Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L0PAT1

Protein Details
Accession L0PAT1    Localization Confidence Low Confidence Score 7.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-34SKSINFYKKESKKHHFDASSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 6, plas 5, cyto_mito 5, mito 4.5, cyto 4.5, E.R. 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017945  DHBP_synth_RibB-like_a/b_dom  
IPR006070  Sua5-like_dom  
IPR038385  Sua5/YwlC_C  
IPR005145  Sua5_C  
IPR010923  T(6)A37_SUA5  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003725  F:double-stranded RNA binding  
GO:0061710  F:L-threonylcarbamoyladenylate synthase  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF03481  Sua5_C  
PF01300  Sua5_yciO_yrdC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51163  YRDC  
Amino Acid Sequences MEKNDFLTRILPVSSKSINFYKKESKKHHFDASSLTISSPDTLKALQEAVQVLKEGIFPIAFPTETVYGLGADATNSKAVMSIFQAKNRPSDNPLIVHISSLDQLQRMFHSNVEKIETEDIIPPIYMPLIDRFWPGPLTIILPIKNFKISPIVAAKKDTIAIRMPSNHIALAIIALFDMPIAAPSANISTRPSSTLASHVYHDFKGKIPIIIDDGPCHIGLESTVVDGLVDPPVILRPGSITKEQIKSCGGKWKNVLVYTHKDTNEVSETIPRAPGMKYKHYSPKAKVVLFEPTSEESVIKWVTQNIDVNIEKKTLIGIMRTMHWKREHLKEIYLKWKTLDCELGCTGSEITKNIFSSLRNMDLQNVNIILIEGVSEKDEGLAIMNRIRCSASIIVLN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.26
3 0.29
4 0.35
5 0.41
6 0.42
7 0.48
8 0.53
9 0.57
10 0.66
11 0.71
12 0.73
13 0.75
14 0.8
15 0.82
16 0.74
17 0.67
18 0.65
19 0.61
20 0.55
21 0.46
22 0.39
23 0.29
24 0.27
25 0.27
26 0.2
27 0.14
28 0.12
29 0.12
30 0.13
31 0.13
32 0.14
33 0.14
34 0.16
35 0.17
36 0.17
37 0.18
38 0.17
39 0.16
40 0.15
41 0.14
42 0.12
43 0.1
44 0.09
45 0.08
46 0.1
47 0.12
48 0.11
49 0.11
50 0.13
51 0.13
52 0.14
53 0.14
54 0.12
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.07
59 0.06
60 0.07
61 0.08
62 0.08
63 0.07
64 0.07
65 0.08
66 0.08
67 0.09
68 0.12
69 0.21
70 0.23
71 0.28
72 0.34
73 0.34
74 0.39
75 0.4
76 0.39
77 0.34
78 0.39
79 0.38
80 0.34
81 0.35
82 0.35
83 0.32
84 0.29
85 0.25
86 0.19
87 0.16
88 0.16
89 0.14
90 0.1
91 0.1
92 0.11
93 0.13
94 0.16
95 0.16
96 0.18
97 0.22
98 0.23
99 0.25
100 0.27
101 0.25
102 0.22
103 0.23
104 0.21
105 0.17
106 0.17
107 0.16
108 0.13
109 0.12
110 0.1
111 0.09
112 0.09
113 0.07
114 0.06
115 0.08
116 0.1
117 0.11
118 0.12
119 0.13
120 0.14
121 0.14
122 0.13
123 0.12
124 0.11
125 0.12
126 0.13
127 0.15
128 0.15
129 0.16
130 0.17
131 0.17
132 0.18
133 0.16
134 0.14
135 0.16
136 0.15
137 0.18
138 0.24
139 0.27
140 0.27
141 0.28
142 0.28
143 0.24
144 0.26
145 0.23
146 0.17
147 0.16
148 0.17
149 0.18
150 0.19
151 0.21
152 0.21
153 0.21
154 0.18
155 0.15
156 0.13
157 0.11
158 0.09
159 0.06
160 0.04
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.02
165 0.02
166 0.02
167 0.02
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.04
172 0.05
173 0.06
174 0.07
175 0.08
176 0.09
177 0.09
178 0.11
179 0.12
180 0.12
181 0.12
182 0.15
183 0.17
184 0.16
185 0.17
186 0.18
187 0.18
188 0.18
189 0.19
190 0.16
191 0.14
192 0.18
193 0.17
194 0.16
195 0.15
196 0.15
197 0.17
198 0.18
199 0.18
200 0.13
201 0.14
202 0.14
203 0.13
204 0.13
205 0.09
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.06
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.04
224 0.06
225 0.1
226 0.13
227 0.14
228 0.18
229 0.22
230 0.29
231 0.29
232 0.29
233 0.29
234 0.28
235 0.29
236 0.35
237 0.31
238 0.3
239 0.33
240 0.36
241 0.37
242 0.38
243 0.39
244 0.34
245 0.4
246 0.4
247 0.44
248 0.38
249 0.35
250 0.33
251 0.34
252 0.31
253 0.25
254 0.21
255 0.19
256 0.2
257 0.2
258 0.2
259 0.16
260 0.14
261 0.14
262 0.19
263 0.21
264 0.28
265 0.3
266 0.37
267 0.47
268 0.53
269 0.6
270 0.59
271 0.63
272 0.62
273 0.6
274 0.55
275 0.47
276 0.48
277 0.42
278 0.39
279 0.32
280 0.26
281 0.26
282 0.25
283 0.23
284 0.14
285 0.16
286 0.16
287 0.13
288 0.12
289 0.13
290 0.15
291 0.19
292 0.22
293 0.19
294 0.25
295 0.26
296 0.26
297 0.25
298 0.24
299 0.2
300 0.17
301 0.16
302 0.12
303 0.12
304 0.12
305 0.14
306 0.15
307 0.18
308 0.27
309 0.29
310 0.32
311 0.35
312 0.39
313 0.42
314 0.5
315 0.55
316 0.49
317 0.56
318 0.57
319 0.6
320 0.65
321 0.63
322 0.54
323 0.48
324 0.49
325 0.43
326 0.39
327 0.4
328 0.3
329 0.32
330 0.32
331 0.32
332 0.28
333 0.27
334 0.24
335 0.19
336 0.2
337 0.15
338 0.17
339 0.19
340 0.2
341 0.2
342 0.22
343 0.2
344 0.25
345 0.28
346 0.3
347 0.29
348 0.29
349 0.33
350 0.35
351 0.35
352 0.31
353 0.27
354 0.22
355 0.19
356 0.19
357 0.13
358 0.09
359 0.08
360 0.06
361 0.06
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.08
366 0.08
367 0.07
368 0.1
369 0.12
370 0.13
371 0.18
372 0.22
373 0.22
374 0.24
375 0.25
376 0.22
377 0.24
378 0.25