FuNGI

L0PBD2

Protein Details

Accession

L0PBD2

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
877-899	NLAKLDSARQKRKEEQERKQAEA	Hydrophilic
944-977	KDKDSDDQGKSKKKNKQKKKKQKKLENEDSEIST	Basic
982-1017	QNNYDNEKQKKTKTNEQPKKKRKISKISSKREIINS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
953-967	KSKKKNKQKKKKQKK
991-1011	KKTKTNEQPKKKRKISKISSK

Subcellular Location(s)

nucl 25

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR031101 Ctr9 IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf IPR019734 TPR_repeat
Gene Ontology	GO:0043231 C:intracellular membrane-bounded organelle GO:0016570 P:histone modification GO:0006355 P:regulation of DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF14559 TPR_19 PF13174 TPR_6
PROSITE	View protein in PROSITE PS50005 TPR

Amino Acid Sequences

SFREEIQKKQPRIIEVPLKEQGQLVEIDCATLPEDAMELCEILECESASKELWIQFSYEYRRQGYVNQAIDILTRGLKADISRENKLPLYSMLAALYLEKARRAPKTTNQEHSESTIQTKDYYHQQVTQALNEANRIDFSFLPNILTRAVWNIMRAASEKTLMDQAGKYFDSVLKTDRNNLFAMLGKARILFSHKNYTGALKLYQTILSSKPDFIPDPRIGIGLCFWELNMKQDAKAAWERSLELDSKNVSSNTLLALYHLYSAFSKTGTSEFLEEYKKSLQYAQNAYKESQEASYSANILSSYFFSKKNINSKNYEKASGLYQHSYNTKESNFISAIGLGQIKLIQDDIIGAKLIFEKITEQNPKCIEALTILGSIYTYEILSINSKNDKQLEKQKAKSLLERAILLINNSTERDFSDSGIFITLAALCEDEDNNISLECKEIYIYYLILMTLAYERALNLEHRFPTNILPQLLNNIGVLYHTKENLINARQFYQDALNQCVSIGQQENNTTDVDALVTTLTYNLARCEEQAENYEEAKKFYEELLQRHPDYVEARVRLCHMEIMKGGTEDTSKKIKRLIETDPDNLDVRAYFGWYLSRQKWNKASNDNPEQRHYTHTLKYFDKHDRYSLTAMGNLNLRIARESRPTTDIEKEKRQKIYEKAVEFFDKALQLDPKNAYAAQGIAIALAENKQHAKALLILSKVRETLKNESVYINMGHCLTEMKQYSRAIESYELALNKYQNRSNLITFSSLGKAWLQRGKEERSLLALKEALKYTEKALKLQPNNTAIIFNIAFIQFKFAEIARILPENRRSVDDLEYALKILNNAIDTFSDLANSKHPPYSKEDIQQRANMGRNTTLRQLERAIQQQKEFESTNLAKLDSARQKRKEEQERKQAEAEALRASEEKKQRELAEERRIMQEQIKEWAMKRKEENSIIEDDTEKDKDSDDQGKSKKKNKQKKKKQKKLENEDSEISTETEEQNNYDNEKQKKTKTNEQPKKKRKISKISSKREIINSDDEAENYKDKEMLNISDETHITKEYDKNNLFGSDIE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.57
3	0.61
4	0.6
5	0.56
6	0.5
7	0.46
8	0.37
9	0.29
10	0.26
11	0.2
12	0.18
13	0.17
14	0.17
15	0.16
16	0.16
17	0.15
18	0.13
19	0.11
20	0.07
21	0.08
22	0.07
23	0.09
24	0.08
25	0.07
26	0.07
27	0.08
28	0.08
29	0.09
30	0.1
31	0.09
32	0.09
33	0.11
34	0.12
35	0.11
36	0.12
37	0.14
38	0.16
39	0.19
40	0.18
41	0.19
42	0.2
43	0.27
44	0.34
45	0.36
46	0.39
47	0.39
48	0.41
49	0.4
50	0.43
51	0.46
52	0.47
53	0.44
54	0.39
55	0.37
56	0.34
57	0.34
58	0.3
59	0.22
60	0.14
61	0.11
62	0.11
63	0.11
64	0.13
65	0.13
66	0.18
67	0.26
68	0.31
69	0.35
70	0.37
71	0.4
72	0.41
73	0.41
74	0.36
75	0.29
76	0.29
77	0.26
78	0.24
79	0.2
80	0.18
81	0.17
82	0.16
83	0.17
84	0.14
85	0.14
86	0.15
87	0.19
88	0.24
89	0.3
90	0.36
91	0.4
92	0.47
93	0.57
94	0.64
95	0.69
96	0.68
97	0.66
98	0.62
99	0.6
100	0.55
101	0.45
102	0.4
103	0.34
104	0.3
105	0.27
106	0.27
107	0.25
108	0.3
109	0.35
110	0.34
111	0.35
112	0.38
113	0.43
114	0.44
115	0.43
116	0.38
117	0.33
118	0.31
119	0.29
120	0.27
121	0.21
122	0.19
123	0.18
124	0.16
125	0.15
126	0.17
127	0.19
128	0.18
129	0.2
130	0.2
131	0.2
132	0.19
133	0.18
134	0.15
135	0.15
136	0.18
137	0.16
138	0.16
139	0.17
140	0.17
141	0.18
142	0.19
143	0.19
144	0.17
145	0.19
146	0.18
147	0.18
148	0.2
149	0.19
150	0.19
151	0.17
152	0.17
153	0.19
154	0.19
155	0.18
156	0.16
157	0.18
158	0.19
159	0.19
160	0.22
161	0.24
162	0.25
163	0.34
164	0.35
165	0.35
166	0.33
167	0.32
168	0.3
169	0.26
170	0.29
171	0.22
172	0.2
173	0.18
174	0.18
175	0.17
176	0.17
177	0.2
178	0.22
179	0.26
180	0.35
181	0.35
182	0.37
183	0.37
184	0.39
185	0.36
186	0.33
187	0.29
188	0.2
189	0.21
190	0.2
191	0.2
192	0.18
193	0.18
194	0.18
195	0.21
196	0.21
197	0.22
198	0.22
199	0.24
200	0.25
201	0.25
202	0.3
203	0.26
204	0.28
205	0.27
206	0.26
207	0.23
208	0.21
209	0.19
210	0.14
211	0.13
212	0.1
213	0.09
214	0.14
215	0.14
216	0.17
217	0.21
218	0.2
219	0.2
220	0.22
221	0.23
222	0.23
223	0.29
224	0.28
225	0.26
226	0.26
227	0.27
228	0.26
229	0.29
230	0.25
231	0.19
232	0.2
233	0.18
234	0.19
235	0.21
236	0.19
237	0.17
238	0.15
239	0.15
240	0.13
241	0.13
242	0.11
243	0.09
244	0.11
245	0.1
246	0.11
247	0.1
248	0.1
249	0.09
250	0.12
251	0.11
252	0.1
253	0.1
254	0.1
255	0.11
256	0.12
257	0.12
258	0.12
259	0.13
260	0.16
261	0.19
262	0.18
263	0.2
264	0.22
265	0.22
266	0.21
267	0.26
268	0.27
269	0.3
270	0.39
271	0.44
272	0.46
273	0.47
274	0.47
275	0.43
276	0.39
277	0.33
278	0.26
279	0.19
280	0.14
281	0.14
282	0.15
283	0.14
284	0.12
285	0.12
286	0.1
287	0.1
288	0.1
289	0.09
290	0.12
291	0.14
292	0.15
293	0.16
294	0.21
295	0.27
296	0.37
297	0.43
298	0.44
299	0.49
300	0.55
301	0.62
302	0.6
303	0.56
304	0.47
305	0.4
306	0.39
307	0.38
308	0.34
309	0.27
310	0.25
311	0.26
312	0.28
313	0.29
314	0.27
315	0.24
316	0.22
317	0.22
318	0.22
319	0.23
320	0.21
321	0.19
322	0.17
323	0.14
324	0.14
325	0.12
326	0.12
327	0.08
328	0.07
329	0.07
330	0.07
331	0.07
332	0.07
333	0.05
334	0.05
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.06
341	0.07
342	0.08
343	0.06
344	0.06
345	0.09
346	0.12
347	0.19
348	0.28
349	0.28
350	0.33
351	0.34
352	0.36
353	0.33
354	0.3
355	0.23
356	0.16
357	0.16
358	0.12
359	0.11
360	0.09
361	0.09
362	0.08
363	0.08
364	0.07
365	0.06
366	0.04
367	0.04
368	0.05
369	0.06
370	0.08
371	0.09
372	0.11
373	0.15
374	0.16
375	0.18
376	0.22
377	0.24
378	0.28
379	0.37
380	0.45
381	0.49
382	0.53
383	0.57
384	0.6
385	0.59
386	0.59
387	0.54
388	0.49
389	0.42
390	0.39
391	0.33
392	0.28
393	0.26
394	0.21
395	0.16
396	0.11
397	0.11
398	0.11
399	0.1
400	0.08
401	0.08
402	0.13
403	0.12
404	0.13
405	0.13
406	0.13
407	0.13
408	0.13
409	0.12
410	0.08
411	0.07
412	0.07
413	0.05
414	0.05
415	0.05
416	0.04
417	0.05
418	0.05
419	0.06
420	0.06
421	0.06
422	0.06
423	0.06
424	0.07
425	0.06
426	0.07
427	0.06
428	0.06
429	0.06
430	0.05
431	0.06
432	0.07
433	0.07
434	0.06
435	0.06
436	0.06
437	0.05
438	0.05
439	0.05
440	0.04
441	0.04
442	0.04
443	0.04
444	0.04
445	0.05
446	0.06
447	0.07
448	0.09
449	0.12
450	0.13
451	0.14
452	0.15
453	0.15
454	0.17
455	0.2
456	0.22
457	0.19
458	0.19
459	0.18
460	0.2
461	0.19
462	0.17
463	0.12
464	0.08
465	0.07
466	0.07
467	0.08
468	0.08
469	0.08
470	0.08
471	0.09
472	0.09
473	0.11
474	0.15
475	0.17
476	0.17
477	0.18
478	0.19
479	0.19
480	0.19
481	0.18
482	0.16
483	0.16
484	0.15
485	0.17
486	0.15
487	0.15
488	0.14
489	0.14
490	0.12
491	0.11
492	0.1
493	0.08
494	0.1
495	0.12
496	0.13
497	0.13
498	0.13
499	0.11
500	0.1
501	0.09
502	0.07
503	0.05
504	0.05
505	0.03
506	0.03
507	0.03
508	0.03
509	0.04
510	0.04
511	0.04
512	0.05
513	0.06
514	0.07
515	0.07
516	0.1
517	0.1
518	0.11
519	0.14
520	0.16
521	0.16
522	0.17
523	0.21
524	0.17
525	0.18
526	0.18
527	0.15
528	0.13
529	0.12
530	0.18
531	0.17
532	0.2
533	0.26
534	0.29
535	0.29
536	0.29
537	0.28
538	0.24
539	0.22
540	0.23
541	0.2
542	0.18
543	0.18
544	0.18
545	0.19
546	0.18
547	0.17
548	0.16
549	0.11
550	0.12
551	0.12
552	0.13
553	0.12
554	0.12
555	0.11
556	0.09
557	0.1
558	0.09
559	0.12
560	0.19
561	0.19
562	0.2
563	0.24
564	0.27
565	0.29
566	0.32
567	0.35
568	0.35
569	0.38
570	0.4
571	0.37
572	0.36
573	0.33
574	0.29
575	0.23
576	0.14
577	0.11
578	0.08
579	0.08
580	0.06
581	0.06
582	0.08
583	0.1
584	0.15
585	0.17
586	0.27
587	0.28
588	0.33
589	0.41
590	0.45
591	0.49
592	0.52
593	0.55
594	0.55
595	0.63
596	0.64
597	0.59
598	0.56
599	0.53
600	0.46
601	0.44
602	0.4
603	0.35
604	0.33
605	0.36
606	0.38
607	0.37
608	0.38
609	0.4
610	0.44
611	0.44
612	0.41
613	0.38
614	0.36
615	0.36
616	0.36
617	0.32
618	0.25
619	0.23
620	0.21
621	0.19
622	0.19
623	0.16
624	0.15
625	0.13
626	0.12
627	0.1
628	0.12
629	0.13
630	0.17
631	0.2
632	0.21
633	0.23
634	0.25
635	0.27
636	0.33
637	0.37
638	0.38
639	0.46
640	0.5
641	0.54
642	0.57
643	0.57
644	0.57
645	0.56
646	0.6
647	0.57
648	0.53
649	0.49
650	0.46
651	0.45
652	0.38
653	0.33
654	0.24
655	0.18
656	0.15
657	0.16
658	0.16
659	0.15
660	0.19
661	0.19
662	0.19
663	0.19
664	0.18
665	0.17
666	0.13
667	0.13
668	0.09
669	0.09
670	0.08
671	0.06
672	0.06
673	0.05
674	0.05
675	0.06
676	0.05
677	0.06
678	0.07
679	0.07
680	0.08
681	0.08
682	0.09
683	0.11
684	0.15
685	0.17
686	0.18
687	0.19
688	0.2
689	0.21
690	0.22
691	0.2
692	0.21
693	0.22
694	0.27
695	0.32
696	0.32
697	0.32
698	0.31
699	0.3
700	0.28
701	0.24
702	0.18
703	0.13
704	0.11
705	0.1
706	0.09
707	0.1
708	0.09
709	0.15
710	0.17
711	0.18
712	0.23
713	0.24
714	0.25
715	0.26
716	0.26
717	0.21
718	0.21
719	0.19
720	0.16
721	0.19
722	0.17
723	0.16
724	0.17
725	0.18
726	0.21
727	0.24
728	0.24
729	0.24
730	0.29
731	0.31
732	0.31
733	0.31
734	0.28
735	0.26
736	0.24
737	0.23
738	0.2
739	0.17
740	0.16
741	0.15
742	0.16
743	0.19
744	0.22
745	0.21
746	0.25
747	0.31
748	0.35
749	0.39
750	0.38
751	0.34
752	0.35
753	0.37
754	0.31
755	0.28
756	0.25
757	0.21
758	0.23
759	0.23
760	0.19
761	0.19
762	0.2
763	0.21
764	0.25
765	0.24
766	0.24
767	0.3
768	0.37
769	0.41
770	0.44
771	0.47
772	0.43
773	0.44
774	0.42
775	0.35
776	0.26
777	0.25
778	0.21
779	0.15
780	0.14
781	0.12
782	0.12
783	0.11
784	0.15
785	0.11
786	0.11
787	0.13
788	0.11
789	0.14
790	0.13
791	0.15
792	0.13
793	0.17
794	0.18
795	0.22
796	0.28
797	0.29
798	0.3
799	0.31
800	0.32
801	0.31
802	0.33
803	0.29
804	0.26
805	0.24
806	0.23
807	0.2
808	0.18
809	0.16
810	0.12
811	0.11
812	0.11
813	0.09
814	0.09
815	0.1
816	0.09
817	0.11
818	0.12
819	0.11
820	0.11
821	0.1
822	0.11
823	0.14
824	0.17
825	0.18
826	0.21
827	0.23
828	0.24
829	0.32
830	0.38
831	0.4
832	0.46
833	0.52
834	0.55
835	0.58
836	0.58
837	0.54
838	0.53
839	0.53
840	0.47
841	0.4
842	0.39
843	0.38
844	0.38
845	0.4
846	0.41
847	0.36
848	0.36
849	0.37
850	0.36
851	0.39
852	0.44
853	0.45
854	0.42
855	0.43
856	0.44
857	0.43
858	0.42
859	0.37
860	0.29
861	0.31
862	0.28
863	0.31
864	0.29
865	0.27
866	0.24
867	0.24
868	0.33
869	0.34
870	0.43
871	0.47
872	0.53
873	0.6
874	0.68
875	0.77
876	0.8
877	0.8
878	0.81
879	0.82
880	0.81
881	0.79
882	0.73
883	0.65
884	0.58
885	0.5
886	0.42
887	0.34
888	0.28
889	0.24
890	0.23
891	0.21
892	0.25
893	0.3
894	0.32
895	0.33
896	0.38
897	0.39
898	0.45
899	0.52
900	0.54
901	0.57
902	0.57
903	0.55
904	0.55
905	0.55
906	0.49
907	0.46
908	0.42
909	0.34
910	0.35
911	0.36
912	0.33
913	0.34
914	0.42
915	0.41
916	0.42
917	0.46
918	0.47
919	0.52
920	0.56
921	0.58
922	0.52
923	0.53
924	0.47
925	0.42
926	0.36
927	0.31
928	0.29
929	0.25
930	0.23
931	0.19
932	0.18
933	0.2
934	0.25
935	0.31
936	0.32
937	0.39
938	0.46
939	0.56
940	0.64
941	0.7
942	0.73
943	0.75
944	0.82
945	0.85
946	0.88
947	0.89
948	0.92
949	0.95
950	0.97
951	0.97
952	0.97
953	0.97
954	0.97
955	0.96
956	0.94
957	0.89
958	0.81
959	0.72
960	0.63
961	0.53
962	0.42
963	0.32
964	0.24
965	0.2
966	0.2
967	0.19
968	0.18
969	0.21
970	0.23
971	0.27
972	0.31
973	0.37
974	0.39
975	0.48
976	0.55
977	0.59
978	0.67
979	0.7
980	0.75
981	0.78
982	0.83
983	0.85
984	0.89
985	0.91
986	0.92
987	0.95
988	0.94
989	0.93
990	0.92
991	0.93
992	0.92
993	0.92
994	0.93
995	0.92
996	0.92
997	0.87
998	0.83
999	0.79
1000	0.72
1001	0.66
1002	0.62
1003	0.54
1004	0.48
1005	0.43
1006	0.36
1007	0.33
1008	0.32
1009	0.3
1010	0.25
1011	0.23
1012	0.22
1013	0.21
1014	0.26
1015	0.26
1016	0.26
1017	0.27
1018	0.27
1019	0.28
1020	0.29
1021	0.3
1022	0.27
1023	0.24
1024	0.22
1025	0.2
1026	0.23
1027	0.29
1028	0.3
1029	0.4
1030	0.39
1031	0.39
1032	0.41
1033	0.41

L0PBD2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer