21
97	0.22
98	0.2
99	0.19
100	0.17
101	0.14
102	0.13
103	0.13
104	0.13
105	0.11
106	0.11
107	0.08
108	0.07
109	0.07
110	0.06
111	0.06
112	0.06
113	0.06
114	0.08
115	0.08
116	0.09
117	0.12
118	0.12
119	0.14
120	0.14
121	0.15
122	0.13
123	0.14
124	0.14
125	0.13
126	0.13
127	0.14
128	0.14
129	0.15
130	0.17
131	0.16
132	0.17
133	0.23
134	0.24
135	0.22
136	0.24
137	0.24
138	0.24
139	0.26
140	0.27
141	0.2
142	0.19
143	0.21
144	0.24
145	0.22
146	0.27
147	0.32
148	0.34
149	0.4
150	0.43
151	0.45
152	0.43
153	0.45
154	0.46
155	0.44
156	0.41
157	0.36
158	0.33
159	0.27
160	0.24
161	0.22
162	0.14
163	0.08
164	0.07
165	0.05
166	0.04
167	0.06
168	0.06
169	0.06
170	0.09
171	0.08
172	0.09
173	0.11
174	0.11
175	0.1
176	0.11
177	0.12
178	0.14
179	0.15
180	0.14
181	0.13
182	0.13
183	0.13
184	0.13
185	0.12
186	0.08
187	0.08
188	0.09
189	0.12
190	0.12
191	0.13
192	0.14
193	0.14
194	0.16
195	0.16
196	0.15
197	0.14
198	0.14
199	0.14
200	0.12
201	0.12
202	0.1
203	0.1
204	0.1
205	0.07
206	0.07
207	0.07
208	0.06
209	0.06
210	0.06
211	0.06
212	0.08
213	0.09
214	0.11
215	0.12
216	0.14
217	0.14
218	0.14
219	0.16
220	0.14
221	0.17
222	0.18
223	0.24
224	0.23
225	0.27
226	0.27
227	0.29
228	0.32
229	0.33
230	0.31
231	0.31
232	0.31
233	0.28
234	0.3
235	0.27
236	0.25
237	0.23
238	0.22
239	0.21
240	0.18
241	0.18
242	0.17
243	0.16
244	0.16
245	0.16
246	0.15
247	0.12
248	0.12
249	0.12
250	0.11
251	0.1
252	0.09
253	0.08
254	0.07
255	0.08
256	0.13
257	0.14
258	0.14
259	0.15
260	0.15
261	0.15
262	0.15
263	0.14
264	0.09
265	0.08
266	0.09
267	0.09
268	0.09
269	0.08
270	0.07
271	0.06
272	0.05
273	0.04
274	0.02
275	0.02
276	0.02
277	0.02
278	0.03
279	0.03
280	0.05
281	0.05
282	0.06
283	0.08
284	0.1
285	0.12
286	0.13
287	0.16
288	0.18
289	0.17
290	0.17
291	0.15
292	0.13
293	0.12
294	0.1
295	0.1
296	0.08
297	0.09
298	0.13
299	0.15
300	0.16
301	0.16
302	0.16
303	0.14
304	0.13
305	0.12
306	0.08
307	0.07
308	0.06
309	0.06
310	0.05
311	0.05
312	0.04
313	0.04
314	0.03
315	0.03
316	0.03
317	0.03
318	0.04
319	0.05
320	0.05
321	0.06
322	0.07
323	0.07
324	0.07
325	0.09
326	0.08
327	0.09
328	0.1
329	0.08
330	0.09
331	0.09
332	0.08
333	0.07
334	0.07
335	0.06
336	0.06
337	0.05
338	0.06
339	0.05
340	0.06
341	0.06
342	0.06
343	0.06
344	0.06
345	0.06
346	0.06
347	0.07
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.06
352	0.06
353	0.06
354	0.05
355	0.06
356	0.08
357	0.09
358	0.11
359	0.14
360	0.18
361	0.2
362	0.22
363	0.21
364	0.24
365	0.28
366	0.29
367	0.3
368	0.28
369	0.26
370	0.25
371	0.26
372	0.23
373	0.18
374	0.16
375	0.15
376	0.14
377	0.16
378	0.17
379	0.2
380	0.22
381	0.24
382	0.28
383	0.33
384	0.32
385	0.37
386	0.36
387	0.34
388	0.28
389	0.26
390	0.22
391	0.16
392	0.14
393	0.08
394	0.07
395	0.07
396	0.06
397	0.05
398	0.04
399	0.04
400	0.04
401	0.04
402	0.05
403	0.05
404	0.06
405	0.06
406	0.08
407	0.15
408	0.15
409	0.16
410	0.17
411	0.17
412	0.18
413	0.19
414	0.24
415	0.22
416	0.28
417	0.28
418	0.27
419	0.27
420	0.26
421	0.24
422	0.18
423	0.13
424	0.07
425	0.07
426	0.07
427	0.07
428	0.06
429	0.06
430	0.05
431	0.05
432	0.04
433	0.03
434	0.03
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.04
439	0.04
440	0.04
441	0.05
442	0.04
443	0.04
444	0.04
445	0.05
446	0.05
447	0.05
448	0.05
449	0.05
450	0.06
451	0.07
452	0.08
453	0.09
454	0.11
455	0.11
456	0.12
457	0.14
458	0.15
459	0.14
460	0.18
461	0.21
462	0.25
463	0.28
464	0.3
465	0.32
466	0.35
467	0.35
468	0.31
469	0.29
470	0.26
471	0.25
472	0.23
473	0.21
474	0.2
475	0.23
476	0.22
477	0.22
478	0.19
479	0.16
480	0.14
481	0.12
482	0.11
483	0.07
484	0.07
485	0.06
486	0.08
487	0.09
488	0.11
489	0.12
490	0.11
491	0.13
492	0.16
493	0.19
494	0.18
495	0.18
496	0.16
497	0.15
498	0.15
499	0.13
500	0.1
501	0.08
502	0.07
503	0.07
504	0.07
505	0.07
506	0.07
507	0.11
508	0.11
509	0.1
510	0.1
511	0.1
512	0.1
513	0.11
514	0.12
515	0.12
516	0.12
517	0.12
518	0.12
519	0.12
520	0.13
521	0.11
522	0.11
523	0.09
524	0.11
525	0.14
526	0.15
527	0.15
528	0.15
529	0.15
530	0.16
531	0.13
532	0.11
533	0.08
534	0.07
535	0.05
536	0.05
537	0.05
538	0.05
539	0.06
540	0.06
541	0.06
542	0.07
543	0.07
544	0.08
545	0.09
546	0.11
547	0.13
548	0.15
549	0.16
550	0.17
551	0.19
552	0.19
553	0.19
554	0.18
555	0.16
556	0.14
557	0.13
558	0.12
559	0.1
560	0.09
561	0.07
562	0.05
563	0.04
564	0.04
565	0.03
566	0.02
567	0.02
568	0.02
569	0.02
570	0.02
571	0.01

L0PDM6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer