Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3RXE4

Protein Details
Accession E3RXE4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-67AKSVASNVKDKKKSKKAPTPEPESDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-58VKAGRVTKPAATPKSKSKDIAKSVASNVKDKKKSKKA
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG pte:PTT_14050  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGKTKIADKSSKKDKNSELASVKAGRVTKPAATPKSKSKDIAKSVASNVKDKKKSKKAPTPEPESDSSSESESESEDSSESSSEEEVVEKKTPAKAAPKAAAKADSDSDSDSSEEDSDSDSSEDEKPAPKAKANGVKKAAAKAESSDSDSDSSSDSEDEKPAAKAEATSDSDSDADSSDADSDEEEAPSKKRKAEEVDEPIVKKSKVEEPAAEEGIKNLFVGNMSWNIDEDWLRREFEGFGEIVGCRVITDRETGRAKGFGYVEFSNAADAAKAQKEMHEYELDGRQLNVDFSTPRAKPDANGGARANKYGDKRSPPSNTLFLGNVSFECSNESIQEVFAEYGSITRVSLPTDRDTGALKGFGYVDFSSQQEATAALEALNGQDIGGRAIRIDYATPREDNGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.74
3 0.72
4 0.71
5 0.64
6 0.58
7 0.59
8 0.53
9 0.46
10 0.41
11 0.38
12 0.31
13 0.31
14 0.31
15 0.3
16 0.35
17 0.44
18 0.48
19 0.52
20 0.56
21 0.62
22 0.67
23 0.67
24 0.65
25 0.65
26 0.66
27 0.66
28 0.69
29 0.63
30 0.59
31 0.6
32 0.61
33 0.55
34 0.52
35 0.53
36 0.56
37 0.6
38 0.63
39 0.68
40 0.72
41 0.8
42 0.83
43 0.86
44 0.86
45 0.88
46 0.91
47 0.89
48 0.85
49 0.8
50 0.72
51 0.66
52 0.58
53 0.49
54 0.4
55 0.32
56 0.26
57 0.21
58 0.18
59 0.14
60 0.14
61 0.12
62 0.12
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.09
68 0.09
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.09
73 0.1
74 0.13
75 0.15
76 0.15
77 0.18
78 0.2
79 0.22
80 0.25
81 0.32
82 0.34
83 0.39
84 0.45
85 0.48
86 0.47
87 0.47
88 0.46
89 0.39
90 0.35
91 0.31
92 0.26
93 0.21
94 0.2
95 0.19
96 0.16
97 0.15
98 0.13
99 0.12
100 0.11
101 0.1
102 0.08
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.08
108 0.1
109 0.11
110 0.12
111 0.12
112 0.15
113 0.17
114 0.22
115 0.24
116 0.24
117 0.27
118 0.33
119 0.42
120 0.44
121 0.5
122 0.47
123 0.5
124 0.5
125 0.5
126 0.45
127 0.37
128 0.33
129 0.26
130 0.27
131 0.23
132 0.24
133 0.2
134 0.18
135 0.17
136 0.17
137 0.15
138 0.13
139 0.12
140 0.09
141 0.09
142 0.1
143 0.1
144 0.11
145 0.11
146 0.11
147 0.11
148 0.11
149 0.11
150 0.1
151 0.09
152 0.1
153 0.14
154 0.16
155 0.16
156 0.16
157 0.16
158 0.16
159 0.15
160 0.14
161 0.09
162 0.06
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.08
173 0.08
174 0.1
175 0.16
176 0.18
177 0.19
178 0.2
179 0.24
180 0.29
181 0.33
182 0.4
183 0.41
184 0.44
185 0.44
186 0.43
187 0.39
188 0.36
189 0.31
190 0.23
191 0.18
192 0.19
193 0.22
194 0.23
195 0.23
196 0.25
197 0.29
198 0.29
199 0.27
200 0.21
201 0.16
202 0.15
203 0.14
204 0.09
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.06
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.11
217 0.1
218 0.12
219 0.12
220 0.12
221 0.12
222 0.13
223 0.12
224 0.12
225 0.13
226 0.09
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.04
234 0.05
235 0.06
236 0.06
237 0.09
238 0.1
239 0.16
240 0.19
241 0.2
242 0.21
243 0.22
244 0.22
245 0.22
246 0.22
247 0.17
248 0.19
249 0.18
250 0.18
251 0.17
252 0.16
253 0.12
254 0.12
255 0.11
256 0.06
257 0.06
258 0.08
259 0.09
260 0.1
261 0.1
262 0.12
263 0.16
264 0.18
265 0.2
266 0.18
267 0.18
268 0.2
269 0.24
270 0.23
271 0.2
272 0.18
273 0.16
274 0.16
275 0.16
276 0.12
277 0.1
278 0.09
279 0.11
280 0.18
281 0.17
282 0.19
283 0.22
284 0.22
285 0.21
286 0.29
287 0.37
288 0.32
289 0.36
290 0.36
291 0.4
292 0.4
293 0.41
294 0.34
295 0.29
296 0.31
297 0.34
298 0.39
299 0.4
300 0.44
301 0.51
302 0.56
303 0.55
304 0.56
305 0.52
306 0.47
307 0.41
308 0.38
309 0.31
310 0.25
311 0.22
312 0.17
313 0.17
314 0.15
315 0.13
316 0.15
317 0.14
318 0.14
319 0.14
320 0.15
321 0.12
322 0.12
323 0.12
324 0.11
325 0.1
326 0.09
327 0.09
328 0.07
329 0.08
330 0.09
331 0.09
332 0.07
333 0.08
334 0.09
335 0.12
336 0.16
337 0.19
338 0.21
339 0.24
340 0.24
341 0.24
342 0.26
343 0.25
344 0.24
345 0.21
346 0.18
347 0.16
348 0.16
349 0.15
350 0.17
351 0.15
352 0.16
353 0.16
354 0.17
355 0.18
356 0.17
357 0.17
358 0.13
359 0.13
360 0.12
361 0.12
362 0.12
363 0.08
364 0.09
365 0.09
366 0.09
367 0.1
368 0.08
369 0.06
370 0.08
371 0.08
372 0.1
373 0.12
374 0.11
375 0.11
376 0.12
377 0.13
378 0.12
379 0.15
380 0.18
381 0.23
382 0.27
383 0.28