Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3RDC4

Protein Details
Accession E3RDC4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
310-335LDTINRLLKKQPPKRGRKALQDEDGQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
289-309RRAEMARRRKNLSEKRNEEEK
313-327INRLLKKQPPKRGRK
Subcellular Location(s) mito 18, mito_nucl 13.333, cyto_mito 10.333, nucl 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029523  INO80B/Ies2  
IPR006880  INO80B_C  
Gene Ontology GO:0031011  C:Ino80 complex  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
KEGG pte:PTT_01985  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04795  PAPA-1  
Amino Acid Sequences MPRLRSRAAPQALTALSAAPTASSTRPRRGTANQSPAAAVIQRSSPEETRQSIHLTVKSSPNKLRQATGGATPKAGVNRQNIVAGKRASRSSRVVREVDSEDDEDEDDAEEVDAMDVDDDDSDENDVDAEGDEDEDMDAEGDEDDDMEDTPAPRITVNANRGIPVKPAPAIKLTKAQDRVEAKEMAMDDDDDDDDLSDPDSDLEEEDAEGEDEDAEGEEDDDMGVTPGGDMDEDMDSDEDLSRDQTPDVSKMTKRQRALVTEEGDGTLLALSNEAQKKKHLTAEEHAMRRAEMARRRKNLSEKRNEEEKLDTINRLLKKQPPKRGRKALQDEDGQEEEPEPERANPLFVRYIQNAKGTQLAVPDEWLQAPVGNLFTGDLQKGAQKPFSGRMVEEVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.23
3 0.17
4 0.15
5 0.14
6 0.08
7 0.09
8 0.1
9 0.14
10 0.23
11 0.28
12 0.37
13 0.43
14 0.45
15 0.51
16 0.57
17 0.64
18 0.65
19 0.69
20 0.64
21 0.59
22 0.57
23 0.51
24 0.44
25 0.35
26 0.25
27 0.16
28 0.15
29 0.16
30 0.18
31 0.22
32 0.23
33 0.26
34 0.31
35 0.32
36 0.32
37 0.34
38 0.35
39 0.35
40 0.38
41 0.35
42 0.34
43 0.35
44 0.42
45 0.45
46 0.48
47 0.51
48 0.54
49 0.59
50 0.58
51 0.57
52 0.5
53 0.49
54 0.45
55 0.46
56 0.45
57 0.37
58 0.35
59 0.33
60 0.32
61 0.3
62 0.31
63 0.29
64 0.26
65 0.29
66 0.3
67 0.34
68 0.35
69 0.33
70 0.36
71 0.33
72 0.31
73 0.31
74 0.35
75 0.33
76 0.35
77 0.41
78 0.43
79 0.49
80 0.52
81 0.5
82 0.47
83 0.49
84 0.47
85 0.43
86 0.36
87 0.29
88 0.23
89 0.21
90 0.2
91 0.15
92 0.12
93 0.1
94 0.07
95 0.06
96 0.06
97 0.05
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.03
102 0.03
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.04
116 0.05
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.04
129 0.03
130 0.03
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.11
143 0.17
144 0.2
145 0.25
146 0.25
147 0.26
148 0.28
149 0.27
150 0.25
151 0.21
152 0.19
153 0.16
154 0.17
155 0.17
156 0.2
157 0.21
158 0.21
159 0.27
160 0.27
161 0.31
162 0.35
163 0.34
164 0.36
165 0.37
166 0.39
167 0.35
168 0.33
169 0.27
170 0.24
171 0.23
172 0.17
173 0.14
174 0.11
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.06
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.1
233 0.11
234 0.13
235 0.16
236 0.18
237 0.19
238 0.27
239 0.37
240 0.41
241 0.41
242 0.46
243 0.48
244 0.48
245 0.53
246 0.51
247 0.44
248 0.38
249 0.37
250 0.31
251 0.25
252 0.21
253 0.14
254 0.08
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.1
260 0.15
261 0.17
262 0.18
263 0.21
264 0.26
265 0.29
266 0.34
267 0.33
268 0.34
269 0.37
270 0.47
271 0.51
272 0.49
273 0.48
274 0.42
275 0.37
276 0.34
277 0.34
278 0.3
279 0.31
280 0.4
281 0.47
282 0.53
283 0.58
284 0.63
285 0.69
286 0.73
287 0.75
288 0.75
289 0.72
290 0.74
291 0.77
292 0.71
293 0.63
294 0.57
295 0.48
296 0.45
297 0.4
298 0.34
299 0.28
300 0.34
301 0.34
302 0.33
303 0.35
304 0.36
305 0.45
306 0.53
307 0.61
308 0.66
309 0.74
310 0.81
311 0.87
312 0.88
313 0.88
314 0.89
315 0.87
316 0.83
317 0.78
318 0.7
319 0.65
320 0.58
321 0.47
322 0.37
323 0.29
324 0.24
325 0.2
326 0.19
327 0.15
328 0.14
329 0.18
330 0.18
331 0.21
332 0.2
333 0.22
334 0.24
335 0.26
336 0.31
337 0.3
338 0.37
339 0.36
340 0.41
341 0.38
342 0.35
343 0.37
344 0.31
345 0.29
346 0.26
347 0.25
348 0.2
349 0.21
350 0.22
351 0.19
352 0.19
353 0.18
354 0.15
355 0.13
356 0.13
357 0.12
358 0.12
359 0.1
360 0.1
361 0.1
362 0.11
363 0.13
364 0.13
365 0.12
366 0.12
367 0.17
368 0.22
369 0.25
370 0.27
371 0.28
372 0.32
373 0.37
374 0.43
375 0.4
376 0.36