FuNGI

L0P710

Protein Details

Accession

L0P710

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
84-105	DGVAPRAKMNQQRSRRFKAAKE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 12, mito 6, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR016494 5_3_exoribonuclease_1 IPR014722 Rib_L2_dom2 IPR041385 SH3_12 IPR040992 XRN1_D1 IPR047007 XRN1_D1_sf IPR041106 XRN1_D2_D3 IPR040486 Xrn1_D3 IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR047008 XRN1_SH3_sf
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF18129 SH3_12 PF18332 XRN1_D1 PF18334 XRN1_D2_D3 PF18194 Xrn1_D3 PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGIPKFFRWISERYPMCSQLITEKRVPEFDNLYLDMNGIIHNCTHMDENKKEIPENEAFLAIFKYIEHLFGTIKPKKLFFLSVDGVAPRAKMNQQRSRRFKAAKEAYELYQEKISKGEDVPKDPFDSNCITPGTLFMKRLSEQLKYFINRKVSEDTNWKGIEIIFSGHEVPGEGEHKIMEYIRLSKAQPDYEPNLRHCLYGLDADLIMLGLLSHDPHFCLLREEVLFGSVKKKKQELEEQNFYLMHLCLLREYLEMEFQELTNIPNFPYNFEKIIDDFILLAFFVGNDFLPHLPKLHINEGALALVFKIYKKVIPKARGYINNAGVINLERLALVLEELEKQEREDFRNELEDKNWVGSKKKGLLTMTSNQKKLFLEMERFVSGNLETLVLPSTLSATDRSFVFKMADDFYVKCTKYTIENEKYLRFEKDNKVENGNEIKDIIDRELSRYKNAIILDIEKDDSHKEDAIFEEKWIKWKDSYYIEKLGFSINDTKKLKEMAENYIEGLQWVLFYYYRGVSSWSWFYKYHYSPKVSDIKKGFAANLSFTLGTPFKPFEQLMAVLPERSKKLVPKPFADLMVNETSPIRDFYPEDFELDMNDKKASWEAIAKIPFINEELLLSVIKAKEHLLTDEEKNRNTFGHNIKYTYDENLDYIYVPYIDVFPLIPHCHCKAEVYKYPEILGVEQFIYGLCKGVNLGNTSPAGFPTLNTLPHTNYLDHQGVNVFKSESRNESMIIIIQNQVDLETVEEFAQKKIGKRVFVGWPYLHEARLNAISTEEFRYEGVFSPENSIVTVSKTHNDSAAWKKVALRLESNYKKHYGVIINTVQAIAHVSMLKGLRKTENGASEKDYEPCNSQNPEHPLQLVLNEVFVEDSRYIEKPPLDIKQEYPLGSRGFFLGEYNYGRPLEITAHKNGKIDCWIATQTREPEFGKLIFQKFSKRTVYYPSYVAAKIVGLTGIAFSKLMSSFFVIVDKQKVNLGLNLKYEAKKIKVLGYSRKTEKGWEYTQEAINLIQEYKKRFPDFVLSVQSHVFDDIPLINKLIPEKNYKEKVKEIRSWLKIINEENNFEKVSLDVEQLDQLSMQMVEKELDKISENIPLFTPRRINNVPRNAILKPSQCELRLQDQEFSLGDRVVYVHDSGKVPIATKGIVVRTGKKVIDIIFDVPFMSGTTLGGKCSAYRGLSVETHFLLNLTKRTLIVSTKTSVNKNNTRIEPNIHATQLKTPHSFSRPAHPFQKKVYSNTSQDIQHTYYHNPSTQSLNTSDFKRGTHHFLGNSTKASFQNTSKASFQNISKSYHSISLHSHSYSTKYKIKETSALHTT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.5
3	0.47
4	0.43
5	0.38
6	0.38
7	0.42
8	0.42
9	0.41
10	0.44
11	0.45
12	0.47
13	0.48
14	0.44
15	0.41
16	0.39
17	0.39
18	0.35
19	0.35
20	0.3
21	0.28
22	0.23
23	0.18
24	0.16
25	0.12
26	0.11
27	0.09
28	0.1
29	0.1
30	0.11
31	0.16
32	0.2
33	0.28
34	0.3
35	0.37
36	0.42
37	0.44
38	0.46
39	0.42
40	0.43
41	0.4
42	0.4
43	0.34
44	0.29
45	0.27
46	0.25
47	0.25
48	0.18
49	0.14
50	0.1
51	0.12
52	0.11
53	0.12
54	0.12
55	0.12
56	0.14
57	0.2
58	0.29
59	0.32
60	0.39
61	0.4
62	0.41
63	0.43
64	0.45
65	0.44
66	0.38
67	0.4
68	0.36
69	0.35
70	0.35
71	0.32
72	0.3
73	0.26
74	0.23
75	0.16
76	0.18
77	0.22
78	0.29
79	0.39
80	0.47
81	0.57
82	0.68
83	0.75
84	0.8
85	0.84
86	0.82
87	0.77
88	0.79
89	0.78
90	0.73
91	0.71
92	0.66
93	0.58
94	0.61
95	0.56
96	0.47
97	0.43
98	0.38
99	0.32
100	0.31
101	0.3
102	0.24
103	0.25
104	0.32
105	0.31
106	0.36
107	0.4
108	0.4
109	0.43
110	0.41
111	0.39
112	0.34
113	0.34
114	0.3
115	0.29
116	0.27
117	0.23
118	0.22
119	0.25
120	0.27
121	0.25
122	0.26
123	0.24
124	0.28
125	0.28
126	0.34
127	0.34
128	0.34
129	0.32
130	0.36
131	0.41
132	0.41
133	0.45
134	0.44
135	0.49
136	0.45
137	0.48
138	0.48
139	0.44
140	0.46
141	0.5
142	0.47
143	0.47
144	0.45
145	0.41
146	0.35
147	0.32
148	0.28
149	0.2
150	0.18
151	0.12
152	0.13
153	0.14
154	0.13
155	0.12
156	0.11
157	0.1
158	0.12
159	0.13
160	0.12
161	0.11
162	0.11
163	0.12
164	0.13
165	0.12
166	0.12
167	0.13
168	0.17
169	0.2
170	0.23
171	0.23
172	0.28
173	0.33
174	0.33
175	0.33
176	0.36
177	0.39
178	0.44
179	0.49
180	0.46
181	0.48
182	0.45
183	0.42
184	0.36
185	0.32
186	0.25
187	0.23
188	0.21
189	0.15
190	0.14
191	0.14
192	0.13
193	0.11
194	0.08
195	0.05
196	0.04
197	0.03
198	0.03
199	0.05
200	0.06
201	0.06
202	0.07
203	0.09
204	0.11
205	0.11
206	0.15
207	0.15
208	0.18
209	0.18
210	0.19
211	0.17
212	0.18
213	0.18
214	0.15
215	0.23
216	0.25
217	0.29
218	0.33
219	0.37
220	0.39
221	0.47
222	0.57
223	0.59
224	0.63
225	0.67
226	0.64
227	0.61
228	0.57
229	0.49
230	0.4
231	0.29
232	0.2
233	0.13
234	0.12
235	0.1
236	0.11
237	0.11
238	0.09
239	0.11
240	0.1
241	0.13
242	0.12
243	0.14
244	0.13
245	0.12
246	0.14
247	0.13
248	0.13
249	0.12
250	0.12
251	0.11
252	0.16
253	0.16
254	0.18
255	0.22
256	0.24
257	0.24
258	0.25
259	0.26
260	0.22
261	0.25
262	0.22
263	0.17
264	0.14
265	0.12
266	0.11
267	0.09
268	0.08
269	0.05
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.06
276	0.07
277	0.09
278	0.1
279	0.11
280	0.12
281	0.17
282	0.21
283	0.24
284	0.26
285	0.24
286	0.25
287	0.24
288	0.23
289	0.19
290	0.14
291	0.1
292	0.08
293	0.08
294	0.06
295	0.08
296	0.09
297	0.12
298	0.18
299	0.26
300	0.34
301	0.4
302	0.46
303	0.5
304	0.57
305	0.61
306	0.62
307	0.62
308	0.56
309	0.54
310	0.48
311	0.42
312	0.34
313	0.28
314	0.23
315	0.15
316	0.12
317	0.07
318	0.07
319	0.07
320	0.06
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.06
325	0.08
326	0.1
327	0.09
328	0.1
329	0.16
330	0.19
331	0.21
332	0.24
333	0.24
334	0.24
335	0.32
336	0.33
337	0.29
338	0.27
339	0.27
340	0.24
341	0.25
342	0.26
343	0.2
344	0.22
345	0.25
346	0.3
347	0.34
348	0.36
349	0.37
350	0.36
351	0.39
352	0.41
353	0.45
354	0.49
355	0.48
356	0.47
357	0.43
358	0.45
359	0.41
360	0.37
361	0.34
362	0.28
363	0.28
364	0.28
365	0.31
366	0.29
367	0.28
368	0.26
369	0.22
370	0.18
371	0.13
372	0.11
373	0.09
374	0.07
375	0.08
376	0.09
377	0.08
378	0.07
379	0.06
380	0.07
381	0.06
382	0.07
383	0.08
384	0.08
385	0.1
386	0.1
387	0.14
388	0.13
389	0.14
390	0.14
391	0.14
392	0.16
393	0.16
394	0.18
395	0.16
396	0.16
397	0.19
398	0.24
399	0.23
400	0.21
401	0.2
402	0.19
403	0.24
404	0.31
405	0.37
406	0.36
407	0.42
408	0.45
409	0.47
410	0.5
411	0.46
412	0.42
413	0.35
414	0.37
415	0.39
416	0.44
417	0.49
418	0.47
419	0.49
420	0.46
421	0.48
422	0.46
423	0.39
424	0.31
425	0.24
426	0.22
427	0.19
428	0.19
429	0.15
430	0.13
431	0.13
432	0.17
433	0.23
434	0.23
435	0.24
436	0.24
437	0.24
438	0.24
439	0.23
440	0.21
441	0.16
442	0.18
443	0.17
444	0.17
445	0.17
446	0.14
447	0.15
448	0.13
449	0.14
450	0.13
451	0.13
452	0.12
453	0.12
454	0.14
455	0.17
456	0.16
457	0.15
458	0.2
459	0.18
460	0.25
461	0.27
462	0.26
463	0.24
464	0.26
465	0.3
466	0.31
467	0.37
468	0.34
469	0.39
470	0.38
471	0.36
472	0.35
473	0.32
474	0.24
475	0.2
476	0.25
477	0.2
478	0.28
479	0.29
480	0.29
481	0.29
482	0.31
483	0.3
484	0.26
485	0.28
486	0.26
487	0.27
488	0.27
489	0.26
490	0.25
491	0.24
492	0.18
493	0.15
494	0.09
495	0.06
496	0.05
497	0.05
498	0.04
499	0.05
500	0.07
501	0.07
502	0.08
503	0.08
504	0.11
505	0.11
506	0.13
507	0.18
508	0.18
509	0.2
510	0.2
511	0.23
512	0.29
513	0.32
514	0.38
515	0.39
516	0.41
517	0.4
518	0.45
519	0.51
520	0.44
521	0.47
522	0.41
523	0.38
524	0.38
525	0.37
526	0.31
527	0.25
528	0.25
529	0.19
530	0.18
531	0.16
532	0.13
533	0.12
534	0.14
535	0.11
536	0.11
537	0.12
538	0.12
539	0.11
540	0.14
541	0.13
542	0.12
543	0.13
544	0.13
545	0.13
546	0.15
547	0.15
548	0.13
549	0.14
550	0.15
551	0.14
552	0.15
553	0.15
554	0.17
555	0.26
556	0.34
557	0.37
558	0.38
559	0.42
560	0.43
561	0.43
