Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3S5J6

Protein Details
Accession E3S5J6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-27VAVARPPQPPRLRRESQRPGVARHydrophilic
326-345HPNNKNPAPPRKTRKRTTAEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12.833, cyto_mito 2.333, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
KEGG pte:PTT_17900  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MSGPVAVARPPQPPRLRRESQRPGVARTTTKQPTMEDDSGVKQEEPRKYVYTQQDILAKHKGKPPSLRVYLHPKHFRLNDSQETLPYAGPMRELLEAIKDKVVPHNMVEDLYEFNTPWYDNCLIVEVHDFRSNVVKPKDESNTTGDGASSAFSIHNYNSFITPSPFAPHPVNKPESKPAQASASAQSKEAEVKEDKENMPAPGQNGAANKQTGPGKVRTVVLFPTPQSQLADMQLLASTPVTDLAALKRMQAQGRAAGMPPTPMTAIPSTPTFSNGPSPKRQKMLLDDSNVHEFEAELLNATCPPLYLEPTKSFGHSLALMDAITHPNNKNPAPPRKTRKRTTAELAADEAEAQGLQRFMLAGDEYQAVMMAAATGNDDNAVRAAANSQTFARFKTIANIRANHEETERRKKEEDARVAQAKRQAQMEAELQRKRELETRQQAELAERQQALRQQAQHQAQLQQQNQLQQNQIQQNEALRAAAAAQHQLSTATASQVASTPQSATQSQFSPTVRQQTPMAASAASPRVGGPASHPMGSTPMVPTASSQAINSPARPPSAVSHHQNQMARSVSQQQNPSRTGTPHMVQGTPVMNASMPNRNMTPTPSRMNQGSPPIAMQGQTPMMMQQASQPGQNMTPEMMQNFNQQRLHQVRMQQLQQQSASPGNQQQQQMQQLAFQKAGQHIQTQGVPQNQNPQQYRQQLAAHYFRQLQQQQQNQQQMAMSPQGGMQQNVPQQGMTFANMSLQQMRARYQQQKAAIMQTYGGQNIPQHIMQQMQQMEMQIKQREQREQQQAQMAQMQNAGMGNQMNTGQMNGMQNVNSNNPMHMQQYQQLLQQQRQQAANQGRLMQMRQQAALAGNQMPQGMMGNMNAMNNMQGGMQGMNVNNMGNMQGMNMAQMGQMNGGMGGMQGAQMNAGIQGMNMNQMSQQQMQQMMMMRQAQQNAQRMGQQGGQQGGDMGWSGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.67
3 0.72
4 0.73
5 0.8
6 0.81
7 0.81
8 0.84
9 0.8
10 0.76
11 0.74
12 0.71
13 0.65
14 0.59
15 0.59
16 0.55
17 0.55
18 0.52
19 0.46
20 0.48
21 0.51
22 0.48
23 0.41
24 0.38
25 0.37
26 0.38
27 0.38
28 0.31
29 0.28
30 0.34
31 0.38
32 0.38
33 0.4
34 0.41
35 0.41
36 0.49
37 0.53
38 0.53
39 0.49
40 0.5
41 0.51
42 0.49
43 0.51
44 0.51
45 0.45
46 0.43
47 0.46
48 0.49
49 0.51
50 0.58
51 0.62
52 0.63
53 0.68
54 0.65
55 0.66
56 0.7
57 0.7
58 0.71
59 0.71
60 0.64
61 0.65
62 0.66
63 0.64
64 0.63
65 0.63
66 0.61
67 0.57
68 0.56
69 0.49
70 0.48
71 0.44
72 0.35
73 0.28
74 0.22
75 0.17
76 0.16
77 0.16
78 0.14
79 0.14
80 0.14
81 0.13
82 0.18
83 0.2
84 0.21
85 0.23
86 0.22
87 0.23
88 0.29
89 0.34
90 0.29
91 0.27
92 0.3
93 0.28
94 0.27
95 0.27
96 0.21
97 0.18
98 0.17
99 0.17
100 0.12
101 0.12
102 0.13
103 0.13
104 0.12
105 0.16
106 0.16
107 0.15
108 0.16
109 0.18
110 0.16
111 0.17
112 0.22
113 0.19
114 0.2
115 0.24
116 0.23
117 0.22
118 0.3
119 0.32
120 0.35
121 0.36
122 0.38
123 0.35
124 0.43
125 0.49
126 0.45
127 0.45
128 0.41
129 0.42
130 0.38
131 0.36
132 0.29
133 0.22
134 0.19
135 0.16
136 0.11
137 0.07
138 0.06
139 0.07
140 0.09
141 0.09
142 0.12
143 0.14
144 0.15
145 0.15
146 0.17
147 0.17
148 0.18
149 0.19
150 0.17
151 0.2
152 0.2
153 0.22
154 0.27
155 0.31
156 0.35
157 0.42
158 0.46
159 0.46
160 0.49
161 0.54
162 0.54
163 0.53
164 0.48
165 0.43
166 0.42
167 0.4
168 0.38
169 0.36
170 0.38
171 0.33
172 0.32
173 0.29
174 0.26
175 0.28
176 0.26
177 0.24
178 0.2
179 0.22
180 0.27
181 0.32
182 0.32
183 0.33
184 0.35
185 0.31
186 0.32
187 0.3
188 0.26
189 0.23
190 0.23
191 0.22
192 0.22
193 0.22
194 0.23
195 0.22
196 0.21
197 0.22
198 0.25
199 0.25
200 0.27
201 0.28
202 0.28
203 0.3
204 0.32
205 0.29
206 0.28
207 0.26
208 0.25
209 0.24
210 0.22
211 0.24
212 0.23
213 0.23
214 0.22
215 0.21
216 0.19
217 0.18
218 0.19
219 0.14
220 0.13
221 0.11
222 0.1
223 0.09
224 0.07
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.08
232 0.13
233 0.13
234 0.13
235 0.17
236 0.21
237 0.23
238 0.25
239 0.25
240 0.24
241 0.26
242 0.26
243 0.22
244 0.21
245 0.19
246 0.17
247 0.16
248 0.13
249 0.11
250 0.1
251 0.13
252 0.12
253 0.12
254 0.13
255 0.14
256 0.14
257 0.14
258 0.17
259 0.15
260 0.15
261 0.23
262 0.27
263 0.31
264 0.39
265 0.47
266 0.49
267 0.51
268 0.52
269 0.48
270 0.5
271 0.55
272 0.51
273 0.48
274 0.46
275 0.45
276 0.47
277 0.42
278 0.34
279 0.24
280 0.18
281 0.15
282 0.13
283 0.1
284 0.07
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.07
290 0.05
291 0.07
292 0.07
293 0.11
294 0.14
295 0.18
296 0.2
297 0.24
298 0.25
299 0.24
300 0.23
301 0.21
302 0.19
303 0.16
304 0.14
305 0.11
306 0.11
307 0.09
308 0.09
309 0.09
310 0.1
311 0.1
312 0.12
313 0.12
314 0.15
315 0.2
316 0.2
317 0.26
318 0.33
319 0.42
320 0.46
321 0.55
322 0.62
323 0.7
324 0.78
325 0.79
326 0.8
327 0.77
328 0.77
329 0.74
330 0.73
331 0.65
332 0.57
333 0.5
334 0.4
335 0.33
336 0.27
337 0.19
338 0.1
339 0.07
340 0.05
341 0.05
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.05
348 0.05
349 0.04
350 0.06
351 0.07
352 0.07
353 0.06
354 0.06
355 0.05
356 0.05
357 0.04
358 0.03
359 0.03
360 0.03
361 0.03
362 0.03
363 0.03
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.05
372 0.07
373 0.07
374 0.08
375 0.09
376 0.12
377 0.13
378 0.14
379 0.16
380 0.15
381 0.14
382 0.22
383 0.26
384 0.31
385 0.34
386 0.36
387 0.36
388 0.41
389 0.42
390 0.35
391 0.32
392 0.32
393 0.34
394 0.43
395 0.42
396 0.39
397 0.39
