Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L0PDY9

Protein Details
Accession L0PDY9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
253-323IINHLSKKRKTNQSEPSLKQKKKKSKLPKNYDPNKQPDPERWIPKKLRSYYKPPKEKKKKSNRTQGELASEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
259-314KKRKTNQSEPSLKQKKKKSKLPKNYDPNKQPDPERWIPKKLRSYYKPPKEKKKKSN
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013699  Signal_recog_part_SRP72_RNA-bd  
IPR026270  SRP72  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005786  C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting  
GO:0008312  F:7S RNA binding  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF08492  SRP72  
Amino Acid Sequences MNSALSNIKLSKLTKFQNKIISKNIAILNLYCEKYSACNNIIKKIQNKYPDDNTIILILVSSILARFTGNQACTQLMELHEKNPSNIPLSLAIIQFMISSKNIRNAQKIMEKLLDSLKENKNKRFSPGLIRLAVEIYERRGREDLAQQELYAASKYWRSTGSNDPKLIELLYASGKSKLKNIISKKGNPNISAIDDFSYLLKISPNNQKALAGLTIYYLNTDISEALKYANKLPSPDLLIQKMDANYLEKSGIINHLSKKRKTNQSEPSLKQKKKKSKLPKNYDPNKQPDPERWIPKKLRSYYKPPKEKKKKSNRTQGELASENSSMTIRKKKIMTIIFKFKLINMTPI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.55
3 0.59
4 0.64
5 0.69
6 0.68
7 0.67
8 0.65
9 0.56
10 0.56
11 0.52
12 0.44
13 0.39
14 0.34
15 0.32
16 0.31
17 0.31
18 0.24
19 0.22
20 0.2
21 0.22
22 0.27
23 0.28
24 0.25
25 0.31
26 0.33
27 0.4
28 0.45
29 0.49
30 0.5
31 0.52
32 0.55
33 0.58
34 0.62
35 0.63
36 0.64
37 0.63
38 0.59
39 0.52
40 0.47
41 0.38
42 0.32
43 0.24
44 0.17
45 0.11
46 0.07
47 0.06
48 0.05
49 0.04
50 0.04
51 0.04
52 0.05
53 0.06
54 0.1
55 0.15
56 0.16
57 0.18
58 0.19
59 0.2
60 0.2
61 0.2
62 0.18
63 0.15
64 0.22
65 0.21
66 0.22
67 0.27
68 0.27
69 0.27
70 0.29
71 0.29
72 0.24
73 0.24
74 0.24
75 0.19
76 0.21
77 0.23
78 0.18
79 0.17
80 0.13
81 0.13
82 0.11
83 0.1
84 0.09
85 0.07
86 0.1
87 0.11
88 0.19
89 0.25
90 0.28
91 0.32
92 0.33
93 0.38
94 0.41
95 0.41
96 0.37
97 0.34
98 0.31
99 0.28
100 0.3
101 0.26
102 0.22
103 0.29
104 0.32
105 0.38
106 0.42
107 0.48
108 0.52
109 0.51
110 0.54
111 0.52
112 0.48
113 0.49
114 0.53
115 0.52
116 0.45
117 0.44
118 0.39
119 0.33
120 0.3
121 0.22
122 0.14
123 0.12
124 0.15
125 0.15
126 0.17
127 0.17
128 0.18
129 0.19
130 0.25
131 0.25
132 0.26
133 0.26
134 0.24
135 0.24
136 0.23
137 0.2
138 0.14
139 0.11
140 0.06
141 0.08
142 0.09
143 0.1
144 0.12
145 0.13
146 0.17
147 0.27
148 0.36
149 0.4
150 0.4
151 0.39
152 0.37
153 0.36
154 0.32
155 0.22
156 0.11
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.08
161 0.11
162 0.12
163 0.13
164 0.16
165 0.2
166 0.22
167 0.29
168 0.33
169 0.39
170 0.43
171 0.5
172 0.55
173 0.56
174 0.56
175 0.49
176 0.46
177 0.39
178 0.35
179 0.28
180 0.22
181 0.16
182 0.13
183 0.13
184 0.11
185 0.1
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.07
190 0.12
191 0.21
192 0.24
193 0.25
194 0.25
195 0.25
196 0.24
197 0.25
198 0.21
199 0.11
200 0.09
201 0.08
202 0.09
203 0.08
204 0.08
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.07
214 0.09
215 0.1
216 0.14
217 0.18
218 0.19
219 0.2
220 0.21
221 0.22
222 0.25
223 0.29
224 0.28
225 0.26
226 0.25
227 0.24
228 0.26
229 0.23
230 0.2
231 0.16
232 0.15
233 0.13
234 0.14
235 0.13
236 0.1
237 0.1
238 0.11
239 0.13
240 0.13
241 0.17
242 0.22
243 0.31
244 0.38
245 0.42
246 0.5
247 0.56
248 0.64
249 0.68
250 0.72
251 0.73
252 0.76
253 0.82
254 0.77
255 0.79
256 0.79
257 0.78
258 0.76
259 0.76
260 0.77
261 0.77
262 0.83
263 0.83
264 0.84
265 0.9
266 0.92
267 0.93
268 0.93
269 0.92
270 0.92
271 0.89
272 0.86
273 0.81
274 0.76
275 0.69
276 0.66
277 0.65
278 0.64
279 0.66
280 0.64
281 0.67
282 0.69
283 0.74
284 0.76
285 0.75
286 0.77
287 0.74
288 0.79
289 0.81
290 0.84
291 0.86
292 0.86
293 0.89
294 0.9
295 0.94
296 0.94
297 0.94
298 0.94
299 0.94
300 0.96
301 0.94
302 0.91
303 0.88
304 0.82
305 0.78
306 0.69
307 0.61
308 0.53
309 0.43
310 0.35
311 0.27
312 0.23
313 0.18
314 0.21
315 0.28
316 0.28
317 0.35
318 0.38
319 0.42
320 0.5
321 0.57
322 0.61
323 0.61
324 0.68
325 0.64
326 0.64
327 0.6
328 0.52
329 0.52