Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K9GCH5

Protein Details
Accession K9GCH5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-49KSSPAVPKKKYMRRGDVEAARHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
70-112NKRKLEDEEADRNRAREEKKRRLAEESKARRAEEELAKERERR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, mito_nucl 10.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004098  Prp18  
IPR014906  PRP4-like  
IPR036285  PRP4-like_sf  
IPR039979  PRPF18  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF02840  Prp18  
PF08799  PRP4  
Amino Acid Sequences MDFAALMSKEISKAKGSDSSKPSATDTEKSSPAVPKKKYMRRGDVEAARIEAYNQEQGRLAREREERMANKRKLEDEEADRNRAREEKKRRLAEESKARRAEEELAKERERRQRLGLPELPENTPVNGDEEEDIEEEELKAKLRELNAPIQLFGEDYSARLRRYRRLVQRAAVPRKRVTDGPIPTTLEPVSGGQMIIPAKIPKDQGSRLFLFRQLGSYFNMVLSEWEQALAKRDVSVRESFQGKQAFNAMTQSRENMTPLFRLFEKSELEDGLLEPIVEIVHKAQQRRYVDANDAYLRVSIGKAAWPIGVTMVGIHERSAREKLHQSDQQAHILSDEITRKYLQSIKRCLSFAQVRWPPQDQLQMMG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.31
3 0.34
4 0.4
5 0.43
6 0.47
7 0.46
8 0.47
9 0.46
10 0.44
11 0.45
12 0.4
13 0.41
14 0.41
15 0.41
16 0.41
17 0.42
18 0.44
19 0.48
20 0.53
21 0.5
22 0.54
23 0.63
24 0.7
25 0.76
26 0.78
27 0.79
28 0.76
29 0.81
30 0.8
31 0.76
32 0.71
33 0.62
34 0.54
35 0.44
36 0.37
37 0.29
38 0.23
39 0.19
40 0.22
41 0.2
42 0.2
43 0.22
44 0.23
45 0.28
46 0.3
47 0.29
48 0.29
49 0.34
50 0.37
51 0.4
52 0.48
53 0.48
54 0.53
55 0.62
56 0.59
57 0.61
58 0.61
59 0.6
60 0.56
61 0.56
62 0.53
63 0.5
64 0.56
65 0.53
66 0.55
67 0.52
68 0.47
69 0.44
70 0.44
71 0.42
72 0.41
73 0.48
74 0.53
75 0.62
76 0.69
77 0.69
78 0.72
79 0.73
80 0.73
81 0.73
82 0.71
83 0.71
84 0.66
85 0.64
86 0.55
87 0.51
88 0.49
89 0.44
90 0.43
91 0.41
92 0.43
93 0.45
94 0.48
95 0.53
96 0.54
97 0.52
98 0.47
99 0.47
100 0.48
101 0.51
102 0.56
103 0.54
104 0.48
105 0.48
106 0.47
107 0.42
108 0.38
109 0.33
110 0.25
111 0.2
112 0.17
113 0.15
114 0.12
115 0.12
116 0.1
117 0.1
118 0.11
119 0.1
120 0.1
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.08
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.1
130 0.12
131 0.17
132 0.18
133 0.24
134 0.27
135 0.28
136 0.27
137 0.25
138 0.23
139 0.18
140 0.15
141 0.11
142 0.07
143 0.07
144 0.11
145 0.13
146 0.14
147 0.18
148 0.2
149 0.25
150 0.33
151 0.41
152 0.47
153 0.54
154 0.58
155 0.57
156 0.63
157 0.67
158 0.69
159 0.64
160 0.58
161 0.52
162 0.5
163 0.49
164 0.42
165 0.36
166 0.34
167 0.33
168 0.33
169 0.32
170 0.31
171 0.29
172 0.29
173 0.24
174 0.16
175 0.14
176 0.1
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.05
181 0.08
182 0.08
183 0.07
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.11
188 0.12
189 0.13
190 0.18
191 0.21
192 0.24
193 0.29
194 0.3
195 0.31
196 0.31
197 0.29
198 0.27
199 0.23
200 0.22
201 0.17
202 0.17
203 0.16
204 0.16
205 0.14
206 0.12
207 0.12
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.08
216 0.12
217 0.12
218 0.11
219 0.12
220 0.15
221 0.16
222 0.19
223 0.22
224 0.19
225 0.22
226 0.25
227 0.23
228 0.27
229 0.31
230 0.27
231 0.26
232 0.28
233 0.24
234 0.22
235 0.27
236 0.22
237 0.19
238 0.2
239 0.2
240 0.18
241 0.18
242 0.19
243 0.16
244 0.16
245 0.16
246 0.16
247 0.17
248 0.16
249 0.19
250 0.19
251 0.21
252 0.22
253 0.22
254 0.23
255 0.2
256 0.2
257 0.17
258 0.16
259 0.13
260 0.11
261 0.08
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.11
269 0.14
270 0.17
271 0.21
272 0.28
273 0.32
274 0.36
275 0.4
276 0.38
277 0.41
278 0.41
279 0.42
280 0.36
281 0.34
282 0.29
283 0.25
284 0.21
285 0.16
286 0.13
287 0.1
288 0.08
289 0.11
290 0.11
291 0.12
292 0.12
293 0.12
294 0.12
295 0.11
296 0.11
297 0.08
298 0.07
299 0.08
300 0.1
301 0.1
302 0.1
303 0.13
304 0.14
305 0.18
306 0.23
307 0.22
308 0.27
309 0.35
310 0.4
311 0.45
312 0.49
313 0.5
314 0.54
315 0.56
316 0.57
317 0.5
318 0.45
319 0.36
320 0.32
321 0.28
322 0.24
323 0.25
324 0.2
325 0.2
326 0.21
327 0.21
328 0.25
329 0.31
330 0.34
331 0.39
332 0.47
333 0.52
334 0.57
335 0.58
336 0.54
337 0.56
338 0.56
339 0.51
340 0.52
341 0.53
342 0.53
343 0.58
344 0.61
345 0.54
346 0.51
347 0.56