FuNGI

K9F9Z4

Protein Details

Accession

K9F9Z4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
83-105	RQAEGIRPPKRNRLNVRVREIFL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 11, cyto 8.5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015712 DNA-dir_RNA_pol_su2 IPR007120 DNA-dir_RNAP_su2_dom IPR037033 DNA-dir_RNAP_su2_hyb_sf IPR007121 RNA_pol_bsu_CS IPR007644 RNA_pol_bsu_protrusion IPR007642 RNA_pol_Rpb2_2 IPR037034 RNA_pol_Rpb2_2_sf IPR007645 RNA_pol_Rpb2_3 IPR007641 RNA_pol_Rpb2_7 IPR014724 RNA_pol_RPB2_OB-fold IPR009674 Rpa2_dom_4
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0032549 F:ribonucleoside binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF06883 RNA_pol_Rpa2_4 PF04563 RNA_pol_Rpb2_1 PF04561 RNA_pol_Rpb2_2 PF04565 RNA_pol_Rpb2_3 PF00562 RNA_pol_Rpb2_6 PF04560 RNA_pol_Rpb2_7
PROSITE	View protein in PROSITE PS01166 RNA_POL_BETA
CDD	cd00653 RNA_pol_B_RPB2

Amino Acid Sequences

MAPAATETQWSVEYDTLRRENLFKNPPTDHTAYPSLAESIRPHIDSFNALFDDSKILEAGLKDIGIKTFLDGELETYEQKKARQAEGIRPPKRNRLNVRVREIFLDKPTLPPANKYATRNREIYPSECRERHSTYRGKLRARLEYQVNNGDWMESVRELGNVPIMVRTNRCHLEKATPDELVRHNEESEELGGFYIVNGNEKLIRMLVVGKRNYPMSIIRGSFVKRGQTYTKFGVQIRSVRPDQTSQTNVLHYLSDGNVTFRFSWRKNEYLIPVMMILKALAETNDREIFEAIVGGASSKGMKNTFVTDRVELLLRTYHAYQKHSQYDCRSHLGKAFRPVLGVPADMPDEEVGTEFLRKVVLPHLGNENVTEAQDWDKFKLITFMIRKLYSTVAGDCAPDNPDAVSNQEILLGGFLYGMILKERIEEWLRSFGPIARDWSIRNNGAKFTDEAFERDFLSKIVKRSNENIGNALEYFLSTGNLVSPTGLDLQQTSGYTVIAEKINFYRFISHFRMIHRGSFFAQLKTTTVRKLLPESWGFLCPVHTPDGSPCGLLNHLAHKCFISTDNLDVSQLPRTLVQLGVRSESSVALDESVVVQLDGRIIGYCSPKQAQRIADTIRYWKVEGKNNIPRELEIGYIPNSSGGQYPGVYMFSQSARMYRPVKYLALDKLDYVGPFEQPFMEIACVESDLIPGLSTHIEFTPTNILSIVANMTPFSDYNQSPRNMYQCQMSKQTMGTPGTSIAHRTDNKLYRIQTGQTPIVRPPLYNAYGLDNFPNGMNAVVAIISYTGYDMDDAMIINKSAHERGFGHGTVYKTKVVTLADNDSRRTKSKREVTKLFGFAPGDEVKEQVRNIIDEDGMPHLGARVKEGDKIAAWHNVRFDPASDSYVNVDGVTHYMKYKDAEEGYVDSIRLMGSESGNEPAQSLSIKYRIPRKPVIGDKFSSRHGQKGVLSQLWPAVDMPFSESGMQPDLIINPHAFPSRKAPLLLRSKKTHSSNAFPGMTIAQMIESMAGKAGAMHGLPQDSTPFQFSEENTATDYFGEQLRKAGYNYYGNEPLYSGITGREFSADIYMGLVYYQRLRHMVNDKFQVRTTGPVNALTGQPVKGRAKGGGIRVGEMERDSLIAHGAAFLLQDRLMNCSDAQHTWICRSCGSFLSTQVAVSGSSRSRTAINPGAAAAAAKAAPNQQSTNAHAGSAIGALGGVNGVVRCRRCAREATFDDSRAEVWEDGDGHRYVGGDNVTIVAVPGVLRYLDVELAAMGIRMKFLVEN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.29
3	0.31
4	0.31
5	0.33
6	0.35
7	0.37
8	0.44
9	0.51
10	0.48
11	0.52
12	0.54
13	0.56
14	0.59
15	0.58
16	0.5
17	0.47
18	0.47
19	0.4
20	0.38
21	0.34
22	0.29
23	0.25
24	0.26
25	0.22
26	0.24
27	0.28
28	0.27
29	0.27
30	0.26
31	0.27
32	0.28
33	0.27
34	0.26
35	0.22
36	0.21
37	0.21
38	0.2
39	0.22
40	0.18
41	0.17
42	0.12
43	0.12
44	0.14
45	0.13
46	0.14
47	0.12
48	0.11
49	0.12
50	0.13
51	0.14
52	0.13
53	0.12
54	0.12
55	0.14
56	0.13
57	0.14
58	0.13
59	0.14
60	0.15
61	0.17
62	0.18
63	0.16
64	0.21
65	0.21
66	0.23
67	0.28
68	0.31
69	0.33
70	0.4
71	0.44
72	0.5
73	0.58
74	0.67
75	0.68
76	0.72
77	0.74
78	0.75
79	0.8
80	0.8
81	0.79
82	0.79
83	0.83
84	0.83
85	0.87
86	0.83
87	0.75
88	0.7
89	0.64
90	0.57
91	0.49
92	0.46
93	0.37
94	0.34
95	0.37
96	0.39
97	0.36
98	0.36
99	0.38
100	0.41
101	0.46
102	0.49
103	0.54
104	0.56
105	0.6
106	0.6
107	0.56
108	0.56
109	0.54
110	0.52
111	0.51
112	0.51
113	0.54
114	0.53
115	0.55
116	0.53
117	0.57
118	0.6
119	0.6
120	0.61
121	0.6
122	0.69
123	0.72
124	0.72
125	0.72
126	0.71
127	0.72
128	0.67
129	0.66
130	0.63
131	0.61
132	0.61
133	0.6
134	0.54
135	0.46
136	0.41
137	0.34
138	0.27
139	0.22
140	0.19
141	0.12
142	0.13
143	0.11
144	0.12
145	0.12
146	0.12
147	0.14
148	0.12
149	0.12
150	0.14
151	0.16
152	0.18
153	0.21
154	0.23
155	0.27
156	0.33
157	0.35
158	0.36
159	0.36
160	0.43
161	0.47
162	0.52
163	0.48
164	0.45
165	0.43
166	0.44
167	0.45
168	0.41
169	0.38
170	0.32
171	0.29
172	0.27
173	0.27
174	0.25
175	0.22
176	0.16
177	0.12
178	0.1
179	0.1
180	0.09
181	0.08
182	0.1
183	0.09
184	0.11
185	0.11
186	0.12
187	0.14
188	0.14
189	0.15
190	0.12
191	0.12
192	0.1
193	0.16
194	0.21
195	0.27
196	0.29
197	0.3
198	0.33
199	0.33
200	0.33
201	0.29
202	0.27
203	0.24
204	0.28
205	0.26
206	0.25
207	0.27
208	0.29
209	0.32
210	0.31
211	0.34
212	0.29
213	0.33
214	0.4
215	0.42
216	0.45
217	0.45
218	0.48
219	0.45
220	0.45
221	0.46
222	0.44
223	0.46
224	0.45
225	0.47
226	0.43
227	0.41
228	0.42
229	0.4
230	0.39
231	0.39
232	0.37
233	0.34
234	0.35
235	0.34
236	0.32
237	0.29
238	0.25
239	0.18
240	0.17
241	0.13
242	0.13
243	0.12
244	0.13
245	0.13
246	0.15
247	0.16
248	0.18
249	0.25
250	0.24
251	0.34
252	0.37
253	0.39
254	0.4
255	0.45
256	0.45
257	0.43
258	0.41
259	0.32
260	0.28
261	0.26
262	0.23
263	0.17
264	0.13
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.06
269	0.08
270	0.09
271	0.13
272	0.16
273	0.16
274	0.17
275	0.17
276	0.17
277	0.15
278	0.14
279	0.09
280	0.06
281	0.06
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.06
286	0.06
287	0.09
288	0.09
289	0.11
290	0.13
291	0.18
292	0.21
293	0.24
294	0.26
295	0.25
296	0.25
297	0.25
298	0.25
299	0.2
300	0.17
301	0.16
302	0.14
303	0.15
304	0.16
305	0.19
306	0.22
307	0.26
308	0.3
309	0.36
310	0.44
311	0.45
312	0.49
313	0.51
314	0.56
315	0.55
316	0.56
317	0.5
318	0.42
319	0.44
320	0.46
321	0.43
322	0.43
323	0.43
324	0.37
325	0.36
326	0.35
327	0.33
328	0.27
329	0.22
330	0.15
331	0.13
332	0.13
333	0.12
334	0.12
335	0.09
336	0.08
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.06
341	0.07
342	0.07
343	0.07
344	0.07
345	0.07
346	0.08
347	0.11
348	0.18
349	0.17
350	0.19
351	0.24
352	0.25
353	0.25
354	0.24
355	0.23
356	0.17
357	0.16
358	0.14
359	0.1
360	0.11
361	0.15
362	0.16
363	0.15
364	0.17
365	0.17
366	0.17
367	0.2
368	0.18
369	0.22
370	0.24
371	0.28
372	0.3
373	0.3
374	0.3
375	0.28
376	0.29
377	0.23
378	0.21
379	0.17
380	0.15
381	0.15
382	0.15
383	0.13
384	0.13
385	0.13
386	0.12
387	0.11
388	0.09
389	0.1
390	0.1
391	0.11
392	0.11
393	0.1
394	0.1
395	0.1
396	0.1
397	0.08
398	0.08
399	0.06
400	0.05
401	0.04
402	0.04
403	0.03
404	0.03
405	0.04
406	0.04
407	0.05
408	0.05
409	0.06
410	0.06
411	0.1
412	0.12
413	0.13
414	0.15
415	0.22
416	0.22
417	0.21
418	0.22
419	0.21
420	0.22
421	0.23
422	0.24
423	0.2
424	0.21
425	0.22
426	0.27
427	0.29
428	0.3
429	0.32
430	0.3
431	0.29
432	0.29
433	0.3
434	0.25
435	0.22
436	0.2
437	0.17
438	0.18
439	0.17
440	0.16
441	0.16
442	0.16
443	0.14
444	0.12
445	0.18
446	0.19
447	0.2
448	0.26
449	0.27
450	0.29
451	0.33
452	0.42
453	0.41
454	0.39
455	0.39
456	0.33
457	0.31
458	0.28
459	0.24
460	0.15
461	0.09
462	0.09
463	0.06
464	0.06
465	0.05
466	0.05
467	0.05
468	0.06
469	0.06
470	0.05
471	0.05
472	0.06
473	0.07
474	0.08
475	0.07
476	0.07
477	0.08
478	0.09
479	0.09
480	0.09
481	0.08
482	0.07
483	0.07
484	0.07
485	0.08
486	0.08
487	0.08
488	0.09
489	0.11
490	0.13
491	0.13
492	0.14
493	0.17
494	0.16
495	0.23
496	0.27
497	0.28
498	0.29
499	0.3
500	0.38
501	0.33
502	0.36
503	0.31
504	0.27
505	0.25
506	0.3
507	0.3
508	0.24
509	0.24
510	0.2
511	0.2
512	0.22
513	0.23
514	0.17
515	0.17
516	0.18
517	0.18
518	0.22
519	0.23
520	0.25
521	0.24
522	0.25
523	0.25
524	0.24
525	0.23
526	0.19
527	0.18
528	0.14
529	0.14
530	0.14
531	0.12
532	0.11
533	0.12
534	0.15
535	0.14
536	0.13
537	0.12
538	0.1
539	0.1
540	0.11
541	0.11
542	0.15
543	0.16
544	0.16
545	0.17
546	0.16
547	0.16
548	0.15
549	0.16
550	0.12
551	0.12
552	0.13
553	0.14
554	0.14
555	0.14
556	0.13
557	0.13
558	0.12
559	0.11
560	0.1
561	0.09
562	0.1
563	0.1
564	0.11
565	0.12
566	0.13
567	0.13
568	0.14
569	0.14
570	0.13
571	0.13
572	0.12
573	0.1
574	0.07
575	0.07
576	0.06
577	0.05
578	0.05
579	0.05
580	0.05
581	0.05
582	0.04
583	0.04
584	0.03
585	0.04
586	0.03
587	0.03
588	0.03
589	0.04
590	0.06
591	0.09
592	0.09
593	0.11
594	0.13
595	0.15
596	0.18
597	0.22
598	0.22
599	0.22
600	0.26
601	0.26
602	0.28
603	0.27
604	0.28
605	0.26
606	0.25
607	0.22
608	0.23
609	0.26
610	0.29
611	0.33
612	0.37
613	0.43
614	0.44
615	0.47
616	0.42
617	0.37
618	0.32
619	0.28
620	0.21
621	0.13
622	0.12
623	0.1
624	0.1
625	0.09
626	0.08
627	0.07
628	0.07
629	0.07
630	0.07
631	0.07
632	0.06
633	0.07
634	0.07
635	0.08
636	0.07
637	0.07
638	0.07
639	0.07
640	0.1
641	0.09
642	0.11
643	0.11
644	0.16
645	0.18
646	0.19
647	0.21
648	0.21
649	0.22
650	0.22
651	0.24
652	0.22
653	0.23
654	0.22
655	0.19
656	0.18
657	0.18
658	0.16
659	0.14
660	0.12
661	0.09
662	0.09
663	0.09
664	0.08
665	0.07
666	0.08
667	0.07
668	0.06
669	0.05
670	0.06
671	0.06
672	0.06
673	0.05
674	0.05
675	0.04
676	0.04
677	0.04
678	0.04
679	0.04
680	0.04
681	0.05
682	0.05
683	0.06
684	0.05
685	0.08
686	0.08
687	0.09
688	0.14
689	0.13
690	0.13
691	0.13
692	0.13
693	0.1
694	0.11
695	0.11
696	0.05
697	0.06
698	0.05
699	0.06
700	0.06
701	0.06
702	0.07
703	0.1
704	0.1
705	0.15
706	0.2
707	0.21
708	0.22
709	0.24
710	0.27
711	0.24
712	0.25
713	0.27
714	0.26
715	0.29
716	0.33
717	0.32
718	0.28
719	0.27
720	0.29
721	0.28
722	0.24
723	0.21
724	0.17
725	0.17
726	0.17
727	0.16
728	0.15
729	0.12
730	0.17
731	0.17
732	0.21
733	0.27
734	0.31
735	0.34
736	0.38
737	0.37
738	0.35
739	0.36
740	0.34
741	0.29
742	0.28
743	0.29
744	0.27
745	0.27
746	0.24
747	0.29
748	0.28
749	0.24
750	0.23
751	0.24
752	0.24
753	0.23
754	0.23
755	0.2
756	0.22
757	0.22
758	0.2
759	0.14
760	0.13
761	0.12
762	0.12
763	0.07
764	0.06
765	0.05
766	0.04
767	0.04
768	0.04
769	0.03
770	0.03
771	0.03
772	0.03
773	0.03
774	0.03
775	0.03
776	0.03
777	0.04
778	0.04
779	0.04
780	0.04
781	0.04
782	0.05
783	0.05
784	0.05
785	0.05
786	0.06
787	0.08
788	0.09
789	0.09
790	0.11
791	0.12
792	0.14
793	0.18
794	0.17
795	0.17
796	0.19
797	0.21
798	0.22
799	0.23
800	0.22
801	0.18
802	0.18
803	0.19
804	0.17
805	0.17
806	0.16
807	0.21
808	0.25
809	0.27
810	0.29
811	0.3
812	0.32
813	0.35
814	0.36
815	0.35
816	0.39
817	0.46
818	0.54
819	0.59
820	0.63
821	0.65
822	0.68
823	0.66
824	0.57
825	0.51
826	0.41
827	0.32
828	0.3
829	0.24
830	0.18
831	0.15
832	0.15
833	0.13
834	0.16
835	0.15
836	0.14
837	0.14
838	0.13
839	0.14
840	0.15
841	0.14
842	0.11
843	0.12
844	0.11
845	0.11
846	0.1
847	0.08
848	0.08
849	0.11
850	0.11
851	0.12
852	0.15
853	0.15
854	0.19
855	0.19
856	0.19
857	0.17
858	0.19
859	0.2
860	0.23
861	0.23
862	0.22
863	0.24
864	0.23
865	0.24
866	0.22
867	0.2
868	0.18
869	0.18
870	0.2
871	0.17
872	0.18
873	0.18
874	0.19
875	0.18
876	0.13
877	0.11
878	0.08
879	0.09
880	0.1
881	0.09
882	0.08
883	0.09
884	0.11
885	0.12
886	0.13
887	0.16
888	0.15
889	0.16
890	0.17
891	0.18
892	0.19
893	0.19
894	0.17
895	0.13
896	0.12
897	0.11
898	0.09
899	0.08
900	0.07
901	0.06
902	0.08
903	0.09
904	0.11
905	0.12
906	0.11
907	0.11
908	0.09
909	0.1
910	0.09
911	0.1
912	0.1
913	0.14
914	0.16
915	0.19
916	0.29
917	0.34
918	0.4
919	0.45
920	0.48
921	0.53
922	0.61
923	0.64
924	0.6
925	0.56
926	0.56
927	0.53
928	0.5
929	0.49
930	0.41
931	0.38
932	0.35
933	0.37
934	0.33
935	0.37
936	0.39
937	0.34
938	0.33
939	0.29
940	0.29
941	0.25
942	0.23
943	0.17
944	0.12
945	0.1
946	0.09
947	0.12
948	0.1
949	0.11
950	0.12
951	0.11
952	0.12
953	0.14
954	0.14
955	0.11
956	0.11
957	0.11
958	0.11
959	0.13
960	0.11
961	0.1
962	0.12
963	0.16
964	0.16
965	0.17
966	0.23
967	0.28
968	0.29
969	0.31
970	0.32
971	0.36
972	0.47
973	0.54
974	0.54
975	0.54
976	0.58
977	0.64
978	0.66
979	0.66
980	0.6
981	0.59
982	0.58
983	0.6
984	0.55
985	0.46
986	0.43
987	0.34
988	0.28
989	0.21
990	0.14
991	0.07
992	0.06
993	0.06
994	0.06
995	0.06
996	0.06
997	0.06
998	0.05
999	0.05
1000	0.05
1001	0.06
1002	0.06
1003	0.05
1004	0.07
1005	0.08
1006	0.09
1007	0.09
1008	0.1
1009	0.12
1010	0.12
1011	0.13
1012	0.14
1013	0.13
1014	0.15
1015	0.17
1016	0.17
1017	0.24
1018	0.24
1019	0.24
1020	0.24
1021	0.24
1022	0.22
1023	0.19
1024	0.19
1025	0.12
1026	0.14
1027	0.15
1028	0.13
1029	0.16
1030	0.18
1031	0.2
1032	0.2
1033	0.22
1034	0.23
1035	0.27
1036	0.3
1037	0.33
1038	0.35
1039	0.34
1040	0.33
1041	0.3
1042	0.26
1043	0.21
1044	0.19
1045	0.13
1046	0.11
1047	0.12
1048	0.12
1049	0.12
1050	0.12
1051	0.11
1052	0.11
1053	0.13
1054	0.11
1055	0.1
1056	0.1
1057	0.09
1058	0.08
1059	0.08
1060	0.08
1061	0.07
1062	0.11
1063	0.12
1064	0.14
1065	0.16
1066	0.17
1067	0.25
1068	0.33
1069	0.39
1070	0.42
1071	0.5
1072	0.5
1073	0.51
1074	0.51
1075	0.48
1076	0.4
1077	0.38
1078	0.34
1079	0.3
1080	0.29
1081	0.29
1082	0.29
1083	0.26
1084	0.25
1085	0.24
1086	0.23
1087	0.19
1088	0.2
1089	0.25
1090	0.26
1091	0.28
1092	0.29
1093	0.27
1094	0.32
1095	0.35
1096	0.38
1097	0.38
1098	0.36
1099	0.33
1100	0.33
1101	0.32
1102	0.27
1103	0.23
1104	0.19
1105	0.12
1106	0.12
1107	0.11
1108	0.09
1109	0.09
1110	0.08
1111	0.07
1112	0.07
1113	0.07
1114	0.06
1115	0.06
1116	0.07
1117	0.07
1118	0.07
1119	0.09
1120	0.09
1121	0.13
1122	0.14
1123	0.15
1124	0.14
1125	0.17
1126	0.19
1127	0.18
1128	0.21
1129	0.23
1130	0.24
1131	0.29
1132	0.33
1133	0.32
1134	0.3
1135	0.32
1136	0.31
1137	0.3
1138	0.32
1139	0.28
1140	0.25
1141	0.28
1142	0.27
1143	0.24
1144	0.23
1145	0.19
1146	0.16
1147	0.15
1148	0.17
1149	0.14
1150	0.16
1151	0.17
1152	0.17
1153	0.19
1154	0.21
1155	0.28
1156	0.31
1157	0.3
1158	0.29
1159	0.29
1160	0.28
1161	0.26
1162	0.24
1163	0.16
1164	0.1
1165	0.08
1166	0.08
1167	0.09
1168	0.12
1169	0.16
1170	0.19
1171	0.2
1172	0.25
1173	0.28
1174	0.33
1175	0.38
1176	0.34
1177	0.31
1178	0.28
1179	0.26
1180	0.21
1181	0.18
1182	0.13
1183	0.06
1184	0.05
1185	0.05
1186	0.05
1187	0.04
1188	0.03
1189	0.04
1190	0.04
1191	0.07
1192	0.12
1193	0.14
1194	0.2
1195	0.27
1196	0.31
1197	0.35
1198	0.43
1199	0.48
1200	0.54
1201	0.57
1202	0.59
1203	0.59
1204	0.56
1205	0.54
1206	0.46
1207	0.4
1208	0.32
1209	0.3
1210	0.22
1211	0.17
1212	0.18
1213	0.17
1214	0.18
1215	0.22
1216	0.19
1217	0.17
1218	0.17
1219	0.17
1220	0.14
1221	0.16
1222	0.16
1223	0.12
1224	0.12
1225	0.12
1226	0.12
1227	0.11
1228	0.11
1229	0.07
1230	0.06
1231	0.06
1232	0.06
1233	0.06
1234	0.06
1235	0.06
1236	0.07
1237	0.09
1238	0.09
1239	0.09
1240	0.09
1241	0.08
1242	0.08
1243	0.08
1244	0.08
1245	0.07
1246	0.07
1247	0.07
1248	0.07

K9F9Z4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer