Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L0PGC7

Protein Details
Accession L0PGC7    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
500-524YTKMLEESRKPRHLKKPIFNGQYVKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
202-207KKRKKK
338-356KSRRRFGGKERRYNATKKR
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
CDD cd08045  TAF4  
Amino Acid Sequences MRDYYEQPAYSPSIPKTTPYLYSGATKGSVNPSPVSGKFSEDRQDTEKLQDALVSAGEEEHNMSRSYDYGFGSNTLSFEEDRTKITDFLNPIPLNDLIYRIAISNSLKTIDPEVAPLLALSLRNRMAGLLSDMIILSKHRTTSPPINKKIIDNVGKILEEINNKEKDMEEKRRAQLLSKRLEEKNKIDKQSSLSGNPDDMDKKRKKKETGINSASKSLSEDTQKRNTDTTAAIMMGSGPNGPGGKKYSWMTSIPSLSLGYTTKTHRITENSSPTNPKTISIEPAQEVGIITIRDALNVLEMDKEGAGEVFGRGARKLTVPINTGYESGILKINNKFTKSRRRFGGKERRYNATKKRLVCSTKNKKKLEIINIKNKIHDIHIHWDEMLEEKQRIQKAISENKYKQSDYVNNLHKIFLNSYDNTSKKLQELMLQQDHHKNASPKNINISPQSQEYNCSRMLSSTLSLSPSISDNSPATPNTCISCEQLREELAICKNRMAVYTKMLEESRKPRHLKKPIFNGQYVKPQAIDLNLVSSTLDMSGDDVLSSKNGIFSGKWGKFKWG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.35
3 0.37
4 0.37
5 0.37
6 0.34
7 0.35
8 0.3
9 0.34
10 0.33
11 0.29
12 0.27
13 0.24
14 0.24
15 0.28
16 0.3
17 0.28
18 0.27
19 0.28
20 0.32
21 0.33
22 0.34
23 0.29
24 0.3
25 0.3
26 0.33
27 0.38
28 0.35
29 0.38
30 0.37
31 0.41
32 0.38
33 0.41
34 0.43
35 0.36
36 0.33
37 0.3
38 0.26
39 0.22
40 0.21
41 0.16
42 0.09
43 0.09
44 0.09
45 0.08
46 0.1
47 0.11
48 0.12
49 0.13
50 0.13
51 0.13
52 0.14
53 0.16
54 0.18
55 0.17
56 0.17
57 0.17
58 0.18
59 0.2
60 0.19
61 0.17
62 0.14
63 0.15
64 0.13
65 0.14
66 0.19
67 0.18
68 0.19
69 0.21
70 0.22
71 0.23
72 0.24
73 0.27
74 0.25
75 0.28
76 0.35
77 0.32
78 0.31
79 0.32
80 0.31
81 0.28
82 0.25
83 0.23
84 0.14
85 0.15
86 0.15
87 0.12
88 0.12
89 0.13
90 0.14
91 0.14
92 0.15
93 0.16
94 0.16
95 0.16
96 0.18
97 0.18
98 0.16
99 0.16
100 0.15
101 0.14
102 0.13
103 0.12
104 0.1
105 0.09
106 0.1
107 0.09
108 0.13
109 0.14
110 0.14
111 0.14
112 0.14
113 0.13
114 0.13
115 0.14
116 0.11
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.09
123 0.1
124 0.1
125 0.11
126 0.13
127 0.15
128 0.22
129 0.33
130 0.43
131 0.5
132 0.55
133 0.59
134 0.59
135 0.59
136 0.6
137 0.58
138 0.52
139 0.44
140 0.4
141 0.37
142 0.35
143 0.33
144 0.26
145 0.21
146 0.19
147 0.21
148 0.25
149 0.25
150 0.25
151 0.25
152 0.25
153 0.28
154 0.35
155 0.41
156 0.41
157 0.48
158 0.51
159 0.56
160 0.56
161 0.54
162 0.53
163 0.51
164 0.51
165 0.49
166 0.52
167 0.51
168 0.58
169 0.57
170 0.58
171 0.6
172 0.6
173 0.58
174 0.54
175 0.52
176 0.49
177 0.51
178 0.46
179 0.38
180 0.34
181 0.31
182 0.29
183 0.27
184 0.25
185 0.21
186 0.2
187 0.27
188 0.33
189 0.41
190 0.49
191 0.57
192 0.61
193 0.67
194 0.74
195 0.75
196 0.78
197 0.76
198 0.74
199 0.67
200 0.64
201 0.55
202 0.45
203 0.36
204 0.26
205 0.21
206 0.21
207 0.25
208 0.28
209 0.36
210 0.38
211 0.38
212 0.38
213 0.36
214 0.32
215 0.27
216 0.22
217 0.15
218 0.13
219 0.11
220 0.1
221 0.1
222 0.07
223 0.07
224 0.05
225 0.04
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.07
230 0.1
231 0.1
232 0.14
233 0.15
234 0.16
235 0.19
236 0.2
237 0.21
238 0.2
239 0.21
240 0.18
241 0.17
242 0.15
243 0.13
244 0.13
245 0.11
246 0.09
247 0.1
248 0.12
249 0.17
250 0.18
251 0.19
252 0.21
253 0.24
254 0.27
255 0.33
256 0.39
257 0.37
258 0.37
259 0.39
260 0.38
261 0.39
262 0.34
263 0.26
264 0.22
265 0.21
266 0.22
267 0.2
268 0.21
269 0.17
270 0.18
271 0.17
272 0.13
273 0.12
274 0.09
275 0.08
276 0.06
277 0.06
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.07
284 0.08
285 0.08
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.04
292 0.04
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.04
297 0.05
298 0.06
299 0.06
300 0.07
301 0.08
302 0.08
303 0.11
304 0.13
305 0.16
306 0.17
307 0.18
308 0.2
309 0.2
310 0.2
311 0.17
312 0.16
313 0.12
314 0.11
315 0.13
316 0.1
317 0.13
318 0.15
319 0.22
320 0.23
321 0.26
322 0.3
323 0.35
324 0.46
325 0.5
326 0.54
327 0.55
328 0.6
329 0.63
330 0.69
331 0.73
332 0.72
333 0.75
334 0.72
335 0.71
336 0.67
337 0.71
338 0.69
339 0.68
340 0.65
341 0.59
342 0.59
343 0.6
344 0.62
345 0.63
346 0.64
347 0.65
348 0.69
349 0.75
350 0.73
351 0.69
352 0.7
353 0.69
354 0.69
355 0.68
356 0.66
357 0.67
358 0.73
359 0.69
360 0.63
361 0.56
362 0.46
363 0.38
364 0.34
365 0.28
366 0.28
367 0.3
368 0.29
369 0.28
370 0.27
371 0.24
372 0.22
373 0.2
374 0.14
375 0.13
376 0.14
377 0.2
378 0.21
379 0.22
380 0.2
381 0.23
382 0.3
383 0.39
384 0.44
385 0.49
386 0.5
387 0.57
388 0.61
389 0.56
390 0.49
391 0.47
392 0.46
393 0.43
394 0.49
395 0.49
396 0.49
397 0.5
398 0.48
399 0.43
400 0.38
401 0.34
402 0.3
403 0.27
404 0.23
405 0.27
406 0.34
407 0.32
408 0.34
409 0.35
410 0.31
411 0.28
412 0.3
413 0.26
414 0.25
415 0.3
416 0.35
417 0.38
418 0.38
419 0.41
420 0.44
421 0.45
422 0.4
423 0.4
424 0.36
425 0.35
426 0.44
427 0.46
428 0.42
429 0.49
430 0.51
431 0.49
432 0.49
433 0.47
434 0.4
435 0.38
436 0.39
437 0.31
438 0.32
439 0.31
440 0.31
441 0.28
442 0.27
443 0.23
444 0.2
445 0.22
446 0.2
447 0.19
448 0.18
449 0.18
450 0.18
451 0.18
452 0.17
453 0.16
454 0.15
455 0.16
456 0.14
457 0.15
458 0.14
459 0.17
460 0.19
461 0.19
462 0.19
463 0.19
464 0.21
465 0.2
466 0.21
467 0.2
468 0.21
469 0.26
470 0.27
471 0.28
472 0.29
473 0.28
474 0.27
475 0.27
476 0.3
477 0.31
478 0.34
479 0.32
480 0.3
481 0.32
482 0.32
483 0.33
484 0.32
485 0.28
486 0.27
487 0.31
488 0.31
489 0.32
490 0.33
491 0.33
492 0.36
493 0.43
494 0.47
495 0.52
496 0.57
497 0.63
498 0.72
499 0.8
500 0.82
501 0.83
502 0.84
503 0.85
504 0.85
505 0.82
506 0.77
507 0.71
508 0.71
509 0.64
510 0.54
511 0.44
512 0.39
513 0.35
514 0.31
515 0.29
516 0.19
517 0.19
518 0.18
519 0.17
520 0.16
521 0.13
522 0.12
523 0.09
524 0.09
525 0.05
526 0.07
527 0.08
528 0.08
529 0.08
530 0.08
531 0.08
532 0.09
533 0.1
534 0.09
535 0.1
536 0.1
537 0.12
538 0.12
539 0.18
540 0.29
541 0.34
542 0.4