Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L0P948

Protein Details
Accession L0P948    Localization Confidence High Confidence Score 19.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MIHSKFVSFKRRKSKEKALNGDKKILNHydrophilic
289-308GRKLRVIRAKNIPKNRSRSEHydrophilic
322-348NKDISKKYIQHNIRKKHFDKNNYTKLVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-16RRKSKE
298-304KNIPKNR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.5, mito 4, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034777  Nop12_RRM1  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR047189  RRM2_Nop12p-like  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12669  RRM1_Nop12p_like  
cd12670  RRM2_Nop12p_like  
Amino Acid Sequences MIHSKFVSFKRRKSKEKALNGDKKILNDIFMENDYLNFDDTKNIKKRRYKESLEDYSIEEKYFEKLLKDENEEETNNIKKRKLENNIFKSNSNAENNASEKHDLDPKDDFEKALCTIFVGNLPISVVSSKSVYKNFKTKFLEFGKIKSIRFRSIAFSTFLPKKIAYIQKKFHTKRDLLNAYIVYETQESSKNALALNGVVFLDRHLRVDSVAYPAPHVPKRSIFIGNLSFDAQEEQLWSYFAHCGEIEFVRIVRDNKTNLGKGFAYVQFKDRESIDQALLLHDKEGLCGRKLRVIRAKNIPKNRSRSEYKEKNKILNTENLNKDISKKYIQHNIRKKHFDKNNYTKLVEKNMVFEGKRASKNHK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.86
3 0.89
4 0.9
5 0.9
6 0.9
7 0.85
8 0.84
9 0.76
10 0.67
11 0.63
12 0.53
13 0.43
14 0.35
15 0.32
16 0.26
17 0.25
18 0.24
19 0.17
20 0.17
21 0.17
22 0.16
23 0.15
24 0.13
25 0.12
26 0.17
27 0.2
28 0.29
29 0.37
30 0.44
31 0.52
32 0.6
33 0.68
34 0.71
35 0.79
36 0.77
37 0.78
38 0.8
39 0.8
40 0.76
41 0.7
42 0.62
43 0.57
44 0.5
45 0.4
46 0.3
47 0.22
48 0.19
49 0.21
50 0.19
51 0.15
52 0.16
53 0.23
54 0.27
55 0.32
56 0.32
57 0.33
58 0.36
59 0.35
60 0.36
61 0.34
62 0.36
63 0.36
64 0.37
65 0.35
66 0.37
67 0.45
68 0.52
69 0.58
70 0.61
71 0.67
72 0.73
73 0.8
74 0.76
75 0.69
76 0.62
77 0.56
78 0.52
79 0.44
80 0.37
81 0.29
82 0.3
83 0.31
84 0.29
85 0.27
86 0.22
87 0.2
88 0.21
89 0.25
90 0.22
91 0.23
92 0.24
93 0.25
94 0.27
95 0.26
96 0.24
97 0.19
98 0.21
99 0.19
100 0.16
101 0.13
102 0.1
103 0.1
104 0.1
105 0.1
106 0.09
107 0.08
108 0.07
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.07
116 0.09
117 0.12
118 0.19
119 0.23
120 0.26
121 0.35
122 0.36
123 0.44
124 0.48
125 0.46
126 0.48
127 0.48
128 0.53
129 0.45
130 0.45
131 0.45
132 0.43
133 0.43
134 0.41
135 0.4
136 0.35
137 0.36
138 0.35
139 0.31
140 0.3
141 0.32
142 0.26
143 0.23
144 0.25
145 0.26
146 0.26
147 0.23
148 0.19
149 0.19
150 0.24
151 0.32
152 0.35
153 0.39
154 0.44
155 0.49
156 0.6
157 0.62
158 0.62
159 0.6
160 0.55
161 0.53
162 0.57
163 0.53
164 0.43
165 0.44
166 0.36
167 0.3
168 0.27
169 0.22
170 0.13
171 0.1
172 0.09
173 0.08
174 0.1
175 0.1
176 0.12
177 0.13
178 0.12
179 0.12
180 0.12
181 0.11
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.09
190 0.09
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.12
196 0.12
197 0.12
198 0.14
199 0.13
200 0.13
201 0.15
202 0.2
203 0.21
204 0.22
205 0.2
206 0.21
207 0.24
208 0.26
209 0.27
210 0.23
211 0.25
212 0.27
213 0.25
214 0.24
215 0.22
216 0.18
217 0.15
218 0.16
219 0.12
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.1
228 0.09
229 0.1
230 0.09
231 0.09
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.14
239 0.14
240 0.16
241 0.2
242 0.21
243 0.26
244 0.32
245 0.34
246 0.31
247 0.34
248 0.3
249 0.26
250 0.29
251 0.28
252 0.27
253 0.25
254 0.28
255 0.28
256 0.28
257 0.3
258 0.26
259 0.25
260 0.24
261 0.26
262 0.22
263 0.21
264 0.21
265 0.21
266 0.22
267 0.18
268 0.14
269 0.14
270 0.13
271 0.12
272 0.18
273 0.18
274 0.19
275 0.24
276 0.25
277 0.29
278 0.32
279 0.39
280 0.43
281 0.46
282 0.53
283 0.59
284 0.68
285 0.71
286 0.79
287 0.79
288 0.78
289 0.81
290 0.79
291 0.77
292 0.74
293 0.74
294 0.74
295 0.77
296 0.77
297 0.79
298 0.78
299 0.78
300 0.76
301 0.74
302 0.67
303 0.65
304 0.63
305 0.62
306 0.6
307 0.55
308 0.51
309 0.45
310 0.45
311 0.42
312 0.39
313 0.37
314 0.39
315 0.43
316 0.52
317 0.6
318 0.66
319 0.71
320 0.76
321 0.79
322 0.84
323 0.8
324 0.8
325 0.81
326 0.8
327 0.82
328 0.82
329 0.82
330 0.78
331 0.77
332 0.72
333 0.69
334 0.67
335 0.62
336 0.52
337 0.45
338 0.45
339 0.5
340 0.43
341 0.41
342 0.41
343 0.43
344 0.49