562	0.38
563	0.29
564	0.26
565	0.24
566	0.21
567	0.16
568	0.14
569	0.12
570	0.12
571	0.13
572	0.09
573	0.08
574	0.09
575	0.11
576	0.17
577	0.17
578	0.18
579	0.17
580	0.16
581	0.16
582	0.18
583	0.17
584	0.11
585	0.11
586	0.1
587	0.1
588	0.1
589	0.1
590	0.08
591	0.1
592	0.11
593	0.16
594	0.17
595	0.17
596	0.16
597	0.16
598	0.15
599	0.13
600	0.11
601	0.07
602	0.06
603	0.06
604	0.06
605	0.06
606	0.06
607	0.07
608	0.06
609	0.06
610	0.07
611	0.07
612	0.09
613	0.09
614	0.1
615	0.1
616	0.13
617	0.16
618	0.24
619	0.26
620	0.25
621	0.25
622	0.25
623	0.23
624	0.22
625	0.25
626	0.22
627	0.28
628	0.28
629	0.29
630	0.29
631	0.32
632	0.31
633	0.26
634	0.23
635	0.15
636	0.14
637	0.13
638	0.12
639	0.09
640	0.09
641	0.07
642	0.05
643	0.05
644	0.05
645	0.05
646	0.04
647	0.04
648	0.04
649	0.04
650	0.06
651	0.07
652	0.08
653	0.11
654	0.12
655	0.13
656	0.13
657	0.16
658	0.18
659	0.24
660	0.3
661	0.33
662	0.34
663	0.33
664	0.33
665	0.32
666	0.27
667	0.21
668	0.15
669	0.1
670	0.08
671	0.08
672	0.07
673	0.06
674	0.06
675	0.05
676	0.05
677	0.04
678	0.04
679	0.05
680	0.06
681	0.08
682	0.09
683	0.1
684	0.11
685	0.12
686	0.12
687	0.12
688	0.11
689	0.11
690	0.09
691	0.09
692	0.12
693	0.14
694	0.14
695	0.15
696	0.16
697	0.15
698	0.18
699	0.2
700	0.15
701	0.14
702	0.18
703	0.18
704	0.17
705	0.16
706	0.15
707	0.14
708	0.14
709	0.14
710	0.1
711	0.1
712	0.13
713	0.14
714	0.15
715	0.17
716	0.17
717	0.16
718	0.16
719	0.15
720	0.14
721	0.13
722	0.11
723	0.1
724	0.09
725	0.09
726	0.08
727	0.08
728	0.06
729	0.06
730	0.05
731	0.04
732	0.05
733	0.05
734	0.07
735	0.08
736	0.08
737	0.12
738	0.13
739	0.15
740	0.22
741	0.25
742	0.25
743	0.26
744	0.31
745	0.33
746	0.34
747	0.35
748	0.27
749	0.26
750	0.3
751	0.3
752	0.25
753	0.19
754	0.17
755	0.15
756	0.18
757	0.16
758	0.1
759	0.1
760	0.1
761	0.11
762	0.13
763	0.11
764	0.09
765	0.09
766	0.1
767	0.1
768	0.11
769	0.13
770	0.12
771	0.12
772	0.15
773	0.16
774	0.15
775	0.14
776	0.14
777	0.11
778	0.11
779	0.14
780	0.11
781	0.13
782	0.15
783	0.15
784	0.15
785	0.15
786	0.2
787	0.24
788	0.3
789	0.28
790	0.27
791	0.28
792	0.31
793	0.35
794	0.32
795	0.28
796	0.25
797	0.34
798	0.41
799	0.42
800	0.41
801	0.39
802	0.37
803	0.35
804	0.36
805	0.29
806	0.24
807	0.27
808	0.26
809	0.24
810	0.24
811	0.23
812	0.18
813	0.14
814	0.13
815	0.07
816	0.06
817	0.06
818	0.06
819	0.09
820	0.11
821	0.13
822	0.13
823	0.14
824	0.16
825	0.17
826	0.2
827	0.22
828	0.28
829	0.29
830	0.29
831	0.31
832	0.32
833	0.32
834	0.31
835	0.28
836	0.21
837	0.21
838	0.22
839	0.24
840	0.23
841	0.23
842	0.28
843	0.33
844	0.35
845	0.33
846	0.31
847	0.27
848	0.25
849	0.24
850	0.19
851	0.13
852	0.09
853	0.08
854	0.08
855	0.07
856	0.07
857	0.08
858	0.06
859	0.07
860	0.09
861	0.1
862	0.11
863	0.14
864	0.14
865	0.15
866	0.19
867	0.22
868	0.25
869	0.26
870	0.27
871	0.3
872	0.33
873	0.31
874	0.29
875	0.28
876	0.24
877	0.23
878	0.22
879	0.16
880	0.14
881	0.13
882	0.12
883	0.09
884	0.11
885	0.13
886	0.13
887	0.15
888	0.14
889	0.14
890	0.14
891	0.13
892	0.15
893	0.19
894	0.21
895	0.25
896	0.3
897	0.32
898	0.35
899	0.34
900	0.32
901	0.29
902	0.27
903	0.22
904	0.2
905	0.21
906	0.2
907	0.22
908	0.24
909	0.25
910	0.26
911	0.28
912	0.26
913	0.25
914	0.26
915	0.24
916	0.25
917	0.26
918	0.27
919	0.26
920	0.27
921	0.33
922	0.33
923	0.39
924	0.4
925	0.37
926	0.37
927	0.42
928	0.45
929	0.4
930	0.39
931	0.35
932	0.32
933	0.3
934	0.28
935	0.2
936	0.14
937	0.12
938	0.11
939	0.09
940	0.05
941	0.05
942	0.05
943	0.05
944	0.05
945	0.05
946	0.05
947	0.06
948	0.07
949	0.07
950	0.08
951	0.09
952	0.1
953	0.1
954	0.12
955	0.11
956	0.13
957	0.18
958	0.18
959	0.17
960	0.18
961	0.2
962	0.19
963	0.23
964	0.24
965	0.22
966	0.24
967	0.26
968	0.28
969	0.27
970	0.3
971	0.3
972	0.29
973	0.29
974	0.29
975	0.32
976	0.35
977	0.4
978	0.46
979	0.48
980	0.53
981	0.54
982	0.57
983	0.52
984	0.51
985	0.5
986	0.47
987	0.45
988	0.42
989	0.41
990	0.4
991	0.41
992	0.37
993	0.32
994	0.25
995	0.23
996	0.19
997	0.16
998	0.15
999	0.16
1000	0.22
1001	0.26
1002	0.33
1003	0.34
1004	0.33
1005	0.35
1006	0.4
1007	0.41
1008	0.41
1009	0.43
1010	0.37
1011	0.37
1012	0.36
1013	0.35
1014	0.26
1015	0.22
1016	0.17
1017	0.09
1018	0.1
1019	0.1
1020	0.13
1021	0.13
1022	0.13
1023	0.13
1024	0.14
1025	0.18
1026	0.21
1027	0.22
1028	0.27
1029	0.32
1030	0.41
1031	0.5
1032	0.54
1033	0.55
1034	0.59
1035	0.65
1036	0.66
1037	0.68
1038	0.67
1039	0.68
1040	0.67
1041	0.66
1042	0.61
1043	0.56
1044	0.52
1045	0.48
1046	0.47
1047	0.4
1048	0.4
1049	0.38
1050	0.38
1051	0.33
1052	0.29
1053	0.25
1054	0.17
1055	0.16
1056	0.14
1057	0.13
1058	0.11
1059	0.11
1060	0.13
1061	0.13
1062	0.12
1063	0.1
1064	0.09
1065	0.08
1066	0.08
1067	0.08
1068	0.07
1069	0.07
1070	0.08
1071	0.09
1072	0.11
1073	0.11
1074	0.12
1075	0.13
1076	0.14
1077	0.14
1078	0.21
1079	0.2
1080	0.19
1081	0.2
1082	0.26
1083	0.26
1084	0.28
1085	0.34
1086	0.29
1087	0.37
1088	0.42
1089	0.5
1090	0.53
1091	0.61
1092	0.61
1093	0.59
1094	0.61
1095	0.53
1096	0.52
1097	0.5
1098	0.46
1099	0.39
1100	0.38
1101	0.39
1102	0.36
1103	0.4
1104	0.39
1105	0.42
1106	0.44
1107	0.43
1108	0.42
1109	0.38
1110	0.39
1111	0.35
1112	0.32
1113	0.24
1114	0.16
1115	0.14
1116	0.12
1117	0.11
1118	0.11
1119	0.12
1120	0.11
1121	0.11
1122	0.15
1123	0.16
1124	0.16
1125	0.2
1126	0.2
1127	0.2
1128	0.21
1129	0.21
1130	0.18
1131	0.18
1132	0.21
1133	0.19
1134	0.24
1135	0.25
1136	0.28
1137	0.32
1138	0.37
1139	0.36
1140	0.33
1141	0.35
1142	0.3
1143	0.32
1144	0.29
1145	0.26
1146	0.22
1147	0.22
1148	0.2
1149	0.17
1150	0.16
1151	0.12
1152	0.1
1153	0.08
1154	0.07
1155	0.12
1156	0.12
1157	0.13
1158	0.14
1159	0.14
1160	0.14
1161	0.17
1162	0.2
1163	0.16
1164	0.17
1165	0.19
1166	0.22
1167	0.25
1168	0.26
1169	0.26
1170	0.23
1171	0.23
1172	0.21
1173	0.19
1174	0.19
1175	0.19
1176	0.21
1177	0.21
1178	0.21
1179	0.2
1180	0.22
1181	0.25
1182	0.26
1183	0.26
1184	0.27
1185	0.28
1186	0.33
1187	0.38
1188	0.42
1189	0.47
1190	0.52
1191	0.56
1192	0.59
1193	0.65
1194	0.64
1195	0.64
1196	0.62
1197	0.6
1198	0.58
1199	0.56
1200	0.53
1201	0.47
1202	0.43
1203	0.39
1204	0.42
1205	0.43
1206	0.42
1207	0.39
1208	0.37
1209	0.42
1210	0.45
1211	0.51
1212	0.46
1213	0.5
1214	0.51
1215	0.55
1216	0.62
1217	0.63
1218	0.63
1219	0.63
1220	0.72
1221	0.66
1222	0.65
1223	0.67
1224	0.65
1225	0.62
1226	0.62
1227	0.59
1228	0.51
1229	0.49
1230	0.48
1231	0.41
1232	0.38
1233	0.36
1234	0.35
1235	0.38
1236	0.39
1237	0.39
1238	0.37
1239	0.37
1240	0.38
1241	0.38
1242	0.38
1243	0.34
1244	0.35
1245	0.36
1246	0.36
1247	0.41
1248	0.37
1249	0.35
1250	0.36
1251	0.38
1252	0.41
1253	0.44
1254	0.46
1255	0.42
1256	0.46
1257	0.53
1258	0.51
1259	0.5
1260	0.43
1261	0.4
1262	0.36
1263	0.39
1264	0.38
1265	0.33
1266	0.38
1267	0.37
1268	0.41
1269	0.41
1270	0.41
1271	0.41
1272	0.42
1273	0.42
1274	0.43
1275	0.43
1276	0.44
1277	0.43
1278	0.44
1279	0.42
1280	0.44
1281	0.42
1282	0.35
1283	0.37
1284	0.37
1285	0.39
1286	0.36
1287	0.36
1288	0.3
1289	0.35
1290	0.39
1291	0.41
1292	0.42
1293	0.41
1294	0.48
1295	0.52
1296	0.56
1297	0.58
1298	0.56

L0P710

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer