Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L0PDC1

Protein Details
Accession L0PDC1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
87-106NLLISKINTKRKRNNLILSFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 9, pero 3, cyto 2.5, mito 2, E.R. 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023601  Golgi_SNAP_su1  
Gene Ontology GO:0005801  C:cis-Golgi network  
GO:0000139  C:Golgi membrane  
GO:0006888  P:endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport  
GO:0015031  P:protein transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF12352  V-SNARE_C  
Amino Acid Sequences MLDIIYGSNIMMTLTKNNTKKHGNTIEDSESDYFLRESSRLDNSHNMADQILLQASATRDDFQQQKYILDNMNQRLSRTISHIPGINLLISKINTKRKRNNLILSFVISTCIIITYFIM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.25
3 0.31
4 0.34
5 0.4
6 0.46
7 0.49
8 0.54
9 0.58
10 0.54
11 0.52
12 0.55
13 0.52
14 0.45
15 0.45
16 0.35
17 0.27
18 0.22
19 0.2
20 0.14
21 0.11
22 0.11
23 0.09
24 0.1
25 0.12
26 0.17
27 0.17
28 0.2
29 0.24
30 0.25
31 0.27
32 0.25
33 0.22
34 0.17
35 0.16
36 0.13
37 0.1
38 0.08
39 0.05
40 0.05
41 0.05
42 0.06
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.1
48 0.13
49 0.13
50 0.17
51 0.16
52 0.17
53 0.18
54 0.2
55 0.18
56 0.2
57 0.23
58 0.22
59 0.29
60 0.28
61 0.27
62 0.27
63 0.28
64 0.25
65 0.25
66 0.26
67 0.22
68 0.23
69 0.25
70 0.23
71 0.24
72 0.23
73 0.18
74 0.14
75 0.13
76 0.13
77 0.12
78 0.16
79 0.21
80 0.31
81 0.39
82 0.48
83 0.58
84 0.66
85 0.75
86 0.8
87 0.83
88 0.78
89 0.76
90 0.69
91 0.62
92 0.54
93 0.44
94 0.37
95 0.26
96 0.2
97 0.14
98 0.13
99 0.09