Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L0PDG4

Protein Details
Accession L0PDG4    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-32MGKSKKEKKDEKKGTFNPSNKKKISRNPHFFIHydrophilic
58-79ANPLAPKKLRKRVLKTLRKGKLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-26KSKKEKKDEKKGTFNPSNKKKISR
63-77PKKLRKRVLKTLRKG
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029064  L30e-like  
IPR004038  Ribosomal_L7Ae/L30e/S12e/Gad45  
IPR018492  Ribosomal_L7Ae/L8/Nhp2  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01248  Ribosomal_L7Ae  
Amino Acid Sequences MGKSKKEKKDEKKGTFNPSNKKKISRNPHFFIVKVDNSEKKHKKTDSDDYIDSLSPIANPLAPKKLRKRVLKTLRKGKLVILAGDISPIDVISHLPVLCEDYSCPYVFVPSKESLGEASNTQRPTSCIMIIPGGKNKDLSTAKETYMETYEEVLKQIENAHTWSHNTDEI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.87
3 0.84
4 0.84
5 0.83
6 0.83
7 0.77
8 0.78
9 0.77
10 0.77
11 0.8
12 0.81
13 0.8
14 0.76
15 0.79
16 0.73
17 0.64
18 0.6
19 0.56
20 0.47
21 0.43
22 0.43
23 0.4
24 0.42
25 0.52
26 0.54
27 0.53
28 0.59
29 0.58
30 0.6
31 0.62
32 0.68
33 0.65
34 0.64
35 0.59
36 0.52
37 0.5
38 0.42
39 0.34
40 0.24
41 0.15
42 0.09
43 0.09
44 0.07
45 0.07
46 0.08
47 0.1
48 0.18
49 0.21
50 0.28
51 0.36
52 0.45
53 0.52
54 0.6
55 0.66
56 0.69
57 0.78
58 0.81
59 0.81
60 0.82
61 0.8
62 0.74
63 0.67
64 0.57
65 0.52
66 0.43
67 0.34
68 0.25
69 0.19
70 0.16
71 0.15
72 0.14
73 0.07
74 0.05
75 0.05
76 0.03
77 0.03
78 0.03
79 0.03
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.08
85 0.07
86 0.08
87 0.07
88 0.1
89 0.11
90 0.12
91 0.12
92 0.1
93 0.13
94 0.14
95 0.15
96 0.16
97 0.16
98 0.17
99 0.16
100 0.17
101 0.15
102 0.15
103 0.15
104 0.12
105 0.15
106 0.19
107 0.19
108 0.19
109 0.19
110 0.19
111 0.22
112 0.23
113 0.2
114 0.16
115 0.17
116 0.21
117 0.22
118 0.24
119 0.26
120 0.26
121 0.26
122 0.25
123 0.24
124 0.29
125 0.29
126 0.31
127 0.3
128 0.31
129 0.31
130 0.34
131 0.34
132 0.29
133 0.28
134 0.24
135 0.2
136 0.19
137 0.21
138 0.17
139 0.18
140 0.16
141 0.14
142 0.13
143 0.17
144 0.17
145 0.16
146 0.18
147 0.2
148 0.22
149 0.24
150 0.26