398 0.43
399 0.5
400 0.52
401 0.54
402 0.48
403 0.52
404 0.55
405 0.54
406 0.52
407 0.48
408 0.41
409 0.35
410 0.31
411 0.25
412 0.19
413 0.21
414 0.24
415 0.24
416 0.28
417 0.28
418 0.27
419 0.29
420 0.29
421 0.28
422 0.3
423 0.28
424 0.32
425 0.39
426 0.42
427 0.4
428 0.4
429 0.39
430 0.35
431 0.34
432 0.25
433 0.2
434 0.17
435 0.16
436 0.17
437 0.2
438 0.21
439 0.21
440 0.22
441 0.22
442 0.29
443 0.31
444 0.32
445 0.31
446 0.32
447 0.32
448 0.37
449 0.34
450 0.31
451 0.31
452 0.34
453 0.34
454 0.33
455 0.3
456 0.25
457 0.31
458 0.3
459 0.29
460 0.24
461 0.22
462 0.2
463 0.21
464 0.18
465 0.11
466 0.07
467 0.06
468 0.06
469 0.08
470 0.07
471 0.07
472 0.07
473 0.07
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.06
478 0.06
479 0.06
480 0.06
481 0.06
482 0.06
483 0.07
484 0.07
485 0.07
486 0.07
487 0.07
488 0.07
489 0.09
490 0.1
491 0.1
492 0.12
493 0.13
494 0.14
495 0.17
496 0.17
497 0.19
498 0.2
499 0.27
500 0.26
501 0.26
502 0.25
503 0.24
504 0.25
505 0.23
506 0.21
507 0.13
508 0.12
509 0.13
510 0.14
511 0.12
512 0.1
513 0.09
514 0.09
515 0.09
516 0.09
517 0.09
518 0.15
519 0.16
520 0.16
521 0.16
522 0.15
523 0.17
524 0.18
525 0.16
526 0.09
527 0.09
528 0.09
529 0.09
530 0.1
531 0.11
532 0.11
533 0.11
534 0.1
535 0.1
536 0.15
537 0.16
538 0.17
539 0.17
540 0.17
541 0.17
542 0.17
543 0.17
544 0.15
545 0.21
546 0.27
547 0.28
548 0.32
549 0.35
550 0.39
551 0.4
552 0.37
553 0.34
554 0.3
555 0.27
556 0.23
557 0.28
558 0.28
559 0.31
560 0.37
561 0.36
562 0.39
563 0.41
564 0.42
565 0.36
566 0.32
567 0.32
568 0.29
569 0.26
570 0.26
571 0.26
572 0.23
573 0.21
574 0.22
575 0.2
576 0.16
577 0.15
578 0.1
579 0.08
580 0.1
581 0.12
582 0.16
583 0.15
584 0.17
585 0.17
586 0.18
587 0.19
588 0.22
589 0.25
590 0.23
591 0.27
592 0.27
593 0.3
594 0.3
595 0.32
596 0.31
597 0.32
598 0.28
599 0.24
600 0.23
601 0.21
602 0.2
603 0.18
604 0.14
605 0.1
606 0.09
607 0.09
608 0.09
609 0.08
610 0.08
611 0.08
612 0.08
613 0.1
614 0.15
615 0.15
616 0.16
617 0.16
618 0.16
619 0.17
620 0.18
621 0.15
622 0.1
623 0.11
624 0.12
625 0.12
626 0.13
627 0.13
628 0.21
629 0.23
630 0.27
631 0.27
632 0.26
633 0.34
634 0.36
635 0.39
636 0.34
637 0.37
638 0.39
639 0.43
640 0.45
641 0.42
642 0.41
643 0.4
644 0.38
645 0.33
646 0.28
647 0.25
648 0.24
649 0.2
650 0.23
651 0.24
652 0.28
653 0.28
654 0.3
655 0.33
656 0.36
657 0.36
658 0.31
659 0.31
660 0.31
661 0.32
662 0.29
663 0.24
664 0.22
665 0.22
666 0.26
667 0.23
668 0.19
669 0.19
670 0.2
671 0.21
672 0.21
673 0.23
674 0.26
675 0.26
676 0.26
677 0.34
678 0.35
679 0.41
680 0.41
681 0.42
682 0.44
683 0.49
684 0.5
685 0.44
686 0.44
687 0.39
688 0.43
689 0.43
690 0.36
691 0.34
692 0.34
693 0.32
694 0.38
695 0.38
696 0.4
697 0.42
698 0.49
699 0.53
700 0.59
701 0.63
702 0.55
703 0.53
704 0.45
705 0.37
706 0.32
707 0.26
708 0.18
709 0.12
710 0.13
711 0.17
712 0.18
713 0.18
714 0.17
715 0.2
716 0.23
717 0.25
718 0.24
719 0.19
720 0.18
721 0.2
722 0.19
723 0.15
724 0.13
725 0.1
726 0.12
727 0.13
728 0.14
729 0.13
730 0.14
731 0.15
732 0.16
733 0.19
734 0.24
735 0.31
736 0.37
737 0.4
738 0.44
739 0.46
740 0.5
741 0.49
742 0.49
743 0.42
744 0.35
745 0.31
746 0.27
747 0.24
748 0.2
749 0.18
750 0.13
751 0.12
752 0.15
753 0.17
754 0.14
755 0.14
756 0.14
757 0.16
758 0.17
759 0.23
760 0.21
761 0.19
762 0.2
763 0.2
764 0.21
765 0.22
766 0.27
767 0.25
768 0.27
769 0.31
770 0.36
771 0.43
772 0.47
773 0.54
774 0.58
775 0.58
776 0.6
777 0.63
778 0.59
779 0.53
780 0.54
781 0.45
782 0.35
783 0.32
784 0.27
785 0.19
786 0.18
787 0.16
788 0.1
789 0.09
790 0.09
791 0.09
792 0.09
793 0.09
794 0.09
795 0.1
796 0.09
797 0.11
798 0.13
799 0.13
800 0.14
801 0.14
802 0.16
803 0.18
804 0.2
805 0.21
806 0.19
807 0.19
808 0.2
809 0.21
810 0.22
811 0.22
812 0.22
813 0.23
814 0.29
815 0.3
816 0.31
817 0.36
818 0.38
819 0.4
820 0.44
821 0.45
822 0.43
823 0.44
824 0.42
825 0.45
826 0.47
827 0.49
828 0.45
829 0.42
830 0.4
831 0.4
832 0.41
833 0.38
834 0.37
835 0.33
836 0.3
837 0.28
838 0.26
839 0.25
840 0.25
841 0.22
842 0.17
843 0.17
844 0.17
845 0.17
846 0.15
847 0.13
848 0.13
849 0.11
850 0.1
851 0.08
852 0.1
853 0.11
854 0.12
855 0.12
856 0.11
857 0.1
858 0.09
859 0.1
860 0.07
861 0.06
862 0.07
863 0.07
864 0.08
865 0.11
866 0.11
867 0.12
868 0.13
869 0.12
870 0.11
871 0.11
872 0.11
873 0.09
874 0.08
875 0.07
876 0.08
877 0.08
878 0.09
879 0.09
880 0.08
881 0.08
882 0.09
883 0.1
884 0.08
885 0.08
886 0.07
887 0.07
888 0.06
889 0.06
890 0.05
891 0.05
892 0.04
893 0.05
894 0.05
895 0.05
896 0.06
897 0.06
898 0.06
899 0.06
900 0.06
901 0.05
902 0.05
903 0.07
904 0.07
905 0.12
906 0.11
907 0.11
908 0.12
909 0.15
910 0.2
911 0.2
912 0.23
913 0.23
914 0.25
915 0.25
916 0.27
917 0.29
918 0.26
919 0.29
920 0.28
921 0.28
922 0.3
923 0.33
924 0.35
925 0.38
926 0.44
927 0.43
928 0.42
929 0.43
930 0.41
931 0.42
932 0.4
933 0.38
934 0.34
935 0.34
936 0.32
937 0.28
938 0.26
939 0.22
940 0.19