FuNGI

L0PIM6

Protein Details

Accession

L0PIM6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
969-991	LEELMRKKNRKIKAEKQLGLNLK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
975-981	KKNRKIK

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 7, nucl 6.5, cyto 6.5, pero 5, mito 4, plas 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR037289 Elp2 IPR019440 MAU2 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0033588 C:elongator holoenzyme complex GO:0005634 C:nucleus GO:0051301 P:cell division GO:0007059 P:chromosome segregation GO:0007064 P:mitotic sister chromatid cohesion GO:0002098 P:tRNA wobble uridine modification
Pfam	View protein in Pfam PF10345 Cohesin_load PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION

Amino Acid Sequences

MKIDIDIGFHGNTFGKILTTRFFKITMEEGLWAAMISSGCNSSPNVSDWSPYSGLIAFGTHQNVALYDPFNVNCNGIFETLIGHTGSVTAVRFFWGFCDKKEGILSGSLDSTVKIWKKKTNCFECVYTILEHKSPIHVLATLASYIIIGATDGMISIWKINDLDTYELFIDNIQVINSVNMYPLSMSLHVLPNTTNMLFTVGGSSNLIDVYVSSIVNGKYVFTYISSLDGHSDWVRSLDITVEQKTGDLLLASASQDKYVRIWRIAHIFVCEKGETASNELKNNDNEIDILLTNKIFNFLVEEENIIHKYSVSFDALLMGHDDWIFTCSWHPNGELKLLTASADTSLIIWHPDNHSGIWVSLCRVGELSLSKGSSTATGSFGGFFGGLWGPNEELFTEARRIRRICMGEEGFKEYRKLITTGIGCLEAVLQRESIPVKVEIRTRLRMAEVIFEETDNLGEAEEVLSKGVILAQRVRGKWGTEDEICDAALASTYSYGNIGKSRENHDQKMYSGGGRTGGHRLGLYFCFLEFDVLSRAEWRDTERGGRMSILSKIQQVSRNQGDQMVYIVACLLEIYVRIEQEEYYLARQRLDHISEIQAGFKDISTLNLVKMIFSVFLNIMQGYREAAVHELKDLHSALDALAQYDMDHSPQNAIEISLGSEGCSKLAIHWFNRQQLFVYGHLLAGICYLPDYTSSKAQVFLNEGLEMLKCKHFACIPYTCQLLTRFKDNLVYDSFLSNNLRTNRNLDWFSITRELCLIYYCFALMLRSDFDKAFEVGIPFSFFVYLFIRSVYSRSRQVFIVFNNNTKALYMLLKGTYAQFTDQLDIALKAYDSIPASIQAICLLGNLNSALIFQGNKLHDKRRAHEILNHIKPLCQSSNFTQLRFAWDLVNGSMGDDVLHSKNCLLSVVSTFEKHANNQLRVIASIVLCYYFIIHSETEQAEKILISAYLLSRNAGSNLWAFMSGELLEELMRKKNRKIKAEKQLGLNLKHKECILDLFNHAHVITID

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.12
3	0.13
4	0.16
5	0.2
6	0.24
7	0.27
8	0.27
9	0.28
10	0.27
11	0.29
12	0.31
13	0.29
14	0.25
15	0.23
16	0.22
17	0.21
18	0.2
19	0.16
20	0.12
21	0.1
22	0.08
23	0.07
24	0.09
25	0.1
26	0.1
27	0.12
28	0.13
29	0.13
30	0.16
31	0.18
32	0.22
33	0.22
34	0.24
35	0.24
36	0.29
37	0.27
38	0.25
39	0.24
40	0.19
41	0.19
42	0.17
43	0.16
44	0.11
45	0.14
46	0.16
47	0.14
48	0.14
49	0.14
50	0.14
51	0.15
52	0.17
53	0.14
54	0.14
55	0.17
56	0.17
57	0.19
58	0.19
59	0.18
60	0.16
61	0.17
62	0.17
63	0.15
64	0.15
65	0.12
66	0.13
67	0.13
68	0.14
69	0.12
70	0.1
71	0.09
72	0.09
73	0.09
74	0.09
75	0.09
76	0.09
77	0.09
78	0.11
79	0.11
80	0.1
81	0.14
82	0.22
83	0.23
84	0.23
85	0.31
86	0.3
87	0.33
88	0.36
89	0.33
90	0.26
91	0.28
92	0.29
93	0.21
94	0.22
95	0.19
96	0.17
97	0.15
98	0.15
99	0.18
100	0.22
101	0.26
102	0.31
103	0.38
104	0.47
105	0.57
106	0.67
107	0.69
108	0.69
109	0.69
110	0.68
111	0.64
112	0.58
113	0.5
114	0.42
115	0.36
116	0.33
117	0.28
118	0.27
119	0.23
120	0.23
121	0.22
122	0.21
123	0.19
124	0.16
125	0.16
126	0.15
127	0.16
128	0.13
129	0.12
130	0.1
131	0.08
132	0.07
133	0.07
134	0.05
135	0.03
136	0.03
137	0.03
138	0.03
139	0.03
140	0.03
141	0.04
142	0.04
143	0.06
144	0.06
145	0.07
146	0.08
147	0.08
148	0.11
149	0.13
150	0.15
151	0.15
152	0.17
153	0.16
154	0.16
155	0.16
156	0.13
157	0.12
158	0.1
159	0.1
160	0.07
161	0.07
162	0.07
163	0.08
164	0.09
165	0.08
166	0.08
167	0.07
168	0.08
169	0.07
170	0.08
171	0.09
172	0.09
173	0.1
174	0.12
175	0.17
176	0.17
177	0.18
178	0.17
179	0.17
180	0.19
181	0.18
182	0.16
183	0.11
184	0.13
185	0.13
186	0.12
187	0.14
188	0.11
189	0.12
190	0.12
191	0.12
192	0.1
193	0.1
194	0.09
195	0.05
196	0.05
197	0.07
198	0.08
199	0.07
200	0.07
201	0.11
202	0.11
203	0.13
204	0.12
205	0.1
206	0.1
207	0.1
208	0.11
209	0.08
210	0.1
211	0.09
212	0.12
213	0.12
214	0.12
215	0.13
216	0.13
217	0.15
218	0.14
219	0.14
220	0.11
221	0.12
222	0.12
223	0.1
224	0.1
225	0.09
226	0.13
227	0.15
228	0.17
229	0.17
230	0.16
231	0.16
232	0.16
233	0.15
234	0.1
235	0.07
236	0.05
237	0.05
238	0.06
239	0.07
240	0.1
241	0.09
242	0.11
243	0.12
244	0.12
245	0.14
246	0.2
247	0.23
248	0.23
249	0.25
250	0.28
251	0.33
252	0.35
253	0.33
254	0.3
255	0.29
256	0.27
257	0.27
258	0.23
259	0.18
260	0.16
261	0.18
262	0.15
263	0.19
264	0.23
265	0.23
266	0.26
267	0.27
268	0.3
269	0.28
270	0.3
271	0.26
272	0.2
273	0.17
274	0.15
275	0.15
276	0.11
277	0.11
278	0.09
279	0.08
280	0.08
281	0.08
282	0.09
283	0.08
284	0.08
285	0.1
286	0.1
287	0.12
288	0.12
289	0.13
290	0.12
291	0.14
292	0.15
293	0.13
294	0.12
295	0.1
296	0.1
297	0.11
298	0.13
299	0.12
300	0.11
301	0.1
302	0.13
303	0.13
304	0.13
305	0.12
306	0.1
307	0.09
308	0.09
309	0.09
310	0.06
311	0.08
312	0.07
313	0.06
314	0.08
315	0.1
316	0.12
317	0.13
318	0.15
319	0.17
320	0.18
321	0.21
322	0.19
323	0.17
324	0.17
325	0.16
326	0.14
327	0.1
328	0.09
329	0.06
330	0.06
331	0.06
332	0.05
333	0.05
334	0.05
335	0.07
336	0.07
337	0.08
338	0.1
339	0.12
340	0.13
341	0.13
342	0.14
343	0.13
344	0.13
345	0.12
346	0.11
347	0.1
348	0.12
349	0.12
350	0.11
351	0.1
352	0.1
353	0.11
354	0.12
355	0.13
356	0.12
357	0.12
358	0.12
359	0.12
360	0.12
361	0.11
362	0.11
363	0.1
364	0.1
365	0.1
366	0.1
367	0.11
368	0.1
369	0.09
370	0.08
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.07
377	0.07
378	0.07
379	0.08
380	0.06
381	0.07
382	0.07
383	0.08
384	0.12
385	0.15
386	0.17
387	0.23
388	0.23
389	0.24
390	0.3
391	0.31
392	0.28
393	0.33
394	0.33
395	0.32
396	0.32
397	0.37
398	0.31
399	0.3
400	0.29
401	0.22
402	0.21
403	0.19
404	0.19
405	0.13
406	0.17
407	0.17
408	0.17
409	0.17
410	0.16
411	0.13
412	0.12
413	0.12
414	0.08
415	0.09
416	0.08
417	0.07
418	0.07
419	0.09
420	0.1
421	0.09
422	0.1
423	0.1
424	0.11
425	0.14
426	0.17
427	0.22
428	0.27
429	0.29
430	0.28
431	0.27
432	0.26
433	0.26
434	0.23
435	0.21
436	0.17
437	0.17
438	0.16
439	0.15
440	0.14
441	0.12
442	0.11
443	0.07
444	0.06
445	0.04
446	0.03
447	0.04
448	0.04
449	0.04
450	0.04
451	0.04
452	0.04
453	0.03
454	0.04
455	0.05
456	0.06
457	0.06
458	0.08
459	0.14
460	0.19
461	0.19
462	0.22
463	0.21
464	0.21
465	0.22
466	0.23
467	0.21
468	0.18
469	0.19
470	0.18
471	0.17
472	0.16
473	0.14
474	0.11
475	0.07
476	0.06
477	0.05
478	0.03
479	0.04
480	0.04
481	0.04
482	0.05
483	0.05
484	0.06
485	0.08
486	0.09
487	0.11
488	0.14
489	0.2
490	0.29
491	0.33
492	0.35
493	0.36
494	0.36
495	0.34
496	0.35
497	0.3
498	0.21
499	0.17
500	0.15
501	0.15
502	0.14
503	0.15
504	0.13
505	0.13
506	0.12
507	0.12
508	0.12
509	0.11
510	0.11
511	0.11
512	0.08
513	0.08
514	0.08
515	0.08
516	0.09
517	0.06
518	0.07
519	0.08
520	0.08
521	0.08
522	0.08
523	0.09
524	0.09
525	0.09
526	0.11
527	0.12
528	0.13
529	0.16
530	0.17
531	0.18
532	0.18
533	0.18
534	0.16
535	0.15
536	0.16
537	0.15
538	0.14
539	0.15
540	0.15
541	0.18
542	0.23
543	0.23
544	0.27
545	0.29
546	0.29
547	0.27
548	0.28
549	0.25
550	0.19
551	0.19
552	0.13
553	0.09
554	0.08
555	0.07
556	0.05
557	0.04
558	0.04
559	0.03
560	0.02
561	0.03
562	0.05
563	0.06
564	0.06
565	0.06
566	0.07
567	0.07
568	0.07
569	0.09
570	0.08
571	0.1
572	0.15
573	0.15
574	0.16
575	0.16
576	0.18
577	0.21
578	0.22
579	0.21
580	0.18
581	0.19
582	0.21
583	0.21
584	0.19
585	0.14
586	0.13
587	0.12
588	0.1
589	0.1
590	0.07
591	0.08
592	0.1
593	0.11
594	0.1
595	0.13
596	0.13
597	0.11
598	0.12
599	0.11
600	0.09
601	0.08
602	0.09
603	0.06
604	0.07
605	0.07
606	0.07
607	0.07
608	0.06
609	0.07
610	0.06
611	0.06
612	0.06
613	0.06
614	0.08
615	0.09
616	0.09
617	0.1
618	0.1
619	0.1
620	0.12
621	0.12
622	0.1
623	0.09
624	0.09
625	0.08
626	0.1
627	0.1
628	0.08
629	0.08
630	0.08
631	0.07
632	0.09
633	0.09
634	0.07
635	0.08
636	0.07
637	0.08
638	0.09
639	0.09
640	0.08
641	0.08
642	0.07
643	0.07
644	0.07
645	0.07
646	0.07
647	0.07
648	0.08
649	0.08
650	0.08
651	0.08
652	0.07
653	0.08
654	0.15
655	0.18
656	0.19
657	0.28
658	0.32
659	0.38
660	0.4
661	0.39
662	0.33
663	0.34
664	0.34
665	0.27
666	0.25
667	0.18
668	0.17
669	0.17
670	0.15
671	0.11
672	0.09
673	0.08
674	0.04
675	0.04
676	0.05
677	0.04
678	0.06
679	0.09
680	0.11
681	0.14
682	0.17
683	0.17
684	0.2
685	0.21
686	0.2
687	0.22
688	0.22
689	0.19
690	0.17
691	0.17
692	0.14
693	0.14
694	0.13
695	0.11
696	0.11
697	0.11
698	0.11
699	0.14
700	0.16
701	0.18
702	0.22
703	0.26
704	0.27
705	0.29
706	0.3
707	0.28
708	0.28
709	0.31
710	0.33
711	0.29
712	0.32
713	0.3
714	0.3
715	0.36
716	0.33
717	0.32
718	0.27
719	0.27
720	0.22
721	0.22
722	0.22
723	0.19
724	0.2
725	0.17
726	0.21
727	0.23
728	0.25
729	0.25
730	0.29
731	0.3
732	0.34
733	0.35
734	0.3
735	0.32
736	0.31
737	0.34
738	0.36
739	0.32
740	0.27
741	0.26
742	0.25
743	0.19
744	0.19
745	0.15
746	0.09
747	0.1
748	0.09
749	0.09
750	0.08
751	0.08
752	0.07
753	0.09
754	0.1
755	0.11
756	0.13
757	0.13
758	0.14
759	0.16
760	0.15
761	0.15
762	0.14
763	0.14
764	0.12
765	0.13
766	0.13
767	0.11
768	0.11
769	0.1
770	0.09
771	0.1
772	0.11
773	0.12
774	0.11
775	0.11
776	0.13
777	0.13
778	0.15
779	0.18
780	0.21
781	0.27
782	0.29
783	0.31
784	0.31
785	0.33
786	0.35
787	0.34
788	0.4
789	0.34
790	0.35
791	0.36
792	0.35
793	0.32
794	0.27
795	0.25
796	0.16
797	0.15
798	0.13
799	0.13
800	0.13
801	0.13
802	0.14
803	0.15
804	0.15
805	0.14
806	0.13
807	0.14
808	0.14
809	0.16
810	0.15
811	0.14
812	0.14
813	0.14
814	0.13
815	0.11
816	0.1
817	0.09
818	0.09
819	0.11
820	0.11
821	0.11
822	0.11
823	0.12
824	0.13
825	0.12
826	0.12
827	0.1
828	0.09
829	0.08
830	0.08
831	0.08
832	0.07
833	0.07
834	0.07
835	0.07
836	0.06
837	0.07
838	0.07
839	0.07
840	0.07
841	0.07
842	0.13
843	0.16
844	0.23
845	0.27
846	0.34
847	0.41
848	0.47
849	0.51
850	0.54
851	0.59
852	0.55
853	0.57
854	0.6
855	0.63
856	0.63
857	0.65
858	0.54
859	0.5
860	0.48
861	0.48
862	0.42
863	0.35
864	0.33
865	0.32
866	0.43
867	0.43
868	0.42
869	0.41
870	0.37
871	0.41
872	0.39
873	0.35
874	0.25
875	0.25
876	0.26
877	0.21
878	0.22
879	0.15
880	0.13
881	0.12
882	0.11
883	0.09
884	0.08
885	0.11
886	0.11
887	0.13
888	0.13
889	0.13
890	0.15
891	0.15
892	0.15
893	0.13
894	0.13
895	0.14
896	0.19
897	0.2
898	0.2
899	0.21
900	0.25
901	0.27
902	0.26
903	0.34
904	0.38
905	0.38
906	0.4
907	0.42
908	0.38
909	0.36
910	0.36
911	0.29
912	0.2
913	0.18
914	0.16
915	0.13
916	0.12
917	0.11
918	0.11
919	0.08
920	0.09
921	0.11
922	0.11
923	0.11
924	0.16
925	0.17
926	0.18
927	0.18
928	0.18
929	0.16
930	0.15
931	0.15
932	0.11
933	0.09
934	0.08
935	0.1
936	0.11
937	0.15
938	0.15
939	0.16
940	0.16
941	0.18
942	0.19
943	0.17
944	0.17
945	0.14
946	0.15
947	0.15
948	0.14
949	0.13
950	0.12
951	0.13
952	0.11
953	0.1
954	0.09
955	0.08
956	0.08
957	0.11
958	0.13
959	0.2
960	0.27
961	0.31
962	0.4
963	0.48
964	0.57
965	0.65
966	0.73
967	0.76
968	0.79
969	0.86
970	0.83
971	0.81
972	0.81
973	0.79
974	0.75
975	0.72
976	0.69
977	0.6
978	0.58
979	0.51
980	0.44
981	0.38
982	0.37
983	0.34
984	0.3
985	0.31
986	0.32
987	0.32
988	0.32
989	0.3

L0PIM6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer