FuNGI

L0PED5

Protein Details

Accession

L0PED5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
253-276	NESLRKKWKSFPKRSSYNKWQDID	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002755 DNA_primase_S IPR014052 DNA_primase_ssu_euk/arc
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003896 F:DNA primase activity GO:0046872 F:metal ion binding
Pfam	View protein in Pfam PF01896 DNA_primase_S
CDD	cd04860 AE_Prim_S

Amino Acid Sequences

MNLNDDQEFSDPSVIFAFYQRIFPFKWIFYEWLNRSSVPSKAFCNREIAFTLQNDAYLRYNSFPTYEAFRKEVLRLNPSRFEIGPVYNANPRDRKTLRKAMFKPLEKELVFDIDLTDYDDVRTCCFKTDICSKCWCFITAAIKVIDLTLREDFGFQHILWVYSGRRGVHAWVCDKRARELSDQKRKAVSVYLELVRGSTTSGKKVDLKRPLHPSISRSLRILKETFRSDILISQNPWESDEGSEKLLEFITDNESLRKKWKSFPKRSSYNKWQDIDSVAEEGVSKNLDTKALLAAKQDIILEYMYPRLDVEVSKHLNHLLKSPFCVHPGTGRICVPIDHNSLENFDPFKVPTVTQLLHEIDTWDKEREENDGISETSEKHEHISDYEKTSLKPYIEYFKKFVSLIIKEELINKKRQEESNGSITLDF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.16
3	0.17
4	0.2
5	0.16
6	0.22
7	0.22
8	0.24
9	0.25
10	0.29
11	0.32
12	0.29
13	0.32
14	0.3
15	0.32
16	0.34
17	0.43
18	0.42
19	0.42
20	0.42
21	0.38
22	0.39
23	0.39
24	0.39
25	0.34
26	0.33
27	0.34
28	0.4
29	0.44
30	0.41
31	0.45
32	0.41
33	0.4
34	0.41
35	0.38
36	0.35
37	0.31
38	0.34
39	0.26
40	0.27
41	0.24
42	0.23
43	0.22
44	0.19
45	0.2
46	0.18
47	0.2
48	0.19
49	0.19
50	0.18
51	0.18
52	0.23
53	0.27
54	0.29
55	0.29
56	0.31
57	0.32
58	0.34
59	0.39
60	0.37
61	0.41
62	0.43
63	0.47
64	0.5
65	0.5
66	0.5
67	0.43
68	0.41
69	0.35
70	0.31
71	0.3
72	0.26
73	0.27
74	0.28
75	0.31
76	0.33
77	0.35
78	0.36
79	0.41
80	0.43
81	0.49
82	0.54
83	0.61
84	0.63
85	0.68
86	0.7
87	0.71
88	0.77
89	0.74
90	0.69
91	0.63
92	0.64
93	0.53
94	0.5
95	0.4
96	0.34
97	0.28
98	0.24
99	0.19
100	0.12
101	0.12
102	0.12
103	0.11
104	0.08
105	0.08
106	0.12
107	0.11
108	0.13
109	0.15
110	0.14
111	0.16
112	0.17
113	0.17
114	0.19
115	0.29
116	0.31
117	0.32
118	0.4
119	0.39
120	0.42
121	0.43
122	0.39
123	0.3
124	0.31
125	0.33
126	0.28
127	0.29
128	0.25
129	0.24
130	0.22
131	0.21
132	0.18
133	0.12
134	0.12
135	0.09
136	0.1
137	0.1
138	0.1
139	0.1
140	0.11
141	0.13
142	0.1
143	0.13
144	0.12
145	0.13
146	0.13
147	0.14
148	0.13
149	0.14
150	0.17
151	0.13
152	0.15
153	0.14
154	0.18
155	0.2
156	0.23
157	0.25
158	0.26
159	0.3
160	0.31
161	0.32
162	0.32
163	0.33
164	0.33
165	0.34
166	0.41
167	0.48
168	0.56
169	0.58
170	0.57
171	0.54
172	0.51
173	0.44
174	0.38
175	0.29
176	0.21
177	0.22
178	0.21
179	0.2
180	0.19
181	0.18
182	0.14
183	0.13
184	0.1
185	0.11
186	0.11
187	0.14
188	0.15
189	0.17
190	0.23
191	0.29
192	0.36
193	0.4
194	0.42
195	0.46
196	0.53
197	0.54
198	0.53
199	0.48
200	0.43
201	0.42
202	0.44
203	0.38
204	0.32
205	0.34
206	0.31
207	0.32
208	0.31
209	0.26
210	0.26
211	0.27
212	0.27
213	0.22
214	0.22
215	0.19
216	0.21
217	0.22
218	0.19
219	0.18
220	0.18
221	0.19
222	0.18
223	0.19
224	0.15
225	0.13
226	0.11
227	0.14
228	0.13
229	0.12
230	0.12
231	0.11
232	0.11
233	0.1
234	0.09
235	0.06
236	0.06
237	0.09
238	0.1
239	0.11
240	0.14
241	0.15
242	0.16
243	0.22
244	0.26
245	0.26
246	0.32
247	0.42
248	0.5
249	0.6
250	0.69
251	0.72
252	0.77
253	0.83
254	0.85
255	0.85
256	0.85
257	0.82
258	0.73
259	0.64
260	0.56
261	0.49
262	0.42
263	0.32
264	0.22
265	0.14
266	0.13
267	0.12
268	0.11
269	0.1
270	0.07
271	0.06
272	0.08
273	0.09
274	0.09
275	0.09
276	0.1
277	0.14
278	0.16
279	0.17
280	0.15
281	0.17
282	0.17
283	0.18
284	0.17
285	0.12
286	0.11
287	0.1
288	0.09
289	0.08
290	0.1
291	0.09
292	0.09
293	0.08
294	0.08
295	0.09
296	0.09
297	0.12
298	0.19
299	0.22
300	0.23
301	0.24
302	0.27
303	0.29
304	0.29
305	0.32
306	0.3
307	0.29
308	0.31
309	0.35
310	0.33
311	0.32
312	0.33
313	0.27
314	0.26
315	0.31
316	0.31
317	0.3
318	0.29
319	0.28
320	0.27
321	0.27
322	0.25
323	0.24
324	0.24
325	0.22
326	0.23
327	0.22
328	0.24
329	0.24
330	0.23
331	0.19
332	0.16
333	0.17
334	0.16
335	0.19
336	0.18
337	0.18
338	0.2
339	0.24
340	0.24
341	0.24
342	0.28
343	0.26
344	0.25
345	0.25
346	0.22
347	0.19
348	0.22
349	0.23
350	0.2
351	0.19
352	0.2
353	0.2
354	0.23
355	0.25
356	0.22
357	0.21
358	0.21
359	0.21
360	0.21
361	0.22
362	0.18
363	0.18
364	0.19
365	0.18
366	0.17
367	0.2
368	0.2
369	0.21
370	0.26
371	0.27
372	0.3
373	0.35
374	0.35
375	0.33
376	0.36
377	0.38
378	0.33
379	0.32
380	0.31
381	0.36
382	0.42
383	0.46
384	0.45
385	0.44
386	0.46
387	0.42
388	0.42
389	0.4
390	0.35
391	0.35
392	0.35
393	0.34
394	0.31
395	0.39
396	0.45
397	0.41
398	0.46
399	0.45
400	0.49
401	0.55
402	0.59
403	0.6
404	0.58
405	0.6
406	0.6
407	0.58

L0PED5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer