FuNGI

L0PCH4

Protein Details

Accession

L0PCH4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
104-123	EWLIRKFKIHKKNQDSLLLS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR022125 U3snoRNP10_N IPR040191 UTP10
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:1990904 C:ribonucleoprotein complex GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF12397 U3snoRNP10

Amino Acid Sequences

MSTLAHQLQTIHQNHLESLDKKKKVISLLFDPSEAADQDLDSIFALAKPKFERFSKTLFSEKSKYIDRFEQTKSENDSLDKCIDTFLSLLAPYFLLRPSIKVLEWLIRKFKIHKKNQDSLLLSIFPYHMHPFFIKILSIIDIPLPTWSFLIPFKNRKTCPTHYIIAKSLSENEILFSMFMNYVQCKVKEKRDYQTLLKFWATCITEAIYIMKKESTNEEIVLSKTLPNIFEGLLLQSSSEYQIANYIIIIAISAYYSLSEKSLIIALTLVSKTLDKTTTNSGLICLAQLAQTREGYKPLPDSVFKSISKLKDINEKLIMIGEKYRSDKLIVGYILCLIENKIKNNDFSLFEELELFLSKARLSKDEFKIIIHTIFLQIIQFKNLPAETKNKISDIIKKFKEDPLFRSILKDISETFKNNIAEIQSILQITIVELPPTISNDIETKQPDLIKKETKIMEKEMSILINTVQNITHDLFFINSNQIFHKAFSIACKYPTGIDILFSCPALQTTFSKLCFLSQIWVSQNSNSNNLEEIAITALKQYQTLISNEQKKNIDYQFFIPKTASKIIHLLANKLEELPSTDFIIYGFNDNMYEILIPNMEECIFDNNYIYKIFNDLFEPNNKKEDISFKLSILKFICSHIISCPFEDVWFKLLKIINNSTEKNILKTKLLLPILKDYQNLNLQEKNKSLVIKELFKIVVKGENGPGTKLLLEITKSNHMEFAIEACQRLSELWKYIKHNIMFEVCKTFIDISEDRNKATYIFNNL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.37
3	0.39
4	0.32
5	0.4
6	0.45
7	0.45
8	0.45
9	0.49
10	0.49
11	0.49
12	0.53
13	0.5
14	0.49
15	0.55
16	0.55
17	0.51
18	0.47
19	0.4
20	0.36
21	0.29
22	0.21
23	0.12
24	0.11
25	0.12
26	0.12
27	0.11
28	0.09
29	0.09
30	0.08
31	0.1
32	0.15
33	0.13
34	0.18
35	0.22
36	0.27
37	0.32
38	0.35
39	0.41
40	0.41
41	0.48
42	0.5
43	0.51
44	0.54
45	0.54
46	0.58
47	0.55
48	0.54
49	0.53
50	0.54
51	0.52
52	0.5
53	0.53
54	0.52
55	0.53
56	0.53
57	0.55
58	0.5
59	0.54
60	0.55
61	0.5
62	0.46
63	0.43
64	0.42
65	0.38
66	0.38
67	0.32
68	0.24
69	0.22
70	0.2
71	0.18
72	0.15
73	0.12
74	0.1
75	0.1
76	0.1
77	0.09
78	0.09
79	0.09
80	0.1
81	0.1
82	0.12
83	0.13
84	0.15
85	0.19
86	0.22
87	0.21
88	0.23
89	0.25
90	0.29
91	0.34
92	0.38
93	0.39
94	0.39
95	0.43
96	0.48
97	0.55
98	0.58
99	0.62
100	0.68
101	0.71
102	0.77
103	0.8
104	0.8
105	0.74
106	0.66
107	0.59
108	0.49
109	0.4
110	0.32
111	0.26
112	0.18
113	0.18
114	0.18
115	0.15
116	0.17
117	0.17
118	0.2
119	0.22
120	0.22
121	0.19
122	0.16
123	0.17
124	0.16
125	0.16
126	0.12
127	0.11
128	0.1
129	0.1
130	0.12
131	0.11
132	0.1
133	0.1
134	0.1
135	0.1
136	0.13
137	0.21
138	0.27
139	0.35
140	0.43
141	0.52
142	0.54
143	0.59
144	0.64
145	0.63
146	0.62
147	0.6
148	0.58
149	0.54
150	0.57
151	0.53
152	0.49
153	0.44
154	0.38
155	0.35
156	0.29
157	0.25
158	0.2
159	0.17
160	0.13
161	0.12
162	0.11
163	0.08
164	0.09
165	0.07
166	0.08
167	0.09
168	0.09
169	0.13
170	0.17
171	0.18
172	0.24
173	0.29
174	0.38
175	0.46
176	0.5
177	0.55
178	0.6
179	0.64
180	0.64
181	0.68
182	0.6
183	0.55
184	0.52
185	0.44
186	0.35
187	0.36
188	0.3
189	0.21
190	0.21
191	0.18
192	0.16
193	0.16
194	0.18
195	0.15
196	0.14
197	0.15
198	0.16
199	0.15
200	0.16
201	0.2
202	0.21
203	0.2
204	0.2
205	0.2
206	0.2
207	0.2
208	0.2
209	0.17
210	0.13
211	0.14
212	0.14
213	0.13
214	0.12
215	0.13
216	0.11
217	0.12
218	0.11
219	0.1
220	0.09
221	0.09
222	0.08
223	0.07
224	0.07
225	0.07
226	0.08
227	0.06
228	0.06
229	0.08
230	0.09
231	0.09
232	0.08
233	0.07
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.03
238	0.03
239	0.03
240	0.03
241	0.03
242	0.03
243	0.04
244	0.05
245	0.05
246	0.06
247	0.06
248	0.06
249	0.08
250	0.08
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.08
255	0.08
256	0.08
257	0.07
258	0.07
259	0.08
260	0.1
261	0.12
262	0.1
263	0.13
264	0.18
265	0.21
266	0.22
267	0.21
268	0.2
269	0.19
270	0.18
271	0.15
272	0.1
273	0.07
274	0.08
275	0.1
276	0.12
277	0.12
278	0.13
279	0.15
280	0.16
281	0.17
282	0.16
283	0.15
284	0.16
285	0.16
286	0.18
287	0.17
288	0.2
289	0.23
290	0.27
291	0.26
292	0.27
293	0.29
294	0.29
295	0.32
296	0.31
297	0.27
298	0.32
299	0.34
300	0.34
301	0.32
302	0.3
303	0.25
304	0.25
305	0.24
306	0.15
307	0.16
308	0.13
309	0.14
310	0.16
311	0.17
312	0.15
313	0.16
314	0.18
315	0.16
316	0.19
317	0.16
318	0.14
319	0.14
320	0.14
321	0.13
322	0.1
323	0.09
324	0.06
325	0.12
326	0.14
327	0.15
328	0.19
329	0.21
330	0.21
331	0.23
332	0.25
333	0.21
334	0.22
335	0.24
336	0.19
337	0.18
338	0.18
339	0.16
340	0.14
341	0.12
342	0.09
343	0.05
344	0.06
345	0.06
346	0.08
347	0.09
348	0.11
349	0.14
350	0.23
351	0.26
352	0.31
353	0.31
354	0.29
355	0.3
356	0.29
357	0.26
358	0.17
359	0.14
360	0.09
361	0.09
362	0.09
363	0.07
364	0.07
365	0.07
366	0.09
367	0.09
368	0.08
369	0.09
370	0.09
371	0.1
372	0.1
373	0.15
374	0.16
375	0.2
376	0.21
377	0.21
378	0.22
379	0.23
380	0.3
381	0.32
382	0.38
383	0.35
384	0.37
385	0.38
386	0.4
387	0.46
388	0.39
389	0.37
390	0.34
391	0.35
392	0.33
393	0.33
394	0.3
395	0.24
396	0.23
397	0.19
398	0.14
399	0.16
400	0.18
401	0.17
402	0.18
403	0.21
404	0.2
405	0.19
406	0.19
407	0.16
408	0.14
409	0.13
410	0.13
411	0.09
412	0.09
413	0.08
414	0.07
415	0.07
416	0.06
417	0.08
418	0.07
419	0.06
420	0.06
421	0.07
422	0.07
423	0.08
424	0.09
425	0.06
426	0.07
427	0.09
428	0.1
429	0.12
430	0.13
431	0.13
432	0.14
433	0.17
434	0.19
435	0.22
436	0.26
437	0.29
438	0.29
439	0.34
440	0.37
441	0.39
442	0.39
443	0.39
444	0.36
445	0.31
446	0.31
447	0.26
448	0.22
449	0.17
450	0.14
451	0.11
452	0.1
453	0.1
454	0.09
455	0.08
456	0.08
457	0.1
458	0.11
459	0.1
460	0.09
461	0.09
462	0.09
463	0.1
464	0.1
465	0.12
466	0.11
467	0.12
468	0.12
469	0.16
470	0.16
471	0.15
472	0.16
473	0.13
474	0.13
475	0.16
476	0.21
477	0.19
478	0.2
479	0.2
480	0.19
481	0.19
482	0.19
483	0.18
484	0.12
485	0.12
486	0.11
487	0.13
488	0.13
489	0.12
490	0.12
491	0.09
492	0.1
493	0.09
494	0.1
495	0.09
496	0.15
497	0.18
498	0.19
499	0.2
500	0.2
501	0.2
502	0.2
503	0.19
504	0.17
505	0.14
506	0.18
507	0.18
508	0.22
509	0.22
510	0.23
511	0.29
512	0.27
513	0.31
514	0.27
515	0.26
516	0.23
517	0.23
518	0.2
519	0.13
520	0.12
521	0.09
522	0.08
523	0.07
524	0.07
525	0.08
526	0.08
527	0.08
528	0.08
529	0.1
530	0.13
531	0.15
532	0.2
533	0.26
534	0.36
535	0.37
536	0.42
537	0.42
538	0.4
539	0.44
540	0.43
541	0.39
542	0.31
543	0.34
544	0.38
545	0.37
546	0.37
547	0.31
548	0.29
549	0.3
550	0.34
551	0.3
552	0.22
553	0.24
554	0.24
555	0.28
556	0.27
557	0.25
558	0.21
559	0.22
560	0.21
561	0.18
562	0.17
563	0.12
564	0.16
565	0.17
566	0.16
567	0.16
568	0.15
569	0.15
570	0.15
571	0.16
572	0.13
573	0.12
574	0.11
575	0.1
576	0.1
577	0.1
578	0.1
579	0.08
580	0.08
581	0.06
582	0.06
583	0.06
584	0.06
585	0.06
586	0.07
587	0.07
588	0.07
589	0.08
590	0.12
591	0.12
592	0.13
593	0.14
594	0.14
595	0.15
596	0.16
597	0.16
598	0.11
599	0.14
600	0.15
601	0.14
602	0.16
603	0.17
604	0.19
605	0.28
606	0.33
607	0.32
608	0.36
609	0.35
610	0.32
611	0.34
612	0.37
613	0.34
614	0.36
615	0.36
616	0.32
617	0.41
618	0.41
619	0.42
620	0.37
621	0.34
622	0.27
623	0.27
624	0.31
625	0.23
626	0.24
627	0.23
628	0.29
629	0.28
630	0.28
631	0.29
632	0.24
633	0.24
634	0.26
635	0.23
636	0.19
637	0.19
638	0.18
639	0.21
640	0.24
641	0.26
642	0.31
643	0.35
644	0.39
645	0.43
646	0.45
647	0.42
648	0.47
649	0.44
650	0.42
651	0.43
652	0.38
653	0.34
654	0.37
655	0.37
656	0.38
657	0.42
658	0.39
659	0.36
660	0.42
661	0.44
662	0.43
663	0.41
664	0.34
665	0.36
666	0.4
667	0.41
668	0.37
669	0.38
670	0.39
671	0.42
672	0.43
673	0.4
674	0.36
675	0.35
676	0.32
677	0.34
678	0.37
679	0.38
680	0.37
681	0.38
682	0.36
683	0.35
684	0.35
685	0.28
686	0.29
687	0.24
688	0.27
689	0.26
690	0.31
691	0.3
692	0.3
693	0.3
694	0.25
695	0.23
696	0.2
697	0.18
698	0.14
699	0.16
700	0.17
701	0.21
702	0.28
703	0.3
704	0.3
705	0.3
706	0.27
707	0.26
708	0.23
709	0.22
710	0.2
711	0.2
712	0.2
713	0.18
714	0.18
715	0.18
716	0.18
717	0.2
718	0.18
719	0.23
720	0.3
721	0.36
722	0.42
723	0.49
724	0.57
725	0.54
726	0.53
727	0.51
728	0.52
729	0.48
730	0.45
731	0.44
732	0.36
733	0.33
734	0.33
735	0.29
736	0.23
737	0.28
738	0.26
739	0.27
740	0.36
741	0.37
742	0.36
743	0.36
744	0.35
745	0.29
746	0.34

L0PCH4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer