FuNGI

K0KWA0

Protein Details

Accession

K0KWA0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
103-122	GVAPRAKMNQQRARRFRSAR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 15, mito 5, cyto 5, cyto_mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPAFYRWLSRKYPKIISPTLEEDATVVDGVTVPPSYSNPNPNGELDNLYLDMNGIVHPCSHPENRPPPETEDEMLLAVFEYTDRVLNMARPRKVLMIAVDGVAPRAKMNQQRARRFRSARDAKIQDEERQRLQDLREGYGEVIDEAVKVKKTWDSNAITPGTPFMDKLALALRYWTAYKLSSDPGWKDLQVIISDATVPGEGEHKIMNFVRSQRSDIEYNPNTKHAIYGLDADLIFLGLATHEPHFRVLREDVFARDNKMMSVQEKMNLSEEHRKLIEEKESKKPFLWLNINVLREYLEIELNIPRLPFKFDLERAIDDWVFMCFFCGNDFLPHLPSLDVRDNSIDLLVSIWKQVLPKMKSYITCDGILNLENVEVLLSNLAPREADIFRQRQAQDQRRNDNDKRRKVWQEEDKIAKNQYLANVTKGKADKGTYTPVNNLPLFDVNNQSVGKVHMSNKELAQAQINAGKTPDATTDDSSAKEESETPQPEVKEEDVENANQANISAAAALRQKLLANKTKKSEDATIGEKRQIPDSPTDSAVSSDSEAADVDGDPVRLFEPGYHDRYYRIKFHISDEEVEATSKEVVKHYIEGISWVLLYYYQGCPSWNWYYPYHYAPFAQDFTNIKDLDIKFTQGKPFLPYEQLMSVLPAASGHNLPEIFRPLMSDADSPIIDFYPEDFPIDMNGKKMSWQGIVLLPFIDEKRLLEVVRDQYPKLTDAEKGRNVRKEDVVFLSKENKRFKEFKKLYSDSKKVEAIDFHFNKTGLCGKVLSNEKFQFDSILPCPIEGDDHQYNDLDTNAFLYADYIMPPKSHGKSIILTGYIKHKPVLSQEDKDGIVYGRGGGRRNYHDASQNIIETGPGSNSSYAPRFGGYKFFLWLAAQQQQQFQQQQNLKQFMNSNQNQRIGMNPTVQPSSSGNLSVRPGSQNLPQPSRNGVLRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.65
2	0.66
3	0.71
4	0.71
5	0.66
6	0.64
7	0.61
8	0.56
9	0.47
10	0.4
11	0.32
12	0.26
13	0.23
14	0.16
15	0.1
16	0.07
17	0.07
18	0.08
19	0.09
20	0.08
21	0.07
22	0.09
23	0.11
24	0.17
25	0.22
26	0.3
27	0.32
28	0.37
29	0.39
30	0.4
31	0.42
32	0.38
33	0.35
34	0.29
35	0.27
36	0.23
37	0.2
38	0.18
39	0.15
40	0.13
41	0.1
42	0.09
43	0.08
44	0.08
45	0.09
46	0.1
47	0.13
48	0.18
49	0.23
50	0.28
51	0.37
52	0.47
53	0.53
54	0.57
55	0.58
56	0.58
57	0.59
58	0.58
59	0.49
60	0.41
61	0.35
62	0.31
63	0.26
64	0.2
65	0.14
66	0.09
67	0.08
68	0.05
69	0.05
70	0.06
71	0.07
72	0.07
73	0.09
74	0.1
75	0.16
76	0.25
77	0.33
78	0.36
79	0.37
80	0.39
81	0.4
82	0.41
83	0.39
84	0.32
85	0.28
86	0.26
87	0.24
88	0.24
89	0.21
90	0.2
91	0.18
92	0.15
93	0.1
94	0.13
95	0.19
96	0.25
97	0.36
98	0.45
99	0.54
100	0.65
101	0.73
102	0.78
103	0.82
104	0.8
105	0.77
106	0.79
107	0.79
108	0.76
109	0.77
110	0.73
111	0.66
112	0.69
113	0.65
114	0.62
115	0.61
116	0.58
117	0.53
118	0.52
119	0.51
120	0.46
121	0.44
122	0.41
123	0.34
124	0.32
125	0.28
126	0.26
127	0.24
128	0.21
129	0.19
130	0.14
131	0.12
132	0.09
133	0.08
134	0.09
135	0.11
136	0.11
137	0.11
138	0.13
139	0.18
140	0.21
141	0.26
142	0.32
143	0.35
144	0.37
145	0.44
146	0.44
147	0.39
148	0.36
149	0.33
150	0.27
151	0.22
152	0.18
153	0.13
154	0.13
155	0.12
156	0.13
157	0.16
158	0.15
159	0.15
160	0.16
161	0.15
162	0.15
163	0.16
164	0.16
165	0.13
166	0.13
167	0.16
168	0.17
169	0.2
170	0.21
171	0.26
172	0.27
173	0.28
174	0.29
175	0.27
176	0.26
177	0.24
178	0.24
179	0.19
180	0.18
181	0.15
182	0.13
183	0.13
184	0.12
185	0.1
186	0.07
187	0.07
188	0.06
189	0.07
190	0.07
191	0.08
192	0.09
193	0.09
194	0.13
195	0.14
196	0.16
197	0.17
198	0.22
199	0.29
200	0.3
201	0.32
202	0.32
203	0.35
204	0.35
205	0.35
206	0.4
207	0.37
208	0.41
209	0.4
210	0.39
211	0.36
212	0.33
213	0.31
214	0.22
215	0.19
216	0.15
217	0.16
218	0.15
219	0.15
220	0.15
221	0.14
222	0.13
223	0.1
224	0.09
225	0.05
226	0.05
227	0.03
228	0.04
229	0.05
230	0.07
231	0.08
232	0.09
233	0.12
234	0.14
235	0.14
236	0.18
237	0.2
238	0.21
239	0.23
240	0.23
241	0.23
242	0.25
243	0.26
244	0.25
245	0.24
246	0.22
247	0.19
248	0.21
249	0.2
250	0.17
251	0.21
252	0.19
253	0.2
254	0.21
255	0.22
256	0.23
257	0.22
258	0.25
259	0.3
260	0.3
261	0.3
262	0.29
263	0.28
264	0.27
265	0.3
266	0.35
267	0.33
268	0.37
269	0.44
270	0.48
271	0.49
272	0.48
273	0.48
274	0.41
275	0.42
276	0.44
277	0.36
278	0.4
279	0.44
280	0.44
281	0.39
282	0.37
283	0.29
284	0.22
285	0.21
286	0.14
287	0.09
288	0.08
289	0.09
290	0.11
291	0.11
292	0.11
293	0.1
294	0.1
295	0.1
296	0.14
297	0.14
298	0.16
299	0.21
300	0.22
301	0.27
302	0.29
303	0.3
304	0.27
305	0.28
306	0.25
307	0.19
308	0.18
309	0.13
310	0.1
311	0.08
312	0.09
313	0.06
314	0.06
315	0.07
316	0.08
317	0.08
318	0.09
319	0.11
320	0.1
321	0.12
322	0.12
323	0.12
324	0.11
325	0.11
326	0.14
327	0.19
328	0.18
329	0.17
330	0.18
331	0.18
332	0.17
333	0.17
334	0.12
335	0.06
336	0.07
337	0.07
338	0.06
339	0.06
340	0.06
341	0.07
342	0.07
343	0.11
344	0.19
345	0.2
346	0.23
347	0.27
348	0.3
349	0.32
350	0.37
351	0.4
352	0.33
353	0.33
354	0.29
355	0.26
356	0.24
357	0.22
358	0.16
359	0.11
360	0.08
361	0.06
362	0.06
363	0.05
364	0.04
365	0.03
366	0.03
367	0.03
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.04
373	0.08
374	0.08
375	0.12
376	0.17
377	0.19
378	0.2
379	0.27
380	0.27
381	0.31
382	0.41
383	0.47
384	0.52
385	0.58
386	0.64
387	0.65
388	0.73
389	0.72
390	0.73
391	0.73
392	0.72
393	0.69
394	0.69
395	0.69
396	0.66
397	0.69
398	0.68
399	0.66
400	0.63
401	0.65
402	0.6
403	0.56
404	0.51
405	0.42
406	0.34
407	0.27
408	0.23
409	0.22
410	0.19
411	0.2
412	0.23
413	0.23
414	0.26
415	0.26
416	0.24
417	0.21
418	0.21
419	0.19
420	0.19
421	0.24
422	0.21
423	0.22
424	0.24
425	0.24
426	0.27
427	0.25
428	0.22
429	0.18
430	0.17
431	0.17
432	0.15
433	0.15
434	0.11
435	0.14
436	0.14
437	0.13
438	0.12
439	0.12
440	0.12
441	0.12
442	0.15
443	0.17
444	0.19
445	0.21
446	0.2
447	0.23
448	0.22
449	0.2
450	0.18
451	0.14
452	0.13
453	0.15
454	0.15
455	0.11
456	0.11
457	0.1
458	0.09
459	0.09
460	0.09
461	0.09
462	0.11
463	0.11
464	0.14
465	0.15
466	0.15
467	0.16
468	0.15
469	0.12
470	0.11
471	0.11
472	0.1
473	0.16
474	0.17
475	0.18
476	0.21
477	0.21
478	0.21
479	0.22
480	0.2
481	0.16
482	0.14
483	0.15
484	0.13
485	0.13
486	0.13
487	0.12
488	0.11
489	0.08
490	0.08
491	0.05
492	0.04
493	0.04
494	0.04
495	0.03
496	0.06
497	0.07
498	0.08
499	0.07
500	0.08
501	0.09
502	0.12
503	0.17
504	0.24
505	0.28
506	0.31
507	0.36
508	0.37
509	0.38
510	0.38
511	0.37
512	0.33
513	0.31
514	0.32
515	0.33
516	0.32
517	0.34
518	0.33
519	0.3
520	0.28
521	0.27
522	0.23
523	0.22
524	0.24
525	0.23
526	0.21
527	0.21
528	0.19
529	0.18
530	0.17
531	0.13
532	0.11
533	0.09
534	0.08
535	0.07
536	0.07
537	0.06
538	0.06
539	0.05
540	0.06
541	0.06
542	0.06
543	0.06
544	0.06
545	0.06
546	0.06
547	0.06
548	0.06
549	0.12
550	0.17
551	0.21
552	0.22
553	0.22
554	0.25
555	0.32
556	0.34
557	0.32
558	0.31
559	0.32
560	0.31
561	0.35
562	0.4
563	0.36
564	0.34
565	0.31
566	0.29
567	0.24
568	0.23
569	0.19
570	0.12
571	0.11
572	0.11
573	0.1
574	0.09
575	0.11
576	0.12
577	0.13
578	0.13
579	0.14
580	0.12
581	0.13
582	0.12
583	0.1
584	0.09
585	0.08
586	0.07
587	0.05
588	0.06
589	0.07
590	0.08
591	0.09
592	0.09
593	0.1
594	0.11
595	0.16
596	0.2
597	0.22
598	0.24
599	0.24
600	0.29
601	0.32
602	0.35
603	0.31
604	0.28
605	0.25
606	0.24
607	0.25
608	0.22
609	0.19
610	0.19
611	0.19
612	0.21
613	0.26
614	0.23
615	0.2
616	0.26
617	0.25
618	0.27
619	0.26
620	0.25
621	0.23
622	0.26
623	0.29
624	0.25
625	0.26
626	0.24
627	0.26
628	0.25
629	0.25
630	0.23
631	0.22
632	0.2
633	0.2
634	0.16
635	0.14
636	0.13
637	0.1
638	0.09
639	0.07
640	0.07
641	0.07
642	0.08
643	0.07
644	0.09
645	0.1
646	0.1
647	0.12
648	0.16
649	0.15
650	0.14
651	0.15
652	0.14
653	0.15
654	0.17
655	0.15
656	0.12
657	0.14
658	0.14
659	0.12
660	0.12
661	0.1
662	0.08
663	0.08
664	0.09
665	0.1
666	0.11
667	0.12
668	0.11
669	0.11
670	0.14
671	0.18
672	0.16
673	0.14
674	0.15
675	0.14
676	0.16
677	0.18
678	0.18
679	0.15
680	0.15
681	0.16
682	0.18
683	0.19
684	0.18
685	0.15
686	0.13
687	0.14
688	0.13
689	0.13
690	0.09
691	0.09
692	0.12
693	0.14
694	0.14
695	0.14
696	0.2
697	0.23
698	0.31
699	0.32
700	0.29
701	0.3
702	0.31
703	0.31
704	0.27
705	0.24
706	0.21
707	0.27
708	0.35
709	0.39
710	0.45
711	0.5
712	0.55
713	0.57
714	0.57
715	0.55
716	0.49
717	0.46
718	0.45
719	0.42
720	0.36
721	0.34
722	0.4
723	0.38
724	0.43
725	0.47
726	0.45
727	0.48
728	0.55
729	0.58
730	0.6
731	0.61
732	0.62
733	0.65
734	0.66
735	0.7
736	0.71
737	0.74
738	0.66
739	0.65
740	0.6
741	0.51
742	0.48
743	0.42
744	0.36
745	0.4
746	0.38
747	0.35
748	0.35
749	0.33
750	0.31
751	0.3
752	0.32
753	0.22
754	0.22
755	0.2
756	0.18
757	0.26
758	0.35
759	0.35
760	0.37
761	0.38
762	0.39
763	0.39
764	0.39
765	0.34
766	0.26
767	0.29
768	0.22
769	0.26
770	0.24
771	0.22
772	0.23
773	0.2
774	0.22
775	0.17
776	0.23
777	0.2
778	0.22
779	0.23
780	0.22
781	0.23
782	0.2
783	0.2
784	0.13
785	0.1
786	0.09
787	0.09
788	0.09
789	0.08
790	0.08
791	0.08
792	0.08
793	0.09
794	0.1
795	0.1
796	0.11
797	0.14
798	0.2
799	0.22
800	0.25
801	0.27
802	0.29
803	0.3
804	0.35
805	0.35
806	0.31
807	0.29
808	0.27
809	0.33
810	0.33
811	0.32
812	0.29
813	0.26
814	0.27
815	0.34
816	0.42
817	0.41
818	0.41
819	0.44
820	0.46
821	0.45
822	0.42
823	0.36
824	0.27
825	0.21
826	0.17
827	0.15
828	0.16
829	0.19
830	0.21
831	0.24
832	0.3
833	0.34
834	0.41
835	0.42
836	0.41
837	0.46
838	0.45
839	0.47
840	0.44
841	0.39
842	0.32
843	0.29
844	0.25
845	0.18
846	0.18
847	0.12
848	0.11
849	0.12
850	0.13
851	0.14
852	0.19
853	0.2
854	0.21
855	0.21
856	0.21
857	0.22
858	0.21
859	0.28
860	0.26
861	0.25
862	0.26
863	0.25
864	0.25
865	0.23
866	0.25
867	0.24
868	0.27
869	0.29
870	0.29
871	0.33
872	0.37
873	0.43
874	0.46
875	0.44
876	0.47
877	0.5
878	0.56
879	0.61
880	0.62
881	0.55
882	0.53
883	0.54
884	0.52
885	0.56
886	0.54
887	0.55
888	0.56
889	0.59
890	0.56
891	0.52
892	0.5
893	0.45
894	0.43
895	0.38
896	0.34
897	0.35
898	0.36
899	0.35
900	0.33
901	0.29
902	0.29
903	0.25
904	0.26
905	0.23
906	0.24
907	0.27
908	0.27
909	0.27
910	0.27
911	0.28
912	0.28
913	0.34
914	0.39
915	0.45
916	0.49
917	0.49
918	0.49
919	0.51
920	0.54

K0KWA0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer