Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L0PCJ6

Protein Details
Accession L0PCJ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-30MQITSKRKRDQKAQKLSKSTKKTCIRNSIDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036882  Alba-like_dom_sf  
IPR014612  Pop7/Rpp20  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004526  F:ribonuclease P activity  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
Pfam View protein in Pfam  
PF12328  Rpp20  
Amino Acid Sequences MQITSKRKRDQKAQKLSKSTKKTCIRNSIDTPTKRAVLHVLDASIRKRTIPHPINTLNKMFISRKTLLMSIIKKMRHKLISEPKGKPIILYAQSAAIERALEAALILSYQIPLNIQVETGTIEVVDDVLPYDLDKMITSQVRLNSTVKVIISFANLSLFCIKKQHSL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.88
3 0.9
4 0.89
5 0.88
6 0.84
7 0.83
8 0.82
9 0.82
10 0.8
11 0.82
12 0.78
13 0.76
14 0.76
15 0.75
16 0.75
17 0.68
18 0.64
19 0.57
20 0.53
21 0.44
22 0.39
23 0.34
24 0.27
25 0.28
26 0.24
27 0.21
28 0.2
29 0.22
30 0.23
31 0.22
32 0.2
33 0.17
34 0.19
35 0.2
36 0.29
37 0.34
38 0.36
39 0.4
40 0.47
41 0.52
42 0.53
43 0.52
44 0.43
45 0.36
46 0.36
47 0.3
48 0.25
49 0.26
50 0.24
51 0.24
52 0.24
53 0.24
54 0.23
55 0.27
56 0.26
57 0.25
58 0.28
59 0.29
60 0.3
61 0.32
62 0.36
63 0.34
64 0.34
65 0.38
66 0.44
67 0.49
68 0.54
69 0.53
70 0.51
71 0.51
72 0.5
73 0.4
74 0.31
75 0.27
76 0.21
77 0.21
78 0.17
79 0.15
80 0.16
81 0.16
82 0.14
83 0.09
84 0.07
85 0.06
86 0.06
87 0.05
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.03
92 0.03
93 0.03
94 0.03
95 0.03
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.05
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.08
106 0.07
107 0.06
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.03
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.05
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.12
124 0.14
125 0.15
126 0.18
127 0.22
128 0.24
129 0.27
130 0.27
131 0.25
132 0.25
133 0.26
134 0.23
135 0.19
136 0.17
137 0.16
138 0.17
139 0.15
140 0.14
141 0.15
142 0.15
143 0.16
144 0.21
145 0.22
146 0.2
147 0.25