Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3S756

Protein Details
Accession E3S756    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-51QSAVNSKKRKATKEPEVKKKAKTMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
34-49KKRKATKEPEVKKKAK
149-167EKDGEKIASKLTRKDRKAS
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034393  TatSF1-like  
Gene Ontology GO:0005686  C:U2 snRNP  
GO:0005684  C:U2-type spliceosomal complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG pte:PTT_18626  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSDLEDFMEEMGQGRRSGSPTSDAPDNQSAVNSKKRKATKEPEVKKKAKTMENKAIWITNLPPDTTFKELEDEFSRFGIIDKGADGQPRIKMYNDEETGKFTGNAMIVYFKKEAIVNAIKMMDDYVLRPGDYSNGNIRVEPANIDHKKEKDGEKIASKLTRKDRKASERNRQELNRKLNEWSDNEEEVAAAFAPKKNKWAKVAIVKHVFTLKELEEDDEAILDIKEDFREAGEKYGEVTNCTLYDKEPEGIMTVRFREFESAENFMKDYQGKSYARRRLQISLAEDKPKFKKSSKVEEPDSEEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.17
3 0.19
4 0.22
5 0.22
6 0.24
7 0.25
8 0.29
9 0.33
10 0.31
11 0.34
12 0.35
13 0.34
14 0.29
15 0.29
16 0.29
17 0.29
18 0.38
19 0.38
20 0.38
21 0.46
22 0.53
23 0.59
24 0.65
25 0.7
26 0.71
27 0.77
28 0.83
29 0.85
30 0.88
31 0.86
32 0.81
33 0.79
34 0.76
35 0.73
36 0.73
37 0.72
38 0.72
39 0.71
40 0.69
41 0.63
42 0.56
43 0.48
44 0.4
45 0.32
46 0.27
47 0.24
48 0.21
49 0.2
50 0.22
51 0.25
52 0.26
53 0.25
54 0.2
55 0.22
56 0.22
57 0.25
58 0.25
59 0.23
60 0.21
61 0.2
62 0.19
63 0.15
64 0.16
65 0.14
66 0.11
67 0.09
68 0.09
69 0.11
70 0.12
71 0.14
72 0.14
73 0.15
74 0.18
75 0.2
76 0.21
77 0.19
78 0.21
79 0.23
80 0.31
81 0.31
82 0.31
83 0.29
84 0.31
85 0.31
86 0.29
87 0.25
88 0.16
89 0.16
90 0.13
91 0.12
92 0.09
93 0.12
94 0.11
95 0.14
96 0.14
97 0.12
98 0.13
99 0.13
100 0.13
101 0.16
102 0.19
103 0.16
104 0.17
105 0.17
106 0.16
107 0.16
108 0.16
109 0.1
110 0.07
111 0.07
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.11
118 0.12
119 0.13
120 0.14
121 0.18
122 0.18
123 0.18
124 0.19
125 0.18
126 0.17
127 0.16
128 0.14
129 0.2
130 0.2
131 0.24
132 0.25
133 0.25
134 0.27
135 0.3
136 0.31
137 0.28
138 0.31
139 0.32
140 0.32
141 0.33
142 0.33
143 0.34
144 0.32
145 0.33
146 0.39
147 0.44
148 0.43
149 0.48
150 0.54
151 0.59
152 0.68
153 0.71
154 0.72
155 0.72
156 0.75
157 0.75
158 0.72
159 0.69
160 0.67
161 0.67
162 0.6
163 0.52
164 0.49
165 0.47
166 0.45
167 0.4
168 0.37
169 0.32
170 0.27
171 0.26
172 0.24
173 0.19
174 0.15
175 0.13
176 0.08
177 0.05
178 0.05
179 0.08
180 0.11
181 0.12
182 0.2
183 0.25
184 0.3
185 0.33
186 0.38
187 0.42
188 0.49
189 0.54
190 0.55
191 0.55
192 0.51
193 0.49
194 0.47
195 0.4
196 0.31
197 0.28
198 0.2
199 0.16
200 0.16
201 0.17
202 0.14
203 0.14
204 0.13
205 0.1
206 0.1
207 0.08
208 0.07
209 0.06
210 0.05
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.09
217 0.1
218 0.13
219 0.13
220 0.13
221 0.15
222 0.19
223 0.19
224 0.18
225 0.18
226 0.17
227 0.16
228 0.18
229 0.16
230 0.13
231 0.17
232 0.18
233 0.18
234 0.16
235 0.16
236 0.17
237 0.18
238 0.19
239 0.18
240 0.18
241 0.18
242 0.18
243 0.19
244 0.2
245 0.2
246 0.23
247 0.24
248 0.27
249 0.27
250 0.27
251 0.27
252 0.24
253 0.26
254 0.23
255 0.2
256 0.19
257 0.26
258 0.27
259 0.35
260 0.44
261 0.51
262 0.55
263 0.6
264 0.6
265 0.58
266 0.62
267 0.61
268 0.58
269 0.57
270 0.56
271 0.58
272 0.56
273 0.57
274 0.57
275 0.57
276 0.56
277 0.52
278 0.56
279 0.57
280 0.67
281 0.71
282 0.74
283 0.73
284 0.75