Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PKC7

Protein Details
Accession A0A1D8PKC7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
92-118DDNIAQRKKLRSKKRKLDKSGTKNDKQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
98-122RKKLRSKKRKLDKSGTKNDKQIKKL
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0030619  F:U1 snRNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG cal:CAALFM_C305940CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSSPRQTIYVNNLNEKVSINKLKNELQQTFNVCGKILQISALKTLKLKGQAFITFEDIPSATKALELNKKDLFSKPMNVTYAKSDADVISTDDNIAQRKKLRSKKRKLDKSGTKNDKQIKKLRDEWKELPPNHILLIQNLEKFDDLKIYFEKFAGFDNVRLVKVKNLAFIEFESEDLAKSCLDQTTEDDLKQFGHDVILSFAKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.38
3 0.33
4 0.32
5 0.37
6 0.34
7 0.37
8 0.42
9 0.47
10 0.52
11 0.56
12 0.52
13 0.47
14 0.5
15 0.49
16 0.49
17 0.46
18 0.39
19 0.31
20 0.27
21 0.25
22 0.21
23 0.16
24 0.15
25 0.15
26 0.15
27 0.21
28 0.22
29 0.22
30 0.21
31 0.22
32 0.23
33 0.28
34 0.28
35 0.25
36 0.28
37 0.3
38 0.31
39 0.31
40 0.32
41 0.24
42 0.23
43 0.21
44 0.17
45 0.15
46 0.14
47 0.12
48 0.08
49 0.08
50 0.09
51 0.14
52 0.21
53 0.22
54 0.26
55 0.28
56 0.29
57 0.3
58 0.31
59 0.31
60 0.26
61 0.3
62 0.29
63 0.3
64 0.31
65 0.31
66 0.3
67 0.27
68 0.27
69 0.21
70 0.18
71 0.15
72 0.13
73 0.13
74 0.12
75 0.1
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.09
81 0.11
82 0.11
83 0.12
84 0.16
85 0.22
86 0.31
87 0.39
88 0.49
89 0.58
90 0.68
91 0.77
92 0.83
93 0.87
94 0.87
95 0.88
96 0.88
97 0.87
98 0.87
99 0.85
100 0.77
101 0.74
102 0.74
103 0.71
104 0.66
105 0.65
106 0.59
107 0.57
108 0.63
109 0.64
110 0.63
111 0.64
112 0.61
113 0.63
114 0.67
115 0.6
116 0.55
117 0.48
118 0.42
119 0.35
120 0.34
121 0.24
122 0.17
123 0.21
124 0.2
125 0.19
126 0.18
127 0.18
128 0.15
129 0.15
130 0.15
131 0.15
132 0.13
133 0.14
134 0.16
135 0.18
136 0.18
137 0.18
138 0.18
139 0.14
140 0.15
141 0.18
142 0.17
143 0.16
144 0.22
145 0.23
146 0.23
147 0.25
148 0.24
149 0.22
150 0.27
151 0.27
152 0.27
153 0.26
154 0.26
155 0.26
156 0.26
157 0.27
158 0.21
159 0.2
160 0.16
161 0.15
162 0.14
163 0.14
164 0.14
165 0.09
166 0.09
167 0.1
168 0.11
169 0.12
170 0.13
171 0.17
172 0.25
173 0.28
174 0.27
175 0.27
176 0.25
177 0.25
178 0.24
179 0.21
180 0.13
181 0.12
182 0.13
183 0.13
184 0.16