Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L0PIN1

Protein Details
Accession L0PIN1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28SKKKGNSKNYRNCKKHRAESRKLKIFFYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
162-201EHRDRSRNRYLHKRHLSRSSPRNHYHRRSRSPSISRSKHR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022209  CWC25  
Pfam View protein in Pfam  
PF12542  CWC25  
Amino Acid Sequences SKKKGNSKNYRNCKKHRAESRKLKIFFYVLIRSRKRVERLDWMYAAPHLSGDSRTTEEMEAYLLGRKRIDDILKEDTSKLENGNQPFIASQNANTVRDIQNKIREDPLLAIKKQEQAQYEAIRNNPIKLRQLIEAQNGKNKKHHLDQHTHSRHSRYSPQKSEHRDRSRNRYLHKRHLSRSSPRNHYHRRSRSPSISRSKHRSPDRQYHSTQKPSSTKRHYDSSVFYHHSSHYSDSKNTTNGGVNKKAHHDNEKERAEKLAAMMKNAEALDQERQKRLEKLSKQEAEDERRENEERMINQKWGDNKSTYLREIARKAYGASIDLPDHIR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.91
2 0.9
3 0.91
4 0.9
5 0.9
6 0.91
7 0.93
8 0.92
9 0.84
10 0.75
11 0.68
12 0.6
13 0.53
14 0.48
15 0.47
16 0.43
17 0.51
18 0.53
19 0.53
20 0.58
21 0.61
22 0.61
23 0.6
24 0.59
25 0.6
26 0.63
27 0.66
28 0.6
29 0.53
30 0.47
31 0.4
32 0.36
33 0.24
34 0.18
35 0.12
36 0.11
37 0.12
38 0.12
39 0.14
40 0.15
41 0.16
42 0.18
43 0.17
44 0.16
45 0.15
46 0.14
47 0.12
48 0.1
49 0.14
50 0.14
51 0.15
52 0.15
53 0.15
54 0.17
55 0.22
56 0.25
57 0.24
58 0.28
59 0.34
60 0.35
61 0.36
62 0.34
63 0.3
64 0.29
65 0.26
66 0.22
67 0.21
68 0.24
69 0.25
70 0.28
71 0.27
72 0.25
73 0.24
74 0.24
75 0.21
76 0.16
77 0.14
78 0.19
79 0.22
80 0.23
81 0.23
82 0.26
83 0.27
84 0.34
85 0.38
86 0.34
87 0.39
88 0.41
89 0.42
90 0.41
91 0.37
92 0.31
93 0.3
94 0.33
95 0.31
96 0.28
97 0.29
98 0.29
99 0.33
100 0.35
101 0.36
102 0.29
103 0.27
104 0.32
105 0.34
106 0.35
107 0.33
108 0.3
109 0.33
110 0.32
111 0.3
112 0.28
113 0.27
114 0.28
115 0.27
116 0.28
117 0.24
118 0.29
119 0.3
120 0.33
121 0.36
122 0.33
123 0.38
124 0.39
125 0.38
126 0.37
127 0.37
128 0.35
129 0.36
130 0.42
131 0.43
132 0.48
133 0.52
134 0.59
135 0.61
136 0.61
137 0.56
138 0.51
139 0.46
140 0.42
141 0.46
142 0.45
143 0.48
144 0.51
145 0.55
146 0.6
147 0.66
148 0.71
149 0.72
150 0.72
151 0.72
152 0.71
153 0.74
154 0.76
155 0.73
156 0.69
157 0.7
158 0.67
159 0.69
160 0.74
161 0.7
162 0.66
163 0.7
164 0.71
165 0.69
166 0.7
167 0.68
168 0.67
169 0.66
170 0.71
171 0.71
172 0.73
173 0.75
174 0.77
175 0.77
176 0.76
177 0.78
178 0.77
179 0.76
180 0.76
181 0.75
182 0.73
183 0.72
184 0.72
185 0.72
186 0.71
187 0.72
188 0.73
189 0.7
190 0.73
191 0.74
192 0.72
193 0.69
194 0.7
195 0.69
196 0.68
197 0.62
198 0.59
199 0.59
200 0.59
201 0.65
202 0.63
203 0.63
204 0.59
205 0.63
206 0.58
207 0.54
208 0.51
209 0.47
210 0.45
211 0.41
212 0.38
213 0.33
214 0.31
215 0.3
216 0.28
217 0.27
218 0.26
219 0.26
220 0.28
221 0.3
222 0.32
223 0.31
224 0.3
225 0.28
226 0.28
227 0.31
228 0.35
229 0.39
230 0.38
231 0.4
232 0.45
233 0.49
234 0.48
235 0.49
236 0.51
237 0.52
238 0.59
239 0.64
240 0.6
241 0.54
242 0.51
243 0.44
244 0.38
245 0.31
246 0.29
247 0.22
248 0.22
249 0.22
250 0.2
251 0.22
252 0.21
253 0.19
254 0.12
255 0.14
256 0.2
257 0.27
258 0.31
259 0.32
260 0.35
261 0.39
262 0.43
263 0.49
264 0.52
265 0.52
266 0.58
267 0.64
268 0.67
269 0.65
270 0.68
271 0.67
272 0.65
273 0.64
274 0.58
275 0.5
276 0.5
277 0.51
278 0.44
279 0.41
280 0.4
281 0.38
282 0.41
283 0.42
284 0.39
285 0.39
286 0.41
287 0.43
288 0.41
289 0.42
290 0.37
291 0.38
292 0.43
293 0.46
294 0.44
295 0.43
296 0.44
297 0.47
298 0.49
299 0.49
300 0.46
301 0.42
302 0.41
303 0.39
304 0.35
305 0.29
306 0.27
307 0.26
308 0.22