Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3RUM4

Protein Details
Accession E3RUM4    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-155APPTVAEKPKRRYTKKATTVADESEKPKPKPRARKPKPKSDREIPDSEDHydrophilic
185-210ANAPKLTKTGKLRKSRAKKQAPEEGGHydrophilic
752-771KPLPPKAKTKSKEKAKSPATHydrophilic
817-842RSPTTSPSKAKKPSNHKDKAPLRHADHydrophilic
907-930HTSIRVYKKATQKQAKAWNQQMKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
115-123PKRRYTKKA
129-146ESEKPKPKPRARKPKPKS
189-235KLTKTGKLRKSRAKKQAPEEGGEAPIPKPRKTRVAKPKAAATRVKGG
405-412GKATKKKP
464-488KKPLRKRKSASDKADSKAKSKKTST
727-735PKKRGRPPK
752-769KPLPPKAKTKSKEKAKSP
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027784  Slx4_ascomycetes  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
KEGG pte:PTT_12799  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
Amino Acid Sequences MAGHSYDVVVLSSSPPAASPQYEAAPRRVAMPASSPLAFSPAASPIRTTAGASRVNSRAAPIPEGAVRGFATVGSLVRSEHFTTRIDNERAETNEAPPPRELPDVVAPPTVAEKPKRRYTKKATTVADESEKPKPKPRARKPKPKSDREIPDSEDELRLPPRPINSHFFDDKGREPPLEPQGEAANAPKLTKTGKLRKSRAKKQAPEEGGEAPIPKPRKTRVAKPKAAATRVKGGKQHDASTIFAHFQDDAHKGEGSAGLGTRARTEELDAPVENPSIWDVPESPRPKTSATIKQRVPSPVAEGLDLEEAVVRRRDWTPPRDTTIPSPFTNSTGKENKALVPGAGGAFTSMIFNFAYAQPPLAQPTETMVDSTTEGTLATKRRRVELVEIRSNQINSRDSSPEKGKATKKKPRTITDLMTEKYAVKDAEPVTGEAFGAFFEPLVSTTKILLNDTSAPDTNVPLKKPLRKRKSASDKADSKAKSKKTSTKSAKQMHVEEKLLSPTSALSRLSKQDVLFGTSSQLVLDESPTTIRQIQSAIKESEQDSNSFAAPAPLRWPKLDKVQSKGGLWAASSRDDKGRVLEHMSDVYIPEPDRTQDIPLLMDGARDKPDEIADDASSFIDIDDIVPDPPSAILISSDLPTPPRNPSRTSQTVEHSNDDYEMTDVGYEDIDNFEQAPPPSNQNADPDNSFIDIDDIDIPLSAHIRQPPTMKLKPPAPMSVTDNGSPKKRGRPPKSLVPIANVSASSTPSLKPLPPKAKTKSKEKAKSPATPLKSLGRFIDIDEILDSEDEGLAALSPTPPRVRKLVDSGPLPLILRSPTTSPSKAKKPSNHKDKAPLRHADITPVYCIATRMLEWTHIKASVFSQLTSHIRSLPPTTDPTKPSWHEKILIYDPIVLEDFTQYINAHTSIRVYKKATQKQAKAWNQQMKADGEPLLTIDKDGDDDEVLAVERELEGFMLQAWCESLSVCCIWGEGRGKGGARKGLY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.12
4 0.15
5 0.15
6 0.18
7 0.2
8 0.25
9 0.31
10 0.34
11 0.35
12 0.37
13 0.36
14 0.36
15 0.35
16 0.31
17 0.27
18 0.29
19 0.29
20 0.28
21 0.29
22 0.26
23 0.23
24 0.25
25 0.23
26 0.18
27 0.16
28 0.19
29 0.21
30 0.21
31 0.22
32 0.2
33 0.25
34 0.25
35 0.24
36 0.22
37 0.26
38 0.31
39 0.32
40 0.37
41 0.36
42 0.38
43 0.36
44 0.34
45 0.35
46 0.32
47 0.33
48 0.27
49 0.27
50 0.26
51 0.28
52 0.25
53 0.2
54 0.18
55 0.15
56 0.15
57 0.11
58 0.11
59 0.1
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.1
64 0.11
65 0.15
66 0.17
67 0.19
68 0.21
69 0.21
70 0.24
71 0.3
72 0.38
73 0.36
74 0.35
75 0.34
76 0.37
77 0.39
78 0.41
79 0.36
80 0.31
81 0.35
82 0.35
83 0.36
84 0.31
85 0.3
86 0.27
87 0.29
88 0.26
89 0.25
90 0.3
91 0.32
92 0.33
93 0.31
94 0.28
95 0.26
96 0.29
97 0.27
98 0.25
99 0.29
100 0.37
101 0.44
102 0.54
103 0.65
104 0.68
105 0.75
106 0.8
107 0.83
108 0.84
109 0.85
110 0.79
111 0.75
112 0.72
113 0.67
114 0.62
115 0.54
116 0.48
117 0.48
118 0.52
119 0.48
120 0.53
121 0.59
122 0.63
123 0.71
124 0.78
125 0.8
126 0.83
127 0.92
128 0.92
129 0.93
130 0.93
131 0.92
132 0.9
133 0.89
134 0.89
135 0.84
136 0.81
137 0.74
138 0.68
139 0.6
140 0.53
141 0.44
142 0.34
143 0.3
144 0.27
145 0.26
146 0.23
147 0.23
148 0.27
149 0.31
150 0.35
151 0.39
152 0.41
153 0.45
154 0.45
155 0.44
156 0.42
157 0.41
158 0.4
159 0.38
160 0.36
161 0.3
162 0.3
163 0.35
164 0.39
165 0.38
166 0.34
167 0.3
168 0.29
169 0.29
170 0.28
171 0.23
172 0.2
173 0.17
174 0.18
175 0.16
176 0.16
177 0.17
178 0.24
179 0.32
180 0.37
181 0.46
182 0.56
183 0.65
184 0.74
185 0.83
186 0.86
187 0.87
188 0.88
189 0.87
190 0.85
191 0.86
192 0.78
193 0.71
194 0.63
195 0.54
196 0.45
197 0.38
198 0.31
199 0.21
200 0.23
201 0.23
202 0.24
203 0.27
204 0.3
205 0.4
206 0.45
207 0.56
208 0.61
209 0.69
210 0.73
211 0.72
212 0.76
213 0.74
214 0.73
215 0.68
216 0.6
217 0.59
218 0.56
219 0.56
220 0.52
221 0.49
222 0.51
223 0.49
224 0.48
225 0.43
226 0.41
227 0.38
228 0.35
229 0.32
230 0.24
231 0.21
232 0.19
233 0.14
234 0.12
235 0.15
236 0.15
237 0.16
238 0.17
239 0.17
240 0.15
241 0.16
242 0.17
243 0.13
244 0.11
245 0.1
246 0.1
247 0.11
248 0.11
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.11
253 0.14
254 0.17
255 0.19
256 0.21
257 0.2
258 0.2
259 0.2
260 0.2
261 0.17
262 0.12
263 0.11
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.13
269 0.22
270 0.25
271 0.25
272 0.27
273 0.29
274 0.29
275 0.33
276 0.37
277 0.39
278 0.46
279 0.52
280 0.53
281 0.55
282 0.59
283 0.57
284 0.52
285 0.42
286 0.38
287 0.33
288 0.31
289 0.26
290 0.21
291 0.19
292 0.17
293 0.15
294 0.11
295 0.08
296 0.07
297 0.09
298 0.1
299 0.09
300 0.11
301 0.13
302 0.21
303 0.27
304 0.34
305 0.4
306 0.44
307 0.5
308 0.5
309 0.51
310 0.5
311 0.5
312 0.47
313 0.4
314 0.4
315 0.34
316 0.34
317 0.35
318 0.3
319 0.29
320 0.31
321 0.32
322 0.31
323 0.32
324 0.31
325 0.3
326 0.29
327 0.22
328 0.16
329 0.15
330 0.12
331 0.11
332 0.09
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.04
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.07
342 0.07
343 0.09
344 0.09
345 0.1
346 0.1
347 0.11
348 0.13
349 0.12
350 0.11
351 0.09
352 0.12
353 0.13
354 0.12
355 0.12
356 0.1
357 0.1
358 0.11
359 0.11
360 0.09
361 0.06
362 0.06
363 0.07
364 0.1
365 0.15
366 0.19
367 0.23
368 0.24
369 0.26
370 0.28
371 0.3
372 0.36
373 0.39
374 0.43
375 0.47
376 0.47
377 0.47
378 0.46
379 0.44
380 0.37
381 0.32
382 0.26
383 0.19
384 0.22
385 0.24
386 0.24
387 0.28
388 0.31
389 0.32
390 0.32
391 0.38
392 0.42
393 0.48
394 0.57
395 0.61
396 0.67
397 0.7
398 0.75
399 0.74
400 0.74
401 0.7
402 0.64
403 0.62
404 0.58
405 0.5
406 0.43
407 0.38
408 0.3
409 0.24
410 0.22
411 0.15
412 0.09
413 0.13
414 0.13
415 0.15
416 0.15
417 0.15
418 0.14
419 0.14
420 0.13
421 0.08
422 0.08
423 0.05
424 0.05
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.05
430 0.08
431 0.08
432 0.08
433 0.09
434 0.12
435 0.12
436 0.13
437 0.12
438 0.1
439 0.12
440 0.13
441 0.14
442 0.12
443 0.12
444 0.12
445 0.12
446 0.17
447 0.17
448 0.17
449 0.21
450 0.26
451 0.33
452 0.43
453 0.53
454 0.56
455 0.62
456 0.66
457 0.71
458 0.77
459 0.8
460 0.77
461 0.75
462 0.71
463 0.65
464 0.67
465 0.58
466 0.51
467 0.48
468 0.46
469 0.44
470 0.44
471 0.5
472 0.49
473 0.59
474 0.62
475 0.64
476 0.69
477 0.7
478 0.7
479 0.65
480 0.64
481 0.58
482 0.54
483 0.46
484 0.37
485 0.3
486 0.27
487 0.23
488 0.17
489 0.12
490 0.09
491 0.09
492 0.1
493 0.1
494 0.1
495 0.12
496 0.14
497 0.17
498 0.18
499 0.17
500 0.2
501 0.19
502 0.21
503 0.19
504 0.17
505 0.15
506 0.13
507 0.13
508 0.09
509 0.08
510 0.06
511 0.05
512 0.06
513 0.05
514 0.05
515 0.06
516 0.06
517 0.07
518 0.09
519 0.09
520 0.09
521 0.11
522 0.14
523 0.16
524 0.2
525 0.2
526 0.19
527 0.2
528 0.21
529 0.25
530 0.22
531 0.2
532 0.17
533 0.17
534 0.16
535 0.15
536 0.14
537 0.1
538 0.1
539 0.1
540 0.14
541 0.17
542 0.18
543 0.18
544 0.22
545 0.22
546 0.31
547 0.39
548 0.38
549 0.39
550 0.45
551 0.46
552 0.44
553 0.43
554 0.35
555 0.27
556 0.23
557 0.21
558 0.15
559 0.16
560 0.17
561 0.16
562 0.16
563 0.18
564 0.18
565 0.17
566 0.18
567 0.15
568 0.17
569 0.17
570 0.16
571 0.15
572 0.15
573 0.13
574 0.11
575 0.1
576 0.09
577 0.08
578 0.08
579 0.08
580 0.08
581 0.11
582 0.12
583 0.13
584 0.13
585 0.13
586 0.13
587 0.12
588 0.13
589 0.1
590 0.1
591 0.1
592 0.1
593 0.11
594 0.11
595 0.11
596 0.1
597 0.11
598 0.11
599 0.12
600 0.12
601 0.11
602 0.11
603 0.11
604 0.1
605 0.09
606 0.08
607 0.06
608 0.04
609 0.04
610 0.04
611 0.04
612 0.05
613 0.05
614 0.06
615 0.06
616 0.06
617 0.06
618 0.06
619 0.05
620 0.04
621 0.05
622 0.05
623 0.07
624 0.07
625 0.08
626 0.08
627 0.1
628 0.11
629 0.13
630 0.19
631 0.25
632 0.27
633 0.31
634 0.35
635 0.42
636 0.47
637 0.49
638 0.46
639 0.44
640 0.5
641 0.49
642 0.47
643 0.39
644 0.33
645 0.29
646 0.26
647 0.21
648 0.13
649 0.1
650 0.07
651 0.06
652 0.06
653 0.06
654 0.05
655 0.05
656 0.04
657 0.06
658 0.06
659 0.06
660 0.06
661 0.07
662 0.1
663 0.1
664 0.13
665 0.13
666 0.17
667 0.19
668 0.2
669 0.21
670 0.22
671 0.24
672 0.23
673 0.23
674 0.2
675 0.2
676 0.19
677 0.17
678 0.13
679 0.11
680 0.09
681 0.09
682 0.08
683 0.07
684 0.06
685 0.07
686 0.07
687 0.06
688 0.07
689 0.07
690 0.09
691 0.12
692 0.15
693 0.18
694 0.2
695 0.27
696 0.34
697 0.39
698 0.41
699 0.43
700 0.46
701 0.5
702 0.5
703 0.48
704 0.42
705 0.4
706 0.4
707 0.39
708 0.37
709 0.33
710 0.35
711 0.34
712 0.35
713 0.37
714 0.36
715 0.41
716 0.47
717 0.56
718 0.59
719 0.66
720 0.69
721 0.75
722 0.79
723 0.77
724 0.69
725 0.63
726 0.58
727 0.49
728 0.43
729 0.32
730 0.25
731 0.19
732 0.18
733 0.14
734 0.13
735 0.12
736 0.13
737 0.16
738 0.17
739 0.24
740 0.33
741 0.41
742 0.46
743 0.55
744 0.6
745 0.68
746 0.71
747 0.75
748 0.75
749 0.76
750 0.8
751 0.78
752 0.8
753 0.77
754 0.8
755 0.78
756 0.77
757 0.71
758 0.65
759 0.61
760 0.59
761 0.54
762 0.48
763 0.41
764 0.35
765 0.3
766 0.28
767 0.31
768 0.23
769 0.21
770 0.19
771 0.18
772 0.14
773 0.14
774 0.13
775 0.06
776 0.06
777 0.05
778 0.04
779 0.04
780 0.04
781 0.04
782 0.04
783 0.06
784 0.07
785 0.1
786 0.16
787 0.19
788 0.21
789 0.26
790 0.3
791 0.33
792 0.41
793 0.45
794 0.46
795 0.45
796 0.46
797 0.42
798 0.4
799 0.35
800 0.27
801 0.22
802 0.16
803 0.16
804 0.15
805 0.15
806 0.19
807 0.24
808 0.29
809 0.34
810 0.41
811 0.49
812 0.56
813 0.63
814 0.68
815 0.73
816 0.79
817 0.83
818 0.84
819 0.8
820 0.82
821 0.83
822 0.83
823 0.8
824 0.76
825 0.71
826 0.7
827 0.65
828 0.61
829 0.56
830 0.48
831 0.41
832 0.36
833 0.3
834 0.22
835 0.22
836 0.17
837 0.14
838 0.12
839 0.14
840 0.14
841 0.2
842 0.21
843 0.24
844 0.25
845 0.25
846 0.25
847 0.24
848 0.24
849 0.26
850 0.25
851 0.22
852 0.21
853 0.24
854 0.28
855 0.29
856 0.29
857 0.24
858 0.24
859 0.27
860 0.3
861 0.27
862 0.28
863 0.3
864 0.33
865 0.36
866 0.38
867 0.39
868 0.45
869 0.46
870 0.51
871 0.52
872 0.53
873 0.51
874 0.51
875 0.54
876 0.5
877 0.5
878 0.42
879 0.38
880 0.33
881 0.3
882 0.28
883 0.21
884 0.16
885 0.13
886 0.13
887 0.1
888 0.11
889 0.09
890 0.1
891 0.13
892 0.13
893 0.13
894 0.13
895 0.17
896 0.23
897 0.28
898 0.32
899 0.35
900 0.41
901 0.51
902 0.6
903 0.66
904 0.69
905 0.72
906 0.76
907 0.82
908 0.84
909 0.84
910 0.84
911 0.83
912 0.76
913 0.73
914 0.69
915 0.61
916 0.53
917 0.46
918 0.38
919 0.29
920 0.25
921 0.22
922 0.19
923 0.16
924 0.14
925 0.12
926 0.11
927 0.12
928 0.12
929 0.12
930 0.1
931 0.1
932 0.1
933 0.1
934 0.1
935 0.09
936 0.08
937 0.07
938 0.07
939 0.07
940 0.07
941 0.06
942 0.06
943 0.06
944 0.08
945 0.09
946 0.08
947 0.08
948 0.09
949 0.09
950 0.09
951 0.1
952 0.09
953 0.11
954 0.12
955 0.12
956 0.11
957 0.11
958 0.12
959 0.18
960 0.22
961 0.2
962 0.23
963 0.26
964 0.29
965 0.33
966 0.39