Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L0PH34

Protein Details
Accession L0PH34    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
244-268EQLAKISKKKAEKDRLEKERVRNMSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
248-258KISKKKAEKDR
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 9, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012879  CCDC47  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0032469  P:endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis  
Pfam View protein in Pfam  
PF07946  CCDC47  
Amino Acid Sequences MVRLYPLFSAQFAQVGIKKNDSVRLHNWNPARFISYATGRIYIDYAHIQFIMPMRQNVLSLLKCALKAFFADEPIARDRLYVDMVISDDAFDDFVFAVVNKAIMRWLREKYYHLSFTRVLETPILPETYVVMSESPEIMSALLENDAFIQCITASEFELEYFIVSDQPSKRPKSPDQKYRKTVSFCIRLPLLLHLDRVVSIVTQCITFVDFLADRAHWRSNISQKLKAAREEVNRKLRKLQDEEQLAKISKKKAEKDRLEKERVRNMSFQEQRKIEMLRCKCYKIFKILKHTIITVALL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.26
3 0.28
4 0.29
5 0.32
6 0.33
7 0.41
8 0.41
9 0.43
10 0.43
11 0.5
12 0.51
13 0.55
14 0.59
15 0.54
16 0.53
17 0.48
18 0.45
19 0.35
20 0.35
21 0.33
22 0.31
23 0.31
24 0.3
25 0.3
26 0.27
27 0.27
28 0.24
29 0.19
30 0.18
31 0.17
32 0.16
33 0.15
34 0.15
35 0.14
36 0.15
37 0.17
38 0.21
39 0.19
40 0.19
41 0.2
42 0.21
43 0.21
44 0.22
45 0.25
46 0.2
47 0.19
48 0.21
49 0.2
50 0.2
51 0.2
52 0.18
53 0.13
54 0.13
55 0.15
56 0.14
57 0.14
58 0.15
59 0.15
60 0.18
61 0.2
62 0.21
63 0.17
64 0.16
65 0.15
66 0.15
67 0.16
68 0.12
69 0.09
70 0.09
71 0.1
72 0.1
73 0.09
74 0.07
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.05
79 0.05
80 0.04
81 0.04
82 0.05
83 0.04
84 0.05
85 0.05
86 0.06
87 0.05
88 0.05
89 0.08
90 0.09
91 0.13
92 0.17
93 0.19
94 0.22
95 0.25
96 0.28
97 0.3
98 0.35
99 0.38
100 0.34
101 0.35
102 0.33
103 0.33
104 0.33
105 0.29
106 0.23
107 0.18
108 0.17
109 0.15
110 0.15
111 0.13
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.08
116 0.08
117 0.07
118 0.05
119 0.05
120 0.06
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.05
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.05
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.04
150 0.05
151 0.05
152 0.09
153 0.1
154 0.17
155 0.23
156 0.26
157 0.3
158 0.36
159 0.45
160 0.52
161 0.6
162 0.64
163 0.69
164 0.76
165 0.78
166 0.78
167 0.75
168 0.68
169 0.65
170 0.63
171 0.6
172 0.51
173 0.48
174 0.42
175 0.36
176 0.33
177 0.29
178 0.26
179 0.19
180 0.18
181 0.15
182 0.15
183 0.15
184 0.14
185 0.11
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.08
197 0.07
198 0.09
199 0.1
200 0.1
201 0.11
202 0.14
203 0.17
204 0.15
205 0.17
206 0.22
207 0.29
208 0.39
209 0.42
210 0.44
211 0.46
212 0.54
213 0.55
214 0.52
215 0.47
216 0.45
217 0.5
218 0.53
219 0.58
220 0.6
221 0.61
222 0.6
223 0.64
224 0.63
225 0.62
226 0.61
227 0.59
228 0.57
229 0.61
230 0.63
231 0.58
232 0.56
233 0.49
234 0.45
235 0.44
236 0.41
237 0.39
238 0.43
239 0.49
240 0.55
241 0.65
242 0.71
243 0.77
244 0.82
245 0.85
246 0.87
247 0.85
248 0.83
249 0.82
250 0.78
251 0.72
252 0.65
253 0.62
254 0.63
255 0.64
256 0.62
257 0.61
258 0.56
259 0.55
260 0.54
261 0.52
262 0.47
263 0.49
264 0.49
265 0.5
266 0.53
267 0.55
268 0.55
269 0.61
270 0.61
271 0.62
272 0.66
273 0.64
274 0.7
275 0.74
276 0.76
277 0.69
278 0.64
279 0.56