FuNGI

L0P9C1

Protein Details

Accession

L0P9C1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
974-995	EDNNRKERKHIVEKNLDKRNIF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
687-710	AKPRHRSDKKTLEEAKTEKVKKKQ

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR028598 BOP1/Erb1 IPR012953 BOP1_N_dom IPR034805 Nop4_RRM1 IPR034806 Nop4_RRM2 IPR034808 Nop4p_RRM3 IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR019775 WD40_repeat_CS IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0003723 F:RNA binding GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF08145 BOP1NT PF00076 RRM_1 PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM PS00678 WD_REPEATS_1 PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION
CDD	cd12674 RRM1_Nop4p cd12675 RRM2_Nop4p cd12676 RRM3_Nop4p

Amino Acid Sequences

MVAGSRRGVHSTAQPAEETDESLDWGLQNVSEDTDGAQDTDSIEDTEYVSSGDSEVIAGYGSESSTEETRNTIGGVSLDKYAGTGVISKETGEEVRLTAEELDLVRKIQQGRVPDDEFDPYEIIKIVRAIREGRIVLKSEADWEKHPVFYDIWSDASAKTHEHIMHIPAPKMPLPIHSESYNPPEEYLPSDDEIDKWNHTLPEDRETNYLPSKYRSLRLVPGYDRFMQERFERCLDLYLAPRVRRNRLNIDPDSLLPKLPPPEDLRPFPTRCSTVYKGHEGRVRSIDVDSSGLWLASGGDDCVVRVWEVITGKEMWRFHIENTDNPVDSLAWRPTKNSDLISVSCGNHVYMLLPSVLNDKVKDAAKELSTSGFNTDPSQTAKTLATWSRPSSTQVDRGLVLLLNVKKRIRRVVWHRQGDYFVTLAPENGNTAVLVHLLSKHQSQTPFKKIKGLVQTLAFHPTKPLFFVATQRYVRVYNLVKQELVKIIQPGLRWISSIDIHPQGDNLILGSYDKKLAWIDMDLSPRPYKTLCYHTKALRSVAFHKGIYPLFCSASDDGSIHVFHGMVYNDLMQNPLLVPLKILKGHEITCSLGILDGAQMTQDGNENVHNTSIFVRRIPLDVSLPSFTSFFEEIGRVKHAMIVTDPETKKSKGYGFVSFSTHSDAEKAICELKKRTLSGHFLKAEFAKPRHRSDKKTLEEAKTEKVKKKQLRPFLIIRNLPWSVRKKDHAFFLEFGKYGKVVNVIIPRKKGGKMSGFAFVHMKQMSAAEEAIKCINGVELEGRHVAVDWALSQSEWKDFLEKEEKSAKDIDTDDSVSSFMETKDIISNNTELVNKSDSSEKGSVIKEDQKPPTALYDSNERTLFVKNLSFQTTDNELFSHFCQFGRLKYARVVMDAFTGRSKGTAFVCFHHKMDMENCLNVYRDLTQQSALSVNKKSTVLQNQILDDNIEKFTLDGHLVSVFPALNKEDISVIEDNNRKERKHIVEKNLDKRNIFLLNEGYIDPKSSLFNLLNETERDMRNQSLTQRKKLLEKNPSLYISLTRLAVRNIPKDISDKDLKALARKACVDFAKEVKEKKRAPLTREENLRD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.33
3	0.36
4	0.34
5	0.28
6	0.21
7	0.17
8	0.17
9	0.17
10	0.16
11	0.12
12	0.13
13	0.11
14	0.1
15	0.11
16	0.11
17	0.12
18	0.11
19	0.12
20	0.11
21	0.13
22	0.13
23	0.11
24	0.11
25	0.1
26	0.1
27	0.11
28	0.12
29	0.1
30	0.1
31	0.1
32	0.11
33	0.11
34	0.11
35	0.09
36	0.09
37	0.08
38	0.08
39	0.08
40	0.07
41	0.06
42	0.06
43	0.06
44	0.06
45	0.05
46	0.05
47	0.06
48	0.05
49	0.06
50	0.07
51	0.09
52	0.11
53	0.13
54	0.13
55	0.14
56	0.16
57	0.15
58	0.15
59	0.13
60	0.12
61	0.12
62	0.14
63	0.13
64	0.14
65	0.13
66	0.13
67	0.12
68	0.11
69	0.1
70	0.09
71	0.11
72	0.11
73	0.14
74	0.15
75	0.15
76	0.15
77	0.17
78	0.17
79	0.15
80	0.15
81	0.11
82	0.13
83	0.13
84	0.14
85	0.12
86	0.11
87	0.12
88	0.11
89	0.13
90	0.12
91	0.13
92	0.14
93	0.18
94	0.2
95	0.23
96	0.26
97	0.3
98	0.35
99	0.42
100	0.42
101	0.39
102	0.39
103	0.38
104	0.36
105	0.31
106	0.26
107	0.19
108	0.18
109	0.17
110	0.15
111	0.13
112	0.16
113	0.17
114	0.19
115	0.22
116	0.23
117	0.25
118	0.31
119	0.31
120	0.31
121	0.31
122	0.32
123	0.3
124	0.29
125	0.27
126	0.28
127	0.31
128	0.29
129	0.28
130	0.31
131	0.32
132	0.32
133	0.32
134	0.28
135	0.24
136	0.23
137	0.25
138	0.2
139	0.19
140	0.19
141	0.19
142	0.17
143	0.19
144	0.18
145	0.15
146	0.15
147	0.19
148	0.19
149	0.21
150	0.23
151	0.25
152	0.3
153	0.33
154	0.33
155	0.29
156	0.32
157	0.3
158	0.31
159	0.27
160	0.25
161	0.28
162	0.31
163	0.33
164	0.31
165	0.32
166	0.32
167	0.38
168	0.37
169	0.31
170	0.28
171	0.25
172	0.25
173	0.26
174	0.27
175	0.23
176	0.2
177	0.22
178	0.21
179	0.21
180	0.23
181	0.22
182	0.19
183	0.18
184	0.2
185	0.19
186	0.2
187	0.26
188	0.26
189	0.31
190	0.33
191	0.33
192	0.33
193	0.34
194	0.38
195	0.36
196	0.36
197	0.3
198	0.31
199	0.36
200	0.37
201	0.4
202	0.4
203	0.39
204	0.43
205	0.46
206	0.49
207	0.46
208	0.47
209	0.47
210	0.45
211	0.43
212	0.38
213	0.33
214	0.3
215	0.32
216	0.32
217	0.33
218	0.32
219	0.31
220	0.3
221	0.32
222	0.3
223	0.28
224	0.25
225	0.28
226	0.32
227	0.33
228	0.38
229	0.41
230	0.46
231	0.49
232	0.53
233	0.54
234	0.57
235	0.63
236	0.6
237	0.59
238	0.54
239	0.49
240	0.46
241	0.37
242	0.29
243	0.2
244	0.21
245	0.2
246	0.19
247	0.22
248	0.24
249	0.33
250	0.38
251	0.42
252	0.45
253	0.48
254	0.49
255	0.48
256	0.47
257	0.4
258	0.37
259	0.42
260	0.4
261	0.41
262	0.45
263	0.51
264	0.48
265	0.52
266	0.53
267	0.47
268	0.47
269	0.42
270	0.38
271	0.3
272	0.28
273	0.23
274	0.2
275	0.19
276	0.14
277	0.12
278	0.11
279	0.09
280	0.09
281	0.08
282	0.07
283	0.06
284	0.06
285	0.04
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.06
290	0.06
291	0.06
292	0.06
293	0.06
294	0.08
295	0.09
296	0.1
297	0.11
298	0.12
299	0.13
300	0.18
301	0.18
302	0.18
303	0.23
304	0.23
305	0.22
306	0.3
307	0.31
308	0.3
309	0.36
310	0.36
311	0.31
312	0.3
313	0.29
314	0.2
315	0.19
316	0.2
317	0.19
318	0.21
319	0.21
320	0.22
321	0.25
322	0.28
323	0.3
324	0.27
325	0.25
326	0.24
327	0.24
328	0.27
329	0.27
330	0.24
331	0.22
332	0.21
333	0.17
334	0.14
335	0.13
336	0.1
337	0.07
338	0.08
339	0.07
340	0.07
341	0.07
342	0.09
343	0.11
344	0.11
345	0.11
346	0.11
347	0.15
348	0.17
349	0.17
350	0.17
351	0.19
352	0.19
353	0.2
354	0.19
355	0.17
356	0.16
357	0.16
358	0.16
359	0.13
360	0.13
361	0.13
362	0.14
363	0.14
364	0.16
365	0.17
366	0.15
367	0.17
368	0.16
369	0.16
370	0.19
371	0.2
372	0.22
373	0.23
374	0.25
375	0.25
376	0.26
377	0.28
378	0.28
379	0.29
380	0.31
381	0.3
382	0.3
383	0.27
384	0.27
385	0.24
386	0.19
387	0.16
388	0.15
389	0.15
390	0.17
391	0.2
392	0.22
393	0.23
394	0.27
395	0.34
396	0.32
397	0.39
398	0.46
399	0.54
400	0.62
401	0.68
402	0.66
403	0.6
404	0.59
405	0.5
406	0.42
407	0.31
408	0.21
409	0.14
410	0.12
411	0.11
412	0.09
413	0.08
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.05
418	0.05
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.06
424	0.06
425	0.08
426	0.09
427	0.1
428	0.13
429	0.18
430	0.25
431	0.32
432	0.41
433	0.46
434	0.45
435	0.51
436	0.49
437	0.5
438	0.51
439	0.47
440	0.39
441	0.37
442	0.38
443	0.32
444	0.37
445	0.31
446	0.22
447	0.21
448	0.2
449	0.16
450	0.16
451	0.16
452	0.11
453	0.12
454	0.18
455	0.2
456	0.26
457	0.26
458	0.26
459	0.26
460	0.25
461	0.25
462	0.25
463	0.22
464	0.21
465	0.26
466	0.26
467	0.25
468	0.25
469	0.26
470	0.22
471	0.21
472	0.17
473	0.12
474	0.13
475	0.14
476	0.14
477	0.14
478	0.15
479	0.14
480	0.13
481	0.12
482	0.12
483	0.11
484	0.12
485	0.13
486	0.14
487	0.14
488	0.14
489	0.14
490	0.12
491	0.11
492	0.1
493	0.07
494	0.04
495	0.04
496	0.04
497	0.05
498	0.05
499	0.06
500	0.06
501	0.07
502	0.07
503	0.08
504	0.08
505	0.07
506	0.09
507	0.12
508	0.15
509	0.14
510	0.16
511	0.17
512	0.16
513	0.17
514	0.15
515	0.14
516	0.15
517	0.24
518	0.28
519	0.32
520	0.37
521	0.4
522	0.45
523	0.44
524	0.42
525	0.36
526	0.33
527	0.31
528	0.32
529	0.31
530	0.26
531	0.24
532	0.25
533	0.23
534	0.21
535	0.18
536	0.14
537	0.12
538	0.13
539	0.14
540	0.11
541	0.11
542	0.11
543	0.09
544	0.09
545	0.09
546	0.09
547	0.07
548	0.07
549	0.06
550	0.05
551	0.07
552	0.07
553	0.06
554	0.07
555	0.07
556	0.08
557	0.08
558	0.08
559	0.06
560	0.06
561	0.05
562	0.08
563	0.08
564	0.07
565	0.08
566	0.09
567	0.11
568	0.13
569	0.13
570	0.12
571	0.13
572	0.14
573	0.15
574	0.15
575	0.14
576	0.13
577	0.12
578	0.1
579	0.08
580	0.07
581	0.06
582	0.04
583	0.04
584	0.03
585	0.03
586	0.03
587	0.03
588	0.03
589	0.05
590	0.05
591	0.05
592	0.07
593	0.08
594	0.08
595	0.09
596	0.08
597	0.08
598	0.1
599	0.14
600	0.14
601	0.13
602	0.14
603	0.14
604	0.16
605	0.16
606	0.14
607	0.12
608	0.12
609	0.14
610	0.14
611	0.13
612	0.13
613	0.12
614	0.11
615	0.12
616	0.12
617	0.1
618	0.1
619	0.11
620	0.11
621	0.12
622	0.14
623	0.11
624	0.11
625	0.13
626	0.12
627	0.11
628	0.11
629	0.13
630	0.13
631	0.21
632	0.21
633	0.22
634	0.25
635	0.25
636	0.26
637	0.26
638	0.26
639	0.25
640	0.28
641	0.3
642	0.31
643	0.32
644	0.34
645	0.32
646	0.29
647	0.26
648	0.23
649	0.18
650	0.15
651	0.14
652	0.12
653	0.11
654	0.12
655	0.13
656	0.14
657	0.17
658	0.18
659	0.24
660	0.28
661	0.28
662	0.3
663	0.31
664	0.38
665	0.4
666	0.45
667	0.41
668	0.37
669	0.38
670	0.37
671	0.36
672	0.34
673	0.32
674	0.34
675	0.37
676	0.44
677	0.53
678	0.57
679	0.6
680	0.64
681	0.71
682	0.66
683	0.71
684	0.7
685	0.63
686	0.63
687	0.59
688	0.56
689	0.54
690	0.55
691	0.52
692	0.53
693	0.59
694	0.61
695	0.69
696	0.71
697	0.72
698	0.74
699	0.73
700	0.72
701	0.71
702	0.71
703	0.62
704	0.55
705	0.5
706	0.44
707	0.39
708	0.38
709	0.36
710	0.35
711	0.38
712	0.44
713	0.44
714	0.46
715	0.52
716	0.5
717	0.46
718	0.41
719	0.41
720	0.37
721	0.31
722	0.29
723	0.22
724	0.18
725	0.15
726	0.14
727	0.12
728	0.09
729	0.13
730	0.21
731	0.27
732	0.3
733	0.32
734	0.34
735	0.35
736	0.37
737	0.36
738	0.35
739	0.35
740	0.35
741	0.35
742	0.41
743	0.38
744	0.37
745	0.36
746	0.29
747	0.28
748	0.25
749	0.23
750	0.14
751	0.15
752	0.15
753	0.14
754	0.13
755	0.11
756	0.11
757	0.12
758	0.12
759	0.11
760	0.1
761	0.09
762	0.09
763	0.06
764	0.07
765	0.08
766	0.08
767	0.1
768	0.11
769	0.11
770	0.1
771	0.1
772	0.1
773	0.07
774	0.07
775	0.05
776	0.06
777	0.06
778	0.06
779	0.07
780	0.08
781	0.1
782	0.11
783	0.11
784	0.13
785	0.13
786	0.19
787	0.27
788	0.26
789	0.29
790	0.35
791	0.35
792	0.35
793	0.38
794	0.32
795	0.28
796	0.29
797	0.26
798	0.21
799	0.22
800	0.2
801	0.17
802	0.17
803	0.13
804	0.12
805	0.11
806	0.08
807	0.08
808	0.08
809	0.09
810	0.13
811	0.14
812	0.14
813	0.15
814	0.16
815	0.16
816	0.18
817	0.18
818	0.14
819	0.17
820	0.18
821	0.16
822	0.17
823	0.21
824	0.19
825	0.24
826	0.25
827	0.23
828	0.26
829	0.27
830	0.27
831	0.27
832	0.35
833	0.35
834	0.42
835	0.45
836	0.44
837	0.44
838	0.43
839	0.43
840	0.37
841	0.32
842	0.27
843	0.33
844	0.31
845	0.34
846	0.33
847	0.29
848	0.28
849	0.29
850	0.29
851	0.21
852	0.22
853	0.2
854	0.24
855	0.26
856	0.26
857	0.23
858	0.26
859	0.29
860	0.27
861	0.24
862	0.21
863	0.19
864	0.2
865	0.2
866	0.2
867	0.15
868	0.14
869	0.19
870	0.2
871	0.21
872	0.28
873	0.29
874	0.27
875	0.3
876	0.36
877	0.32
878	0.32
879	0.32
880	0.23
881	0.27
882	0.26
883	0.23
884	0.18
885	0.18
886	0.16
887	0.16
888	0.16
889	0.14
890	0.15
891	0.21
892	0.21
893	0.23
894	0.31
895	0.33
896	0.33
897	0.34
898	0.32
899	0.28
900	0.29
901	0.35
902	0.31
903	0.29
904	0.29
905	0.27
906	0.27
907	0.25
908	0.24
909	0.17
910	0.18
911	0.19
912	0.2
913	0.2
914	0.19
915	0.2
916	0.23
917	0.23
918	0.23
919	0.24
920	0.24
921	0.26
922	0.27
923	0.28
924	0.31
925	0.37
926	0.4
927	0.43
928	0.45
929	0.43
930	0.44
931	0.42
932	0.35
933	0.28
934	0.23
935	0.18
936	0.15
937	0.12
938	0.11
939	0.11
940	0.12
941	0.11
942	0.09
943	0.09
944	0.1
945	0.1
946	0.11
947	0.11
948	0.1
949	0.09
950	0.11
951	0.12
952	0.12
953	0.12
954	0.13
955	0.13
956	0.13
957	0.17
958	0.16
959	0.16
960	0.22
961	0.27
962	0.3
963	0.38
964	0.42
965	0.38
966	0.4
967	0.49
968	0.51
969	0.57
970	0.64
971	0.64
972	0.71
973	0.8
974	0.86
975	0.87
976	0.81
977	0.7
978	0.63
979	0.59
980	0.54
981	0.44
982	0.38
983	0.31
984	0.28
985	0.29
986	0.28
987	0.24
988	0.18
989	0.19
990	0.16
991	0.14
992	0.15
993	0.14
994	0.19
995	0.19
996	0.21
997	0.23
998	0.25
999	0.28
1000	0.27
1001	0.3
1002	0.3
1003	0.29
1004	0.31
1005	0.3
1006	0.3
1007	0.31
1008	0.34
1009	0.38
1010	0.44
1011	0.51
1012	0.55
1013	0.6
1014	0.61
1015	0.66
1016	0.71
1017	0.72
1018	0.72
1019	0.73
1020	0.71
1021	0.71
1022	0.69
1023	0.61
1024	0.54
1025	0.47
1026	0.4
1027	0.34
1028	0.29
1029	0.25
1030	0.25
1031	0.26
1032	0.31
1033	0.34
1034	0.36
1035	0.38
1036	0.37
1037	0.37
1038	0.4
1039	0.4
1040	0.41
1041	0.42
1042	0.37
1043	0.36
1044	0.4
1045	0.4
1046	0.42
1047	0.46
1048	0.43
1049	0.42
1050	0.45
1051	0.45
1052	0.47
1053	0.47
1054	0.45
1055	0.43
1056	0.44
1057	0.47
1058	0.49
1059	0.54
1060	0.55
1061	0.62
1062	0.62
1063	0.66
1064	0.72
1065	0.7
1066	0.7
1067	0.73
1068	0.73
1069	0.72

L0P9C1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer