Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L0PFW9

Protein Details
Accession L0PFW9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
122-141EFEEHKKRRLEKKEQLKSTQBasic
149-169ASTTKKNTSKKTQKQNTIPDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
127-134KKRRLEKK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 10.666, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR002699  V_ATPase_D  
Gene Ontology GO:0046961  F:proton-transporting ATPase activity, rotational mechanism  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01813  ATP-synt_D  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12246  RRM1_U1A_like  
cd12247  RRM2_U1A_like  
Amino Acid Sequences MEHESEPPLPKNKKTPVIPTELSVLPPSETIYIRNLSEKVKIDILKKSLEAVFSSYGTILDIIAHKNIRMRGQAFVVFDSIDSAQKAIADVQAFTLFDKPMVLQYSKTKSDATVKRLGTHEEFEEHKKRRLEKKEQLKSTQPKTKQINASTTKKNTSKKTQKQNTIPDEHLPPHKILFLQKLPENITAEVLSAVFNRFSGFKEVRMVPGRPGIAFVEYETNDDAVIAKHGTVGMALGGTVISLKGATTGHSLLKRKSEALTKQFRTIIKSIDDTKMEMGRTMQLAAFSLAEMSYVTGDEVKYQILESARTSSCRLKTKHENISGVFLPVYECVINNENGLYSFTLYYTRLKHRLDHRLIGLGKGGQQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.72
3 0.69
4 0.72
5 0.67
6 0.59
7 0.55
8 0.47
9 0.42
10 0.33
11 0.28
12 0.19
13 0.18
14 0.18
15 0.16
16 0.16
17 0.16
18 0.19
19 0.21
20 0.21
21 0.25
22 0.26
23 0.25
24 0.31
25 0.32
26 0.31
27 0.34
28 0.38
29 0.38
30 0.42
31 0.43
32 0.4
33 0.37
34 0.37
35 0.32
36 0.3
37 0.27
38 0.23
39 0.22
40 0.19
41 0.2
42 0.16
43 0.14
44 0.13
45 0.12
46 0.08
47 0.08
48 0.09
49 0.1
50 0.14
51 0.14
52 0.15
53 0.19
54 0.22
55 0.25
56 0.29
57 0.29
58 0.28
59 0.31
60 0.34
61 0.3
62 0.28
63 0.25
64 0.19
65 0.17
66 0.16
67 0.14
68 0.11
69 0.1
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.1
74 0.09
75 0.1
76 0.09
77 0.09
78 0.11
79 0.12
80 0.12
81 0.12
82 0.13
83 0.11
84 0.1
85 0.1
86 0.09
87 0.12
88 0.15
89 0.15
90 0.15
91 0.23
92 0.29
93 0.31
94 0.32
95 0.29
96 0.28
97 0.37
98 0.41
99 0.4
100 0.42
101 0.4
102 0.43
103 0.44
104 0.45
105 0.38
106 0.33
107 0.29
108 0.23
109 0.25
110 0.28
111 0.35
112 0.35
113 0.39
114 0.42
115 0.48
116 0.55
117 0.63
118 0.67
119 0.68
120 0.76
121 0.79
122 0.8
123 0.77
124 0.77
125 0.76
126 0.74
127 0.73
128 0.65
129 0.64
130 0.64
131 0.66
132 0.64
133 0.6
134 0.6
135 0.59
136 0.62
137 0.6
138 0.58
139 0.57
140 0.56
141 0.58
142 0.55
143 0.59
144 0.63
145 0.65
146 0.73
147 0.76
148 0.78
149 0.8
150 0.83
151 0.79
152 0.73
153 0.65
154 0.56
155 0.5
156 0.43
157 0.39
158 0.3
159 0.24
160 0.2
161 0.19
162 0.18
163 0.17
164 0.2
165 0.19
166 0.2
167 0.21
168 0.23
169 0.25
170 0.26
171 0.25
172 0.2
173 0.18
174 0.15
175 0.14
176 0.11
177 0.09
178 0.07
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.06
185 0.07
186 0.13
187 0.13
188 0.14
189 0.19
190 0.19
191 0.24
192 0.27
193 0.27
194 0.22
195 0.25
196 0.25
197 0.2
198 0.21
199 0.16
200 0.13
201 0.13
202 0.12
203 0.12
204 0.12
205 0.13
206 0.12
207 0.11
208 0.1
209 0.1
210 0.1
211 0.06
212 0.07
213 0.06
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.04
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.02
228 0.02
229 0.02
230 0.02
231 0.04
232 0.04
233 0.06
234 0.08
235 0.1
236 0.14
237 0.19
238 0.23
239 0.24
240 0.29
241 0.3
242 0.29
243 0.31
244 0.35
245 0.38
246 0.44
247 0.52
248 0.49
249 0.52
250 0.55
251 0.53
252 0.51
253 0.45
254 0.39
255 0.32
256 0.34
257 0.33
258 0.33
259 0.32
260 0.28
261 0.28
262 0.27
263 0.24
264 0.21
265 0.19
266 0.17
267 0.16
268 0.16
269 0.14
270 0.11
271 0.12
272 0.12
273 0.11
274 0.08
275 0.08
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.11
291 0.11
292 0.13
293 0.14
294 0.19
295 0.2
296 0.22
297 0.26
298 0.3
299 0.36
300 0.43
301 0.44
302 0.47
303 0.57
304 0.65
305 0.71
306 0.71
307 0.69
308 0.62
309 0.65
310 0.57
311 0.47
312 0.37
313 0.27
314 0.21
315 0.16
316 0.17
317 0.11
318 0.1
319 0.13
320 0.16
321 0.17
322 0.16
323 0.16
324 0.15
325 0.15
326 0.17
327 0.13
328 0.12
329 0.12
330 0.12
331 0.14
332 0.15
333 0.19
334 0.24
335 0.32
336 0.39
337 0.41
338 0.48
339 0.55
340 0.65
341 0.67
342 0.68
343 0.62
344 0.63
345 0.62
346 0.55
347 0.49