Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L0PDF2

Protein Details
Accession L0PDF2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-59QTPLNFFKRQKLPKNTIFKFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001107  Band_7  
IPR036013  Band_7/SPFH_dom_sf  
IPR032435  STML2-like_C  
IPR001972  Stomatin_HflK_fam  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF01145  Band_7  
PF16200  Band_7_C  
CDD cd08829  SPFH_paraslipin  
Amino Acid Sequences MHKSHYLIRDNLQKRLLPSFNYGFINIRHYTDIPRRKFNQTPLNFFKRQKLPKNTIFKFVPQQEAWIVERMGKFSRVLEPGLAILVPFLDRIKYVKSLKEIAMEIPSQSAITLDNVTLELDGVLYVRILDPYKACYGVEDAEYAVAQLAQTTMRSEIGQLALDHVLKERQMLNVNITEAINEAAADWGIKCLRYEIRDIHPPQNVLLAMHRQVSAERSKRAEILESEGQRQSCINIAEGQKQSQILNSEAIKQESINKATGEAEAILLKATATAKGISAIASVLSENPMGLDAVNLRIAEKYVNAFGNIAKESTSIVVPANLNDINSMVAQALTVINKLNQNTPQKKEKSPALPKTPPVLKIAGSEEKEKKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.54
3 0.51
4 0.44
5 0.47
6 0.44
7 0.44
8 0.43
9 0.41
10 0.35
11 0.33
12 0.36
13 0.3
14 0.28
15 0.27
16 0.26
17 0.33
18 0.4
19 0.48
20 0.48
21 0.56
22 0.58
23 0.63
24 0.69
25 0.71
26 0.71
27 0.68
28 0.72
29 0.72
30 0.76
31 0.74
32 0.7
33 0.7
34 0.69
35 0.72
36 0.73
37 0.74
38 0.75
39 0.78
40 0.86
41 0.79
42 0.77
43 0.7
44 0.64
45 0.63
46 0.59
47 0.56
48 0.45
49 0.46
50 0.39
51 0.4
52 0.36
53 0.3
54 0.26
55 0.23
56 0.23
57 0.23
58 0.24
59 0.21
60 0.21
61 0.19
62 0.25
63 0.23
64 0.23
65 0.21
66 0.2
67 0.18
68 0.18
69 0.15
70 0.09
71 0.06
72 0.06
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.06
78 0.08
79 0.11
80 0.18
81 0.21
82 0.25
83 0.29
84 0.33
85 0.33
86 0.35
87 0.33
88 0.28
89 0.28
90 0.24
91 0.2
92 0.16
93 0.15
94 0.11
95 0.1
96 0.08
97 0.06
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.06
106 0.05
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.03
111 0.03
112 0.04
113 0.04
114 0.05
115 0.06
116 0.07
117 0.08
118 0.11
119 0.12
120 0.13
121 0.12
122 0.12
123 0.13
124 0.13
125 0.13
126 0.1
127 0.09
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.06
132 0.04
133 0.04
134 0.03
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.05
139 0.06
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.08
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.09
152 0.09
153 0.08
154 0.1
155 0.09
156 0.1
157 0.14
158 0.14
159 0.16
160 0.16
161 0.16
162 0.16
163 0.14
164 0.12
165 0.09
166 0.08
167 0.06
168 0.05
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.03
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.07
179 0.1
180 0.11
181 0.14
182 0.17
183 0.21
184 0.29
185 0.33
186 0.35
187 0.36
188 0.34
189 0.32
190 0.3
191 0.26
192 0.18
193 0.17
194 0.14
195 0.13
196 0.13
197 0.14
198 0.11
199 0.12
200 0.15
201 0.21
202 0.23
203 0.25
204 0.26
205 0.27
206 0.28
207 0.28
208 0.28
209 0.21
210 0.23
211 0.26
212 0.25
213 0.27
214 0.27
215 0.27
216 0.24
217 0.23
218 0.17
219 0.14
220 0.14
221 0.12
222 0.15
223 0.17
224 0.24
225 0.25
226 0.25
227 0.23
228 0.24
229 0.23
230 0.2
231 0.2
232 0.15
233 0.17
234 0.17
235 0.2
236 0.2
237 0.21
238 0.19
239 0.17
240 0.22
241 0.23
242 0.24
243 0.22
244 0.2
245 0.21
246 0.21
247 0.21
248 0.16
249 0.11
250 0.1
251 0.08
252 0.08
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.08
261 0.08
262 0.09
263 0.1
264 0.08
265 0.08
266 0.07
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.05
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.11
288 0.11
289 0.14
290 0.15
291 0.15
292 0.15
293 0.16
294 0.19
295 0.18
296 0.16
297 0.13
298 0.12
299 0.13
300 0.13
301 0.13
302 0.09
303 0.09
304 0.13
305 0.13
306 0.13
307 0.16
308 0.15
309 0.15
310 0.14
311 0.14
312 0.12
313 0.11
314 0.11
315 0.07
316 0.07
317 0.06
318 0.07
319 0.08
320 0.08
321 0.09
322 0.1
323 0.12
324 0.16
325 0.18
326 0.23
327 0.29
328 0.4
329 0.47
330 0.52
331 0.59
332 0.62
333 0.66
334 0.68
335 0.7
336 0.7
337 0.73
338 0.76
339 0.76
340 0.77
341 0.76
342 0.78
343 0.74
344 0.66
345 0.59
346 0.52
347 0.43
348 0.4
349 0.42
350 0.42
351 0.38
352 0.44