Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L0P9V3

Protein Details
Accession L0P9V3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
467-495HSNTISVKNCKKQKNKNTIEKKENNTNIFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR031766  RRM_occluded  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF16842  RRM_occluded  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12299  RRM4_Prp24  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MENCFSDFSSFITNYDNPNYEEIMIATNKIYNPALIKYQARDFHEIQLSQSNYAYEEFIKYLEWELHQKPQEIELICILFERLLKCYPLSANIWEDYIQFMVEKSTYTKINEKFFQRSIKNYPWSGIPWKYYIYILEHNNYPLQELCAIKDRSISSGTLFHDINEFVKVMEAWCGYCKRRITQWNNNNEEVQYAITELQTSIKLLKNIFKTTDNQKRLEKILISIFTKIGNIDEARKIWKNILKIHTTETKYWLQYFIWERHYGEINNAINILKNASLKHLDFPELVFEIYRDFVIEEGTLELLEKAETIIHKGIKNIQRIKKKVILIFNEYGDVIEVRFPSLRYNSRRRFCYVQMKYPEQALASLSLHGQMFEKKYKLIVNISDSSKKEDRKEASSSEGREIIISNISHESTENDLIDLFSKYGTLESVRLINDRNSKHHKGFCYIIYSTAEQALSALDADKQELHSNTISVKNCKKQKNKNTIEKKENNTNIFSSEDLNPEKKNSHGLRFHDIKNRSLGILYLPDTVNQTRIEDVFKAYGDIDKIELRPDHQGAIVQYKNTSDAGKAAMALDGYAFSDKKIRIVTVETLLQHKPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.32
3 0.33
4 0.29
5 0.31
6 0.32
7 0.26
8 0.25
9 0.21
10 0.2
11 0.18
12 0.17
13 0.15
14 0.17
15 0.17
16 0.19
17 0.19
18 0.17
19 0.19
20 0.21
21 0.25
22 0.27
23 0.3
24 0.31
25 0.38
26 0.43
27 0.45
28 0.48
29 0.46
30 0.48
31 0.52
32 0.48
33 0.43
34 0.45
35 0.42
36 0.36
37 0.35
38 0.28
39 0.22
40 0.22
41 0.21
42 0.14
43 0.15
44 0.14
45 0.13
46 0.14
47 0.13
48 0.15
49 0.16
50 0.17
51 0.22
52 0.25
53 0.33
54 0.36
55 0.38
56 0.37
57 0.38
58 0.41
59 0.35
60 0.34
61 0.29
62 0.25
63 0.22
64 0.21
65 0.18
66 0.13
67 0.14
68 0.14
69 0.14
70 0.15
71 0.17
72 0.17
73 0.2
74 0.21
75 0.22
76 0.24
77 0.25
78 0.26
79 0.25
80 0.26
81 0.23
82 0.22
83 0.19
84 0.16
85 0.13
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.11
92 0.14
93 0.17
94 0.2
95 0.28
96 0.32
97 0.39
98 0.44
99 0.47
100 0.5
101 0.52
102 0.58
103 0.53
104 0.55
105 0.56
106 0.58
107 0.59
108 0.54
109 0.5
110 0.44
111 0.45
112 0.45
113 0.41
114 0.35
115 0.31
116 0.31
117 0.31
118 0.29
119 0.26
120 0.24
121 0.26
122 0.27
123 0.28
124 0.28
125 0.28
126 0.29
127 0.27
128 0.24
129 0.18
130 0.16
131 0.17
132 0.16
133 0.16
134 0.23
135 0.24
136 0.23
137 0.26
138 0.26
139 0.24
140 0.26
141 0.24
142 0.17
143 0.21
144 0.23
145 0.22
146 0.21
147 0.19
148 0.19
149 0.19
150 0.18
151 0.14
152 0.12
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.08
157 0.1
158 0.1
159 0.09
160 0.13
161 0.17
162 0.18
163 0.24
164 0.27
165 0.27
166 0.35
167 0.45
168 0.51
169 0.58
170 0.65
171 0.7
172 0.72
173 0.71
174 0.63
175 0.53
176 0.43
177 0.33
178 0.24
179 0.14
180 0.09
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.1
189 0.12
190 0.15
191 0.16
192 0.21
193 0.24
194 0.27
195 0.29
196 0.28
197 0.3
198 0.38
199 0.47
200 0.46
201 0.46
202 0.47
203 0.47
204 0.47
205 0.47
206 0.37
207 0.3
208 0.3
209 0.29
210 0.27
211 0.24
212 0.22
213 0.19
214 0.18
215 0.15
216 0.11
217 0.1
218 0.1
219 0.11
220 0.13
221 0.14
222 0.18
223 0.2
224 0.2
225 0.23
226 0.25
227 0.27
228 0.32
229 0.37
230 0.35
231 0.35
232 0.38
233 0.41
234 0.4
235 0.37
236 0.35
237 0.34
238 0.31
239 0.31
240 0.28
241 0.2
242 0.23
243 0.27
244 0.26
245 0.26
246 0.26
247 0.26
248 0.26
249 0.29
250 0.24
251 0.2
252 0.23
253 0.19
254 0.18
255 0.18
256 0.15
257 0.13
258 0.13
259 0.13
260 0.08
261 0.08
262 0.09
263 0.1
264 0.13
265 0.13
266 0.15
267 0.16
268 0.15
269 0.14
270 0.14
271 0.14
272 0.12
273 0.11
274 0.09
275 0.08
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.05
280 0.04
281 0.04
282 0.05
283 0.05
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.03
293 0.03
294 0.04
295 0.04
296 0.06
297 0.09
298 0.12
299 0.12
300 0.13
301 0.21
302 0.25
303 0.33
304 0.4
305 0.45
306 0.51
307 0.54
308 0.58
309 0.57
310 0.56
311 0.53
312 0.51
313 0.48
314 0.45
315 0.44
316 0.39
317 0.33
318 0.28
319 0.23
320 0.17
321 0.13
322 0.07
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.07
327 0.08
328 0.1
329 0.15
330 0.22
331 0.28
332 0.39
333 0.47
334 0.52
335 0.55
336 0.57
337 0.57
338 0.57
339 0.61
340 0.56
341 0.56
342 0.56
343 0.56
344 0.52
345 0.48
346 0.42
347 0.31
348 0.26
349 0.18
350 0.14
351 0.11
352 0.1
353 0.09
354 0.1
355 0.1
356 0.1
357 0.1
358 0.11
359 0.14
360 0.17
361 0.18
362 0.16
363 0.19
364 0.21
365 0.23
366 0.23
367 0.23
368 0.25
369 0.29
370 0.32
371 0.35
372 0.34
373 0.37
374 0.39
375 0.39
376 0.37
377 0.41
378 0.41
379 0.41
380 0.44
381 0.4
382 0.42
383 0.43
384 0.41
385 0.36
386 0.33
387 0.28
388 0.24
389 0.23
390 0.17
391 0.16
392 0.13
393 0.13
394 0.12
395 0.13
396 0.12
397 0.12
398 0.13
399 0.13
400 0.15
401 0.13
402 0.12
403 0.12
404 0.12
405 0.13
406 0.12
407 0.08
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.07
412 0.07
413 0.07
414 0.08
415 0.09
416 0.12
417 0.13
418 0.14
419 0.15
420 0.2
421 0.27
422 0.29
423 0.35
424 0.41
425 0.47
426 0.52
427 0.56
428 0.54
429 0.51
430 0.51
431 0.46
432 0.43
433 0.37
434 0.34
435 0.31
436 0.29
437 0.25
438 0.23
439 0.2
440 0.14
441 0.13
442 0.11
443 0.08
444 0.07
445 0.07
446 0.06
447 0.07
448 0.08
449 0.08
450 0.1
451 0.14
452 0.15
453 0.18
454 0.17
455 0.17
456 0.2
457 0.26
458 0.28
459 0.31
460 0.38
461 0.44
462 0.52
463 0.61
464 0.68
465 0.72
466 0.79
467 0.83
468 0.86
469 0.89
470 0.91
471 0.91
472 0.92
473 0.9
474 0.86
475 0.85
476 0.82
477 0.74
478 0.67
479 0.58
480 0.49
481 0.41
482 0.35
483 0.28
484 0.23
485 0.24
486 0.25
487 0.27
488 0.26
489 0.27
490 0.28
491 0.26
492 0.34
493 0.34
494 0.39
495 0.44
496 0.47
497 0.54
498 0.58
499 0.63
500 0.62
501 0.6
502 0.54
503 0.53
504 0.49
505 0.41
506 0.35
507 0.29
508 0.23
509 0.24
510 0.22
511 0.2
512 0.19
513 0.19
514 0.23
515 0.23
516 0.23
517 0.2
518 0.2
519 0.19
520 0.2
521 0.22
522 0.19
523 0.21
524 0.2
525 0.2
526 0.19
527 0.18
528 0.19
529 0.17
530 0.17
531 0.16
532 0.18
533 0.18
534 0.22
535 0.22
536 0.22
537 0.28
538 0.28
539 0.27
540 0.24
541 0.28
542 0.25
543 0.33
544 0.33
545 0.28
546 0.27
547 0.27
548 0.28
549 0.26
550 0.24
551 0.16
552 0.16
553 0.17
554 0.17
555 0.16
556 0.15
557 0.14
558 0.13
559 0.12
560 0.1
561 0.08
562 0.09
563 0.11
564 0.11
565 0.1
566 0.17
567 0.18
568 0.22
569 0.25
570 0.25
571 0.25
572 0.3
573 0.34
574 0.32
575 0.36
576 0.33
577 0.35