FuNGI

L0PA85

Protein Details

Accession

L0PA85

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
81-100	GVAPRAKMNQQRSRRFRAAQ	Hydrophilic
607-626	LSLCSKKKDSEKSIKLNTKL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

EKPIDVDGTLIYPSLSHPNPNGTEFDNLYLDMNGIVHPCTHPEDKPAPTNEDEMMLEIFKYTERIINMVRPRKLLMIALDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQDAEKKASDLEEFLKLLKASGKSIDETLEKKKAWDSNVITPGTPFMDALAKSLRYWIIYKINSDVAWKNLKVIVSDASVPGEGEHKIMEFIRSQRCSPGYDPNTQHVIYGLDADLIMLGLATHEPHFRVLREDVFFQDANSKGCHICGQIGHFAKECTEAELNIPNTSFQFDLERAIDDWVCLCFFVGNDFLPHLPSLDIHEGAIETLGNIWKEKLHEMGGYLTMDGKIDLKRAEIILQALGQQEDHIFRKRHEKLSSSKYIPYLPNDLIMPSNKEDVKMITITNRNAVLNRKNLKLANNTNKNAIQLLKEINNDNSEETQEISSIVKKSYNYQNCAVSTKSSILGKRKADTLDDISKQNSAHDNNPDNGCPSWKWYYPYHYAPFASDFKNISSLNIQFELGKPFLPYEQLMGVLPSASLPRPLQSLMIEEHSEIIDFYPKEFPIDMNGKKFSWQGVVLLPFIDEKRLLKAIEKVYPQLSEEEKSRNTIGNDTLFISEGNALYDNLILSLCSKKKDSEKSIKLNTKLSNGLSGIVLQDENWIPNSTIFSPLTKVSFPDVENDRSLSLIYKISKSSNIHKSMLLRGVKLNKRHLDINDIRLVHLGLSNPQKNNSSQHFSGYINLNNIFSKQCKTPETNVNPNP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.18
3	0.21
4	0.23
5	0.3
6	0.34
7	0.36
8	0.36
9	0.31
10	0.34
11	0.32
12	0.32
13	0.26
14	0.23
15	0.22
16	0.2
17	0.17
18	0.13
19	0.12
20	0.1
21	0.09
22	0.09
23	0.1
24	0.1
25	0.13
26	0.18
27	0.22
28	0.22
29	0.29
30	0.35
31	0.4
32	0.47
33	0.49
34	0.48
35	0.47
36	0.48
37	0.41
38	0.37
39	0.32
40	0.25
41	0.22
42	0.17
43	0.14
44	0.12
45	0.11
46	0.09
47	0.1
48	0.1
49	0.13
50	0.13
51	0.17
52	0.2
53	0.28
54	0.37
55	0.44
56	0.46
57	0.45
58	0.46
59	0.45
60	0.44
61	0.39
62	0.32
63	0.29
64	0.26
65	0.24
66	0.24
67	0.21
68	0.2
69	0.18
70	0.15
71	0.1
72	0.13
73	0.19
74	0.26
75	0.36
76	0.45
77	0.55
78	0.66
79	0.73
80	0.79
81	0.81
82	0.77
83	0.74
84	0.75
85	0.73
86	0.73
87	0.74
88	0.71
89	0.66
90	0.62
91	0.56
92	0.45
93	0.38
94	0.28
95	0.22
96	0.17
97	0.18
98	0.18
99	0.18
100	0.21
101	0.19
102	0.19
103	0.21
104	0.2
105	0.18
106	0.23
107	0.24
108	0.23
109	0.24
110	0.26
111	0.24
112	0.26
113	0.31
114	0.34
115	0.31
116	0.31
117	0.36
118	0.38
119	0.37
120	0.43
121	0.41
122	0.44
123	0.5
124	0.5
125	0.44
126	0.39
127	0.38
128	0.3
129	0.25
130	0.15
131	0.09
132	0.13
133	0.13
134	0.15
135	0.18
136	0.17
137	0.17
138	0.2
139	0.2
140	0.17
141	0.19
142	0.22
143	0.27
144	0.28
145	0.29
146	0.3
147	0.31
148	0.3
149	0.32
150	0.29
151	0.25
152	0.29
153	0.27
154	0.27
155	0.26
156	0.27
157	0.23
158	0.23
159	0.2
160	0.16
161	0.17
162	0.15
163	0.14
164	0.13
165	0.12
166	0.11
167	0.11
168	0.09
169	0.09
170	0.08
171	0.08
172	0.09
173	0.09
174	0.11
175	0.12
176	0.18
177	0.26
178	0.29
179	0.29
180	0.33
181	0.35
182	0.37
183	0.36
184	0.41
185	0.37
186	0.43
187	0.45
188	0.44
189	0.46
190	0.42
191	0.39
192	0.29
193	0.26
194	0.18
195	0.16
196	0.12
197	0.08
198	0.07
199	0.07
200	0.06
201	0.05
202	0.04
203	0.03
204	0.02
205	0.02
206	0.03
207	0.04
208	0.05
209	0.06
210	0.07
211	0.1
212	0.12
213	0.12
214	0.16
215	0.18
216	0.22
217	0.23
218	0.24
219	0.22
220	0.24
221	0.24
222	0.2
223	0.23
224	0.2
225	0.19
226	0.18
227	0.18
228	0.15
229	0.16
230	0.17
231	0.12
232	0.13
233	0.13
234	0.15
235	0.21
236	0.23
237	0.24
238	0.23
239	0.22
240	0.2
241	0.22
242	0.19
243	0.16
244	0.15
245	0.13
246	0.14
247	0.2
248	0.2
249	0.18
250	0.18
251	0.14
252	0.14
253	0.15
254	0.13
255	0.08
256	0.1
257	0.1
258	0.12
259	0.12
260	0.13
261	0.12
262	0.14
263	0.13
264	0.1
265	0.1
266	0.09
267	0.08
268	0.06
269	0.06
270	0.05
271	0.05
272	0.06
273	0.07
274	0.07
275	0.07
276	0.08
277	0.08
278	0.09
279	0.09
280	0.08
281	0.07
282	0.07
283	0.1
284	0.12
285	0.12
286	0.11
287	0.11
288	0.1
289	0.1
290	0.1
291	0.05
292	0.03
293	0.04
294	0.06
295	0.06
296	0.06
297	0.06
298	0.08
299	0.09
300	0.1
301	0.11
302	0.11
303	0.11
304	0.11
305	0.12
306	0.12
307	0.11
308	0.1
309	0.09
310	0.08
311	0.07
312	0.07
313	0.08
314	0.07
315	0.08
316	0.09
317	0.09
318	0.09
319	0.1
320	0.11
321	0.09
322	0.1
323	0.08
324	0.08
325	0.09
326	0.09
327	0.08
328	0.07
329	0.06
330	0.07
331	0.09
332	0.11
333	0.15
334	0.16
335	0.17
336	0.28
337	0.33
338	0.39
339	0.4
340	0.42
341	0.44
342	0.51
343	0.57
344	0.49
345	0.46
346	0.41
347	0.42
348	0.39
349	0.34
350	0.3
351	0.23
352	0.21
353	0.19
354	0.18
355	0.15
356	0.14
357	0.14
358	0.11
359	0.14
360	0.13
361	0.13
362	0.13
363	0.12
364	0.13
365	0.12
366	0.11
367	0.13
368	0.17
369	0.17
370	0.18
371	0.19
372	0.17
373	0.18
374	0.23
375	0.23
376	0.28
377	0.31
378	0.3
379	0.32
380	0.34
381	0.36
382	0.39
383	0.44
384	0.46
385	0.5
386	0.5
387	0.5
388	0.49
389	0.45
390	0.39
391	0.31
392	0.21
393	0.15
394	0.17
395	0.17
396	0.18
397	0.18
398	0.18
399	0.18
400	0.18
401	0.16
402	0.15
403	0.12
404	0.11
405	0.11
406	0.09
407	0.08
408	0.08
409	0.08
410	0.1
411	0.11
412	0.11
413	0.12
414	0.12
415	0.18
416	0.27
417	0.33
418	0.34
419	0.36
420	0.39
421	0.38
422	0.4
423	0.35
424	0.27
425	0.22
426	0.19
427	0.19
428	0.18
429	0.21
430	0.25
431	0.31
432	0.32
433	0.32
434	0.34
435	0.33
436	0.31
437	0.3
438	0.3
439	0.3
440	0.3
441	0.29
442	0.27
443	0.27
444	0.26
445	0.25
446	0.24
447	0.2
448	0.22
449	0.28
450	0.3
451	0.32
452	0.34
453	0.32
454	0.29
455	0.26
456	0.25
457	0.18
458	0.2
459	0.21
460	0.22
461	0.25
462	0.26
463	0.32
464	0.36
465	0.42
466	0.4
467	0.38
468	0.36
469	0.34
470	0.35
471	0.32
472	0.28
473	0.24
474	0.21
475	0.19
476	0.24
477	0.22
478	0.19
479	0.2
480	0.19
481	0.19
482	0.19
483	0.19
484	0.14
485	0.16
486	0.18
487	0.15
488	0.14
489	0.12
490	0.12
491	0.12
492	0.13
493	0.12
494	0.1
495	0.1
496	0.1
497	0.1
498	0.1
499	0.09
500	0.07
501	0.07
502	0.06
503	0.06
504	0.06
505	0.09
506	0.09
507	0.1
508	0.12
509	0.12
510	0.13
511	0.13
512	0.15
513	0.14
514	0.16
515	0.16
516	0.14
517	0.15
518	0.13
519	0.12
520	0.1
521	0.09
522	0.11
523	0.11
524	0.12
525	0.15
526	0.15
527	0.17
528	0.17
529	0.17
530	0.19
531	0.27
532	0.29
533	0.3
534	0.33
535	0.31
536	0.33
537	0.34
538	0.28
539	0.23
540	0.2
541	0.17
542	0.19
543	0.2
544	0.19
545	0.18
546	0.17
547	0.15
548	0.14
549	0.14
550	0.11
551	0.1
552	0.14
553	0.17
554	0.17
555	0.18
556	0.25
557	0.29
558	0.34
559	0.35
560	0.34
561	0.33
562	0.34
563	0.32
564	0.29
565	0.26
566	0.23
567	0.24
568	0.27
569	0.26
570	0.28
571	0.29
572	0.29
573	0.28
574	0.29
575	0.29
576	0.26
577	0.26
578	0.24
579	0.23
580	0.19
581	0.18
582	0.15
583	0.13
584	0.1
585	0.1
586	0.1
587	0.09
588	0.09
589	0.09
590	0.08
591	0.07
592	0.07
593	0.06
594	0.07
595	0.14
596	0.16
597	0.19
598	0.21
599	0.26
600	0.35
601	0.45
602	0.53
603	0.57
604	0.64
605	0.71
606	0.79
607	0.82
608	0.77
609	0.75
610	0.68
611	0.62
612	0.57
613	0.49
614	0.43
615	0.35
616	0.32
617	0.25
618	0.22
619	0.17
620	0.14
621	0.13
622	0.08
623	0.11
624	0.11
625	0.12
626	0.14
627	0.15
628	0.14
629	0.16
630	0.19
631	0.17
632	0.21
633	0.21
634	0.2
635	0.21
636	0.23
637	0.24
638	0.21
639	0.22
640	0.21
641	0.24
642	0.23
643	0.28
644	0.3
645	0.31
646	0.33
647	0.32
648	0.28
649	0.25
650	0.25
651	0.19
652	0.16
653	0.18
654	0.19
655	0.21
656	0.23
657	0.26
658	0.32
659	0.35
660	0.42
661	0.46
662	0.49
663	0.48
664	0.49
665	0.51
666	0.5
667	0.54
668	0.48
669	0.4
670	0.41
671	0.5
672	0.53
673	0.57
674	0.6
675	0.58
676	0.59
677	0.63
678	0.58
679	0.59
680	0.58
681	0.58
682	0.55
683	0.49
684	0.45
685	0.4
686	0.38
687	0.29
688	0.25
689	0.19
690	0.18
691	0.28
692	0.34
693	0.35
694	0.39
695	0.41
696	0.42
697	0.49
698	0.5
699	0.49
700	0.44
701	0.46
702	0.45
703	0.43
704	0.45
705	0.43
706	0.39
707	0.35
708	0.35
709	0.32
710	0.3
711	0.31
712	0.29
713	0.26
714	0.27
715	0.27
716	0.33
717	0.38
718	0.43
719	0.5
720	0.57
721	0.63

L0PA85

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer