FuNGI

L0PBP6

Protein Details

Accession

L0PBP6

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
293-319	GSLSTKARNMRKKRTKKLLRFKQQGIL	Hydrophilic
485-505	LKLELAKRDRKEKKIDPETGE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
296-312	STKARNMRKKRTKKLLR

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 10.5, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024822 Coilin

Amino Acid Sequences

MRIRLATIHPLPPFKCWHFIPTLSDSITIQHLIEDVIETFSLEVKPCQLSLELDGFYLPLKAPICKILRENDLIILKQTGDSFNEKSIVHFVSEKYLSIPNDHLVETNYKNDNEAKNDIDLLKNNEYVSTINNTVKRDHDLAQKIVQGCNLKRKLQYLENENESIKKNNLINFDTLENEITLNAGKKIQISKKKISPIELNSQSSASSSSTKSSTKSSSLSTSSTSATLSSLLSVSSTSAMSSSLSLASSTSESSSISEKDSSDSSTTSRSTSKINQIPLDNKNQKRAPPGQGSLSTKARNMRKKRTKKLLRFKQQGILPDSATFADLLQIEERINKNQNKDIEIKPLKKYIKNKSKGFISKIGNTQNIHIKFDNDGKTILNNKINEKNWEDRCIVKEIECEIPNVPIQDISITPNKNKELLNKISPDRMPPLPENIETLTLLTEPPPIGSIVAFKHLSMNNNYEPILSDYKTAIIIDNSPPNILKLELAKRDRKEKKIDPETGEYIYGKFGVDTDIEQNGQLILAWEDLVSPVLLQKM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.44
2	0.47
3	0.42
4	0.44
5	0.43
6	0.45
7	0.47
8	0.44
9	0.45
10	0.39
11	0.38
12	0.32
13	0.29
14	0.28
15	0.22
16	0.17
17	0.13
18	0.12
19	0.11
20	0.11
21	0.1
22	0.09
23	0.09
24	0.09
25	0.08
26	0.08
27	0.1
28	0.12
29	0.12
30	0.12
31	0.14
32	0.16
33	0.16
34	0.17
35	0.17
36	0.17
37	0.2
38	0.23
39	0.2
40	0.18
41	0.18
42	0.17
43	0.15
44	0.14
45	0.1
46	0.11
47	0.12
48	0.13
49	0.15
50	0.23
51	0.26
52	0.29
53	0.33
54	0.34
55	0.39
56	0.41
57	0.4
58	0.38
59	0.39
60	0.35
61	0.33
62	0.27
63	0.22
64	0.2
65	0.2
66	0.16
67	0.16
68	0.2
69	0.2
70	0.21
71	0.24
72	0.23
73	0.23
74	0.25
75	0.23
76	0.2
77	0.21
78	0.19
79	0.23
80	0.24
81	0.22
82	0.21
83	0.25
84	0.24
85	0.24
86	0.25
87	0.21
88	0.22
89	0.22
90	0.21
91	0.18
92	0.23
93	0.22
94	0.26
95	0.28
96	0.26
97	0.28
98	0.33
99	0.34
100	0.34
101	0.35
102	0.31
103	0.28
104	0.3
105	0.29
106	0.26
107	0.26
108	0.27
109	0.27
110	0.26
111	0.25
112	0.23
113	0.23
114	0.21
115	0.19
116	0.18
117	0.18
118	0.21
119	0.25
120	0.26
121	0.27
122	0.29
123	0.31
124	0.3
125	0.31
126	0.35
127	0.36
128	0.38
129	0.39
130	0.41
131	0.38
132	0.35
133	0.35
134	0.32
135	0.3
136	0.37
137	0.39
138	0.39
139	0.4
140	0.44
141	0.46
142	0.46
143	0.5
144	0.47
145	0.49
146	0.48
147	0.48
148	0.44
149	0.41
150	0.37
151	0.33
152	0.26
153	0.25
154	0.24
155	0.26
156	0.31
157	0.29
158	0.29
159	0.27
160	0.27
161	0.24
162	0.21
163	0.18
164	0.13
165	0.11
166	0.09
167	0.08
168	0.08
169	0.08
170	0.08
171	0.08
172	0.08
173	0.11
174	0.18
175	0.26
176	0.34
177	0.4
178	0.47
179	0.52
180	0.6
181	0.59
182	0.57
183	0.56
184	0.52
185	0.55
186	0.53
187	0.49
188	0.41
189	0.39
190	0.34
191	0.27
192	0.24
193	0.15
194	0.13
195	0.11
196	0.13
197	0.15
198	0.16
199	0.17
200	0.19
201	0.21
202	0.21
203	0.22
204	0.22
205	0.23
206	0.24
207	0.24
208	0.22
209	0.21
210	0.19
211	0.17
212	0.15
213	0.12
214	0.1
215	0.1
216	0.08
217	0.07
218	0.06
219	0.05
220	0.05
221	0.05
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.05
226	0.05
227	0.05
228	0.05
229	0.05
230	0.06
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.07
242	0.09
243	0.09
244	0.09
245	0.1
246	0.1
247	0.11
248	0.12
249	0.12
250	0.11
251	0.11
252	0.11
253	0.12
254	0.13
255	0.13
256	0.14
257	0.13
258	0.16
259	0.19
260	0.27
261	0.29
262	0.31
263	0.32
264	0.33
265	0.38
266	0.38
267	0.44
268	0.44
269	0.41
270	0.46
271	0.46
272	0.46
273	0.47
274	0.5
275	0.47
276	0.44
277	0.44
278	0.4
279	0.43
280	0.44
281	0.42
282	0.4
283	0.34
284	0.3
285	0.35
286	0.39
287	0.43
288	0.48
289	0.55
290	0.62
291	0.72
292	0.79
293	0.84
294	0.87
295	0.89
296	0.92
297	0.91
298	0.91
299	0.88
300	0.81
301	0.77
302	0.68
303	0.64
304	0.57
305	0.47
306	0.37
307	0.29
308	0.27
309	0.2
310	0.18
311	0.12
312	0.07
313	0.08
314	0.07
315	0.08
316	0.07
317	0.08
318	0.08
319	0.12
320	0.13
321	0.16
322	0.23
323	0.25
324	0.28
325	0.33
326	0.35
327	0.35
328	0.39
329	0.37
330	0.41
331	0.45
332	0.46
333	0.44
334	0.49
335	0.5
336	0.51
337	0.58
338	0.58
339	0.62
340	0.66
341	0.68
342	0.66
343	0.7
344	0.7
345	0.66
346	0.64
347	0.58
348	0.54
349	0.55
350	0.55
351	0.5
352	0.44
353	0.42
354	0.42
355	0.39
356	0.38
357	0.32
358	0.28
359	0.26
360	0.32
361	0.33
362	0.26
363	0.25
364	0.22
365	0.25
366	0.29
367	0.31
368	0.3
369	0.29
370	0.33
371	0.4
372	0.42
373	0.43
374	0.43
375	0.47
376	0.45
377	0.48
378	0.44
379	0.4
380	0.4
381	0.39
382	0.35
383	0.28
384	0.27
385	0.25
386	0.3
387	0.27
388	0.26
389	0.22
390	0.23
391	0.22
392	0.2
393	0.18
394	0.11
395	0.11
396	0.11
397	0.11
398	0.13
399	0.18
400	0.19
401	0.21
402	0.27
403	0.28
404	0.3
405	0.32
406	0.36
407	0.38
408	0.42
409	0.46
410	0.47
411	0.48
412	0.51
413	0.5
414	0.46
415	0.43
416	0.39
417	0.38
418	0.34
419	0.38
420	0.36
421	0.35
422	0.35
423	0.31
424	0.3
425	0.25
426	0.23
427	0.16
428	0.13
429	0.12
430	0.1
431	0.11
432	0.09
433	0.09
434	0.1
435	0.09
436	0.09
437	0.09
438	0.12
439	0.11
440	0.16
441	0.16
442	0.16
443	0.21
444	0.24
445	0.28
446	0.29
447	0.34
448	0.31
449	0.33
450	0.33
451	0.27
452	0.27
453	0.27
454	0.27
455	0.22
456	0.21
457	0.19
458	0.2
459	0.21
460	0.19
461	0.16
462	0.13
463	0.15
464	0.18
465	0.24
466	0.24
467	0.24
468	0.24
469	0.23
470	0.23
471	0.21
472	0.19
473	0.2
474	0.28
475	0.35
476	0.43
477	0.5
478	0.54
479	0.64
480	0.71
481	0.72
482	0.74
483	0.74
484	0.78
485	0.8
486	0.83
487	0.79
488	0.77
489	0.73
490	0.65
491	0.58
492	0.47
493	0.38
494	0.3
495	0.24
496	0.17
497	0.13
498	0.11
499	0.11
500	0.11
501	0.12
502	0.14
503	0.17
504	0.17
505	0.17
506	0.17
507	0.15
508	0.14
509	0.12
510	0.1
511	0.08
512	0.08
513	0.08
514	0.07
515	0.08
516	0.08
517	0.09
518	0.07
519	0.06

L0PBP6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer