Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L0PAT7

Protein Details
Accession L0PAT7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-37DKYGVMKDKKIKIPCSKDNYHydrophilic
411-431CLFGHVKNYYRKKPNRLCFIGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 5.5, cyto_mito 4.5, mito 2.5, pero 2, E.R. 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031777  Sortilin_C  
IPR031778  Sortilin_N  
IPR006581  VPS10  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0046907  P:intracellular transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF15902  Sortilin-Vps10  
PF15901  Sortilin_C  
CDD cd15482  Sialidase_non-viral  
Amino Acid Sequences MFLGLSGYRKIPGNTCDDKYGVMKDKKIKIPCSKDNYSDKIIVKSEDFKGDLINYFYIKSKFNDPNDPNDVNETIIILTSEMEIYISHNQGNEWTQILEKESIISIFQNNYADEEIYLLGFENNAWVSRDRFTEIEKITLPAYSHIGYTNFEFHPDNKNWIIYTGCKEKELLRECEAISYYSIDGGKSSDNDVIKGAPKHIKTLITYNDGGEWVYLTPPEKDSNGDKYCSGKLEKCSLNLHGYTERVDFRNTFSSDKVPGLDFAVGNVGEYLDNYLNSNTFMTKDGGITWKEVQKGPYMWKFGDQGSILLLTKDKYFSDHFYYSLDMGNTWQIVYFPSKESFLVYDITTVYSDTSRKFVLFCIKNKSSSTMTTIYIDFTMLTDKKCELNEEFQDKSDFDIWSFQYPKKSSCLFGHVKNYYRKKPNRLCFIGNSPIKYYISKNCTCEVEDYECDYNYERVSNGTCQLVKGVNPPNHLDECKKYNLIEYYKPTGYRRIPLTTCQGGKELDKDSLPIPCPGKESEYRKLRKSLGGFGLFLIIISPFIIIILSGYCMWALYRDRFL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.43
3 0.44
4 0.41
5 0.42
6 0.39
7 0.42
8 0.44
9 0.42
10 0.46
11 0.52
12 0.6
13 0.66
14 0.71
15 0.73
16 0.73
17 0.77
18 0.8
19 0.8
20 0.77
21 0.77
22 0.78
23 0.74
24 0.69
25 0.67
26 0.6
27 0.57
28 0.53
29 0.47
30 0.41
31 0.41
32 0.39
33 0.36
34 0.34
35 0.29
36 0.29
37 0.28
38 0.28
39 0.25
40 0.23
41 0.19
42 0.19
43 0.24
44 0.24
45 0.24
46 0.25
47 0.31
48 0.37
49 0.42
50 0.51
51 0.49
52 0.56
53 0.61
54 0.59
55 0.51
56 0.47
57 0.42
58 0.32
59 0.29
60 0.21
61 0.14
62 0.12
63 0.11
64 0.07
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.08
72 0.13
73 0.14
74 0.14
75 0.14
76 0.15
77 0.17
78 0.2
79 0.18
80 0.15
81 0.14
82 0.14
83 0.15
84 0.18
85 0.17
86 0.14
87 0.14
88 0.13
89 0.13
90 0.13
91 0.13
92 0.12
93 0.12
94 0.14
95 0.15
96 0.14
97 0.16
98 0.16
99 0.15
100 0.13
101 0.13
102 0.11
103 0.09
104 0.09
105 0.07
106 0.06
107 0.06
108 0.05
109 0.06
110 0.06
111 0.08
112 0.09
113 0.11
114 0.13
115 0.15
116 0.17
117 0.18
118 0.19
119 0.21
120 0.27
121 0.26
122 0.28
123 0.26
124 0.26
125 0.23
126 0.24
127 0.22
128 0.15
129 0.17
130 0.14
131 0.13
132 0.14
133 0.15
134 0.14
135 0.15
136 0.19
137 0.16
138 0.17
139 0.18
140 0.19
141 0.26
142 0.26
143 0.3
144 0.27
145 0.28
146 0.26
147 0.26
148 0.26
149 0.21
150 0.25
151 0.28
152 0.27
153 0.26
154 0.27
155 0.3
156 0.37
157 0.4
158 0.39
159 0.34
160 0.36
161 0.36
162 0.37
163 0.34
164 0.25
165 0.2
166 0.16
167 0.13
168 0.12
169 0.13
170 0.1
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.1
175 0.12
176 0.13
177 0.13
178 0.14
179 0.14
180 0.15
181 0.18
182 0.18
183 0.21
184 0.22
185 0.23
186 0.25
187 0.28
188 0.28
189 0.26
190 0.31
191 0.31
192 0.3
193 0.3
194 0.27
195 0.25
196 0.22
197 0.2
198 0.14
199 0.1
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.08
205 0.09
206 0.11
207 0.11
208 0.13
209 0.16
210 0.25
211 0.26
212 0.26
213 0.25
214 0.27
215 0.28
216 0.28
217 0.28
218 0.23
219 0.24
220 0.3
221 0.31
222 0.31
223 0.32
224 0.31
225 0.32
226 0.28
227 0.27
228 0.21
229 0.21
230 0.19
231 0.19
232 0.18
233 0.16
234 0.17
235 0.15
236 0.16
237 0.22
238 0.22
239 0.22
240 0.21
241 0.22
242 0.22
243 0.22
244 0.21
245 0.14
246 0.13
247 0.13
248 0.13
249 0.1
250 0.08
251 0.09
252 0.08
253 0.07
254 0.07
255 0.06
256 0.04
257 0.05
258 0.06
259 0.05
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.08
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.12
274 0.12
275 0.14
276 0.14
277 0.16
278 0.18
279 0.19
280 0.19
281 0.19
282 0.2
283 0.24
284 0.26
285 0.26
286 0.24
287 0.25
288 0.26
289 0.23
290 0.24
291 0.19
292 0.14
293 0.12
294 0.13
295 0.11
296 0.09
297 0.1
298 0.07
299 0.08
300 0.09
301 0.08
302 0.1
303 0.12
304 0.15
305 0.21
306 0.21
307 0.21
308 0.2
309 0.21
310 0.19
311 0.19
312 0.16
313 0.09
314 0.09
315 0.1
316 0.09
317 0.08
318 0.07
319 0.05
320 0.07
321 0.09
322 0.1
323 0.11
324 0.12
325 0.13
326 0.13
327 0.14
328 0.14
329 0.12
330 0.13
331 0.1
332 0.1
333 0.1
334 0.11
335 0.1
336 0.09
337 0.08
338 0.08
339 0.1
340 0.1
341 0.11
342 0.11
343 0.12
344 0.12
345 0.14
346 0.22
347 0.27
348 0.3
349 0.38
350 0.39
351 0.42
352 0.43
353 0.44
354 0.37
355 0.33
356 0.33
357 0.27
358 0.26
359 0.24
360 0.24
361 0.2
362 0.18
363 0.16
364 0.11
365 0.08
366 0.13
367 0.12
368 0.12
369 0.13
370 0.14
371 0.17
372 0.18
373 0.21
374 0.19
375 0.25
376 0.31
377 0.34
378 0.34
379 0.32
380 0.33
381 0.3
382 0.29
383 0.25
384 0.19
385 0.15
386 0.18
387 0.19
388 0.23
389 0.26
390 0.26
391 0.31
392 0.32
393 0.34
394 0.35
395 0.36
396 0.34
397 0.34
398 0.4
399 0.37
400 0.41
401 0.48
402 0.47
403 0.52
404 0.58
405 0.63
406 0.64
407 0.7
408 0.72
409 0.74
410 0.79
411 0.82
412 0.83
413 0.8
414 0.75
415 0.7
416 0.69
417 0.68
418 0.61
419 0.54
420 0.46
421 0.43
422 0.4
423 0.36
424 0.33
425 0.33
426 0.37
427 0.39
428 0.4
429 0.4
430 0.41
431 0.4
432 0.4
433 0.35
434 0.33
435 0.31
436 0.32
437 0.31
438 0.29
439 0.28
440 0.27
441 0.24
442 0.19
443 0.18
444 0.14
445 0.14
446 0.17
447 0.19
448 0.19
449 0.22
450 0.22
451 0.21
452 0.23
453 0.23
454 0.21
455 0.26
456 0.33
457 0.32
458 0.35
459 0.38
460 0.4
461 0.43
462 0.44
463 0.41
464 0.39
465 0.4
466 0.42
467 0.41
468 0.37
469 0.38
470 0.43
471 0.44
472 0.45
473 0.46
474 0.47
475 0.48
476 0.52
477 0.48
478 0.49
479 0.48
480 0.48
481 0.47
482 0.48
483 0.47
484 0.49
485 0.55
486 0.54
487 0.51
488 0.46
489 0.44
490 0.38
491 0.38
492 0.37
493 0.32
494 0.27
495 0.25
496 0.25
497 0.24
498 0.28
499 0.27
500 0.29
501 0.29
502 0.28
503 0.3
504 0.31
505 0.35
506 0.38
507 0.44
508 0.48
509 0.55
510 0.6
511 0.63
512 0.68
513 0.66
514 0.66
515 0.63
516 0.62
517 0.61
518 0.57
519 0.52
520 0.45
521 0.42
522 0.34
523 0.29
524 0.2
525 0.11
526 0.08
527 0.07
528 0.07
529 0.04
530 0.05
531 0.05
532 0.04
533 0.05
534 0.05
535 0.07
536 0.07
537 0.07
538 0.07
539 0.08
540 0.08
541 0.13
542 0.17