FuNGI

L0PDT1

Protein Details

Accession

L0PDT1

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
331-358	VEKQNKENERDARRKRRQIRARRGIQLP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
340-353	RDARRKRRQIRARR

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006939 SNF5
Gene Ontology	GO:0000228 C:nuclear chromosome GO:0070603 C:SWI/SNF superfamily-type complex GO:0006338 P:chromatin remodeling
Pfam	View protein in Pfam PF04855 SNF5

Amino Acid Sequences

MAADFSQTECQVLSGVEQRDEAYQQILQEQQERQLELIRQKKGELLRLSRIMKLRSSGIEGSIQVFGTGYAGYGNGWTGLKPRMLYPHEHRNMKSRVNRFRIPKEIMLIQSQRPELLVPVRIEVDSDRHRLRDYVFMEFFMKCLFSPEQFAEVLCEDFSLPPQPYFATSIAKCITDQLSEYHHHHILDDSVHNSELSSTFLASEQPYTAYKDDDMRIQVKLDIIIAQYNLVDTFEWDINNPYNDPEVFAERMCHELALIGEFKTAIAHSIREQAQMYTKSLFLVGYPFDGGPIEDEDIKTAILPTVSSILRPAEALNEYSPVLYELSESEVEKQNKENERDARRKRRQIRARRGIQLPEFNERLKTQRTPITHSILVPENFHIDQYGINKVPIPGLNDDDDLEKMLNERQRTPPLPPRDIRMKTPVQHYAFSPSMSPSASRYILKFKIPRLKEFLATISDIKSHSSPPSGLVSPSLPLPSWLAVALDALRQRYPHDRFEGFVRQGNSTTETIVRIRCNDCPGKLYIPGPALTVENFEIHLKNRSHRIRVEERLRMSSS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.2
3	0.2
4	0.21
5	0.22
6	0.23
7	0.24
8	0.22
9	0.18
10	0.16
11	0.16
12	0.19
13	0.22
14	0.21
15	0.26
16	0.27
17	0.31
18	0.34
19	0.34
20	0.31
21	0.33
22	0.37
23	0.4
24	0.46
25	0.45
26	0.43
27	0.43
28	0.48
29	0.47
30	0.5
31	0.49
32	0.48
33	0.5
34	0.57
35	0.58
36	0.58
37	0.59
38	0.53
39	0.47
40	0.44
41	0.4
42	0.35
43	0.38
44	0.33
45	0.3
46	0.29
47	0.27
48	0.26
49	0.23
50	0.21
51	0.15
52	0.14
53	0.11
54	0.09
55	0.08
56	0.06
57	0.05
58	0.05
59	0.05
60	0.05
61	0.06
62	0.07
63	0.07
64	0.08
65	0.11
66	0.14
67	0.16
68	0.17
69	0.19
70	0.26
71	0.29
72	0.37
73	0.41
74	0.49
75	0.55
76	0.6
77	0.59
78	0.59
79	0.64
80	0.65
81	0.67
82	0.65
83	0.67
84	0.69
85	0.75
86	0.74
87	0.75
88	0.75
89	0.71
90	0.65
91	0.59
92	0.56
93	0.51
94	0.49
95	0.44
96	0.39
97	0.38
98	0.35
99	0.31
100	0.26
101	0.24
102	0.2
103	0.2
104	0.22
105	0.18
106	0.19
107	0.2
108	0.2
109	0.2
110	0.19
111	0.22
112	0.21
113	0.26
114	0.27
115	0.27
116	0.29
117	0.29
118	0.3
119	0.32
120	0.29
121	0.31
122	0.3
123	0.3
124	0.31
125	0.29
126	0.27
127	0.19
128	0.17
129	0.1
130	0.14
131	0.14
132	0.13
133	0.17
134	0.18
135	0.2
136	0.19
137	0.19
138	0.16
139	0.16
140	0.15
141	0.11
142	0.1
143	0.08
144	0.08
145	0.1
146	0.12
147	0.12
148	0.11
149	0.12
150	0.12
151	0.14
152	0.17
153	0.17
154	0.19
155	0.18
156	0.23
157	0.23
158	0.24
159	0.22
160	0.21
161	0.21
162	0.15
163	0.16
164	0.13
165	0.16
166	0.19
167	0.21
168	0.23
169	0.24
170	0.23
171	0.22
172	0.21
173	0.19
174	0.18
175	0.17
176	0.14
177	0.13
178	0.13
179	0.13
180	0.12
181	0.11
182	0.09
183	0.09
184	0.08
185	0.07
186	0.07
187	0.08
188	0.09
189	0.09
190	0.09
191	0.08
192	0.09
193	0.1
194	0.13
195	0.13
196	0.13
197	0.13
198	0.16
199	0.17
200	0.18
201	0.2
202	0.19
203	0.18
204	0.18
205	0.18
206	0.15
207	0.14
208	0.12
209	0.09
210	0.08
211	0.09
212	0.08
213	0.07
214	0.07
215	0.06
216	0.06
217	0.05
218	0.05
219	0.04
220	0.07
221	0.07
222	0.08
223	0.08
224	0.1
225	0.11
226	0.12
227	0.12
228	0.1
229	0.11
230	0.11
231	0.12
232	0.11
233	0.12
234	0.12
235	0.12
236	0.12
237	0.11
238	0.13
239	0.12
240	0.1
241	0.08
242	0.08
243	0.08
244	0.08
245	0.08
246	0.06
247	0.06
248	0.06
249	0.06
250	0.06
251	0.06
252	0.05
253	0.05
254	0.06
255	0.07
256	0.13
257	0.14
258	0.15
259	0.16
260	0.15
261	0.19
262	0.2
263	0.2
264	0.16
265	0.15
266	0.13
267	0.13
268	0.12
269	0.08
270	0.08
271	0.07
272	0.06
273	0.07
274	0.06
275	0.06
276	0.06
277	0.06
278	0.05
279	0.06
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.07
284	0.07
285	0.07
286	0.06
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.04
292	0.08
293	0.08
294	0.08
295	0.09
296	0.08
297	0.09
298	0.09
299	0.09
300	0.08
301	0.09
302	0.1
303	0.09
304	0.1
305	0.1
306	0.09
307	0.09
308	0.08
309	0.07
310	0.06
311	0.06
312	0.05
313	0.07
314	0.08
315	0.09
316	0.11
317	0.18
318	0.19
319	0.2
320	0.22
321	0.27
322	0.33
323	0.37
324	0.41
325	0.42
326	0.49
327	0.59
328	0.66
329	0.7
330	0.74
331	0.8
332	0.83
333	0.85
334	0.87
335	0.88
336	0.89
337	0.89
338	0.87
339	0.84
340	0.79
341	0.74
342	0.68
343	0.63
344	0.55
345	0.5
346	0.44
347	0.37
348	0.34
349	0.3
350	0.3
351	0.27
352	0.27
353	0.26
354	0.3
355	0.33
356	0.38
357	0.42
358	0.43
359	0.4
360	0.38
361	0.37
362	0.36
363	0.34
364	0.28
365	0.23
366	0.21
367	0.19
368	0.19
369	0.16
370	0.1
371	0.12
372	0.13
373	0.17
374	0.14
375	0.15
376	0.16
377	0.16
378	0.18
379	0.18
380	0.19
381	0.16
382	0.18
383	0.19
384	0.18
385	0.19
386	0.17
387	0.16
388	0.13
389	0.12
390	0.09
391	0.09
392	0.12
393	0.16
394	0.17
395	0.21
396	0.26
397	0.34
398	0.36
399	0.42
400	0.47
401	0.52
402	0.58
403	0.55
404	0.56
405	0.58
406	0.6
407	0.57
408	0.56
409	0.54
410	0.51
411	0.56
412	0.58
413	0.51
414	0.49
415	0.45
416	0.45
417	0.39
418	0.35
419	0.29
420	0.21
421	0.2
422	0.19
423	0.19
424	0.14
425	0.18
426	0.2
427	0.21
428	0.21
429	0.28
430	0.3
431	0.37
432	0.4
433	0.43
434	0.5
435	0.52
436	0.56
437	0.56
438	0.56
439	0.51
440	0.48
441	0.43
442	0.36
443	0.35
444	0.3
445	0.23
446	0.22
447	0.19
448	0.2
449	0.18
450	0.18
451	0.18
452	0.2
453	0.19
454	0.2
455	0.25
456	0.24
457	0.23
458	0.22
459	0.21
460	0.19
461	0.2
462	0.18
463	0.13
464	0.13
465	0.15
466	0.13
467	0.13
468	0.12
469	0.11
470	0.1
471	0.11
472	0.1
473	0.12
474	0.13
475	0.15
476	0.15
477	0.16
478	0.19
479	0.28
480	0.32
481	0.36
482	0.41
483	0.4
484	0.41
485	0.48
486	0.53
487	0.47
488	0.47
489	0.42
490	0.37
491	0.38
492	0.38
493	0.35
494	0.27
495	0.26
496	0.22
497	0.23
498	0.24
499	0.27
500	0.28
501	0.29
502	0.32
503	0.34
504	0.41
505	0.44
506	0.43
507	0.42
508	0.43
509	0.42
510	0.43
511	0.39
512	0.36
513	0.33
514	0.32
515	0.29
516	0.26
517	0.23
518	0.19
519	0.21
520	0.17
521	0.15
522	0.16
523	0.17
524	0.18
525	0.19
526	0.27
527	0.27
528	0.32
529	0.42
530	0.49
531	0.53
532	0.57
533	0.63
534	0.65
535	0.72
536	0.76
537	0.74
538	0.71

L0PDT1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer