Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L0PDE7

Protein Details
Accession L0PDE7    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-55MYVGNRGRKLKRKARYAYRGKLGIHydrophilic
66-88VYYGSKHRTVIQRKKRRTSLDDTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-46RGRKLKRKAR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039602  Rxt2  
IPR013904  RXT2_N  
Gene Ontology GO:0016575  P:histone deacetylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF08595  RXT2_N  
Amino Acid Sequences MKDKETLEELIRFKEALARSENASDSSSSVGMYVGNRGRKLKRKARYAYRGKLGIPSDILTDSKTVYYGSKHRTVIQRKKRRTSLDDTDGEASTHSDDPYRDIHIDELLAPIVHPADLPRHRSYRMSLTQSCLTNLAIQILDVISEEREYNINISKLLFIFLGDDWSIHTAFRTNEKFDMEKNVSEMHSDPEMEPEQSLSLEEGKTALAFPTLFATNDDSQSTCQKQPLADTLLSVNKSFLEKLNQYMDLTENDISDLRKLLQSALDRSNEYIRCLMQVRNDIIRAKRLIKKVYEWCVEAAKKENES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.27
3 0.24
4 0.27
5 0.26
6 0.28
7 0.31
8 0.32
9 0.27
10 0.26
11 0.22
12 0.18
13 0.18
14 0.16
15 0.13
16 0.12
17 0.1
18 0.1
19 0.1
20 0.16
21 0.19
22 0.24
23 0.27
24 0.34
25 0.42
26 0.5
27 0.6
28 0.63
29 0.67
30 0.72
31 0.8
32 0.84
33 0.87
34 0.87
35 0.86
36 0.84
37 0.78
38 0.69
39 0.65
40 0.56
41 0.47
42 0.38
43 0.3
44 0.24
45 0.22
46 0.21
47 0.15
48 0.14
49 0.12
50 0.11
51 0.11
52 0.1
53 0.1
54 0.14
55 0.21
56 0.26
57 0.32
58 0.33
59 0.39
60 0.47
61 0.57
62 0.63
63 0.67
64 0.72
65 0.75
66 0.83
67 0.85
68 0.84
69 0.8
70 0.78
71 0.76
72 0.74
73 0.67
74 0.6
75 0.54
76 0.46
77 0.39
78 0.3
79 0.21
80 0.15
81 0.14
82 0.11
83 0.11
84 0.1
85 0.13
86 0.14
87 0.17
88 0.15
89 0.14
90 0.15
91 0.13
92 0.14
93 0.11
94 0.1
95 0.08
96 0.07
97 0.06
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.04
102 0.05
103 0.12
104 0.16
105 0.22
106 0.25
107 0.28
108 0.3
109 0.32
110 0.34
111 0.35
112 0.38
113 0.39
114 0.37
115 0.38
116 0.41
117 0.4
118 0.37
119 0.29
120 0.23
121 0.18
122 0.16
123 0.13
124 0.08
125 0.08
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.04
130 0.04
131 0.03
132 0.04
133 0.04
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.07
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.1
145 0.08
146 0.06
147 0.07
148 0.06
149 0.07
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.07
154 0.08
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.08
159 0.15
160 0.18
161 0.18
162 0.2
163 0.22
164 0.23
165 0.22
166 0.29
167 0.24
168 0.22
169 0.21
170 0.21
171 0.19
172 0.2
173 0.19
174 0.14
175 0.13
176 0.13
177 0.12
178 0.14
179 0.15
180 0.14
181 0.13
182 0.11
183 0.11
184 0.1
185 0.1
186 0.07
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.06
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.08
199 0.09
200 0.09
201 0.1
202 0.15
203 0.15
204 0.17
205 0.17
206 0.15
207 0.16
208 0.22
209 0.25
210 0.22
211 0.23
212 0.23
213 0.23
214 0.26
215 0.29
216 0.28
217 0.24
218 0.23
219 0.24
220 0.26
221 0.27
222 0.24
223 0.19
224 0.16
225 0.17
226 0.17
227 0.17
228 0.2
229 0.2
230 0.24
231 0.28
232 0.28
233 0.27
234 0.27
235 0.26
236 0.2
237 0.22
238 0.18
239 0.14
240 0.13
241 0.15
242 0.14
243 0.13
244 0.14
245 0.12
246 0.13
247 0.14
248 0.14
249 0.18
250 0.22
251 0.27
252 0.31
253 0.33
254 0.32
255 0.34
256 0.4
257 0.36
258 0.34
259 0.31
260 0.26
261 0.27
262 0.28
263 0.29
264 0.28
265 0.33
266 0.35
267 0.37
268 0.41
269 0.43
270 0.43
271 0.47
272 0.46
273 0.47
274 0.5
275 0.53
276 0.57
277 0.56
278 0.62
279 0.64
280 0.68
281 0.65
282 0.6
283 0.55
284 0.56
285 0.53
286 0.47
287 0.46