Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L0PAC8

Protein Details
Accession L0PAC8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
136-169IYNQYLSKLEKKRKIEKKKQEKRKIINSTKFETMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
145-159EKKRKIEKKKQEKRK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 9.833, cyto 4, cyto_mito 3.833, mito 2.5, plas 2, pero 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021013  ATPase_Vma12  
Gene Ontology GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
GO:0070072  P:vacuolar proton-transporting V-type ATPase complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF11712  Vma12  
Amino Acid Sequences MVLLIQTRRIKDALEKYSSLDDKKNISEYLKNNFIPHFIIADEIQQEHILKIRSIAKEIEYQKLIGTKLPNYKNGKFNKDEYQLIKNQIFAIINILISVFSVIIAIWIWCKNWIMPMRVIASISSGILITTAEIFIYNQYLSKLEKKRKIEKKKQEKRKIINSTKFETM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.42
3 0.42
4 0.49
5 0.5
6 0.45
7 0.4
8 0.36
9 0.35
10 0.37
11 0.38
12 0.33
13 0.33
14 0.37
15 0.37
16 0.41
17 0.44
18 0.41
19 0.4
20 0.38
21 0.36
22 0.31
23 0.27
24 0.2
25 0.13
26 0.14
27 0.12
28 0.13
29 0.13
30 0.11
31 0.11
32 0.11
33 0.11
34 0.1
35 0.13
36 0.12
37 0.11
38 0.15
39 0.2
40 0.2
41 0.21
42 0.22
43 0.21
44 0.27
45 0.3
46 0.3
47 0.25
48 0.24
49 0.23
50 0.25
51 0.23
52 0.18
53 0.18
54 0.19
55 0.26
56 0.29
57 0.36
58 0.39
59 0.43
60 0.48
61 0.52
62 0.53
63 0.48
64 0.49
65 0.48
66 0.46
67 0.45
68 0.41
69 0.39
70 0.36
71 0.37
72 0.34
73 0.26
74 0.23
75 0.21
76 0.18
77 0.13
78 0.12
79 0.09
80 0.08
81 0.08
82 0.07
83 0.06
84 0.05
85 0.05
86 0.03
87 0.02
88 0.03
89 0.03
90 0.03
91 0.03
92 0.03
93 0.05
94 0.05
95 0.06
96 0.07
97 0.08
98 0.08
99 0.14
100 0.18
101 0.2
102 0.21
103 0.24
104 0.25
105 0.25
106 0.25
107 0.19
108 0.16
109 0.13
110 0.12
111 0.09
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.05
122 0.05
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.08
127 0.1
128 0.13
129 0.22
130 0.31
131 0.39
132 0.48
133 0.56
134 0.66
135 0.75
136 0.83
137 0.86
138 0.88
139 0.9
140 0.92
141 0.95
142 0.95
143 0.95
144 0.94
145 0.93
146 0.93
147 0.93
148 0.92
149 0.87