Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L0P8Q4

Protein Details
Accession L0P8Q4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
332-358LPVGDRERPSREKKEKRTQYDEQNNSNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
339-346RPSREKKE
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 15.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01424  R3H  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51061  R3H  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MEKHNEGVQTQGMGGMGGIRIHRNDISQSRLFNGYSVAAENENLPLLRSFSSPTLRPAELGKNSFGALASTSASSVESSAASAVSITQPAMPSPDVLFSKHTPTTYATVHAGGRVERTNASRLGYRVYEDSFLQTSSATASAFHPPSTQQTISSFSYDPSVVTPMTYNNYGYMARRTVFKPREKQPNQWLNESETIPTGSVQNSNINNTFVPSGVPASISDSQENSLQDNSFQEPTMNTLKTTNRAEDGVIPSAIVVKNIPFQIKKEQLLELFDTLDIPKPYAFNYHFDNGNFRGLAFANFYTPEETTRVILSLNGHDIMGRKLRVEYKRVLPVGDRERPSREKKEKRTQYDEQNNSNNPGYTKGKGKFKGDIDLNDEATLKIYSRLLLFRNDQSPNAPNEFIFPPDLNPQQRRIVHLVAEKLDLEHTSCGENDAKYIVVKRLNANNIDNMNKNFWNKSDF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.09
3 0.08
4 0.09
5 0.1
6 0.12
7 0.13
8 0.17
9 0.18
10 0.19
11 0.26
12 0.29
13 0.35
14 0.36
15 0.37
16 0.37
17 0.39
18 0.37
19 0.3
20 0.27
21 0.21
22 0.18
23 0.18
24 0.17
25 0.14
26 0.14
27 0.14
28 0.13
29 0.13
30 0.12
31 0.12
32 0.11
33 0.12
34 0.13
35 0.14
36 0.15
37 0.19
38 0.25
39 0.25
40 0.3
41 0.33
42 0.32
43 0.32
44 0.34
45 0.38
46 0.39
47 0.4
48 0.36
49 0.32
50 0.32
51 0.31
52 0.27
53 0.18
54 0.12
55 0.11
56 0.1
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.09
62 0.08
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.07
73 0.07
74 0.08
75 0.09
76 0.09
77 0.12
78 0.12
79 0.12
80 0.12
81 0.17
82 0.17
83 0.18
84 0.22
85 0.21
86 0.27
87 0.28
88 0.27
89 0.24
90 0.26
91 0.29
92 0.25
93 0.27
94 0.22
95 0.22
96 0.22
97 0.22
98 0.2
99 0.16
100 0.18
101 0.17
102 0.17
103 0.17
104 0.19
105 0.21
106 0.21
107 0.23
108 0.23
109 0.22
110 0.24
111 0.22
112 0.22
113 0.2
114 0.2
115 0.2
116 0.17
117 0.19
118 0.16
119 0.16
120 0.14
121 0.12
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.07
126 0.07
127 0.09
128 0.15
129 0.16
130 0.16
131 0.16
132 0.16
133 0.21
134 0.25
135 0.24
136 0.19
137 0.2
138 0.25
139 0.26
140 0.27
141 0.23
142 0.17
143 0.19
144 0.18
145 0.16
146 0.12
147 0.13
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.1
152 0.12
153 0.13
154 0.12
155 0.11
156 0.13
157 0.13
158 0.14
159 0.15
160 0.15
161 0.14
162 0.17
163 0.18
164 0.27
165 0.34
166 0.4
167 0.45
168 0.52
169 0.63
170 0.64
171 0.7
172 0.71
173 0.73
174 0.68
175 0.64
176 0.57
177 0.5
178 0.49
179 0.42
180 0.31
181 0.23
182 0.2
183 0.16
184 0.14
185 0.11
186 0.08
187 0.09
188 0.1
189 0.15
190 0.15
191 0.17
192 0.18
193 0.18
194 0.17
195 0.16
196 0.15
197 0.1
198 0.09
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.07
203 0.06
204 0.1
205 0.13
206 0.14
207 0.14
208 0.13
209 0.14
210 0.16
211 0.17
212 0.13
213 0.11
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.12
218 0.1
219 0.1
220 0.1
221 0.09
222 0.12
223 0.16
224 0.15
225 0.13
226 0.16
227 0.17
228 0.22
229 0.24
230 0.21
231 0.18
232 0.18
233 0.19
234 0.19
235 0.2
236 0.17
237 0.15
238 0.13
239 0.12
240 0.14
241 0.13
242 0.1
243 0.07
244 0.07
245 0.1
246 0.11
247 0.14
248 0.12
249 0.14
250 0.22
251 0.27
252 0.29
253 0.28
254 0.28
255 0.27
256 0.29
257 0.28
258 0.2
259 0.16
260 0.13
261 0.12
262 0.11
263 0.13
264 0.11
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.11
269 0.16
270 0.17
271 0.16
272 0.2
273 0.23
274 0.24
275 0.24
276 0.28
277 0.24
278 0.25
279 0.22
280 0.17
281 0.16
282 0.14
283 0.15
284 0.13
285 0.11
286 0.1
287 0.11
288 0.12
289 0.12
290 0.11
291 0.12
292 0.12
293 0.12
294 0.12
295 0.12
296 0.12
297 0.1
298 0.11
299 0.11
300 0.11
301 0.12
302 0.12
303 0.11
304 0.12
305 0.13
306 0.15
307 0.17
308 0.16
309 0.15
310 0.18
311 0.26
312 0.3
313 0.33
314 0.36
315 0.38
316 0.46
317 0.46
318 0.44
319 0.38
320 0.42
321 0.46
322 0.48
323 0.44
324 0.39
325 0.46
326 0.52
327 0.58
328 0.6
329 0.63
330 0.66
331 0.73
332 0.81
333 0.85
334 0.86
335 0.87
336 0.84
337 0.84
338 0.84
339 0.81
340 0.77
341 0.75
342 0.68
343 0.63
344 0.57
345 0.47
346 0.37
347 0.36
348 0.32
349 0.28
350 0.34
351 0.36
352 0.44
353 0.48
354 0.51
355 0.52
356 0.51
357 0.57
358 0.53
359 0.5
360 0.47
361 0.45
362 0.42
363 0.35
364 0.33
365 0.24
366 0.21
367 0.18
368 0.13
369 0.11
370 0.11
371 0.12
372 0.13
373 0.17
374 0.18
375 0.23
376 0.27
377 0.3
378 0.37
379 0.37
380 0.36
381 0.37
382 0.4
383 0.4
384 0.39
385 0.35
386 0.27
387 0.3
388 0.3
389 0.27
390 0.26
391 0.21
392 0.2
393 0.26
394 0.33
395 0.37
396 0.39
397 0.42
398 0.48
399 0.49
400 0.52
401 0.51
402 0.47
403 0.45
404 0.47
405 0.47
406 0.4
407 0.4
408 0.34
409 0.29
410 0.27
411 0.22
412 0.19
413 0.15
414 0.14
415 0.14
416 0.14
417 0.17
418 0.18
419 0.18
420 0.17
421 0.17
422 0.17
423 0.18
424 0.21
425 0.24
426 0.26
427 0.29
428 0.35
429 0.42
430 0.48
431 0.51
432 0.51
433 0.52
434 0.52
435 0.53
436 0.52
437 0.47
438 0.46
439 0.45
440 0.46
441 0.42