FuNGI

K0KBB1

Protein Details

Accession

K0KBB1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
420-439	KPTTKDTKGIYSKRREIKPD	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017389 Nucleoporin_NUP53 IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR007846 RRM_NUP35_dom
Gene Ontology	GO:0031965 C:nuclear membrane GO:0005643 C:nuclear pore GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport
Pfam	View protein in Pfam PF05172 Nup35_RRM
PROSITE	View protein in PROSITE PS51472 RRM_NUP35
CDD	cd12721 RRM_Nup53p_fungi

Amino Acid Sequences

MSSAFGNRGSDQSYSKDLFGSSYQNNFDIFKNQDNQQSRFSSLKARTLDSADRSSDDINNSANTSTSQAYSPNRRIPSRNQSFDLSFDSPNPSLAVINQKTNAAQQQTQPLWFNNPRRRAIPSHAVKRETISDIDNESTSFLNKNKQSSNSNPGFKTLTFGTRRNTAQLAHVQAFSDELPPSRTISDLKRDDLSEGHLSFANDTTNGNASLISNNHNAFKDSNKSISLSNSGTPLKYSQNFLPSHLSDSAFSTPSKSLDSPQAISSSPLRTDSESAVLVFGYPESIANSVIKHFAKFGKILEDFEVTRVDPLFTQQKTKTYPIYTGDGWVKLTYDNKASAMRALEESGTVFHGSMIGCVPYSKQAIENIASISINNNDNIGESDLVQQKQNTMQVDGLPNYSNNLQQRIQAKNDDQIFVKPTTKDTKGIYSKRREIKPDGNDNLNILSKVSNWFFGWEDL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.29
3	0.28
4	0.25
5	0.25
6	0.25
7	0.28
8	0.25
9	0.29
10	0.31
11	0.31
12	0.32
13	0.31
14	0.3
15	0.3
16	0.3
17	0.31
18	0.34
19	0.37
20	0.45
21	0.5
22	0.51
23	0.51
24	0.51
25	0.48
26	0.45
27	0.43
28	0.43
29	0.41
30	0.45
31	0.41
32	0.41
33	0.39
34	0.42
35	0.47
36	0.43
37	0.42
38	0.36
39	0.35
40	0.34
41	0.33
42	0.31
43	0.27
44	0.24
45	0.22
46	0.21
47	0.21
48	0.19
49	0.18
50	0.15
51	0.16
52	0.15
53	0.14
54	0.14
55	0.18
56	0.25
57	0.34
58	0.4
59	0.45
60	0.5
61	0.53
62	0.58
63	0.62
64	0.66
65	0.68
66	0.66
67	0.62
68	0.6
69	0.57
70	0.54
71	0.51
72	0.43
73	0.33
74	0.29
75	0.31
76	0.26
77	0.26
78	0.24
79	0.17
80	0.15
81	0.16
82	0.24
83	0.21
84	0.24
85	0.25
86	0.25
87	0.25
88	0.28
89	0.31
90	0.25
91	0.25
92	0.26
93	0.33
94	0.34
95	0.36
96	0.36
97	0.32
98	0.36
99	0.41
100	0.48
101	0.48
102	0.54
103	0.54
104	0.55
105	0.59
106	0.56
107	0.56
108	0.56
109	0.57
110	0.59
111	0.62
112	0.61
113	0.56
114	0.53
115	0.5
116	0.42
117	0.34
118	0.25
119	0.21
120	0.21
121	0.21
122	0.19
123	0.15
124	0.14
125	0.13
126	0.12
127	0.13
128	0.12
129	0.19
130	0.21
131	0.26
132	0.3
133	0.34
134	0.4
135	0.43
136	0.51
137	0.51
138	0.54
139	0.49
140	0.47
141	0.44
142	0.38
143	0.35
144	0.27
145	0.27
146	0.26
147	0.29
148	0.29
149	0.33
150	0.34
151	0.33
152	0.33
153	0.26
154	0.26
155	0.28
156	0.29
157	0.25
158	0.24
159	0.22
160	0.2
161	0.2
162	0.16
163	0.13
164	0.09
165	0.08
166	0.1
167	0.11
168	0.12
169	0.11
170	0.12
171	0.13
172	0.16
173	0.25
174	0.25
175	0.27
176	0.27
177	0.27
178	0.27
179	0.25
180	0.26
181	0.21
182	0.18
183	0.17
184	0.17
185	0.16
186	0.16
187	0.16
188	0.12
189	0.08
190	0.08
191	0.08
192	0.08
193	0.08
194	0.07
195	0.07
196	0.07
197	0.08
198	0.09
199	0.11
200	0.12
201	0.13
202	0.15
203	0.15
204	0.16
205	0.15
206	0.17
207	0.19
208	0.19
209	0.2
210	0.18
211	0.19
212	0.19
213	0.19
214	0.2
215	0.16
216	0.15
217	0.16
218	0.16
219	0.15
220	0.15
221	0.15
222	0.16
223	0.16
224	0.18
225	0.17
226	0.23
227	0.24
228	0.25
229	0.28
230	0.24
231	0.26
232	0.25
233	0.24
234	0.17
235	0.19
236	0.19
237	0.15
238	0.15
239	0.14
240	0.13
241	0.13
242	0.15
243	0.13
244	0.13
245	0.18
246	0.21
247	0.2
248	0.2
249	0.21
250	0.19
251	0.2
252	0.2
253	0.16
254	0.14
255	0.15
256	0.15
257	0.15
258	0.16
259	0.16
260	0.15
261	0.14
262	0.13
263	0.11
264	0.1
265	0.09
266	0.07
267	0.06
268	0.04
269	0.04
270	0.04
271	0.05
272	0.05
273	0.06
274	0.07
275	0.07
276	0.08
277	0.13
278	0.13
279	0.13
280	0.14
281	0.16
282	0.18
283	0.18
284	0.19
285	0.21
286	0.22
287	0.23
288	0.22
289	0.23
290	0.21
291	0.2
292	0.21
293	0.13
294	0.13
295	0.12
296	0.11
297	0.09
298	0.12
299	0.18
300	0.18
301	0.24
302	0.25
303	0.3
304	0.34
305	0.38
306	0.39
307	0.34
308	0.37
309	0.35
310	0.37
311	0.32
312	0.32
313	0.31
314	0.26
315	0.25
316	0.21
317	0.18
318	0.16
319	0.18
320	0.16
321	0.16
322	0.16
323	0.17
324	0.19
325	0.19
326	0.2
327	0.19
328	0.18
329	0.16
330	0.16
331	0.14
332	0.12
333	0.12
334	0.1
335	0.1
336	0.09
337	0.08
338	0.07
339	0.09
340	0.08
341	0.09
342	0.09
343	0.08
344	0.08
345	0.08
346	0.09
347	0.11
348	0.13
349	0.13
350	0.14
351	0.16
352	0.2
353	0.21
354	0.22
355	0.19
356	0.19
357	0.18
358	0.16
359	0.15
360	0.15
361	0.14
362	0.13
363	0.13
364	0.11
365	0.12
366	0.14
367	0.14
368	0.11
369	0.11
370	0.17
371	0.23
372	0.24
373	0.25
374	0.24
375	0.24
376	0.28
377	0.31
378	0.27
379	0.23
380	0.23
381	0.25
382	0.3
383	0.29
384	0.27
385	0.23
386	0.22
387	0.23
388	0.23
389	0.24
390	0.23
391	0.27
392	0.26
393	0.3
394	0.37
395	0.4
396	0.43
397	0.45
398	0.44
399	0.46
400	0.49
401	0.46
402	0.41
403	0.39
404	0.38
405	0.34
406	0.36
407	0.3
408	0.32
409	0.37
410	0.39
411	0.4
412	0.39
413	0.46
414	0.52
415	0.6
416	0.64
417	0.66
418	0.73
419	0.78
420	0.81
421	0.78
422	0.77
423	0.78
424	0.78
425	0.78
426	0.75
427	0.71
428	0.65
429	0.6
430	0.55
431	0.47
432	0.37
433	0.27
434	0.22
435	0.18
436	0.23
437	0.23
438	0.22
439	0.2
440	0.23

K0KBB1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer