Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L0P7M1

Protein Details
Accession L0P7M1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
221-240QFQLRREPIKKKFKSRFINFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005607  BSD_dom  
IPR035925  BSD_dom_sf  
IPR024610  ING_N_histone-binding  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR027079  Tfb1/GTF2H1  
IPR013876  TFIIH_BTF_p62_N  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0000439  C:transcription factor TFIIH core complex  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF03909  BSD  
PF12998  ING  
PF08567  PH_TFIIH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50858  BSD  
CDD cd15505  PHD_ING  
Amino Acid Sequences MKAPNKFLHNNEETYASLNDFTDAIEALPMDLTRNFTLLREVDAKVSSLQHLISSSISNLLTNTNSFQETKSISSSKLQSLLIQIIPYADEKISLASSTRDAVKKHLKRLDLDFSLIENEIPAIIRLGSTNHPAFSSNSNISRSETRKEAIATRRTTTEELNIPNNSRGNHRENSTPIRKKRISHINGGATSPRFDTPDKDKKKGSTYEKIKSKDQNQQSQFQLRREPIKKKFKSRFINFYYIMFKINILIYPNEPTYCYCDQVSYGEMVACDGKKCHREWFHLPCNSYFIIIIFFTNIRYWPSRASSRRMISEVLYKKIKDLQATPITSPRIMVKILVKTQKNETTSYIFTFVSLKAQDDCNNFKLNIQKTISKKNNAHNVQSVSDILARRNFEQDIDLQQSLLKDNNELMKTFSETVIKGNITNEQFWSTRIHLLRTYAVEKYQKRGLYNVLVTIRPQTIDNKIKLSLSREKIHDIFQQHPLIKHIYNKNVPPLSEDDFWGRFFLSRLCKKLRGEKLNTSDSNDEILDKYIDYADNLTQPYTNNTKDISHFIDLIRNEHHIRKTCNFESPIALRDLENVKMSQSLNNLSIKMINFSKNTTEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.33
3 0.24
4 0.2
5 0.17
6 0.17
7 0.14
8 0.13
9 0.11
10 0.1
11 0.09
12 0.08
13 0.08
14 0.07
15 0.08
16 0.08
17 0.09
18 0.1
19 0.14
20 0.14
21 0.16
22 0.16
23 0.16
24 0.22
25 0.2
26 0.24
27 0.23
28 0.24
29 0.25
30 0.26
31 0.26
32 0.23
33 0.24
34 0.21
35 0.18
36 0.18
37 0.16
38 0.16
39 0.16
40 0.15
41 0.14
42 0.13
43 0.15
44 0.15
45 0.14
46 0.13
47 0.15
48 0.15
49 0.15
50 0.17
51 0.16
52 0.18
53 0.18
54 0.19
55 0.21
56 0.22
57 0.23
58 0.27
59 0.26
60 0.26
61 0.31
62 0.35
63 0.33
64 0.35
65 0.33
66 0.29
67 0.3
68 0.32
69 0.27
70 0.23
71 0.2
72 0.16
73 0.16
74 0.15
75 0.14
76 0.1
77 0.09
78 0.09
79 0.11
80 0.11
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.12
85 0.14
86 0.19
87 0.21
88 0.22
89 0.3
90 0.4
91 0.45
92 0.53
93 0.57
94 0.56
95 0.56
96 0.62
97 0.63
98 0.54
99 0.49
100 0.4
101 0.35
102 0.33
103 0.28
104 0.21
105 0.12
106 0.1
107 0.08
108 0.08
109 0.07
110 0.06
111 0.05
112 0.06
113 0.06
114 0.09
115 0.11
116 0.17
117 0.18
118 0.18
119 0.18
120 0.2
121 0.22
122 0.22
123 0.26
124 0.24
125 0.27
126 0.29
127 0.29
128 0.31
129 0.36
130 0.36
131 0.34
132 0.33
133 0.3
134 0.31
135 0.32
136 0.36
137 0.38
138 0.42
139 0.42
140 0.41
141 0.42
142 0.43
143 0.42
144 0.36
145 0.33
146 0.3
147 0.3
148 0.32
149 0.32
150 0.31
151 0.33
152 0.34
153 0.3
154 0.29
155 0.32
156 0.33
157 0.35
158 0.35
159 0.37
160 0.4
161 0.48
162 0.54
163 0.57
164 0.56
165 0.62
166 0.64
167 0.62
168 0.66
169 0.67
170 0.61
171 0.61
172 0.63
173 0.6
174 0.57
175 0.55
176 0.49
177 0.39
178 0.35
179 0.28
180 0.21
181 0.17
182 0.17
183 0.21
184 0.27
185 0.36
186 0.42
187 0.45
188 0.47
189 0.49
190 0.56
191 0.6
192 0.58
193 0.58
194 0.6
195 0.65
196 0.69
197 0.69
198 0.68
199 0.67
200 0.66
201 0.64
202 0.64
203 0.65
204 0.6
205 0.63
206 0.61
207 0.62
208 0.59
209 0.52
210 0.5
211 0.44
212 0.5
213 0.51
214 0.56
215 0.57
216 0.64
217 0.68
218 0.73
219 0.78
220 0.79
221 0.82
222 0.8
223 0.8
224 0.74
225 0.75
226 0.65
227 0.59
228 0.52
229 0.41
230 0.36
231 0.26
232 0.2
233 0.14
234 0.14
235 0.12
236 0.1
237 0.11
238 0.1
239 0.12
240 0.13
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.17
245 0.17
246 0.18
247 0.15
248 0.15
249 0.16
250 0.16
251 0.16
252 0.1
253 0.09
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.07
260 0.08
261 0.11
262 0.14
263 0.16
264 0.23
265 0.27
266 0.33
267 0.4
268 0.48
269 0.54
270 0.54
271 0.54
272 0.47
273 0.45
274 0.39
275 0.32
276 0.22
277 0.14
278 0.1
279 0.09
280 0.09
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.07
286 0.08
287 0.1
288 0.11
289 0.13
290 0.16
291 0.24
292 0.27
293 0.32
294 0.37
295 0.38
296 0.39
297 0.38
298 0.35
299 0.28
300 0.34
301 0.31
302 0.28
303 0.28
304 0.26
305 0.26
306 0.3
307 0.3
308 0.24
309 0.23
310 0.26
311 0.3
312 0.32
313 0.32
314 0.31
315 0.3
316 0.28
317 0.27
318 0.2
319 0.15
320 0.13
321 0.14
322 0.14
323 0.17
324 0.23
325 0.29
326 0.29
327 0.29
328 0.35
329 0.38
330 0.36
331 0.34
332 0.31
333 0.28
334 0.28
335 0.27
336 0.24
337 0.19
338 0.17
339 0.17
340 0.14
341 0.14
342 0.13
343 0.13
344 0.12
345 0.14
346 0.18
347 0.2
348 0.24
349 0.23
350 0.25
351 0.24
352 0.25
353 0.31
354 0.28
355 0.32
356 0.3
357 0.34
358 0.36
359 0.46
360 0.5
361 0.51
362 0.55
363 0.55
364 0.63
365 0.61
366 0.6
367 0.55
368 0.52
369 0.44
370 0.4
371 0.32
372 0.23
373 0.23
374 0.2
375 0.16
376 0.17
377 0.18
378 0.18
379 0.2
380 0.19
381 0.16
382 0.17
383 0.17
384 0.18
385 0.21
386 0.2
387 0.17
388 0.18
389 0.18
390 0.18
391 0.19
392 0.14
393 0.1
394 0.13
395 0.18
396 0.18
397 0.18
398 0.19
399 0.17
400 0.19
401 0.2
402 0.19
403 0.15
404 0.15
405 0.16
406 0.18
407 0.17
408 0.15
409 0.15
410 0.2
411 0.19
412 0.2
413 0.2
414 0.2
415 0.2
416 0.2
417 0.23
418 0.19
419 0.24
420 0.24
421 0.26
422 0.24
423 0.26
424 0.28
425 0.27
426 0.28
427 0.23
428 0.26
429 0.32
430 0.32
431 0.34
432 0.37
433 0.36
434 0.35
435 0.36
436 0.36
437 0.35
438 0.34
439 0.35
440 0.32
441 0.29
442 0.28
443 0.29
444 0.25
445 0.19
446 0.19
447 0.18
448 0.24
449 0.31
450 0.33
451 0.33
452 0.33
453 0.35
454 0.36
455 0.39
456 0.39
457 0.38
458 0.42
459 0.41
460 0.46
461 0.45
462 0.47
463 0.46
464 0.41
465 0.39
466 0.4
467 0.44
468 0.4
469 0.4
470 0.38
471 0.37
472 0.36
473 0.4
474 0.4
475 0.43
476 0.47
477 0.49
478 0.55
479 0.54
480 0.51
481 0.46
482 0.44
483 0.4
484 0.35
485 0.34
486 0.3
487 0.28
488 0.29
489 0.26
490 0.21
491 0.17
492 0.16
493 0.21
494 0.26
495 0.32
496 0.38
497 0.44
498 0.5
499 0.55
500 0.64
501 0.68
502 0.68
503 0.69
504 0.72
505 0.73
506 0.75
507 0.72
508 0.66
509 0.58
510 0.49
511 0.44
512 0.34
513 0.28
514 0.2
515 0.2
516 0.15
517 0.13
518 0.13
519 0.13
520 0.13
521 0.12
522 0.14
523 0.14
524 0.17
525 0.18
526 0.17
527 0.17
528 0.18
529 0.23
530 0.27
531 0.27
532 0.25
533 0.26
534 0.29
535 0.3
536 0.35
537 0.34
538 0.3
539 0.31
540 0.29
541 0.33
542 0.31
543 0.32
544 0.29
545 0.28
546 0.3
547 0.34
548 0.41
549 0.42
550 0.48
551 0.52
552 0.59
553 0.57
554 0.62
555 0.59
556 0.53
557 0.53
558 0.49
559 0.46
560 0.39
561 0.37
562 0.28
563 0.31
564 0.31
565 0.27
566 0.27
567 0.24
568 0.22
569 0.25
570 0.26
571 0.24
572 0.25
573 0.26
574 0.28
575 0.31
576 0.3
577 0.27
578 0.3
579 0.27
580 0.28
581 0.28
582 0.3
583 0.29
584 0.31