FuNGI

Q5AMR1

Protein Details

Accession

Q5AMR1

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
63-83	TKDFTRPVRLHRKDPRNMQFH	Hydrophilic
152-177	PDGGARKNRKNLFKRKTRQINLMNEE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
157-167	RKNRKNLFKRK
388-397	DKEGKKLRKV
491-493	KRP
495-505	PEIASPRKKIK

Subcellular Location(s)

nucl 25

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005674 C:transcription factor TFIIF complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0016251 F:RNA polymerase II general transcription initiation factor activity GO:0001096 F:TFIIF-class transcription factor complex binding GO:0009267 P:cellular response to starvation GO:0030447 P:filamentous growth GO:0036180 P:filamentous growth of a population of unicellular organisms in response to biotic stimulus GO:0036170 P:filamentous growth of a population of unicellular organisms in response to starvation GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	cal:CAALFM_C402060CA -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSQSDVPIKKEVTVKKEDGSTPTSPSKQQEWQTIPLKSCTEEDVKDIRFHIMKFATKQDVNITKDFTRPVRLHRKDPRNMQFHLTREELDQRKREKQQMEKLKQEEKEATAKPTEESEEKEEKDKPTADAAKVAPEKPTLNKNQADMSQVAPDGGARKNRKNLFKRKTRQINLMNEEKRKLRYEEHYPWVIEDYDGKNVFVGNYEAGSTEQQHVLFVFDKDGFKMIPAEKVYRFTPRNRYATLTLEEAEAKMERNSSVPRWLMKHMEDRSISEGTPDQRFRYNSPAANGSVIANVGNGSAGRRMRTVLGGSGSGNDRDSDHDDLDYDEEFADDEEAPIMDGDEEENKLSEKKIKKEMLKAAHFDGQSEAEAEDDLDDLFETEKTRKVDKEGKKLRKVLNKREGGVYDSDEEDGLMPYISKSDLESDEESDDEVQVKKEPSSDSQTDNNTNKTSRAREVGVKSIGDGFVVIKAPPSFLGTMPPGDWNPQARKRPTPEIASPRKKIKLDETIKVKKERTLSPPPVSPTTNAATNTSSPGNGMDLNDAGPDNLLVTVKDVLDIVKDQPLTTKELLMGLKSRVSAHKDNKLRIISIVKQNLRLVDGKLVLKD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.49
3	0.54
4	0.53
5	0.5
6	0.48
7	0.44
8	0.42
9	0.46
10	0.46
11	0.44
12	0.46
13	0.47
14	0.49
15	0.53
16	0.57
17	0.55
18	0.6
19	0.63
20	0.63
21	0.6
22	0.56
23	0.52
24	0.44
25	0.4
26	0.36
27	0.33
28	0.29
29	0.32
30	0.35
31	0.36
32	0.36
33	0.36
34	0.36
35	0.34
36	0.33
37	0.35
38	0.34
39	0.37
40	0.38
41	0.43
42	0.45
43	0.43
44	0.44
45	0.46
46	0.49
47	0.48
48	0.47
49	0.45
50	0.39
51	0.42
52	0.45
53	0.38
54	0.39
55	0.37
56	0.45
57	0.51
58	0.55
59	0.62
60	0.69
61	0.76
62	0.76
63	0.84
64	0.84
65	0.79
66	0.76
67	0.72
68	0.68
69	0.62
70	0.58
71	0.49
72	0.41
73	0.38
74	0.45
75	0.45
76	0.46
77	0.5
78	0.51
79	0.58
80	0.65
81	0.7
82	0.69
83	0.72
84	0.74
85	0.78
86	0.8
87	0.8
88	0.78
89	0.78
90	0.71
91	0.66
92	0.6
93	0.52
94	0.52
95	0.45
96	0.43
97	0.38
98	0.37
99	0.32
100	0.3
101	0.3
102	0.24
103	0.26
104	0.3
105	0.33
106	0.34
107	0.37
108	0.39
109	0.37
110	0.41
111	0.39
112	0.33
113	0.35
114	0.4
115	0.36
116	0.37
117	0.35
118	0.38
119	0.39
120	0.38
121	0.31
122	0.29
123	0.3
124	0.29
125	0.37
126	0.36
127	0.4
128	0.42
129	0.42
130	0.43
131	0.42
132	0.41
133	0.34
134	0.29
135	0.23
136	0.21
137	0.19
138	0.14
139	0.13
140	0.13
141	0.15
142	0.22
143	0.26
144	0.32
145	0.41
146	0.49
147	0.58
148	0.65
149	0.73
150	0.74
151	0.8
152	0.83
153	0.85
154	0.89
155	0.84
156	0.84
157	0.82
158	0.81
159	0.76
160	0.77
161	0.72
162	0.65
163	0.63
164	0.56
165	0.51
166	0.45
167	0.42
168	0.38
169	0.39
170	0.45
171	0.49
172	0.52
173	0.52
174	0.48
175	0.45
176	0.41
177	0.35
178	0.25
179	0.22
180	0.17
181	0.2
182	0.2
183	0.19
184	0.17
185	0.17
186	0.17
187	0.14
188	0.13
189	0.07
190	0.07
191	0.07
192	0.08
193	0.08
194	0.09
195	0.1
196	0.1
197	0.12
198	0.11
199	0.11
200	0.11
201	0.12
202	0.13
203	0.11
204	0.11
205	0.12
206	0.12
207	0.12
208	0.13
209	0.11
210	0.1
211	0.14
212	0.13
213	0.16
214	0.17
215	0.21
216	0.21
217	0.24
218	0.25
219	0.29
220	0.32
221	0.33
222	0.41
223	0.46
224	0.49
225	0.48
226	0.51
227	0.45
228	0.46
229	0.42
230	0.33
231	0.26
232	0.22
233	0.2
234	0.16
235	0.14
236	0.1
237	0.09
238	0.08
239	0.08
240	0.08
241	0.1
242	0.12
243	0.13
244	0.18
245	0.19
246	0.21
247	0.23
248	0.25
249	0.27
250	0.27
251	0.34
252	0.31
253	0.34
254	0.32
255	0.31
256	0.32
257	0.3
258	0.26
259	0.19
260	0.2
261	0.17
262	0.21
263	0.21
264	0.19
265	0.22
266	0.24
267	0.25
268	0.3
269	0.32
270	0.29
271	0.29
272	0.31
273	0.26
274	0.25
275	0.24
276	0.16
277	0.12
278	0.1
279	0.08
280	0.05
281	0.05
282	0.04
283	0.04
284	0.03
285	0.04
286	0.07
287	0.08
288	0.09
289	0.09
290	0.1
291	0.11
292	0.12
293	0.12
294	0.1
295	0.1
296	0.1
297	0.1
298	0.1
299	0.1
300	0.1
301	0.09
302	0.08
303	0.08
304	0.09
305	0.13
306	0.13
307	0.13
308	0.13
309	0.12
310	0.13
311	0.13
312	0.11
313	0.08
314	0.06
315	0.05
316	0.05
317	0.05
318	0.06
319	0.05
320	0.04
321	0.04
322	0.04
323	0.04
324	0.04
325	0.04
326	0.03
327	0.03
328	0.04
329	0.05
330	0.05
331	0.05
332	0.06
333	0.06
334	0.07
335	0.08
336	0.15
337	0.19
338	0.24
339	0.33
340	0.4
341	0.44
342	0.51
343	0.58
344	0.6
345	0.59
346	0.55
347	0.49
348	0.48
349	0.43
350	0.35
351	0.29
352	0.21
353	0.17
354	0.15
355	0.12
356	0.07
357	0.07
358	0.07
359	0.05
360	0.05
361	0.04
362	0.03
363	0.03
364	0.04
365	0.04
366	0.05
367	0.06
368	0.07
369	0.12
370	0.15
371	0.18
372	0.19
373	0.25
374	0.34
375	0.41
376	0.51
377	0.57
378	0.65
379	0.7
380	0.76
381	0.77
382	0.78
383	0.79
384	0.79
385	0.78
386	0.73
387	0.67
388	0.64
389	0.57
390	0.49
391	0.42
392	0.33
393	0.24
394	0.2
395	0.18
396	0.14
397	0.13
398	0.11
399	0.09
400	0.07
401	0.05
402	0.05
403	0.05
404	0.05
405	0.06
406	0.05
407	0.06
408	0.09
409	0.1
410	0.14
411	0.15
412	0.16
413	0.17
414	0.17
415	0.16
416	0.14
417	0.12
418	0.1
419	0.1
420	0.09
421	0.12
422	0.13
423	0.13
424	0.16
425	0.18
426	0.21
427	0.27
428	0.29
429	0.3
430	0.34
431	0.39
432	0.43
433	0.44
434	0.44
435	0.39
436	0.37
437	0.37
438	0.38
439	0.38
440	0.34
441	0.35
442	0.34
443	0.39
444	0.42
445	0.44
446	0.41
447	0.37
448	0.33
449	0.31
450	0.28
451	0.2
452	0.17
453	0.1
454	0.09
455	0.1
456	0.09
457	0.1
458	0.1
459	0.11
460	0.11
461	0.13
462	0.13
463	0.12
464	0.16
465	0.15
466	0.17
467	0.17
468	0.19
469	0.17
470	0.19
471	0.22
472	0.25
473	0.32
474	0.39
475	0.47
476	0.5
477	0.58
478	0.62
479	0.68
480	0.67
481	0.66
482	0.66
483	0.68
484	0.74
485	0.75
486	0.74
487	0.72
488	0.74
489	0.69
490	0.64
491	0.62
492	0.62
493	0.6
494	0.62
495	0.64
496	0.67
497	0.7
498	0.73
499	0.66
500	0.6
501	0.59
502	0.58
503	0.56
504	0.58
505	0.6
506	0.59
507	0.63
508	0.63
509	0.62
510	0.56
511	0.49
512	0.43
513	0.38
514	0.37
515	0.33
516	0.3
517	0.28
518	0.27
519	0.29
520	0.25
521	0.22
522	0.17
523	0.17
524	0.17
525	0.15
526	0.15
527	0.13
528	0.13
529	0.13
530	0.14
531	0.13
532	0.11
533	0.09
534	0.08
535	0.07
536	0.07
537	0.08
538	0.07
539	0.09
540	0.11
541	0.1
542	0.11
543	0.11
544	0.1
545	0.12
546	0.13
547	0.13
548	0.16
549	0.17
550	0.16
551	0.22
552	0.24
553	0.27
554	0.27
555	0.27
556	0.23
557	0.27
558	0.28
559	0.25
560	0.27
561	0.23
562	0.24
563	0.24
564	0.26
565	0.28
566	0.35
567	0.42
568	0.46
569	0.54
570	0.6
571	0.65
572	0.7
573	0.67
574	0.61
575	0.56
576	0.55
577	0.53
578	0.55
579	0.59
580	0.54
581	0.56
582	0.57
583	0.54
584	0.5
585	0.45
586	0.37
587	0.34
588	0.36

Q5AMR1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer